More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_0287 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_0287  50S ribosomal protein L4  100 
 
 		 206 aa  414  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0371511  hitchhiker  0.00627174 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0216  50S ribosomal protein L4  75.73 
 
 		 206 aa  315  3e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000320704  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0226  ribosomal protein L4/L1e  69.57 
 
 		 207 aa  298  4e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0108  50S ribosomal protein L4  67.15 
 
 		 207 aa  278  4e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2459  50S ribosomal protein L4P  66.18 
 
 		 207 aa  278  4e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0863955 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0112  50S ribosomal protein L4  68.12 
 
 		 207 aa  278  4e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000123482  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0868  50S ribosomal protein L4  63.59 
 
 		 206 aa  270  2e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000685593  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0759  50S ribosomal protein L4  62.8 
 
 		 207 aa  264  7e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000566858  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0106  50S ribosomal protein L4  63.29 
 
 		 207 aa  263  1e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000544936  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0132  50S ribosomal protein L4  62.8 
 
 		 207 aa  262  3e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000136863  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0111  50S ribosomal protein L4  62.8 
 
 		 207 aa  262  3e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000572324  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0142  50S ribosomal protein L4  62.8 
 
 		 207 aa  262  3e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000690155  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0111  50S ribosomal protein L4  62.8 
 
 		 207 aa  262  3e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000900585  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0107  50S ribosomal protein L4  62.8 
 
 		 207 aa  262  3e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.56557e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0105  50S ribosomal protein L4  62.8 
 
 		 207 aa  262  3e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000256275  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0123  50S ribosomal protein L4  62.8 
 
 		 207 aa  262  3e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.21989e-61 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0111  50S ribosomal protein L4  62.8 
 
 		 207 aa  262  3e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000163463  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2332  ribosomal protein L4/L1e  61.35 
 
 		 207 aa  262  3e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000847375  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5194  50S ribosomal protein L4  62.8 
 
 		 207 aa  262  3e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000834057  unclonable  1.98377e-25 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0105  50S ribosomal protein L4  62.8 
 
 		 207 aa  258  3e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000104823  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2710  ribosomal protein L4/L1e  60.19 
 
 		 206 aa  259  3e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000254915  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0195  LSU ribosomal protein L4P  57 
 
 		 207 aa  257  7e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00135777  normal  0.0747506 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2904  50S ribosomal protein L4  59.62 
 
 		 208 aa  257  8e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000879055  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3666  50S ribosomal protein L4  54.85 
 
 		 206 aa  246  1e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000305367  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1523  ribosomal protein L4/L1e  58.25 
 
 		 207 aa  242  1.9999999999999999e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.790483  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0423  50S ribosomal protein L4  58.45 
 
 		 207 aa  241  3.9999999999999997e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000203712  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2713  50S ribosomal protein L4  54.37 
 
 		 204 aa  234  8e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2398  50S ribosomal protein L4  54.37 
 
 		 204 aa  234  1.0000000000000001e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000730975  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1482  50S ribosomal protein L4  56.04 
 
 		 207 aa  233  2.0000000000000002e-60  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000984788  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1744  50S ribosomal protein L4  54.81 
 
 		 208 aa  232  3e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000318286  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0292  50S ribosomal protein L4  53.4 
 
 		 205 aa  228  7e-59  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000472593  unclonable  1.9716100000000001e-28 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1830  50S ribosomal protein L4  54.11 
 
 		 207 aa  226  1e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0478396  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1573  ribosomal protein L4/L1e  53.4 
 
 		 207 aa  226  1e-58  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000791532  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2276  50S ribosomal protein L4  54.85 
 
 		 207 aa  225  3e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000009811  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2317  50S ribosomal protein L4  54.85 
 
 		 207 aa  225  3e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000134967  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1556  ribosomal protein L4/L1e  52.68 
 
 		 207 aa  224  6e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0427554  normal  0.977876 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0596  50S ribosomal protein L4P  53.88 
 
 		 207 aa  218  3.9999999999999997e-56  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000475036  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1183  ribosomal protein L4/L1e  53.88 
 
 		 208 aa  217  8.999999999999998e-56  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000599505  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01180  ribosomal protein L4/L1e  53.85 
 
 		 209 aa  216  2e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000715314  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1906  50S ribosomal protein L4  51.21 
 
 		 207 aa  215  4e-55  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000335339  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2401  50S ribosomal protein L4  50 
 
 		 208 aa  212  3.9999999999999995e-54  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000036372  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0059  50S ribosomal protein L4  50.24 
 
 		 207 aa  211  7.999999999999999e-54  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0599605  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0716  ribosomal protein L4/L1e  48.51 
 
 		 223 aa  207  6e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16230  ribosomal protein L4  50 
 
 		 207 aa  207  7e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.308573  decreased coverage  0.0000000146284 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0197  50S ribosomal protein L4  49.26 
 
 		 207 aa  204  6e-52  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00203095  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4916  ribosomal protein L4/L1e  50.99 
 
 		 209 aa  204  7e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.1186  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_418  ribosomal protein L4  49.01 
 
 		 210 aa  204  7e-52  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00538527  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0963  ribosomal protein L4/L1e  50.72 
 
 		 207 aa  202  2e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000403747  hitchhiker  0.0000000000267396 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0695  50S ribosomal protein L4  49.02 
 
 		 208 aa  202  4e-51  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0954  50S ribosomal protein L4  50.45 
 
 		 221 aa  201  8e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000111144  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0475  50S ribosomal protein L4  48.02 
 
 		 210 aa  200  9.999999999999999e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00700158  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0452  50S ribosomal protein L4  48.51 
 
 		 210 aa  200  9.999999999999999e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000515236  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl124  50S ribosomal protein L4  48.04 
 
 		 208 aa  199  3e-50  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000604234  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1347  50S ribosomal protein L4  45.85 
 
 		 206 aa  197  6e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2064  50S ribosomal protein L4  49.76 
 
 		 206 aa  197  9e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000000384651  normal  0.231159 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0702  50S ribosomal protein L4  47.32 
 
 		 206 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000569503  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0982  ribosomal protein L4/L1e  48.31 
 
 		 209 aa  194  7e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.532922  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10010  LSU ribosomal protein L4P  47.83 
 
 		 207 aa  193  2e-48  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000045126  hitchhiker  0.00000000148432 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1137  50S ribosomal protein L4  47.3 
 
 		 223 aa  192  2e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000824266  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2560  50S ribosomal protein L4/L1e  49.02 
 
 		 210 aa  192  3e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0559575  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2773  50S ribosomal protein L4  46.34 
 
 		 206 aa  192  3e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0187174  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1764  50S ribosomal protein L4  46.83 
 
 		 206 aa  192  3e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00135584  normal  0.669415 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0709  50S ribosomal protein L4  48.02 
 
 		 205 aa  191  5e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0382078  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3704  50S ribosomal protein L4  48.34 
 
 		 210 aa  191  7e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1393  50S ribosomal protein L4  51.11 
 
 		 235 aa  189  4e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000162338  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2256  50S ribosomal protein L4  46.83 
 
 		 206 aa  188  4e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000129639  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1293  50S ribosomal protein L4  51.11 
 
 		 235 aa  189  4e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000803665  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0080  50S ribosomal protein L4  47.32 
 
 		 206 aa  187  5.999999999999999e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.186923 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0681  50S ribosomal protein L4  42.23 
 
 		 207 aa  187  1e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.486374  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0251  50S ribosomal protein L4  46.92 
 
 		 211 aa  186  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0248  50S ribosomal protein L4  46.92 
 
 		 211 aa  186  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.890563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4025  ribosomal protein L4/L1e  48.02 
 
 		 221 aa  186  2e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000717748 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1850  50S ribosomal protein L4  48.77 
 
 		 208 aa  186  3e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.264817  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3023  ribosomal protein L4/L1e  46.34 
 
 		 222 aa  186  3e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.443321  normal  0.0189884 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4004  ribosomal protein L4/L1e  47.37 
 
 		 215 aa  185  5e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.070535  normal  0.716068 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1184  ribosomal protein L4/L1e  47.52 
 
 		 223 aa  185  5e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0789  50S ribosomal protein L4  44.55 
 
 		 221 aa  184  1.0000000000000001e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0627  50S ribosomal protein L4  44.39 
 
 		 220 aa  182  3e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000530014  hitchhiker  0.00000000000031805 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2422  50S ribosomal protein L4  45.81 
 
 		 208 aa  182  4.0000000000000006e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00578828  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0661  50S ribosomal protein L4  45.05 
 
 		 210 aa  181  7e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000586581  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0193  ribosomal protein L4/L1e  45.63 
 
 		 214 aa  180  1e-44  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1293  50S ribosomal protein L4  46.41 
 
 		 210 aa  180  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000205733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2231  50S ribosomal protein L4  43.54 
 
 		 210 aa  179  2e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.402946 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3011  50S ribosomal protein L4  44.5 
 
 		 212 aa  179  2e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00787083 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1417  ribosomal protein L4/L1e  44.33 
 
 		 211 aa  180  2e-44  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.977567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1068  50S ribosomal protein L4  42.44 
 
 		 207 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000351414  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0692  50S ribosomal protein L4  45.59 
 
 		 210 aa  178  4.999999999999999e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000477042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0290  ribosomal protein L4/L1e  45.77 
 
 		 208 aa  178  5.999999999999999e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00437959  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3161  50S ribosomal protein L4  46.12 
 
 		 208 aa  178  5.999999999999999e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.614669 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2228  50S ribosomal protein L4  45.81 
 
 		 208 aa  177  8e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000169782  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0848  50S ribosomal protein L4P  47.34 
 
 		 207 aa  177  8e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000392239  decreased coverage  0.0000122182 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2856  50S ribosomal protein L4  42.44 
 
 		 207 aa  177  1e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.400345  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0563  50S ribosomal protein L4/L1e  44.28 
 
 		 216 aa  176  3e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0422  50S ribosomal protein L4  45.73 
 
 		 202 aa  175  4e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00655238  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001741  LSU ribosomal protein L4p (L1e)  46.84 
 
 		 200 aa  174  7e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000116803  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4344  50S ribosomal protein L4  45.15 
 
 		 209 aa  172  1.9999999999999998e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000409516  normal  0.126717 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1087  50S ribosomal protein L4  44.71 
 
 		 215 aa  172  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.10489 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1837  ribosomal protein L4/L1e  44.44 
 
 		 215 aa  172  2.9999999999999996e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00300997  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0290  50S ribosomal protein L4  46.31 
 
 		 212 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0857  50S ribosomal protein L4  45.77 
 
 		 205 aa  172  3.9999999999999995e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>