More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_0485 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_0485  transport system permease protein  100 
 
 		 357 aa  706    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.644371  hitchhiker  0.000336075 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1133  transport system permease protein  58.43 
 
 		 354 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00204897  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1194  transport system permease protein  54.11 
 
 		 357 aa  381  1e-104  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1465  transport system permease protein  54.8 
 
 		 357 aa  377  1e-103  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0274  transport system permease protein  54.31 
 
 		 358 aa  373  1e-102  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00246015  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2330  transport system permease protein  48.19 
 
 		 370 aa  348  1e-94  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.970298  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0247  transport system permease protein  47.56 
 
 		 359 aa  342  5e-93  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0151644  normal  0.610007 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0344  transport system permease protein  52.45 
 
 		 363 aa  341  1e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1491  transport system permease protein  46.53 
 
 		 348 aa  336  3.9999999999999995e-91  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.105364  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1089  hypothetical protein  46.2 
 
 		 355 aa  335  7e-91  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0408  transport system permease protein  46.53 
 
 		 348 aa  333  2e-90  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.586002  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0250  transport system permease protein  48.97 
 
 		 340 aa  333  2e-90  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1175  iron ABC transporter permease  54.44 
 
 		 359 aa  331  1e-89  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1871  iron(III) dicitrate transport system permease protein  46.82 
 
 		 356 aa  331  1e-89  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71238  normal  0.187048 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1048  ABC Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  50.32 
 
 		 336 aa  330  2e-89  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.522195  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0429  transport system permease protein  45.95 
 
 		 348 aa  324  1e-87  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0498  transport system permease protein  44.22 
 
 		 349 aa  309  4e-83  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0506043  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1623  iron(III) dicitrate transport system permease protein  45.85 
 
 		 356 aa  307  1.0000000000000001e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0877318  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0758  transport system permease protein  43.24 
 
 		 344 aa  301  1e-80  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0240676  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1652  transport system permease protein  51.29 
 
 		 357 aa  295  6e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0734  transport system permease protein  42.48 
 
 		 344 aa  293  3e-78  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000599785  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1822  transport system permease protein  46.18 
 
 		 350 aa  284  1.0000000000000001e-75  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3058  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  45.95 
 
 		 346 aa  282  6.000000000000001e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0220  transport system permease protein  45.61 
 
 		 356 aa  281  1e-74  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2148  transport system permease protein  47.11 
 
 		 356 aa  266  2.9999999999999995e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.176717 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0443  transport system permease protein  39.83 
 
 		 355 aa  251  1e-65  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2099  transport system permease protein  42.37 
 
 		 350 aa  249  4e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1638  transport system permease protein  38.08 
 
 		 383 aa  245  9.999999999999999e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.250999  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1318  transport system permease protein  40.12 
 
 		 360 aa  243  5e-63  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.398807  normal  0.0129823 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2616  transport system permease protein  36.39 
 
 		 367 aa  228  1e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1217  transport system permease protein  37.02 
 
 		 362 aa  225  8e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00189959  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1153  hypothetical protein  34.96 
 
 		 375 aa  223  3e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0466  Fe(III) dicitrate ABC transporter, permease  36.68 
 
 		 347 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1094  ABC Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  33.33 
 
 		 373 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0044816  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0290  transport system permease protein  38.01 
 
 		 361 aa  212  1e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.602088  normal  0.107419 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1186  transport system permease protein  36.08 
 
 		 369 aa  208  1e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0026  transport system permease protein  36.25 
 
 		 331 aa  208  1e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0575  transport system permease protein  35.58 
 
 		 357 aa  206  4e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0186  transport system permease protein  33.43 
 
 		 362 aa  205  8e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129161  normal  0.828954 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1041  transport system permease protein  40.61 
 
 		 301 aa  205  1e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1933  transport system permease protein  38.68 
 
 		 330 aa  204  2e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0431  transport system permease protein  34.78 
 
 		 374 aa  204  2e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0297  transport system permease protein  38.36 
 
 		 330 aa  202  5e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.256229  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0990  transport system permease protein  38.33 
 
 		 378 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2425  transport system permease protein  33.64 
 
 		 356 aa  201  9.999999999999999e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2398  hypothetical protein  36.69 
 
 		 361 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.384157 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0815  transport system permease protein  38.58 
 
 		 346 aa  199  5e-50  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2028  transport system permease protein  35.53 
 
 		 356 aa  193  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0852  transport system permease protein  32.85 
 
 		 337 aa  192  5e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.822863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0323  putative hemin ABC transporter, permease protein  36.84 
 
 		 343 aa  192  6e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00139931  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2250  transport system permease protein  35.24 
 
 		 356 aa  192  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.235988 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1353  transport system permease protein  36.39 
 
 		 363 aa  189  5e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3271  transport system permease protein  34.46 
 
 		 370 aa  188  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00536194 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1565  transport system permease protein  35.4 
 
 		 355 aa  188  1e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.435862  normal  0.696259 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1173  iron ABC transporter, permease protein  32.11 
 
 		 356 aa  187  2e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4419  transport system permease protein  36.14 
 
 		 355 aa  187  3e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.347706 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0125  transport system permease protein  38.72 
 
 		 356 aa  187  3e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0132273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1703  heme/hemin ABC transporter, permease protein  31.58 
 
 		 352 aa  186  6e-46  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4112  iron compound ABC transporter, permease  33.33 
 
 		 345 aa  185  9e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3530  transport system permease protein  35.23 
 
 		 365 aa  184  1.0000000000000001e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1377  hypothetical protein  38.26 
 
 		 315 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000118421  hitchhiker  0.00624005 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2340  transport system permease protein  35.31 
 
 		 371 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0252  transport system permease protein  37.99 
 
 		 312 aa  184  2.0000000000000003e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1709  transport system permease protein  35.84 
 
 		 319 aa  183  3e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1219  ABC transporter membrane spanning protein (iron)  32.01 
 
 		 360 aa  183  3e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.11373  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0749  iron compound ABC transporter, permease protein  31.99 
 
 		 342 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4501  iron compound ABC transporter, permease protein  31.12 
 
 		 342 aa  182  6e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1748  transport system permease protein  35.71 
 
 		 347 aa  182  7e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4487  iron compound ABC transporter, permease protein  32.65 
 
 		 342 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4264  iron compound ABC transporter permease  33.33 
 
 		 345 aa  181  2e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4101  iron compound ABC transporter, permease  33.33 
 
 		 345 aa  181  2e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4448  iron compound ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 		 342 aa  181  2e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4596  iron compound ABC transporter permease protein  33.33 
 
 		 342 aa  181  2e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2734  Fe(III) dicitrate ABC transporter, permease  36.23 
 
 		 347 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000167037  hitchhiker  0.000165993 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1099  transport system permease protein  33.14 
 
 		 360 aa  180  2.9999999999999997e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.122873  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3090  transport system permease protein  33.54 
 
 		 360 aa  179  4.999999999999999e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1695  transport system permease protein  33.89 
 
 		 354 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.347986  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4449  iron compound ABC transporter, permease protein  30.84 
 
 		 342 aa  179  8e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0282  transport system permease protein  32.57 
 
 		 371 aa  178  2e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.669954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0986  transport system permease protein  35.03 
 
 		 315 aa  177  2e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.991097  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3020  transport system permease protein  31.75 
 
 		 370 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.277606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3610  transport system permease protein  33.72 
 
 		 360 aa  177  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.137689 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7223  transport system permease protein  34.9 
 
 		 351 aa  177  4e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3036  transport system permease protein  32.67 
 
 		 360 aa  176  4e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0920  ABC transporter permease  32.38 
 
 		 359 aa  176  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.421925 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1539  iron chelate ABC transporter permease  32.3 
 
 		 353 aa  176  5e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.337435 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2668  iron chelate ABC transporter permease  32.3 
 
 		 360 aa  176  5e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0806  ABC transporter permease  32.3 
 
 		 359 aa  176  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.129539  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2750  transport system permease protein  32.3 
 
 		 360 aa  176  5e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2756  transport system permease protein  32.84 
 
 		 360 aa  176  5e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00602737  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0865  ABC transporter permease  32.02 
 
 		 359 aa  176  7e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1738  transport system permease protein  32.15 
 
 		 330 aa  176  7e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.922017  normal  0.205881 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0897  ABC transporter permease  32.09 
 
 		 359 aa  175  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.660141  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4215  transport system permease protein  33.44 
 
 		 342 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2821  transport system permease protein  35.96 
 
 		 322 aa  175  9.999999999999999e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.141731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0647  hemin transport system permease HmuU  32.99 
 
 		 334 aa  174  1.9999999999999998e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.466649 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1179  iron compound ABC transporter, permease protein  35.78 
 
 		 325 aa  174  1.9999999999999998e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00674105  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3566  transport system permease protein  34.93 
 
 		 354 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0167  transport system permease protein  37.72 
 
 		 361 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3804  hemin ABC transporter, permease protein HmuU  32.99 
 
 		 334 aa  174  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>