265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_0480 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_0480  Radical SAM domain protein  100 
 
 
281 aa  585  1e-166  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00535769  hitchhiker  0.00252735 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1114  radical SAM domain-containing protein  26.07 
 
 
322 aa  88.6  1e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0901  radical SAM superfamily protein  26.07 
 
 
358 aa  88.2  1e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0796  Radical SAM domain protein  24.83 
 
 
341 aa  85.1  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.151454 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0205  Radical SAM domain protein  22.7 
 
 
340 aa  83.6  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0667932  normal  0.157312 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3289  Radical SAM domain protein  25 
 
 
351 aa  82.4  0.000000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814974  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2056  Radical SAM domain protein  25.77 
 
 
340 aa  77  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4900  radical SAM domain-containing protein  24.06 
 
 
351 aa  76.6  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.594108  decreased coverage  0.000796621 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3263  radical SAM family Fe-S oxidoreductase  24.75 
 
 
339 aa  76.6  0.0000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.620706  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1794  cofactor modifying protein (cmo)  27.62 
 
 
311 aa  73.6  0.000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.420776 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0967  radical SAM domain-containing protein  22.6 
 
 
355 aa  72.4  0.000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182528  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0853  radical SAM domain-containing protein  22.88 
 
 
332 aa  71.6  0.00000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.796243 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1235  radical SAM domain-containing protein  28.02 
 
 
434 aa  70.5  0.00000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.9409  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0905  radical SAM domain-containing protein  27.27 
 
 
331 aa  70.5  0.00000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.54943  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0240  Radical SAM domain protein  22.61 
 
 
340 aa  70.1  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.548206  normal  0.016979 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2349  Radical SAM domain protein  22.46 
 
 
873 aa  67  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0438  radical SAM domain-containing protein  25.19 
 
 
390 aa  66.6  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.777378  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1043  radical SAM domain-containing protein  25.5 
 
 
297 aa  66.2  0.0000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.104928  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0081  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  24.3 
 
 
373 aa  64.7  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1128  Radical SAM domain protein  23.26 
 
 
327 aa  65.1  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.823251 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0802  radical SAM domain-containing protein  23.61 
 
 
349 aa  65.1  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.186903  normal  0.699659 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1449  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  25.83 
 
 
373 aa  64.3  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0775464  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0342  radical SAM domain-containing protein  22.44 
 
 
335 aa  63.5  0.000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0151075 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2456  coenzyme PQQ biosynthesis protein E  27.87 
 
 
370 aa  63.9  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.152479  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4182  Radical SAM domain protein  24.16 
 
 
367 aa  63.5  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  25.56 
 
 
378 aa  63.2  0.000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0838  radical SAM domain-containing protein  26.67 
 
 
465 aa  62.8  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0155744  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5642  hypothetical protein  23.75 
 
 
292 aa  62.8  0.000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00436698  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0885  glycosyltransferase  32.11 
 
 
392 aa  62.4  0.000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.356928  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04330  Radical SAM domain protein  25.47 
 
 
336 aa  61.6  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5552  hypothetical protein  23.41 
 
 
292 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.05586e-17 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5597  hypothetical protein  23.41 
 
 
292 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5311  hypothetical protein  23.41 
 
 
292 aa  60.8  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5139  molybdenum cofactor biosynthesis enzyme  23.41 
 
 
292 aa  60.8  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.219844  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5153  molybdenum cofactor biosynthesis enzyme  23.41 
 
 
292 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.120302  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5707  hypothetical protein  23.41 
 
 
292 aa  60.8  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5580  hypothetical protein  23.41 
 
 
292 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.488042  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1680  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  24.31 
 
 
397 aa  60.8  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.725852 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5251  radical SAM domain-containing protein  23.41 
 
 
292 aa  60.8  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1180  radical SAM domain-containing protein  24.72 
 
 
418 aa  61.2  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.832103  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2446  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  23.81 
 
 
380 aa  60.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.121554  normal  0.0228236 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3973  radical SAM domain-containing protein  24.41 
 
 
292 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0790  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  23.41 
 
 
380 aa  59.7  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2586  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  23.38 
 
 
340 aa  59.7  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0899  Radical SAM domain protein  26.67 
 
 
345 aa  58.9  0.00000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.467857  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5367  hypothetical protein  23.13 
 
 
279 aa  58.9  0.00000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0445867  hitchhiker  0.0000016486 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1381  radical SAM domain-containing protein  21.89 
 
 
345 aa  58.5  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0848  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  25.47 
 
 
371 aa  58.5  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0173  cofactor modifying protein (cmo)  27.14 
 
 
301 aa  58.2  0.0000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1519  radical SAM domain-containing protein  24.15 
 
 
422 aa  57.8  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.481264  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0857  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  23.29 
 
 
378 aa  58.2  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  24.54 
 
 
349 aa  57.8  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2991  Radical SAM domain protein  22.7 
 
 
397 aa  58.2  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3252  Elongator protein 3/MiaB/NifB  25.25 
 
 
313 aa  57.4  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0454  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  24.18 
 
 
368 aa  57.8  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1542  Radical SAM domain protein  22.98 
 
 
372 aa  57.4  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0085806  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0231  radical SAM family protein  23.88 
 
 
445 aa  57.4  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0106929  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0390  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  23.41 
 
 
380 aa  57.4  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.52753  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1124  Fe-S oxidoreductases  24.12 
 
 
338 aa  57  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1978  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  25.88 
 
 
372 aa  56.6  0.0000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.633092  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2836  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  24.52 
 
 
381 aa  55.8  0.0000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4272  Radical SAM domain protein  23.57 
 
 
337 aa  55.8  0.0000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0795  Radical SAM domain protein  22.79 
 
 
296 aa  55.8  0.0000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2461  Radical SAM domain protein  21.73 
 
 
380 aa  55.8  0.0000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4674  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  26.29 
 
 
389 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0689  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  24.51 
 
 
389 aa  55.1  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.62446  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01588  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  21.12 
 
 
372 aa  55.5  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.150744  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2924  Radical SAM domain protein  26.96 
 
 
446 aa  55.1  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6168  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  23.96 
 
 
374 aa  55.1  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0169631  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5901  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  23.71 
 
 
374 aa  55.1  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.630073 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  22.33 
 
 
389 aa  55.1  0.000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4038  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  24.14 
 
 
370 aa  55.5  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.107289  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1217  Radical SAM domain protein  21.32 
 
 
343 aa  54.7  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0163769  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2470  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  25.17 
 
 
407 aa  54.3  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.616066 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16100  Radical SAM domain protein  24.73 
 
 
462 aa  54.7  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1951  radical SAM family Fe-S protein  23.55 
 
 
326 aa  54.7  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1570  radical SAM domain-containing protein  22.92 
 
 
474 aa  54.3  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3345  radical SAM domain-containing protein  30 
 
 
338 aa  54.7  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2823  radical SAM family protein  26.05 
 
 
332 aa  53.9  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0411588 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3249  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  23.88 
 
 
379 aa  53.9  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.384282  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5119  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  23.88 
 
 
379 aa  53.9  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.830153  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1148  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.44 
 
 
298 aa  53.9  0.000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5162  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  23.88 
 
 
379 aa  53.9  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.426022 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  21.57 
 
 
380 aa  53.9  0.000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5161  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  25.3 
 
 
379 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.164353 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3053  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  25.52 
 
 
385 aa  53.5  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0894  radical SAM domain-containing protein  26.75 
 
 
320 aa  53.1  0.000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.192099  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0613  glycosyl transferase, group 1 family protein / moaA/nifB/pqqE family protein  22.29 
 
 
778 aa  53.1  0.000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.12808  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4172  Radical SAM domain protein  22.73 
 
 
338 aa  53.1  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2025  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.27 
 
 
348 aa  53.1  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0930422  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2098  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  23.89 
 
 
400 aa  53.1  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.456256  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3419  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  23.26 
 
 
414 aa  53.1  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.058581  normal  0.446493 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  22.62 
 
 
496 aa  53.1  0.000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2231  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.11 
 
 
345 aa  53.1  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.813022  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2598  Radical SAM domain protein  29.5 
 
 
307 aa  53.1  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0138317  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3158  radical SAM domain-containing protein  22.74 
 
 
428 aa  52.8  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.271249  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0509  coenzyme PQQ synthesis protein E  25.9 
 
 
389 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  23.1 
 
 
330 aa  52.4  0.000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  21.63 
 
 
325 aa  52.4  0.000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1486  radical SAM family protein  25 
 
 
292 aa  52  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>