More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_0306 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_0245  preprotein translocase subunit SecY  77.38 
 
 
424 aa  667  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.101058  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1504  preprotein translocase subunit SecY  76.48 
 
 
419 aa  641  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0306  preprotein translocase subunit SecY  100 
 
 
421 aa  832  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0894763  normal  0.194972 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0235  preprotein translocase subunit SecY  78.15 
 
 
419 aa  656  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00849669  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2440  preprotein translocase subunit SecY  66.51 
 
 
420 aa  562  1e-159  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2313  preprotein translocase subunit SecY  64.45 
 
 
421 aa  534  1e-150  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0367996  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0442  preprotein translocase subunit SecY  59.58 
 
 
429 aa  509  1e-143  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0886  preprotein translocase subunit SecY  58.19 
 
 
418 aa  504  1e-141  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.609907  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1726  preprotein translocase, SecY subunit  56.55 
 
 
435 aa  489  1e-137  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  7.16119e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0214  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  60.43 
 
 
419 aa  478  1e-134  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.32801  normal  0.494063 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1575  preprotein translocase subunit SecY  54.31 
 
 
435 aa  464  1e-130  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0569624  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0728  preprotein translocase, SecY subunit  52.97 
 
 
429 aa  456  1e-127  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00054251  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0778  preprotein translocase, SecY subunit  53.97 
 
 
430 aa  453  1e-126  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000100686  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1931  preprotein translocase subunit SecY  54.57 
 
 
445 aa  442  1e-123  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.776856  normal  0.537809 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0646  preprotein translocase subunit SecY  51.04 
 
 
435 aa  439  1e-122  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00379524  hitchhiker  8.11889e-07 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1086  preprotein translocase subunit SecY  50.23 
 
 
435 aa  436  1e-121  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.135642  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2837  preprotein translocase subunit SecY  50.46 
 
 
435 aa  435  1e-121  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1366  preprotein translocase subunit SecY  50.12 
 
 
437 aa  436  1e-121  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000833152  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2038  preprotein translocase subunit SecY  53.4 
 
 
447 aa  434  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1953  preprotein translocase subunit SecY  53.16 
 
 
447 aa  434  1e-120  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1164  preprotein translocase, SecY subunit  53.68 
 
 
431 aa  431  1e-120  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0798437  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1926  preprotein translocase subunit SecY  52.21 
 
 
447 aa  426  1e-118  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.228643  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2923  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  53.15 
 
 
427 aa  428  1e-118  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000208113  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1745  preprotein translocase subunit SecY  50.12 
 
 
437 aa  424  1e-117  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.261464  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0953  preprotein translocase subunit SecY  49.07 
 
 
435 aa  421  1e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0415377  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0517  preprotein translocase, SecY subunit  49.53 
 
 
443 aa  421  1e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.120445  unclonable  2.66535e-11 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01360  preprotein translocase, SecY subunit  51.75 
 
 
422 aa  421  1e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000700723  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0347  preprotein translocase, SecY subunit  49.53 
 
 
443 aa  421  1e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.742267  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0299  preprotein translocase subunit SecY  52.87 
 
 
440 aa  415  1e-115  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  6.31755e-08  hitchhiker  3.21163e-06 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0787  preprotein translocase subunit SecY  50 
 
 
442 aa  418  1e-115  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0142235  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00958  preprotein translocase subunit SecY  51.04 
 
 
434 aa  413  1e-114  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0058755  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3308  preprotein translocase subunit SecY  48.15 
 
 
435 aa  412  1e-114  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.02472e-07 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0867  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  48.13 
 
 
442 aa  414  1e-114  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  1.52006e-07  hitchhiker  0.00837403 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2135  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  50.58 
 
 
428 aa  409  1e-113  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.233384  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0721  preprotein translocase subunit SecY  47.56 
 
 
435 aa  410  1e-113  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0099  preprotein translocase subunit SecY  49.08 
 
 
437 aa  409  1e-113  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0986849 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0700  preprotein translocase subunit SecY  48.02 
 
 
435 aa  408  1e-113  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.418561  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0425  preprotein translocase subunit SecY  49.52 
 
 
437 aa  405  1e-112  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.65116  normal  0.157207 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3318  preprotein translocase subunit SecY  47.99 
 
 
441 aa  404  1e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.150394  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2756  preprotein translocase, SecY subunit  49.04 
 
 
443 aa  403  1e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.373135  normal  0.477854 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0739  preprotein translocase subunit SecY  48.07 
 
 
440 aa  403  1e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00521081  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0339  preprotein translocase subunit SecY  47.85 
 
 
440 aa  403  1e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000142446  unclonable  7.06243e-08 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0973  preprotein translocase subunit SecY  50.69 
 
 
428 aa  403  1e-111  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4729  preprotein translocase subunit SecY  47.6 
 
 
443 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0376135  normal  0.430849 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0507  preprotein translocase subunit SecY  47.6 
 
 
443 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0640452  normal  0.0135524 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1856  preprotein translocase, SecY subunit  48.08 
 
 
446 aa  398  1e-110  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0112849  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09050  preprotein translocase subunit SecY  47.6 
 
 
442 aa  399  1e-110  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.224184 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0857  preprotein translocase subunit SecY  47.6 
 
 
442 aa  399  1e-110  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1000  preprotein translocase, SecY subunit  46.93 
 
 
419 aa  400  1e-110  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00382146  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0474  preprotein translocase subunit SecY  47.6 
 
 
443 aa  401  1e-110  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.733359  hitchhiker  4.33507e-06 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0441  preprotein translocase subunit SecY  48.93 
 
 
443 aa  399  1e-110  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0504  preprotein translocase subunit SecY  47.6 
 
 
443 aa  400  1e-110  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000390206  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2237  preprotein translocase subunit SecY  50 
 
 
437 aa  400  1e-110  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.104557  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1118  preprotein translocase subunit SecY  48.38 
 
 
428 aa  399  1e-110  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.348488  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3889  preprotein translocase subunit SecY  47.36 
 
 
442 aa  399  1e-110  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000822061  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1009  preprotein translocase subunit SecY  49.28 
 
 
439 aa  396  1e-109  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00114462  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0309  preprotein translocase subunit SecY  47.53 
 
 
443 aa  395  1e-109  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0197098  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1246  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  47.12 
 
 
463 aa  396  1e-109  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.031052  hitchhiker  0.00314824 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5059  preprotein translocase subunit SecY  47.12 
 
 
442 aa  395  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  8.98122e-06  normal  0.284155 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4528  preprotein translocase subunit SecY  47.12 
 
 
444 aa  397  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.447133  normal  0.242735 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0646  preprotein translocase, SecY subunit  47.12 
 
 
444 aa  397  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.617938  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1106  protein translocase subunit SecY/sec61 alpha  48.08 
 
 
438 aa  392  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.105713 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1863  preprotein translocase subunit SecY  47.85 
 
 
446 aa  392  1e-108  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.271597  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1042  preprotein translocase subunit SecY  48.5 
 
 
439 aa  392  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0178  preprotein translocase subunit SecY  48.93 
 
 
446 aa  392  1e-108  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  4.08952e-07  hitchhiker  0.00214614 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0621  preprotein translocase subunit SecY  48.09 
 
 
439 aa  393  1e-108  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.468859  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0315  preprotein translocase subunit SecY  47.86 
 
 
437 aa  392  1e-108  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0598799  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0680  preprotein translocase subunit SecY  47.24 
 
 
437 aa  393  1e-108  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0862  preprotein translocase, SecY subunit  48.15 
 
 
438 aa  392  1e-108  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.148817  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0340  preprotein translocase subunit SecY  48.48 
 
 
443 aa  392  1e-108  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00542322  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1384  preprotein translocase subunit SecY  48.34 
 
 
443 aa  392  1e-108  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.378018 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0233  preprotein translocase subunit SecY  47.85 
 
 
446 aa  391  1e-107  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  1.81445e-07  unclonable  1.05897e-05 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4670  preprotein translocase subunit SecY  48.44 
 
 
446 aa  390  1e-107  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  5.09869e-07  unclonable  1.21988e-08 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0401  preprotein translocase subunit SecY  48.25 
 
 
439 aa  391  1e-107  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0073  preprotein translocase, SecY subunit  48.58 
 
 
445 aa  389  1e-107  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.867918  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0393  preprotein translocase subunit SecY  48.25 
 
 
439 aa  391  1e-107  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0413341  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0168  preprotein translocase subunit SecY  48.33 
 
 
446 aa  391  1e-107  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  1.14541e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5144  preprotein translocase, SecY subunit  47.19 
 
 
437 aa  390  1e-107  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.552257 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1831  preprotein translocase subunit SecY  46.21 
 
 
443 aa  389  1e-107  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.321149  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1565  preprotein translocase subunit SecY  48.1 
 
 
443 aa  390  1e-107  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.112443  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4298  preprotein translocase subunit SecY  48.68 
 
 
446 aa  390  1e-107  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  2.58427e-07  unclonable  8.37901e-11 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4256  preprotein translocase subunit SecY  48.59 
 
 
443 aa  391  1e-107  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  1.93642e-05  unclonable  4.48849e-12 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1374  preprotein translocase subunit SecY  46.76 
 
 
431 aa  387  1e-106  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0289241  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0495  preprotein translocase subunit SecY  47.61 
 
 
439 aa  387  1e-106  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4223  preprotein translocase subunit SecY  48 
 
 
436 aa  385  1e-106  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0505149  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0204  preprotein translocase subunit SecY  48.93 
 
 
446 aa  386  1e-106  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  6.62692e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1213  preprotein translocase subunit SecY  47.39 
 
 
446 aa  387  1e-106  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3423  preprotein translocase subunit SecY  48.47 
 
 
436 aa  388  1e-106  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.23916 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0131  preprotein translocase subunit SecY  49.42 
 
 
430 aa  385  1e-106  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.129381  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1976  preprotein translocase subunit SecY  47.63 
 
 
446 aa  387  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.923807  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3985  preprotein translocase, SecY subunit  48.28 
 
 
448 aa  387  1e-106  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00342615  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1399  preprotein translocase, SecY subunit  47.45 
 
 
446 aa  385  1e-106  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5050  preprotein translocase subunit SecY  46.89 
 
 
444 aa  387  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.478224  normal  0.981585 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0340  preprotein translocase subunit SecY  48.33 
 
 
435 aa  387  1e-106  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.670272  hitchhiker  0.000594925 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1006  preprotein translocase subunit SecY  46.89 
 
 
446 aa  385  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.38875  hitchhiker  0.00669682 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0127  preprotein translocase subunit SecY  49.42 
 
 
430 aa  387  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1176  preprotein translocase subunit SecY  47.39 
 
 
446 aa  387  1e-106  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0379017  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0130  preprotein translocase subunit SecY  48.96 
 
 
433 aa  384  1e-105  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0066731  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0151  preprotein translocase subunit SecY  48.73 
 
 
433 aa  383  1e-105  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0158065  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0130  preprotein translocase subunit SecY  48.96 
 
 
433 aa  384  1e-105  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00164171  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>