More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_0597 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_0597  3-isopropylmalate dehydrogenase  100 
 
 
523 aa  1071    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000598819  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2140  3-isopropylmalate dehydrogenase  67.61 
 
 
358 aa  498  1e-140  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0288  3-isopropylmalate dehydrogenase  66.1 
 
 
356 aa  473  1e-132  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2252  3-isopropylmalate dehydrogenase  62.01 
 
 
357 aa  425  1e-117  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1794  3-isopropylmalate dehydrogenase  59.55 
 
 
358 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.741097 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2209  3-isopropylmalate dehydrogenase  60.45 
 
 
362 aa  416  9.999999999999999e-116  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000258319  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3358  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.33 
 
 
360 aa  411  1e-113  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2592  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.87 
 
 
371 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.229971  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3222  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.15 
 
 
358 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0908  3-isopropylmalate dehydrogenase  59.66 
 
 
362 aa  408  1.0000000000000001e-112  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0378851  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3353  3-isopropylmalate dehydrogenase  59.38 
 
 
362 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.133211 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0860  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.58 
 
 
371 aa  403  1e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0128  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.71 
 
 
356 aa  405  1e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1045  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.98 
 
 
362 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.18231  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2099  3-isopropylmalate dehydrogenase  59.38 
 
 
355 aa  401  9.999999999999999e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000153808  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1020  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.34 
 
 
356 aa  400  9.999999999999999e-111  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00117198  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0045  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.22 
 
 
362 aa  399  9.999999999999999e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0146911  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0036  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.06 
 
 
355 aa  400  9.999999999999999e-111  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.246582  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0602  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.38 
 
 
362 aa  396  1e-109  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000206723  normal  0.0345378 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1264  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.46 
 
 
355 aa  396  1e-109  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2879  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.14 
 
 
362 aa  394  1e-108  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0348  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.42 
 
 
363 aa  395  1e-108  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000128786  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0387  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.18 
 
 
357 aa  392  1e-108  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.603311  normal  0.830854 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1365  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.58 
 
 
356 aa  392  1e-107  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.528909  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1193  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.72 
 
 
363 aa  389  1e-107  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1740  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.9 
 
 
357 aa  389  1e-107  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0114  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.3 
 
 
352 aa  389  1e-107  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1101  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.5 
 
 
355 aa  390  1e-107  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.815797  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2487  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.98 
 
 
352 aa  386  1e-106  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1988  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.41 
 
 
360 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.325379  normal  0.0231665 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2063  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.66 
 
 
360 aa  388  1e-106  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1516  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.6 
 
 
357 aa  386  1e-106  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0986434  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1904  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.92 
 
 
365 aa  387  1e-106  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000997715  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4657  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.93 
 
 
364 aa  385  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000431802 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3771  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.41 
 
 
360 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0017  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.98 
 
 
355 aa  385  1e-106  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0509  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.5 
 
 
357 aa  387  1e-106  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1716  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.71 
 
 
357 aa  387  1e-106  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1519  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.41 
 
 
360 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.676476  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1563  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.12 
 
 
357 aa  385  1e-106  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.27267  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0347  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.87 
 
 
361 aa  383  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0972  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.65 
 
 
362 aa  384  1e-105  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0864  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.14 
 
 
350 aa  384  1e-105  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000147801  hitchhiker  0.00313755 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0797  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.4 
 
 
357 aa  384  1e-105  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000426941  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0648  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.59 
 
 
358 aa  385  1e-105  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0597503  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1703  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.55 
 
 
351 aa  382  1e-105  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.112603  hitchhiker  0.00699985 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23790  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.41 
 
 
360 aa  383  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0915643 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0340  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.87 
 
 
361 aa  383  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1781  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.83 
 
 
359 aa  383  1e-105  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.500834  hitchhiker  0.00494446 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1892  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.13 
 
 
360 aa  382  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.154027  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02610  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.98 
 
 
357 aa  380  1e-104  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2015  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.7 
 
 
360 aa  382  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.021307  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1341  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.43 
 
 
357 aa  382  1e-104  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.643187 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0585  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.41 
 
 
369 aa  379  1e-104  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0320977  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2175  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.56 
 
 
360 aa  377  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0671441  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1985  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.13 
 
 
360 aa  378  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.2378  decreased coverage  0.00707192 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1014  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.37 
 
 
362 aa  376  1e-103  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1054  3-isopropylmalate dehydrogenase  58.03 
 
 
356 aa  376  1e-103  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.347892 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1918  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.29 
 
 
353 aa  375  1e-103  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3068  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.5 
 
 
354 aa  376  1e-103  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.787339  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3233  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.23 
 
 
357 aa  374  1e-102  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0488471  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1988  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.68 
 
 
363 aa  375  1e-102  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.378872  normal  0.141872 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2586  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.23 
 
 
359 aa  374  1e-102  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2987  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.82 
 
 
362 aa  373  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0123626  normal  0.372327 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0767  3-isopropylmalate dehydrogenase  57.46 
 
 
356 aa  374  1e-102  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2084  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.62 
 
 
357 aa  375  1e-102  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.157532  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2577  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.47 
 
 
362 aa  373  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.338977  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5238  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.77 
 
 
356 aa  370  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.37874 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1247  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.7 
 
 
359 aa  369  1e-101  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2311  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.77 
 
 
355 aa  369  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0192  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.42 
 
 
373 aa  369  1e-101  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1551  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.84 
 
 
360 aa  371  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.346494 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2093  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.84 
 
 
359 aa  371  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0127981  normal  0.7067 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2721  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.77 
 
 
360 aa  370  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0190941  normal  0.0566777 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1958  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.3 
 
 
367 aa  369  1e-101  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.487296  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34260  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.7 
 
 
360 aa  371  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1819  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.58 
 
 
356 aa  370  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.7246  normal  0.707373 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2143  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.3 
 
 
356 aa  369  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.444097  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4439  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.52 
 
 
357 aa  367  1e-100  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0740  3-isopropylmalate dehydrogenase  52.94 
 
 
353 aa  368  1e-100  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0123  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.17 
 
 
363 aa  365  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0556005 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0128  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.17 
 
 
363 aa  365  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0349763 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2472  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.49 
 
 
355 aa  368  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.278486  normal  0.454857 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1546  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.46 
 
 
373 aa  366  1e-100  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.178342  normal  0.073036 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0121  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.17 
 
 
363 aa  365  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.165091  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1230  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.34 
 
 
361 aa  366  1e-100  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.121054 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1221  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.43 
 
 
357 aa  368  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.725495  normal  0.0144759 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1810  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.62 
 
 
356 aa  365  1e-100  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.704264  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4369  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.93 
 
 
355 aa  366  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1047  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.87 
 
 
357 aa  369  1e-100  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0128  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.17 
 
 
363 aa  365  1e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2075  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.6 
 
 
358 aa  365  1e-99  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1732  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.6 
 
 
358 aa  365  1e-99  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00156138  hitchhiker  0.00249428 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0124  3-isopropylmalate dehydrogenase  53.17 
 
 
363 aa  365  1e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.736589  normal  0.998111 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6847  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.21 
 
 
355 aa  364  2e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0118477  normal  0.782262 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0364  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.52 
 
 
354 aa  364  2e-99  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2887  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.21 
 
 
355 aa  364  2e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.423656  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0381  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.52 
 
 
354 aa  364  2e-99  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1539  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.41 
 
 
357 aa  363  3e-99  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1420  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.87 
 
 
362 aa  363  4e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>