More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_0305 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_0305  50S ribosomal protein L15  100 
 
 
146 aa  290  4e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00213706  normal  0.150657 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0234  50S ribosomal protein L15  74.66 
 
 
146 aa  216  1e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000856605  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0244  ribosomal protein L15  71.92 
 
 
146 aa  204  3e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0776465  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2922  50S ribosomal protein L15  69.18 
 
 
146 aa  200  6e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000292378  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0777  50S ribosomal protein L15  66.67 
 
 
147 aa  194  3e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000140275  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0885  50S ribosomal protein L15  68.03 
 
 
147 aa  193  5.000000000000001e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.487854  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0213  LSU ribosomal protein L15P  65.75 
 
 
146 aa  192  1e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261833  normal  0.302282 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0130  50S ribosomal protein L15  67.12 
 
 
146 aa  191  3e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.86911  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0126  50S ribosomal protein L15  66.44 
 
 
146 aa  190  4e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2441  50S ribosomal protein L15P  64.38 
 
 
146 aa  187  2.9999999999999997e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0129  50S ribosomal protein L15  65.75 
 
 
146 aa  185  1e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.100575  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0129  50S ribosomal protein L15  65.75 
 
 
146 aa  185  1e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000173867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0125  50S ribosomal protein L15  65.75 
 
 
146 aa  185  1e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000308575  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0123  50S ribosomal protein L15  65.75 
 
 
146 aa  185  1e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00954178  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0129  50S ribosomal protein L15  65.75 
 
 
146 aa  185  1e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0450407  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0141  50S ribosomal protein L15  65.75 
 
 
146 aa  185  1e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.02363e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0160  50S ribosomal protein L15  65.75 
 
 
146 aa  185  1e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000150646  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0124  50S ribosomal protein L15  65.75 
 
 
146 aa  185  1e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000767925  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0150  50S ribosomal protein L15  65.07 
 
 
146 aa  185  2e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0036731  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0441  50S ribosomal protein L15  65.75 
 
 
147 aa  185  2e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5176  50S ribosomal protein L15  65.07 
 
 
146 aa  184  4e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000327341  unclonable  1.24723e-25 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0123  50S ribosomal protein L15  65.07 
 
 
146 aa  183  5e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00031572  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2695  50S ribosomal protein L15  63.45 
 
 
146 aa  182  1.0000000000000001e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2380  50S ribosomal protein L15  63.45 
 
 
146 aa  182  1.0000000000000001e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2299  50S ribosomal protein L15  61.64 
 
 
146 aa  181  3e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2258  50S ribosomal protein L15  61.64 
 
 
146 aa  181  3e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0168117  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2314  ribosomal protein L15  63.7 
 
 
146 aa  179  1e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0114491  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1505  ribosomal protein L15  62.94 
 
 
149 aa  176  8e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.628014  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0077  50S ribosomal protein L15  62.33 
 
 
146 aa  173  8e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1888  50S ribosomal protein L15  62.33 
 
 
146 aa  173  8e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1375  50S ribosomal protein L15  63.27 
 
 
147 aa  172  9e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0238101  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1311  50S ribosomal protein L15  63.27 
 
 
147 aa  172  9e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000196543  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2692  ribosomal protein L15  63.27 
 
 
147 aa  173  9e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0727  50S ribosomal protein L15  60.27 
 
 
147 aa  171  1.9999999999999998e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0174765  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1727  50S ribosomal protein L15  61.9 
 
 
147 aa  172  1.9999999999999998e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000774697  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0720  ribosomal protein L15  60.54 
 
 
147 aa  169  7.999999999999999e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01350  ribosomal protein L15  63.95 
 
 
147 aa  165  2e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.053024  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0972  50S ribosomal protein L15  59.18 
 
 
147 aa  161  3e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3648  50S ribosomal protein L15  59.86 
 
 
146 aa  160  6e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000516585  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1165  ribosomal protein L15  58.78 
 
 
148 aa  160  6e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0536923  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1464  50S ribosomal protein L15  54.79 
 
 
144 aa  158  3e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000860578  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1812  50S ribosomal protein L15  56.85 
 
 
146 aa  156  8e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0645  50S ribosomal protein L15  54.11 
 
 
148 aa  155  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000111424  hitchhiker  0.000000339891 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1555  ribosomal protein L15  62.84 
 
 
159 aa  154  5.0000000000000005e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00234278  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0309  50S ribosomal protein L15  58.22 
 
 
146 aa  152  2e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  unclonable  2.36933e-28 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3309  50S ribosomal protein L15  52.74 
 
 
146 aa  151  4e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000932499 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0952  50S ribosomal protein L15  52.74 
 
 
146 aa  151  4e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0376093  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1365  ribosomal protein L15  52.05 
 
 
149 aa  149  1e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0025126  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0613  50S ribosomal protein L15P  52.11 
 
 
154 aa  148  3e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0537361  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1574  ribosomal protein L15  54.11 
 
 
172 aa  147  3e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0317141  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0214  50S ribosomal protein L15  55.48 
 
 
144 aa  147  4e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000818631  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1085  50S ribosomal protein L15  50.68 
 
 
146 aa  146  7e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.165048  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1119  ribosomal protein L15  53.06 
 
 
148 aa  145  2.0000000000000003e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.658156  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0470  50S ribosomal protein L15  53.74 
 
 
153 aa  144  3e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000419135  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3986  ribosomal protein L15  54.11 
 
 
176 aa  144  3e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0120912  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2838  50S ribosomal protein L15  58.22 
 
 
148 aa  144  6e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.190663  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0931  ribosomal protein L15  52.74 
 
 
152 aa  143  7.0000000000000006e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00144684  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1005  50S ribosomal protein L15  51.32 
 
 
156 aa  143  8.000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.10484  normal  0.0101477 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0699  50S ribosomal protein L15  52.78 
 
 
147 aa  143  9e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.82238  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3429  50S ribosomal protein L15  51.32 
 
 
162 aa  142  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.278917  normal  0.334623 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1862  50S ribosomal protein L15  53.74 
 
 
159 aa  142  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.225318  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2199  50S ribosomal protein L15  49.34 
 
 
167 aa  140  4e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0650553  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0678  50S ribosomal protein L15  52.74 
 
 
145 aa  140  6e-33  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0493  50S ribosomal protein L15  51.7 
 
 
153 aa  138  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.600314  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1746  50S ribosomal protein L15  53.06 
 
 
148 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.718432  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4933  ribosomal protein L15  51.02 
 
 
150 aa  138  3e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0104537  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0999  ribosomal protein L15  54.05 
 
 
148 aa  138  3e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.120552  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1245  50S ribosomal protein L15  54.11 
 
 
144 aa  137  3e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0277502  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_435  ribosomal protein L15  51.7 
 
 
153 aa  137  3e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0090931  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl141  50S ribosomal protein L15  50.68 
 
 
145 aa  137  7e-32  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5051  50S ribosomal protein L15  48.03 
 
 
161 aa  136  7.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1351  50S ribosomal protein L15  49.34 
 
 
158 aa  136  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.000319107  normal  0.280296 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1449  50S ribosomal protein L15  48.68 
 
 
158 aa  136  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.829233  normal  0.185187 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0284  ribosomal protein L15  53.38 
 
 
152 aa  136  1e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000266342  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2382  50S ribosomal protein L15  55.28 
 
 
147 aa  135  2e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000043437  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1008  50S ribosomal protein L15  49.31 
 
 
144 aa  133  9e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00101008  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4779  50S ribosomal protein L15  46.71 
 
 
160 aa  132  9.999999999999999e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000514125 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0334  50S ribosomal protein L15  52.38 
 
 
162 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.379704  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0098  50S ribosomal protein L15  54.73 
 
 
149 aa  132  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0741055 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0679  50S ribosomal protein L15  54.17 
 
 
153 aa  131  3e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2755  50S ribosomal protein L15  51.02 
 
 
148 aa  131  3e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.203669  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2460  50S ribosomal protein L15  49.66 
 
 
169 aa  130  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.907941  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1659  50S ribosomal protein L15  48.34 
 
 
155 aa  130  3.9999999999999996e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0131033  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2182  50S ribosomal protein L15  49.66 
 
 
169 aa  130  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.34852 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0495  ribosomal protein L15  53.85 
 
 
149 aa  130  5e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.266125  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0272  50S ribosomal protein L15  52.03 
 
 
152 aa  130  5e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.292241  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0473  50S ribosomal protein L15  48.61 
 
 
144 aa  130  6e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.874189  hitchhiker  0.00000311349 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0506  50S ribosomal protein L15  48.61 
 
 
144 aa  130  6e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0331231  normal  0.0198269 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0503  50S ribosomal protein L15  48.61 
 
 
144 aa  130  6e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000448251  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4730  50S ribosomal protein L15  48.61 
 
 
144 aa  130  6e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000304581  normal  0.615753 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1975  50S ribosomal protein L15  49.66 
 
 
156 aa  130  6.999999999999999e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0984244  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0771  ribosomal protein L15  54.79 
 
 
151 aa  130  6.999999999999999e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1214  50S ribosomal protein L15  49.66 
 
 
156 aa  130  7.999999999999999e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1177  50S ribosomal protein L15  49.66 
 
 
156 aa  130  7.999999999999999e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0365287  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0645  ribosomal protein L15  48.61 
 
 
144 aa  130  9e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.182127  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4529  50S ribosomal protein L15  48.61 
 
 
144 aa  130  9e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0663764  normal  0.20573 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2238  50S ribosomal protein L15  52.7 
 
 
149 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.150633  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1334  50S ribosomal protein L15  50.66 
 
 
173 aa  129  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.135432 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2799  50S ribosomal protein L15  50.34 
 
 
175 aa  129  1.0000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.481619 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3890  50S ribosomal protein L15  47.92 
 
 
143 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000709059  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>