More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_0284 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010320  Teth514_0851  elongation factor Tu  82.91 
 
 
400 aa  702    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000784672  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0177  elongation factor Tu  81.91 
 
 
400 aa  665    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000229884  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0270  elongation factor Tu  100 
 
 
400 aa  816    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000107043  normal  0.0107333 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1526  translation elongation factor Tu  82.66 
 
 
400 aa  694    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.358549  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01010  elongation factor Tu  79.65 
 
 
397 aa  646    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000907786  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0810  elongation factor Tu  79.15 
 
 
400 aa  653    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000557985  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0420  elongation factor Tu  82.16 
 
 
400 aa  691    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000158382  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01150  elongation factor Tu  79.65 
 
 
397 aa  646    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.58645e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0192  elongation factor Tu  81.91 
 
 
400 aa  665    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174926  normal  0.0285704 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0284  elongation factor Tu  100 
 
 
400 aa  818    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00091062  hitchhiker  0.00368673 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2462  elongation factor Tu  86.18 
 
 
400 aa  716    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0594726 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2713  translation elongation factor Tu  80.65 
 
 
395 aa  666    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000152961  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0207  elongation factor Tu  83.71 
 
 
399 aa  699    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000266697  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0223  elongation factor Tu  83.96 
 
 
400 aa  701    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.834398  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0865  elongation factor Tu  82.91 
 
 
400 aa  701    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000288327  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2335  elongation factor Tu  83.21 
 
 
400 aa  704    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00040826  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2350  elongation factor Tu  83.21 
 
 
400 aa  704    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00292725  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0409  translation elongation factor Tu  82.66 
 
 
400 aa  694    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000794067  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0213  elongation factor Tu  90.2 
 
 
400 aa  749    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00624803  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0199  elongation factor Tu  90.2 
 
 
400 aa  749    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000189275  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0318  elongation factor Tu  77.39 
 
 
400 aa  632  1e-180  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000823048  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2279  elongation factor Tu  78.23 
 
 
396 aa  629  1e-179  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1932  elongation factor Tu  78.23 
 
 
396 aa  629  1e-179  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2017  elongation factor Tu  78.23 
 
 
396 aa  629  1e-179  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1378  elongation factor Tu  74.19 
 
 
405 aa  629  1e-179  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000857759  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0105  elongation factor Tu  79.65 
 
 
395 aa  630  1e-179  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0979  elongation factor Tu  74.19 
 
 
405 aa  629  1e-179  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.198926  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2367  elongation factor Tu  78.23 
 
 
396 aa  629  1e-179  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.709055  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0440  elongation factor Tu  75.13 
 
 
399 aa  630  1e-179  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000285931  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0520  elongation factor Tu  74.37 
 
 
399 aa  624  1e-178  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.611126  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0686  elongation factor Tu  78.79 
 
 
399 aa  624  1e-178  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.23848e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0699  elongation factor Tu  78.89 
 
 
399 aa  627  1e-178  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000495422  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1325  elongation factor Tu  74.5 
 
 
399 aa  625  1e-178  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000100394  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0499  elongation factor Tu  74.37 
 
 
399 aa  624  1e-178  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000000240706  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0173  elongation factor Tu  74.75 
 
 
399 aa  625  1e-178  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000168704  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1465  elongation factor Tu  74.37 
 
 
399 aa  624  1e-178  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00000111535  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0109  elongation factor Tu  79.15 
 
 
395 aa  627  1e-178  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000245051  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1827  translation elongation factor Tu  75.88 
 
 
400 aa  625  1e-178  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0166  elongation factor Tu  74.37 
 
 
399 aa  625  1e-178  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000496784  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0713  translation elongation factor Tu  75.88 
 
 
400 aa  625  1e-178  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2690  translation elongation factor Tu  77.72 
 
 
405 aa  622  1e-177  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000740208  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2964  elongation factor Tu  77.25 
 
 
396 aa  623  1e-177  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.155343  normal  0.97702 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2909  translation elongation factor Tu  77.72 
 
 
405 aa  622  1e-177  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.124736  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2229  elongation factor Tu  77.47 
 
 
396 aa  624  1e-177  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0152937 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1910  elongation factor Tu  77.47 
 
 
396 aa  624  1e-177  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.256474 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1186  translation elongation factor Tu  75.13 
 
 
397 aa  620  1e-176  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000181174  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1184  translation elongation factor Tu  75.99 
 
 
405 aa  618  1e-176  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000189456  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2621  translation elongation factor Tu  76.24 
 
 
405 aa  620  1e-176  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00169473  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1362  elongation factor Tu  76.63 
 
 
396 aa  617  1e-176  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.641297 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2788  translation elongation factor Tu  74.62 
 
 
397 aa  617  1e-176  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.117991  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2266  elongation factor Tu  76.38 
 
 
396 aa  618  1e-176  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2293  elongation factor Tu  76.38 
 
 
396 aa  618  1e-176  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.404032 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3450  elongation factor Tu  76.63 
 
 
396 aa  619  1e-176  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.939477 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3186  elongation factor Tu  76.13 
 
 
396 aa  619  1e-176  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3204  elongation factor Tu  76.38 
 
 
396 aa  620  1e-176  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1355  elongation factor Tu  75.94 
 
 
396 aa  619  1e-176  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.358693  normal  0.0503589 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2730  elongation factor Tu  77.14 
 
 
400 aa  620  1e-176  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1515  translation elongation factor Tu  75.13 
 
 
397 aa  620  1e-176  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000283253  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1059  elongation factor Tu  75.88 
 
 
396 aa  615  1e-175  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0877336  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2374  elongation factor Tu  75.88 
 
 
396 aa  615  1e-175  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2326  elongation factor Tu  76.88 
 
 
396 aa  617  1e-175  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.0000151481  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3669  elongation factor Tu  75.88 
 
 
396 aa  614  1e-175  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0752  elongation factor Tu  75.38 
 
 
396 aa  614  1e-175  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.993523  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0765  elongation factor Tu  75.38 
 
 
396 aa  614  1e-175  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0667226  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2776  translation elongation factor Tu  74.19 
 
 
397 aa  617  1e-175  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.105082  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0102  elongation factor Tu  78.14 
 
 
395 aa  616  1e-175  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000129876  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2338  elongation factor Tu  76.88 
 
 
396 aa  617  1e-175  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0567224  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3703  elongation factor Tu  75.88 
 
 
396 aa  614  1e-175  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.871346  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0665  elongation factor Tu  79.15 
 
 
396 aa  613  9.999999999999999e-175  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.835908  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1066  elongation factor Tu  79.15 
 
 
396 aa  612  9.999999999999999e-175  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093515  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0678  elongation factor Tu  79.15 
 
 
396 aa  613  9.999999999999999e-175  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.596975  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0918  elongation factor Tu  79.9 
 
 
396 aa  613  9.999999999999999e-175  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3330  elongation factor Tu  79.4 
 
 
396 aa  611  9.999999999999999e-175  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.91579e-16 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3343  elongation factor Tu  79.4 
 
 
396 aa  611  9.999999999999999e-175  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00311584 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1053  elongation factor Tu  79.15 
 
 
396 aa  612  9.999999999999999e-175  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0848244  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0185  elongation factor Tu  74.75 
 
 
394 aa  611  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000201579  hitchhiker  0.00891044 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0180  elongation factor Tu  74.75 
 
 
394 aa  611  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000449049  hitchhiker  0.00322221 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0185  elongation factor Tu  74.75 
 
 
394 aa  610  1e-173  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000202802  normal  0.069078 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0108  elongation factor Tu  77.89 
 
 
395 aa  608  1e-173  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000077853  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0108  elongation factor Tu  78.14 
 
 
395 aa  609  1e-173  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000780653  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0104  elongation factor Tu  78.14 
 
 
395 aa  609  1e-173  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  3.21711e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0102  elongation factor Tu  78.14 
 
 
395 aa  609  1e-173  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000109965  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0103  elongation factor Tu  78 
 
 
396 aa  608  1e-173  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000770541  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5197  elongation factor Tu  77.89 
 
 
395 aa  608  1e-173  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000100424  unclonable  4.51566e-25 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1948  elongation factor Tu  75.44 
 
 
395 aa  609  1e-173  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0120  elongation factor Tu  78.14 
 
 
395 aa  609  1e-173  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.73817e-61 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2326  elongation factor Tu  74.37 
 
 
396 aa  609  1e-173  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000632593  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2338  elongation factor Tu  74.37 
 
 
396 aa  609  1e-173  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000797106  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0197  elongation factor Tu  74.75 
 
 
394 aa  610  1e-173  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000214684  hitchhiker  0.0000000334083 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2171  translation elongation factor Tu  74.62 
 
 
396 aa  609  1e-173  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00686859  normal  0.373473 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0108  elongation factor Tu  78.14 
 
 
395 aa  609  1e-173  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000587402  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0154  elongation factor Tu  73.37 
 
 
395 aa  608  1e-173  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1584  elongation factor Tu  77.72 
 
 
396 aa  608  1e-173  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1947  elongation factor Tu  77.72 
 
 
396 aa  608  1e-173  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2183  translation elongation factor Tu  74.62 
 
 
396 aa  609  1e-173  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.557033  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0265  elongation factor Tu  76.38 
 
 
396 aa  609  1e-173  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000271632  hitchhiker  0.00214055 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0277  elongation factor Tu  76.63 
 
 
396 aa  610  1e-173  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000015281  unclonable  0.000000133625 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0139  elongation factor Tu  77.89 
 
 
395 aa  608  1e-173  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000328194  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1543  elongation factor Tu  75.63 
 
 
396 aa  609  1e-173  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0754  elongation factor Tu  75.63 
 
 
396 aa  607  1e-173  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000150197  normal  0.0210812 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>