More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_0905 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_0905  Prephenate dehydratase  100 
 
 
386 aa  790    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000067938  hitchhiker  0.00000000600467 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1904  prephenate dehydratase  46.09 
 
 
372 aa  313  2.9999999999999996e-84  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0916421  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01900  Prephenate dehydratase  44.21 
 
 
303 aa  233  4.0000000000000004e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2061  Prephenate dehydratase  44.12 
 
 
277 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.152541  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2153  Prephenate dehydratase  44.12 
 
 
277 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1779  prephenate dehydratase  44.12 
 
 
277 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.490374  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0937  prephenate dehydratase  47.23 
 
 
272 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1153  Prephenate dehydratase  42.65 
 
 
276 aa  215  8e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3645  chorismate mutasea  43.84 
 
 
364 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0734175  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2166  chorismate mutase / prephenate dehydratase  42.65 
 
 
373 aa  213  2.9999999999999995e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0178196  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2260  prephenate dehydratase  40.74 
 
 
278 aa  214  2.9999999999999995e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1747  chorismate mutase/prephenate dehydratase  43.48 
 
 
364 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0966339  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1887  chorismate mutase-P and prephenate dehydratase  46.3 
 
 
360 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000192693  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1244  Prephenate dehydratase  42.7 
 
 
283 aa  213  7e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1424  prephenate dehydratase  43.91 
 
 
274 aa  210  3e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000368391  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1360  chorismate mutase  43.12 
 
 
364 aa  209  5e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0302882 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0078  prephenate dehydratase  44.69 
 
 
280 aa  209  5e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0545378  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0961  chorismate mutase  41.61 
 
 
374 aa  209  5e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1769  chorismate mutase  43.12 
 
 
367 aa  209  8e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.653886  normal  0.431896 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4076  prephenate dehydratase  42.75 
 
 
364 aa  209  8e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000787581  normal  0.246318 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3945  chorismate mutase  43.12 
 
 
364 aa  209  9e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.117888  normal  0.0191313 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0097  Prephenate dehydratase  46.4 
 
 
306 aa  208  1e-52  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1376  chorismate mutase  43.12 
 
 
364 aa  209  1e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15830  chorismate mutase  42.75 
 
 
365 aa  208  1e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.351764  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5270  Prephenate dehydratase  44.93 
 
 
315 aa  207  2e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.271199  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1850  prephenate dehydratase  41.67 
 
 
364 aa  207  3e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0140857  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1250  chorismate mutase  42.75 
 
 
382 aa  207  3e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00149804  normal  0.0219371 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1334  prephenate dehydratase  44.32 
 
 
280 aa  206  6e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000128945  normal  0.202615 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0951  chorismate mutase / prephenate dehydratase  39.79 
 
 
365 aa  205  1e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.356586  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23280  chorismate mutase  42.03 
 
 
365 aa  205  1e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.110273 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0904  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydratase  40.66 
 
 
371 aa  204  2e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1552  prephenate dehydratase  42.65 
 
 
279 aa  204  2e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0248162  normal  0.310445 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1244  prephenate dehydratase / chorismate mutase  45.42 
 
 
371 aa  204  2e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0482068  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0990  chorismate mutase  42.65 
 
 
359 aa  203  4e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3051  Prephenate dehydratase  42.09 
 
 
286 aa  203  4e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08570  prephenate dehydratase  41.79 
 
 
286 aa  203  5e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1963  chorismate mutase  41.67 
 
 
365 aa  203  5e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2192  chorismate mutase  42.91 
 
 
355 aa  202  6e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0774  chorismate mutase  40.29 
 
 
371 aa  202  6e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.561025  hitchhiker  0.00484876 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0845  chorismate mutase  40.29 
 
 
371 aa  202  8e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0602148 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00716  P-protein  42.18 
 
 
402 aa  202  8e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00262272  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0071  prephenate dehydratase  42.76 
 
 
324 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0862  prephenate dehydratase / chorismate mutase  44 
 
 
368 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2039  prephenate dehydratase  46.13 
 
 
275 aa  199  5e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00402041 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3039  chorismate mutase  42.65 
 
 
355 aa  199  5e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1336  chorismate mutase  41.61 
 
 
413 aa  199  6e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0495  chorismate mutase  41.26 
 
 
359 aa  199  7e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0778684  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2608  chorismate mutase/prephenate dehydratase  44.53 
 
 
358 aa  199  9e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2150  chorismate mutase  42.7 
 
 
358 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3260  chorismate mutase  41.91 
 
 
359 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1345  chorismate mutase  44.65 
 
 
359 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1313  chorismate mutase  41.26 
 
 
359 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  2.21838e-16 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0806  prephenate dehydratase  40.36 
 
 
284 aa  197  3e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2575  prephenate dehydratase  39.19 
 
 
382 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0965398  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1594  prephenate dehydratase  39.16 
 
 
311 aa  196  8.000000000000001e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1930  prephenate dehydratase  40.75 
 
 
311 aa  194  2e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.898282 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1964  prephenate dehydratase  40.81 
 
 
279 aa  194  2e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.221167 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0716  prephenate dehydratase / chorismate mutase  39.56 
 
 
387 aa  194  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1569  chorismate mutase  39.66 
 
 
360 aa  193  3e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.203479  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0741  chorismate mutase  43.17 
 
 
360 aa  194  3e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0878  Prephenate dehydratase  41.39 
 
 
277 aa  193  4e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.583651  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1442  chorismate mutase  41.37 
 
 
374 aa  193  4e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.105369  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3006  chorismate mutase  42.49 
 
 
360 aa  193  4e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.224868  normal  0.0525817 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1792  chorismate mutase / prephenate dehydratase  40.86 
 
 
360 aa  193  4e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00027177 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1497  P-protein (prephenate dehydratase / chorismate mutase)  41.37 
 
 
374 aa  193  4e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.554673  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3053  prephenate dehydratase  40.54 
 
 
315 aa  193  5e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1019  chorismate mutase  41.61 
 
 
358 aa  192  7e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.789998  unclonable  0.0000000000373166 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0897  chorismate mutase/prephenate dehydratase  41.61 
 
 
358 aa  192  7e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.255743  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0046  Prephenate dehydratase  42.03 
 
 
287 aa  192  9e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1418  chorismate mutase/prephenate dehydratase  41.82 
 
 
362 aa  191  1e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0977  prephenate dehydratase / chorismate mutase  42.49 
 
 
360 aa  191  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.23904  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3121  chorismate mutase  39.86 
 
 
365 aa  191  2e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0293375 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3022  chorismate mutase  43.48 
 
 
360 aa  190  2.9999999999999997e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.123559  normal  0.97386 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0121  prephenate dehydratase  40.78 
 
 
356 aa  190  2.9999999999999997e-47  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3282  chorismate mutase  39.86 
 
 
366 aa  190  2.9999999999999997e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0668525  normal  0.62913 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1635  chorismate mutase/prephenate dehydratase  41.76 
 
 
360 aa  190  4e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1232  prephenate dehydratase  43.96 
 
 
363 aa  189  5.999999999999999e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.964016 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0121  Prephenate dehydratase  43.73 
 
 
305 aa  189  7e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0008  Prephenate dehydratase  42.5 
 
 
279 aa  189  1e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1207  chorismate mutase  37.89 
 
 
371 aa  188  1e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.196084  normal  0.0297935 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1186  prephenate dehydratase  40.22 
 
 
393 aa  188  2e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.343107 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4445  prephenate dehydratase  43.01 
 
 
274 aa  187  3e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0950  chorismate mutase/prephenate dehydratase  41.03 
 
 
360 aa  187  3e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0432  chorismate mutase/prephenate dehydratase  41.03 
 
 
360 aa  187  3e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2997  chorismate mutase/prephenate dehydratase  41.03 
 
 
360 aa  187  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.379619  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2948  chorismate mutase/prephenate dehydratase  41.03 
 
 
360 aa  187  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.457884  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0198  chorismate mutase/prephenate dehydratase  41.03 
 
 
360 aa  187  3e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2885  chorismate mutase/prephenate dehydratase  41.03 
 
 
360 aa  187  3e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.629426  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2575  chorismate mutase/prephenate dehydratase  41.03 
 
 
360 aa  187  3e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0141  Prephenate dehydratase  41.94 
 
 
306 aa  186  7e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.341146  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2535  prephenate dehydratase  39.64 
 
 
282 aa  186  8e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1204  chorismate mutase  40.22 
 
 
393 aa  185  1.0000000000000001e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.973222  normal  0.768195 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1462  prephenate dehydratase  41.03 
 
 
358 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000293484  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0801  chorismate mutase  39.05 
 
 
359 aa  184  3e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1394  chorismate mutase  39.64 
 
 
371 aa  184  3e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0138573  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2466  chorismate mutase / prephenate dehydratase  39.64 
 
 
371 aa  184  3e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.148339 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1950  prephenate dehydratase  41.28 
 
 
366 aa  183  4.0000000000000006e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4721  chorismate mutase  39.27 
 
 
366 aa  183  4.0000000000000006e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.997566 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1617  chorismate mutase  38.91 
 
 
373 aa  183  4.0000000000000006e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0665  prephenate dehydratase  39.93 
 
 
293 aa  183  5.0000000000000004e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.27815  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>