More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_0290 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_0290  ribosomal protein S19  100 
 
 
94 aa  194  3e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00533936  normal  0.0406093 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2456  30S ribosomal protein S19  80.85 
 
 
94 aa  170  5e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0781906 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0229  30S ribosomal protein S19  82.98 
 
 
94 aa  169  9e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1741  30S ribosomal protein S19  80.85 
 
 
94 aa  169  1e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000000745132  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1520  30S ribosomal protein S19  80.85 
 
 
94 aa  169  1e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.914288  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01210  ribosomal protein S19  79.79 
 
 
94 aa  167  4e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.441353  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2907  30S ribosomal protein S19  74.47 
 
 
94 aa  160  5.0000000000000005e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.761008  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0219  ribosomal protein S19  74.47 
 
 
94 aa  157  4e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00075195  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0198  SSU ribosomal protein S19P  75.53 
 
 
94 aa  157  4e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0174859  normal  0.0509464 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2329  ribosomal protein S19  76.92 
 
 
94 aa  157  4e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000239943  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0115  30S ribosomal protein S19  76.67 
 
 
92 aa  156  8e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000709655  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0111  30S ribosomal protein S19  75.56 
 
 
92 aa  154  3e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0762  30S ribosomal protein S19  74.47 
 
 
93 aa  151  2.9999999999999998e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000324039  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2707  ribosomal protein S19  73.91 
 
 
93 aa  151  4e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00775426  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2174  ribosomal protein S19  78.82 
 
 
91 aa  148  2e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.765738  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0426  30S ribosomal protein S19  70.21 
 
 
93 aa  149  2e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0022508  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0719  ribosomal protein S19  69.15 
 
 
94 aa  149  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09960  SSU ribosomal protein S19P  79.76 
 
 
86 aa  148  2e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.328032  hitchhiker  0.00000140006 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0245  30S ribosomal protein S19  72.22 
 
 
92 aa  147  4e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.948054  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0248  30S ribosomal protein S19  72.22 
 
 
92 aa  147  4e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1157  ribosomal protein S19  79.52 
 
 
86 aa  147  7e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000321544  hitchhiker  0.000000515171 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0114  30S ribosomal protein S19  71.11 
 
 
92 aa  146  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000793752  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0114  30S ribosomal protein S19  71.11 
 
 
92 aa  146  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000383993  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0110  30S ribosomal protein S19  71.11 
 
 
92 aa  146  1.0000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.16547e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0108  30S ribosomal protein S19  71.11 
 
 
92 aa  146  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000559577  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0145  30S ribosomal protein S19  71.11 
 
 
92 aa  146  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000029175  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0114  30S ribosomal protein S19  71.11 
 
 
92 aa  146  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000118397  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0126  30S ribosomal protein S19  71.11 
 
 
92 aa  146  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.9760100000000003e-62 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0108  30S ribosomal protein S19  70 
 
 
92 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000257453  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3663  30S ribosomal protein S19  72.22 
 
 
92 aa  145  2.0000000000000003e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000230775  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2710  30S ribosomal protein S19  79.52 
 
 
93 aa  144  5e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2395  30S ribosomal protein S19  79.52 
 
 
93 aa  144  5e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2228  30S ribosomal protein S19  77.11 
 
 
91 aa  143  8.000000000000001e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.749299  normal  0.473501 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0985  30S ribosomal protein S19  65.96 
 
 
94 aa  142  1e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1181  30S ribosomal protein S19  73.81 
 
 
95 aa  142  2e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.538373 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4022  30S ribosomal protein S19  73.81 
 
 
95 aa  140  5e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.717988  hitchhiker  0.00000485262 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3707  30S ribosomal protein S19  65.56 
 
 
92 aa  139  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23430  SSU ribosomal protein S19P  75.31 
 
 
85 aa  139  9.999999999999999e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000187491  hitchhiker  0.0000000975507 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2563  30S ribosomal protein S19  68.89 
 
 
92 aa  139  9.999999999999999e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.61073  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1570  ribosomal protein S19  64.13 
 
 
95 aa  139  9.999999999999999e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000162931  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0871  30S ribosomal protein S19  68.09 
 
 
93 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000215821  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0135  30S ribosomal protein S19  72.29 
 
 
92 aa  138  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000777644  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0695  30S ribosomal protein S19  66.67 
 
 
92 aa  139  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00208226  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1296  30S ribosomal protein S19  73.49 
 
 
92 aa  138  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00413729  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1344  ribosomal protein S19  73.49 
 
 
90 aa  137  3e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1180  ribosomal protein S19  68.13 
 
 
93 aa  137  3.9999999999999997e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000119264  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0109  30S ribosomal protein S19  65.56 
 
 
92 aa  137  3.9999999999999997e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000185939  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3020  30S ribosomal protein S19  72.62 
 
 
95 aa  137  6e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00609436  hitchhiker  0.00770845 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04020  SSU ribosomal protein S19P  67.78 
 
 
93 aa  136  8.999999999999999e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.904114 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6610  ribosomal protein S19  73.49 
 
 
93 aa  136  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4503  ribosomal protein S19  68.89 
 
 
93 aa  135  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0402  ribosomal protein S19  70.24 
 
 
93 aa  135  2e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0062  30S ribosomal protein S19  65.56 
 
 
92 aa  134  3.0000000000000003e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.235454  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0372  30S ribosomal protein S19  72.29 
 
 
91 aa  135  3.0000000000000003e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.252396  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0310  30S ribosomal protein S19  68.89 
 
 
93 aa  135  3.0000000000000003e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187056 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5128  ribosomal protein S19  68.89 
 
 
92 aa  134  4e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.76287 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1827  30S ribosomal protein S19  64.44 
 
 
92 aa  134  4e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.476916  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1127  ribosomal protein S19  67.78 
 
 
93 aa  134  5e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.831563  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23061  30S ribosomal protein S19  72.29 
 
 
91 aa  134  6.0000000000000005e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1959  30S ribosomal protein S19  69.88 
 
 
91 aa  133  7.000000000000001e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2615  30S ribosomal protein S19  71.08 
 
 
92 aa  133  7.000000000000001e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00302204  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6045  30S ribosomal protein S19  67.78 
 
 
93 aa  133  8e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.852276  normal  0.340402 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1125  30S ribosomal protein S19  71.08 
 
 
91 aa  133  9e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19991  30S ribosomal protein S19  71.08 
 
 
91 aa  133  9e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.380662  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3754  ribosomal protein S19  68.67 
 
 
93 aa  132  9.999999999999999e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.396407  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1863  30S ribosomal protein S19  67.06 
 
 
95 aa  132  9.999999999999999e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00494642  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3008  30S ribosomal protein S19  67.06 
 
 
91 aa  132  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0207995  hitchhiker  0.00691739 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2314  30S ribosomal protein S19  71.08 
 
 
92 aa  133  9.999999999999999e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000275126  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2273  30S ribosomal protein S19  71.08 
 
 
92 aa  133  9.999999999999999e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000681992  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4317  ribosomal protein S19  67.78 
 
 
93 aa  131  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1390  30S ribosomal protein S19  67.06 
 
 
95 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000262881  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10719  30S ribosomal protein S19  72.29 
 
 
93 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.560637  normal  0.221771 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3431  ribosomal protein S19  69.88 
 
 
93 aa  132  1.9999999999999998e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17361  30S ribosomal protein S19  68.67 
 
 
91 aa  132  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1646  30S ribosomal protein S19  68.67 
 
 
92 aa  132  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4311  30S ribosomal protein S19  67.78 
 
 
93 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.410711  hitchhiker  0.00992918 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0586  30S ribosomal protein S19  67.78 
 
 
93 aa  132  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17451  30S ribosomal protein S19  68.67 
 
 
92 aa  132  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2151  SSU ribosomal protein S19P  69.88 
 
 
93 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.152821  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3919  30S ribosomal protein S19  67.78 
 
 
93 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1296  30S ribosomal protein S19  67.06 
 
 
95 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000249604  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2398  30S ribosomal protein S19  65.56 
 
 
92 aa  132  1.9999999999999998e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0423225  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2971  30S ribosomal protein S19  71.08 
 
 
93 aa  132  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.241839  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0217  30S ribosomal protein S19  70.59 
 
 
92 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000102796  unclonable  0.00000723515 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17611  30S ribosomal protein S19  68.67 
 
 
92 aa  132  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0287  30S ribosomal protein S19  68.24 
 
 
92 aa  131  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000109471  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3911  30S ribosomal protein S19  68.24 
 
 
92 aa  131  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000343627  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0588  30S ribosomal protein S19  68.24 
 
 
92 aa  131  3e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000935387  normal  0.434912 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0566  30S ribosomal protein S19  66.67 
 
 
92 aa  131  3e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0295  30S ribosomal protein S19  64.52 
 
 
95 aa  131  3e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  unclonable  1.07171e-28 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2683  30S ribosomal protein S19  71.08 
 
 
93 aa  131  3e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1903  30S ribosomal protein S19  64.44 
 
 
92 aa  131  3e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3997  30S ribosomal protein S19  68.24 
 
 
92 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00000877043  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3818  30S ribosomal protein S19  68.24 
 
 
92 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000535385  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0397  ribosomal protein S19  71.08 
 
 
92 aa  130  5e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000239806  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3799  30S ribosomal protein S19  71.08 
 
 
92 aa  130  5e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000135619  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16741  30S ribosomal protein S19  67.47 
 
 
91 aa  130  5e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03118  hypothetical protein  71.08 
 
 
92 aa  130  5e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00218529  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3510  30S ribosomal protein S19  71.08 
 
 
92 aa  130  5e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000924405  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3701  30S ribosomal protein S19  71.08 
 
 
92 aa  130  5e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000204541  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>