More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_0702 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_0702  flagellar biosynthesis protein FliR  100 
 
 
255 aa  490  9.999999999999999e-139  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.310236  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2394  flagellar biosynthesis protein FliR  47.52 
 
 
255 aa  238  5e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0788  flagellar biosynthesis protein FliR  43.65 
 
 
255 aa  202  5e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000389137  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1750  flagellar biosynthetic protein FliR  42.63 
 
 
253 aa  199  3.9999999999999996e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1411  flagellar biosynthetic protein FliR  42.15 
 
 
257 aa  181  1e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.844633  normal  0.465726 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0483  flagellar biosynthesis protein FliR  39.84 
 
 
261 aa  176  2e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0146503  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2033  flagellar biosynthesis protein FliR  37.14 
 
 
265 aa  169  3e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.468794  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2155  flagellar biosynthetic protein FliR  39.47 
 
 
260 aa  168  7e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.71741  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1675  flagellar biosynthesis protein FliR  39.92 
 
 
260 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16700  flagellar biosynthetic protein FliR  33.33 
 
 
259 aa  157  2e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.794978  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2031  type III secretion system inner membrane R protein  38.71 
 
 
255 aa  155  5.0000000000000005e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2697  flagellar biosynthetic protein FliR  36.61 
 
 
255 aa  155  6e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.838221  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2587  flagellar biosynthesis protein FliR  37.02 
 
 
261 aa  144  1e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1128  flagellar biosynthesis protein FliR  39.18 
 
 
257 aa  144  2e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3473  flagellar biosynthetic protein FliR  36.68 
 
 
259 aa  142  5e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0193  flagellar biosynthetic protein FliR  37.14 
 
 
263 aa  142  6e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4136  flagellar biosynthetic protein FliR  33.6 
 
 
260 aa  142  7e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.140259  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3822  flagellar biosynthetic protein FliR  34.02 
 
 
261 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0378  flagellar biosynthetic protein FliR  33.62 
 
 
261 aa  139  6e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1879  flagellar biosynthesis protein FliR  38.53 
 
 
261 aa  138  7.999999999999999e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3906  flagellar biosynthetic protein FliR  33.2 
 
 
261 aa  137  1e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00325261 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0154  flagellar biosynthetic protein FliR  32.52 
 
 
263 aa  137  1e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.502944 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2541  flagellar biosynthesis protein FliR  30.17 
 
 
264 aa  137  1e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00342215  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0068  flagellar biosynthetic protein FliR  32.51 
 
 
266 aa  134  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.981811  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2912  flagellar biosynthetic protein FliR  31.54 
 
 
265 aa  130  3e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.219958  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0763  flagellar biosynthetic protein FliR  32.51 
 
 
258 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3069  flagellar biosynthetic protein FliR  32 
 
 
247 aa  128  8.000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.159103  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4383  flagellar biosynthetic protein FliR  31.15 
 
 
247 aa  128  8.000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3795  flagellar biosynthetic protein FliR  32 
 
 
256 aa  128  8.000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5879  flagellar biosynthesis protein FliR  32.49 
 
 
261 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.250463  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0650  flagellar biosynthetic protein FliR  32.88 
 
 
256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0761  flagellar biosynthesis protein FliR  30.86 
 
 
260 aa  126  3e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.272612  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3288  flagellar biosynthetic protein FliR  31.28 
 
 
265 aa  126  3e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0586  flagellar biosynthetic protein FliR  35.55 
 
 
260 aa  126  3e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5303  flagellar biosynthetic protein FliR  30.51 
 
 
261 aa  126  4.0000000000000003e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.114912 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1126  flagellar biosynthetic protein FliR  32.6 
 
 
256 aa  125  6e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.560402 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4197  flagellar biosynthetic protein FliR  28.46 
 
 
261 aa  125  8.000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2016  flagellar biosynthetic protein FliR  29.88 
 
 
264 aa  125  9e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1612  flagellar biosynthesis protein FliR  34.38 
 
 
262 aa  124  2e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0247066 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31040  flagellar biosynthetic protein FliR  34.3 
 
 
252 aa  124  2e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.567657  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1357  flagellar biosynthetic protein FliR  30.8 
 
 
260 aa  123  2e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.811405  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0867  flagellar biosynthetic protein FliR  31.75 
 
 
253 aa  123  2e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2943  flagellar biosynthetic protein FliR  28.97 
 
 
260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2009  flagellar biosynthetic protein FliR  35.32 
 
 
253 aa  119  3e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1164  flagellar biosynthetic protein FliR  32.64 
 
 
258 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3442  flagellar biosynthetic protein FliR  25.2 
 
 
264 aa  118  7e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0425  flagellar biosynthesis protein FliR  29.63 
 
 
264 aa  118  9e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1138  flagellar biosynthesis protein FliR  28.45 
 
 
264 aa  117  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000910874  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2144  flagellar biosynthesis protein FliR  28.03 
 
 
264 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0345603  hitchhiker  0.00457903 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2139  flagellar biosynthesis protein FliR  28.03 
 
 
264 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.19844  normal  0.226973 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1261  flagellar biosynthesis protein FliR  28.03 
 
 
264 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0910889  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0562  flagellar biosynthetic protein FliR  29.33 
 
 
240 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.949104  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2197  flagellar biosynthesis protein FliR  28.03 
 
 
264 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.103622  normal  0.587287 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1258  flagellar biosynthesis protein FliR  29.8 
 
 
253 aa  116  3e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0798452  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3782  flagellar biosynthetic protein FliR  29.82 
 
 
260 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0184  flagellar biosynthetic protein FliR  27.44 
 
 
267 aa  116  3.9999999999999997e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000300642  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1071  flagellar biosynthesis protein FliR  29.34 
 
 
261 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000309979  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2260  type III secretion system inner membrane R protein  31.78 
 
 
239 aa  114  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.311436  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3095  flagellar biosynthesis protein FliR  30.04 
 
 
264 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1317  flagellar biosynthetic protein FliR  33.48 
 
 
259 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0547  flagellar biosynthesis protein FliR  30.93 
 
 
253 aa  114  2.0000000000000002e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00458922  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1564  flagellar biosynthetic protein FliR  32.65 
 
 
260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.16328  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0035  flagellar biosynthetic protein FliR  29.29 
 
 
260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0035  flagellar biosynthetic protein FliR  29.29 
 
 
260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0054  flagellar biosynthetic protein FliR  29.29 
 
 
260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1234  flagellar biosynthesis protein FliR  29.34 
 
 
261 aa  113  3e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000114634  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2684  flagellar biosynthetic protein FliR  31.67 
 
 
260 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.648177  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1692  flagellar biosynthesis protein FliR  29.34 
 
 
261 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000555568  normal  0.0138418 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0245  flagellar biosynthetic protein FliR  31.67 
 
 
260 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1859  flagellar biosynthetic protein FliR  31.67 
 
 
260 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.352593  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2693  flagellar biosynthetic protein FliR  31.67 
 
 
260 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3268  flagellar biosynthetic protein FliR  31.67 
 
 
260 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0034  flagellar biosynthetic protein FliR  31.67 
 
 
260 aa  112  5e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0034  flagellar biosynthetic protein FliR  31.67 
 
 
260 aa  112  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2974  flagellar biosynthetic protein FliR  35.29 
 
 
252 aa  112  5e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2050  flagellar biosynthesis protein FliR  28.93 
 
 
261 aa  112  6e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000709328  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0741  flagellar biosynthetic protein FliR  32.9 
 
 
253 aa  112  8.000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0373  flagellar biosynthetic fliR transmembrane protein  29.82 
 
 
262 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0036  flagellar biosynthetic protein FliR  30.2 
 
 
260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1640  flagellar biosynthetic protein FliR  31.78 
 
 
253 aa  111  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0027  flagellar biosynthetic protein FliR  30.54 
 
 
260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2183  flagellar biosynthesis protein FliR  28.93 
 
 
261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000259397  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2727  flagellar biosynthesis protein FliR  28.93 
 
 
261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00116197  normal  0.508279 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1698  flagellar biosynthetic protein FliR  28.93 
 
 
261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000412821  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1751  flagellar biosynthetic protein fliR  28.87 
 
 
256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1751  flagellar biosynthetic protein fliR  28.45 
 
 
256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2304  flagellar biosynthesis protein FliR  27.64 
 
 
260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0032  flagellar biosynthetic protein FliR  31.67 
 
 
260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.413107  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0038  flagellar biosynthetic protein FliR  32.17 
 
 
260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2404  flagellar biosynthesis protein FliR  27.64 
 
 
260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.688451  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0742  flagellar biosynthetic protein FliR  29.36 
 
 
247 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.42269  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0859  type III secretion system inner membrane R protein  33.94 
 
 
259 aa  108  6e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.213878  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2231  flagellar biosynthetic protein FliR  30.17 
 
 
253 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.621455  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1966  flagellar biosynthetic protein FliR  33.76 
 
 
266 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0222409  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2329  type III secretion system inner membrane R protein  30.45 
 
 
256 aa  108  9.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0502064  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0409  flagellar biosynthetic protein FliR  29.22 
 
 
257 aa  108  9.000000000000001e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1396  flagellar biosynthetic protein FliR  29.48 
 
 
257 aa  107  2e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2822  flagellar biosynthesis protein FliR  29.6 
 
 
253 aa  106  4e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.104106  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4180  flagellar biosynthetic protein FliR  27.02 
 
 
264 aa  105  6e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1333  flagellar biosynthetic protein FliR  28.37 
 
 
257 aa  105  7e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.762927  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>