More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_0539 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_0539  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 		 330 aa  656    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.540099 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0370  nickel ABC transporter, permease subunit NikC  45.45 
 
 		 284 aa  271  2e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0387  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48 
 
 		 309 aa  260  2e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0349  nickel ABC transporter, permease subunit NikC  45.93 
 
 		 283 aa  256  4e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0860  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.25 
 
 		 287 aa  247  2e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000642732  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0470  nickel ABC transporter, permease protein  47.23 
 
 		 290 aa  241  1e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4391  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  46.07 
 
 		 299 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4232  oligopeptide transport system, permease  46.07 
 
 		 299 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4244  oligopeptide ABC transporter, permease  46.07 
 
 		 299 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4731  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  46.07 
 
 		 299 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4609  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  46.07 
 
 		 299 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2030  ABC transporter, permease protein  45.21 
 
 		 300 aa  228  1e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0884139  normal  0.749678 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3674  oligopeptide ABC transporter, permease  43.98 
 
 		 279 aa  227  2e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0467802 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2452  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.74 
 
 		 296 aa  224  1e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0368392  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0391  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.22 
 
 		 295 aa  224  2e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0718  hypothetical protein  45.49 
 
 		 282 aa  224  2e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.661918 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2400  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.22 
 
 		 373 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2407  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.02 
 
 		 309 aa  221  9.999999999999999e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2403  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.44 
 
 		 304 aa  220  1.9999999999999999e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000292743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0448  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.05 
 
 		 287 aa  220  3e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.144364 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0802  nickel transporter permease NikC  44.44 
 
 		 290 aa  218  1e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0481  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.36 
 
 		 299 aa  218  1e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00209608  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0212  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.85 
 
 		 292 aa  217  2e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000142566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0752  nickel transporter permease NikC  44.44 
 
 		 290 aa  217  2e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1354  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.91 
 
 		 299 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1030  nickel transporter permease NikC  44.08 
 
 		 270 aa  212  7e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.503674  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7616  nickel transporter permease NikC  43.14 
 
 		 291 aa  211  1e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1137  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.48 
 
 		 293 aa  211  2e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000296229  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1867  ABC-type transport system protein  42.91 
 
 		 288 aa  210  3e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2422  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.9 
 
 		 311 aa  210  3e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0201  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.37 
 
 		 292 aa  209  5e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.273251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1504  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.74 
 
 		 289 aa  209  5e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.109416  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03327  nickel transporter subunit  44.54 
 
 		 277 aa  207  3e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0237  nickel ABC transporter, permease subunit NikC  44.54 
 
 		 277 aa  207  3e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3762  nickel transporter permease NikC  44.54 
 
 		 277 aa  207  3e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3962  nickel transporter permease NikC  44.54 
 
 		 277 aa  207  3e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03280  hypothetical protein  44.54 
 
 		 277 aa  207  3e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3677  nickel transporter permease NikC  44.54 
 
 		 277 aa  206  3e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4818  nickel transporter permease NikC  44.54 
 
 		 277 aa  207  3e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0238  nickel transporter permease NikC  44.54 
 
 		 277 aa  207  3e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3843  nickel transporter permease NikC  44.12 
 
 		 277 aa  206  5e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2796  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.45 
 
 		 299 aa  205  1e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1592  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.85 
 
 		 280 aa  204  2e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.961775 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0011  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.96 
 
 		 307 aa  204  2e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6074  nickel transporter permease NikC  42.35 
 
 		 283 aa  203  3e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0628  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.98 
 
 		 294 aa  203  3e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.881682  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3865  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.89 
 
 		 307 aa  202  5e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3369  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40 
 
 		 301 aa  202  7e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1253  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.3 
 
 		 305 aa  201  9.999999999999999e-51  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.95778  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1836  nickel transporter permease NikC  42.64 
 
 		 277 aa  201  9.999999999999999e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00660391 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1282  oligopeptide ABC transporter, permease protein  42.11 
 
 		 300 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.284613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5351  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  41.07 
 
 		 317 aa  201  9.999999999999999e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0958  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.75 
 
 		 318 aa  201  9.999999999999999e-51  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.643704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.85 
 
 		 280 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4042  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.73 
 
 		 307 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4129  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.13 
 
 		 312 aa  201  1.9999999999999998e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1485  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.95 
 
 		 274 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0146821  normal  0.125484 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7646  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.26 
 
 		 304 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0022  nickel ABC transporter, permease subunit NikC  40.53 
 
 		 273 aa  199  6e-50  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00108936  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3250  dipeptide ABC transporter, permease protein DppC, putative  38.11 
 
 		 301 aa  199  7.999999999999999e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.193894  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1183  putative permease of ABC transporter  40 
 
 		 301 aa  198  9e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.056047  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1236  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  39.85 
 
 		 284 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.143707  normal  0.209567 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2849  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.47 
 
 		 304 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0805  ABC dipeptide transporter, inner membrane subunit DppC  39.48 
 
 		 300 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3650  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.54 
 
 		 359 aa  197  2.0000000000000003e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2463  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.48 
 
 		 300 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.342595  normal  0.319214 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4006  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.59 
 
 		 304 aa  197  3e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2052  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.85 
 
 		 280 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3233  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  37.87 
 
 		 300 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0778  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.77 
 
 		 300 aa  196  5.000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0620007  normal  0.517219 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3971  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.87 
 
 		 300 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3535  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.63 
 
 		 300 aa  196  6e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.641847 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1323  nickel transporter permease NikC  37.25 
 
 		 277 aa  195  8.000000000000001e-49  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00536272  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1977  oligopeptide ABC transporter, permease protein  42.69 
 
 		 292 aa  195  1e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0215  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.95 
 
 		 298 aa  194  1e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0103943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0036  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.18 
 
 		 305 aa  195  1e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0186771  normal  0.317689 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3965  hypothetical protein  37.87 
 
 		 300 aa  195  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.16334 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2947  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.32 
 
 		 300 aa  194  2e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456335  normal  0.0430362 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.6 
 
 		 300 aa  194  2e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1435  peptide ABC transporter, permease protein  40.23 
 
 		 282 aa  193  4e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.557175  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2704  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.94 
 
 		 301 aa  193  4e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2035  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.57 
 
 		 277 aa  192  6e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3794  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.26 
 
 		 295 aa  192  7e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.258326 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1395  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  40.45 
 
 		 288 aa  192  7e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.064701  decreased coverage  0.00784209 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0890  glutathione ABC transporter, permease protein GsiD  38.06 
 
 		 303 aa  192  9e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.221253  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2812  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.06 
 
 		 303 aa  191  1e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2275  nickel transporter permease NikC  43.28 
 
 		 299 aa  191  1e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0126063  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2716  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.1 
 
 		 301 aa  191  1e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0455  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.15 
 
 		 309 aa  192  1e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0921  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.34 
 
 		 284 aa  191  1e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.399737 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0424  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.96 
 
 		 296 aa  191  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.271529  normal  0.0400541 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0510  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.82 
 
 		 270 aa  191  1e-47  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2810  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.69 
 
 		 303 aa  190  2e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.482593  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0977  putative dipeptide ABC transporter, permease protein  38.58 
 
 		 302 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.699856  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0903  glutathione ABC transporter, permease protein GsiD  38.06 
 
 		 303 aa  191  2e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0399  putative dipeptide ABC transporter, permease protein  38.58 
 
 		 302 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.19947  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0241  putative dipeptide ABC transporter, permease protein  38.58 
 
 		 302 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1850  ABC transporter permease  38.58 
 
 		 302 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1765  putative glutathione ABC transporter, permease protein  38.58 
 
 		 302 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0374644  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1356  putative dipeptide ABC transporter, permease protein  38.58 
 
 		 302 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.222916  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>