More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_0520 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_0520  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 197 aa  404  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.711752  normal  0.521102 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1909  transcriptional regulator, TetR family  35.38 
 
 		 197 aa  144  1e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0951  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 196 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0301  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 199 aa  117  7.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0864199  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1903  TetR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 197 aa  117  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000201758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0196  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 200 aa  111  8.000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3410  TetR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 196 aa  111  8.000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000655293  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0832  transcriptional regulator, TetR family  30.37 
 
 		 196 aa  109  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3709  TetR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 205 aa  107  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3466  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 200 aa  105  5e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2314  transcriptional regulator, TetR family  29.15 
 
 		 213 aa  103  1e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.251224 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3704  TetR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 202 aa  98.2  8e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0223  transcriptional regulator, TetR family  24.86 
 
 		 195 aa  97.1  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000853805  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1059  TetR family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 212 aa  93.2  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.659814 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3254  TetR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 199 aa  92.4  4e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1325  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 203 aa  91.3  8e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.161657  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1045  transcriptional regulator, TetR family  26.99 
 
 		 203 aa  90.1  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00830488  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2686  TetR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 202 aa  90.1  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0616794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3835  TetR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 202 aa  90.1  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3852  TetR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 202 aa  90.1  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1920  TetR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 202 aa  90.1  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1250  TetR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 202 aa  90.1  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1684  transcriptional regulator, TetR family  31.36 
 
 		 202 aa  89  4e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2878  TetR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 202 aa  87.4  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1307  transcriptional regulator, TetR family  26.99 
 
 		 202 aa  85.1  5e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2178  TetR family transcriptional regulator  22.99 
 
 		 181 aa  85.1  6e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000638624  hitchhiker  0.00000363527 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1833  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 202 aa  85.1  6e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.150168  normal  0.286062 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1915  transcriptional regulator, TetR family  26.32 
 
 		 200 aa  84.3  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1926  transcriptional regulator, TetR family  30.72 
 
 		 202 aa  83.2  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.930045  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3674  nucleoid occlusion protein  26.2 
 
 		 199 aa  83.2  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00408157  normal  0.151909 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1283  transcriptional regulator, TetR family  28.48 
 
 		 199 aa  83.2  0.000000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.255686  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3094  TetR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 212 aa  82  0.000000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1240  TetR family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 201 aa  80.9  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1674  TetR family transcriptional regulator  23.56 
 
 		 201 aa  80.1  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.997457 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1022  transcriptional regulator, TetR family  28.22 
 
 		 202 aa  80.1  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0144  TetR family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 202 aa  79.3  0.00000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0194  nucleoid occlusion protein  24.74 
 
 		 196 aa  78.2  0.00000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000213488  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001824  transcriptional regulator  22.04 
 
 		 196 aa  77.4  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000410739  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3225  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 195 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4652  TetR family transcriptional regulator  26.84 
 
 		 195 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00651  nucleoid occlusion protein  21.51 
 
 		 196 aa  76.6  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0141  nucleoid occlusion protein  25.19 
 
 		 219 aa  76.6  0.0000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.102052  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1046  TetR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 201 aa  75.9  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  27.57 
 
 		 195 aa  75.5  0.0000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2593  nucleoid occlusion protein  22.11 
 
 		 210 aa  75.5  0.0000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000323733  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4421  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 195 aa  75.1  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4260  transcriptional regulator  26.32 
 
 		 195 aa  75.1  0.0000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4272  transcriptional regulator  26.32 
 
 		 195 aa  75.1  0.0000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4762  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 195 aa  75.1  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  28.11 
 
 		 194 aa  75.1  0.0000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4637  transcriptional regulator, TetR family  26.32 
 
 		 195 aa  75.1  0.0000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  24.49 
 
 		 222 aa  75.1  0.0000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3502  nucleoid occlusion protein  26.29 
 
 		 195 aa  73.9  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.284468  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0602  transcriptional regulator, TetR family  25.79 
 
 		 195 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4653  transcriptional regulator, TetR family  25.79 
 
 		 195 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3622  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 236 aa  73.2  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.311842  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4633  transcriptional regulator, TetR family  25.79 
 
 		 195 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.169287  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3302  TetR family transcriptional regulator  23.27 
 
 		 215 aa  73.6  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.696216 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4353  TetR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 195 aa  72.4  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0059  nucleoid occlusion protein  31.16 
 
 		 200 aa  72.4  0.000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0445493  normal  0.11202 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0355  transcriptional regulator, TetR family  27.98 
 
 		 195 aa  72  0.000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0104  transcriptional regulator, TetR family  25.47 
 
 		 198 aa  69.7  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1986  TetR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 218 aa  68.9  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0191052  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0374  nucleoid occlusion protein  27.87 
 
 		 197 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000212742  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0399  nucleoid occlusion protein  27.87 
 
 		 197 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0627309  hitchhiker  0.000000000130483 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0620  nucleoid occlusion protein  27.88 
 
 		 197 aa  67.4  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000140669 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0385  nucleoid occlusion protein  27.87 
 
 		 197 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000224895  hitchhiker  0.00861349 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2985  nucleoid occlusion protein  23.4 
 
 		 205 aa  67.4  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.111899  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1334  TetR family transcriptional regulator  25.91 
 
 		 241 aa  67.4  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1592  transcriptional regulator, TetR family  22.58 
 
 		 198 aa  67.4  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0373  nucleoid occlusion protein  27.87 
 
 		 197 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0485263  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0044  nucleoid occlusion protein  25.44 
 
 		 197 aa  66.6  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00442405  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0459  nucleoid occlusion protein  27.05 
 
 		 197 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0126678  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05370  transcriptional regulator, TetR family  32.54 
 
 		 205 aa  65.1  0.0000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000643211  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3831  nucleoid occlusion protein  27.93 
 
 		 197 aa  65.1  0.0000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4251  nucleoid occlusion protein  27.05 
 
 		 197 aa  64.7  0.0000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3773  nucleoid occlusion protein  27.05 
 
 		 197 aa  64.7  0.0000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.461125 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3600  nucleoid occlusion protein  27.05 
 
 		 197 aa  64.7  0.0000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.741133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0356  nucleoid occlusion protein  27.05 
 
 		 197 aa  64.7  0.0000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3543  TetR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 223 aa  64.3  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0364286 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3979  nucleoid occlusion protein  26.83 
 
 		 216 aa  64.3  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.56213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2389  nucleoid occlusion protein  26.96 
 
 		 204 aa  63.5  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.102395  normal  0.522775 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1248  AcrR family transcriptional regulator  25.31 
 
 		 199 aa  63.2  0.000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0181  nucleoid occlusion protein  27.05 
 
 		 198 aa  63.2  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4564  nucleoid occlusion protein  26.92 
 
 		 197 aa  62.8  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000269162  unclonable  0.0000000294752 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0777  nucleoid occlusion protein  23.57 
 
 		 217 aa  63.2  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4542  transcriptional regulator, TetR family  22.99 
 
 		 201 aa  62.8  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.204937  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3521  nucleoid occlusion protein  23.81 
 
 		 240 aa  62.4  0.000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00047  nucleoid occlusion protein  25.96 
 
 		 195 aa  62.4  0.000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0324  nucleoid occlusion protein  27.93 
 
 		 197 aa  62  0.000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0501  nucleoid occlusion protein  24.37 
 
 		 220 aa  61.2  0.000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.957497  normal  0.22516 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0855  transcriptional regulator, TetR family  23.12 
 
 		 223 aa  61.2  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.835032 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0542  nucleoid occlusion protein  25 
 
 		 214 aa  60.1  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0052  nucleoid occlusion protein  27.59 
 
 		 198 aa  60.1  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.881528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1324  nucleoid occlusion protein  25.76 
 
 		 231 aa  59.7  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.892359 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0323  nucleoid occlusion protein  27.93 
 
 		 197 aa  60.5  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000549659  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4158  nucleoid occlusion protein  27.59 
 
 		 198 aa  60.1  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000407134  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2012  nucleoid occlusion protein  23.53 
 
 		 216 aa  60.5  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0058  nucleoid occlusion protein  27.59 
 
 		 198 aa  60.1  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00579463  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4012  nucleoid occlusion protein  27.68 
 
 		 198 aa  59.3  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.554445  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>