More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_0608 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_0608  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 
584 aa  1198    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0372  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  41.44 
 
 
450 aa  289  9e-77  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1813  tRNA nucleotidyltransferase (CCA-adding enzyme)  37.33 
 
 
437 aa  283  5.000000000000001e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1389  metal dependent phosphohydrolase  37.5 
 
 
442 aa  281  2e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.23743  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1033  polyA polymerase family protein  39.25 
 
 
448 aa  280  4e-74  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0733439  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1756  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  38.06 
 
 
473 aa  272  1e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0026  polyA polymerase family protein  37.02 
 
 
422 aa  271  2e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0026  polyA polymerase family protein  37.08 
 
 
424 aa  270  5.9999999999999995e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2295  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  36.77 
 
 
448 aa  264  4e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.730804  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2631  hypothetical protein  86.23 
 
 
138 aa  263  1e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2106  hypothetical protein  88.32 
 
 
138 aa  260  5.0000000000000005e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2202  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  33.78 
 
 
583 aa  259  7e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1344  hypothetical protein  85.51 
 
 
138 aa  257  4e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1857  hypothetical protein  86.23 
 
 
138 aa  256  6e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2857  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  38.55 
 
 
484 aa  256  9e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.858546  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1023  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  35.32 
 
 
464 aa  253  5.000000000000001e-66  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2057  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  35.16 
 
 
465 aa  253  6e-66  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000115369  normal  0.734292 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05400  uncharacterized domain HDIG-containing protein  35.59 
 
 
451 aa  251  2e-65  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00288807  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3284  protein of unknown function UPF0047  81.16 
 
 
138 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0204  hypothetical protein  84.17 
 
 
139 aa  246  9.999999999999999e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0976  protein of unknown function UPF0047  81.16 
 
 
138 aa  246  9.999999999999999e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.394936  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2359  protein of unknown function UPF0047  81.16 
 
 
138 aa  243  7e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0206  hypothetical protein  83.45 
 
 
139 aa  243  7e-63  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0680  protein of unknown function UPF0047  81.16 
 
 
138 aa  242  1e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000327687  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3827  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  34.2 
 
 
459 aa  241  2e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0456  hypothetical protein  79.71 
 
 
138 aa  236  8e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000105947  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0290  protein of unknown function UPF0047  78.99 
 
 
138 aa  233  5e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.444924  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08990  tRNA nucleotidyltransferase/poly(A) polymerase  33.48 
 
 
467 aa  231  2e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00002367 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1685  hypothetical protein  78.42 
 
 
139 aa  230  5e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2803  polynucleotide adenylyltransferase region  32.8 
 
 
510 aa  230  7e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2109  protein of unknown function UPF0047  74.64 
 
 
138 aa  228  3e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0609464 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0515  protein of unknown function UPF0047  76.81 
 
 
138 aa  227  4e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0221734  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0497  metal dependent phosphohydrolase  35.53 
 
 
492 aa  226  9e-58  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1065  hypothetical protein  76.09 
 
 
138 aa  224  3e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00346486  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2728  protein of unknown function UPF0047  73.19 
 
 
138 aa  223  8e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1152  hypothetical protein  74.82 
 
 
139 aa  223  9.999999999999999e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3230  hypothetical protein  74.82 
 
 
139 aa  223  9.999999999999999e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2666  protein of unknown function UPF0047  76.09 
 
 
138 aa  221  3e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.262754 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1191  hypothetical protein  74.82 
 
 
139 aa  221  3e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1739  protein of unknown function UPF0047  76.09 
 
 
138 aa  220  3.9999999999999997e-56  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0478  metal dependent phosphohydrolase  32.99 
 
 
490 aa  219  7e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.903999  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3072  hypothetical protein  73.19 
 
 
138 aa  219  8.999999999999998e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.455097  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2067  protein of unknown function UPF0047  73.19 
 
 
138 aa  219  1e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0570  hypothetical protein  73.91 
 
 
138 aa  219  2e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0497  metal dependent phosphohydrolase  33.62 
 
 
454 aa  218  2e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1636  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  34.1 
 
 
464 aa  218  2.9999999999999998e-55  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.841879  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3634  protein of unknown function UPF0047  72.66 
 
 
139 aa  217  4e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1956  hypothetical protein  74.1 
 
 
139 aa  217  5e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0266366  normal  0.0623064 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3409  hypothetical protein  74.1 
 
 
139 aa  216  7e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.000525529  normal  0.0925547 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2183  hypothetical protein  72.66 
 
 
139 aa  216  9e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0225  hypothetical protein  74.1 
 
 
139 aa  216  9e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0225  hypothetical protein  73.38 
 
 
139 aa  216  9.999999999999999e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2329  hypothetical protein  70.83 
 
 
157 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.561757  normal  0.383888 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3144  hypothetical protein  74.82 
 
 
139 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.531685  normal  0.493173 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2363  hypothetical protein  72.66 
 
 
139 aa  212  1e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000100491  normal  0.704799 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3485  hypothetical protein  69.78 
 
 
139 aa  206  1e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.666502 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2157  hypothetical protein  69.78 
 
 
139 aa  206  1e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0114  protein of unknown function UPF0047  69.06 
 
 
139 aa  201  3e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000627412  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1410  hypothetical protein  70.5 
 
 
139 aa  199  1.0000000000000001e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.360992 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0920  protein of unknown function UPF0047  69.78 
 
 
139 aa  199  2.0000000000000003e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1520  protein of unknown function UPF0047  68.35 
 
 
139 aa  197  3e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0913014  normal  0.716267 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0833  hypothetical protein  69.06 
 
 
139 aa  196  7e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.236299  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3924  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  31.54 
 
 
502 aa  196  1e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3571  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  33.11 
 
 
483 aa  194  3e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.564653 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0955  protein of unknown function UPF0047  67.63 
 
 
139 aa  194  3e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0812583  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1449  tRNA nucleotidyltransferase  34.06 
 
 
471 aa  193  6e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4968  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  33.48 
 
 
490 aa  193  8e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0111  hypothetical protein  66.91 
 
 
150 aa  191  2e-47  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000308533 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2058  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  31.42 
 
 
469 aa  192  2e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4157  metal dependent phosphohydrolase  31.41 
 
 
496 aa  192  2e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6436  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  35.63 
 
 
473 aa  188  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4574  HDIG domain-containing protein  33.41 
 
 
485 aa  189  2e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.119435 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0060  tRNA adenylyltransferase  33.11 
 
 
475 aa  189  2e-46  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.451798 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2415  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  33.48 
 
 
471 aa  187  6e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3102  metal-dependent phosphohydrolase  31.81 
 
 
552 aa  186  7e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0635  Polynucleotide adenylyltransferase region  33.73 
 
 
427 aa  187  7e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0308  polynucleotide adenylyltransferase region  31.29 
 
 
427 aa  186  1.0000000000000001e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.467855 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4849  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  32.81 
 
 
499 aa  186  1.0000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2542  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  37.33 
 
 
492 aa  185  2.0000000000000003e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.277933 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1799  putative RNA nucleotidyltransferase  40.07 
 
 
273 aa  185  2.0000000000000003e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23340  tRNA adenylyltransferase  30.68 
 
 
483 aa  184  3e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5092  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 
485 aa  184  5.0000000000000004e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000588683 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0722  HDIG  31.76 
 
 
476 aa  182  1e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.314731  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0254  protein of unknown function UPF0047  64.29 
 
 
140 aa  182  1e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1710  tRNA adenylyltransferase  29.61 
 
 
394 aa  182  2e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.141453  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2475  tRNA cytidylyltransferase  33.41 
 
 
436 aa  182  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0152668  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0017  hypothetical protein  58.7 
 
 
136 aa  181  2.9999999999999997e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00239143  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2387  tRNA cytidylyltransferase  32.27 
 
 
436 aa  181  4e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0216975  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37890  tRNA adenylyltransferase  34.4 
 
 
488 aa  181  4e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2407  tRNA adenylyltransferase  33.41 
 
 
471 aa  180  5.999999999999999e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.460481 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39600  tRNA adenylyltransferase  32.44 
 
 
523 aa  180  7e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2353  tRNA cytidylyltransferase  32.27 
 
 
434 aa  179  1e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.103855  normal  0.215704 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5397  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  36.47 
 
 
464 aa  179  2e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1213  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  31.56 
 
 
479 aa  178  3e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06110  tRNA nucleotidyltransferase  31.49 
 
 
477 aa  177  3e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2120  tRNA CCA-pyrophosphorylase  44.5 
 
 
404 aa  177  6e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0665  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  32.29 
 
 
484 aa  177  6e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0990908 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0854  Polynucleotide adenylyltransferase region  31.47 
 
 
468 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00520307 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1445  hypothetical protein  61.15 
 
 
138 aa  174  5e-42  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0875053  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9036  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  32.65 
 
 
491 aa  174  5e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192829  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>