227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_0600 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



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Alignment on homolog gene
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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_0600  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  100 
 
 		 427 aa  887    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1070  L-lysine 2,3-aminomutase  56.39 
 
 		 416 aa  496  1e-139  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.628059 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0670  L-lysine 2,3-aminomutase  55.93 
 
 		 414 aa  496  1e-139  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.420719 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1576  hypothetical protein  58.25 
 
 		 438 aa  496  1e-139  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0162039 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2886  L-lysine 2,3-aminomutase  57.25 
 
 		 416 aa  495  1e-139  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.623873 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0211  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  56.94 
 
 		 437 aa  494  9.999999999999999e-139  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0802  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  56.32 
 
 		 437 aa  489  1e-137  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1649  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  56.56 
 
 		 437 aa  490  1e-137  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.641353 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0274  L-lysine 2,3-aminomutase  57.07 
 
 		 435 aa  487  1e-136  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0207  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  56.35 
 
 		 422 aa  485  1e-136  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1079  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  55.42 
 
 		 440 aa  486  1e-136  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1886  L-lysine 2,3-aminomutase  56.69 
 
 		 420 aa  488  1e-136  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.185712 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0106  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  58.19 
 
 		 433 aa  488  1e-136  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.928991  normal  0.154212 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0189  L-lysine 2,3-aminomutase  54.76 
 
 		 454 aa  483  1e-135  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1795  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  58.05 
 
 		 433 aa  483  1e-135  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0345  L-lysine 2,3-aminomutase  55.13 
 
 		 453 aa  482  1e-135  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000388257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0666  L-lysine 2,3-aminomutase  57.95 
 
 		 433 aa  481  1e-135  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0598217  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0696  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  55.93 
 
 		 440 aa  482  1e-135  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000415374  normal  0.0401463 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1080  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  56.17 
 
 		 436 aa  483  1e-135  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1223  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  56.73 
 
 		 433 aa  484  1e-135  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1401  hypothetical protein  56.25 
 
 		 457 aa  477  1e-133  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.536513  n/a   
 
 
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NC_009051  Memar_0215  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  55.12 
 
 		 437 aa  476  1e-133  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0240  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  56.4 
 
 		 437 aa  474  1e-133  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0221  GNAT family L-lysine 2,3-aminomutase/acetyltransferase  53.32 
 
 		 708 aa  470  1.0000000000000001e-131  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.893806  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_197  L-lysine 2,3-aminomutase/beta-lysine acetyltransferase, GNAT family  53.32 
 
 		 730 aa  469  1.0000000000000001e-131  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009253  Dred_0740  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  62.47 
 
 		 406 aa  462  1e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009616  Tmel_0192  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  53.24 
 
 		 423 aa  462  1e-129  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.863108  n/a   
 
 
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NC_009455  DehaBAV1_0133  L-lysine 2,3-aminomutase  52.73 
 
 		 730 aa  459  9.999999999999999e-129  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009674  Bcer98_1688  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  53.32 
 
 		 472 aa  455  1e-127  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.157129  n/a   
 
 
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NC_003909  BCE_2334  L-lysine 2,3-aminomutase  52.98 
 
 		 473 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_005945  BAS2145  L-lysine 2,3-aminomutase  53.22 
 
 		 473 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_005957  BT9727_2083  lysine 2,3-aminomutase  53.22 
 
 		 473 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2079  lysine 2,3-aminomutase  53.22 
 
 		 473 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.492987  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2408  L-lysine 2,3-aminomutase  53.22 
 
 		 473 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.481514  n/a   
 
 
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NC_011725  BCB4264_A2281  L-lysine 2,3-aminomutase  53.22 
 
 		 473 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007530  GBAA_2300  L-lysine 2,3-aminomutase  53.22 
 
 		 473 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011772  BCG9842_B3042  L-lysine 2,3-aminomutase  53.22 
 
 		 473 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.137592  normal  1 
 
 
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NC_011773  BCAH820_2325  L-lysine 2,3-aminomutase  53.22 
 
 		 473 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_2118  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  53.35 
 
 		 472 aa  449  1e-125  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.284772  n/a   
 
 
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NC_010001  Cphy_1643  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  52.93 
 
 		 393 aa  441  9.999999999999999e-123  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010424  Daud_0171  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  53.17 
 
 		 420 aa  441  9.999999999999999e-123  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009675  Anae109_1315  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  53.69 
 
 		 413 aa  412  1e-114  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.603808  normal  1 
 
 
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NC_007760  Adeh_2548  L-lysine 2,3-aminomutase  53.12 
 
 		 375 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008025  Dgeo_0988  hypothetical protein  52.73 
 
 		 483 aa  408  1.0000000000000001e-112  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.709939  normal  0.113697 
 
 
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NC_011891  A2cp1_1402  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  52.84 
 
 		 415 aa  405  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.522319  n/a   
 
 
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NC_011145  AnaeK_1301  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  52.84 
 
 		 415 aa  405  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.156548  n/a   
 
 
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NC_009943  Dole_1893  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  51.49 
 
 		 454 aa  397  1e-109  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.836798  n/a   
 
 
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NC_008554  Sfum_0711  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  51.34 
 
 		 460 aa  389  1e-107  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.62516  normal  1 
 
 
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NC_010571  Oter_1916  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  52.16 
 
 		 403 aa  389  1e-107  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_002936  DET0628  radical SAM domain-containing protein  48.09 
 
 		 439 aa  379  1e-104  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00861881  n/a   
 
 
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NC_013552  DhcVS_569  lysine 2,3-aminomutase  48.24 
 
 		 439 aa  379  1e-104  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007519  Dde_3041  L-lysine 2,3-aminomutase  49.86 
 
 		 527 aa  377  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009455  DehaBAV1_0601  L-lysine 2,3-aminomutase  46.97 
 
 		 439 aa  377  1e-103  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012034  Athe_2274  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  48.6 
 
 		 407 aa  372  1e-102  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013385  Adeg_1408  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  49.15 
 
 		 427 aa  369  1e-101  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013440  Hoch_3939  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  48.21 
 
 		 419 aa  371  1e-101  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0153502  normal  0.0100362 
 
 
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NC_013501  Rmar_0136  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  49.29 
 
 		 396 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.192198  n/a   
 
 
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NC_010718  Nther_1768  L-lysine 2,3-aminomutase  44.89 
 
 		 412 aa  354  2e-96  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.303353 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1776  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  47.18 
 
 		 411 aa  349  4e-95  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0350095  n/a   
 
 
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NC_011830  Dhaf_1337  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  45.58 
 
 		 413 aa  348  9e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0608146  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1754  L-lysine 2,3-aminomutase  50 
 
 		 353 aa  345  7e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.117521  n/a   
 
 
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NC_009675  Anae109_1316  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  42.67 
 
 		 385 aa  342  7e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1840  L-lysine 2,3-aminomutase  50.57 
 
 		 344 aa  339  5e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000138489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2149  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  49.86 
 
 		 347 aa  339  5e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000218503  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0457  L-lysine 2,3-aminomutase  43.8 
 
 		 415 aa  338  8e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0632034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1302  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  42.33 
 
 		 402 aa  333  4e-90  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.188876  n/a   
 
 
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NC_010730  SYO3AOP1_0796  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  45.38 
 
 		 374 aa  332  7.000000000000001e-90  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4485  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  46.29 
 
 		 381 aa  330  3e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1121  lysine 2,3-aminomutase  44.29 
 
 		 422 aa  330  3e-89  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2520  hypothetical protein  47.81 
 
 		 347 aa  330  4e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.707016  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1403  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  42.06 
 
 		 402 aa  329  5.0000000000000004e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2547  L-lysine 2,3-aminomutase  41.8 
 
 		 402 aa  327  2.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1765  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  50.48 
 
 		 346 aa  327  3e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.930699  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1068  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  43.53 
 
 		 419 aa  326  4.0000000000000003e-88  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000489798  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0599  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  44.57 
 
 		 432 aa  324  1e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2398  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  48.42 
 
 		 344 aa  324  2e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.723604  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2148  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  43.68 
 
 		 422 aa  321  1.9999999999999998e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1821  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  47.85 
 
 		 344 aa  319  5e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00597572 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2931  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  42.51 
 
 		 408 aa  317  2e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000971208  normal  0.769663 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0099  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  44.48 
 
 		 365 aa  316  5e-85  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.521426  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4018  radical SAM domain-containing protein  47.37 
 
 		 360 aa  310  2.9999999999999997e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2103  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  46.71 
 
 		 341 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2513  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  47.28 
 
 		 358 aa  297  2e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1421  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  43.63 
 
 		 358 aa  289  6e-77  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.566148 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1818  lysine 2,3-aminomutase  41.79 
 
 		 397 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3908  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  38.39 
 
 		 362 aa  264  2e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.935392 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3212  hypothetical protein  39.71 
 
 		 340 aa  262  1e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3891  hypothetical protein  41.57 
 
 		 393 aa  257  2e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2740  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  42.24 
 
 		 347 aa  257  3e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.525407 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3192  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  40.13 
 
 		 353 aa  254  3e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3965  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  38.97 
 
 		 345 aa  253  5.000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0453  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  39.59 
 
 		 363 aa  253  6e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.284633 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3223  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  36.81 
 
 		 356 aa  251  2e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010172  Mext_3003  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  42 
 
 		 353 aa  250  4e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.108543  normal  1 
 
 
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NC_011894  Mnod_1886  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  41.46 
 
 		 356 aa  249  5e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3227  L-lysine 2,3-aminomutase  38.37 
 
 		 340 aa  248  2e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011757  Mchl_3228  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  41.33 
 
 		 353 aa  247  3e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.486913 
 
 
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NC_007964  Nham_2300  hypothetical protein  42.47 
 
 		 366 aa  245  9e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.286942  n/a   
 
 
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NC_011365  Gdia_1499  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  38.93 
 
 		 382 aa  244  1.9999999999999999e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.73421  normal  0.589587 
 
 
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NC_011988  Avi_6024  L-lysine 2,3-aminomutase  41.59 
 
 		 349 aa  243  3.9999999999999997e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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