49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_0280 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_0280  putative ribosomal protein L7Ae-like protein  100 
 
 
82 aa  164  5e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000000500453  decreased coverage  0.00000955735 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2466  50S ribosomal protein L7AE  51.22 
 
 
83 aa  92.4  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0116433 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1530  hypothetical protein  52.44 
 
 
83 aa  89.7  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000100287  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0209  ribosomal protein L7ae family protein  50.63 
 
 
83 aa  83.6  9e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000343834  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0219  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  48.1 
 
 
94 aa  82  0.000000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000001803  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0416  ribosomal protein L7AE family protein  49.38 
 
 
83 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000181498  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2717  hypothetical protein  50 
 
 
85 aa  72.4  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.133406  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0861  putative L7Ae-like ribosomal protein  54.93 
 
 
84 aa  71.2  0.000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000301408  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2726  50S ribosomal protein L7AE  46.67 
 
 
79 aa  62.4  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000000168835  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2339  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  40.24 
 
 
86 aa  61.2  0.000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000362211  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0314  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  47.22 
 
 
80 aa  60.5  0.000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000236555  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0105  putative ribosomal protein L7Ae-like  40.24 
 
 
82 aa  58.9  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000154657  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0125  hypothetical protein  36.84 
 
 
82 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000109294  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0806  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  40.85 
 
 
84 aa  58.2  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000124413  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0188  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  35.62 
 
 
82 aa  57.4  0.00000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158603  decreased coverage  0.00101223 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0101  putative ribosomal protein L7Ae-like  37.8 
 
 
82 aa  55.1  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0098  hypothetical protein  36.84 
 
 
82 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000338227  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5201  hypothetical protein  36.84 
 
 
82 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000267841  unclonable  7.36265e-26 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0099  hypothetical protein  36.84 
 
 
82 aa  53.5  0.0000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000059551  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2527  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  39.13 
 
 
120 aa  53.5  0.0000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0104  hypothetical protein  36.84 
 
 
82 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000170175  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0098  hypothetical protein  36.84 
 
 
93 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000182095  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0100  hypothetical protein  36.84 
 
 
93 aa  53.1  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000444841  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0116  hypothetical protein  36.84 
 
 
82 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.74724e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0104  hypothetical protein  36.84 
 
 
93 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000573275  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0135  hypothetical protein  36.84 
 
 
82 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000655713  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0104  hypothetical protein  36.84 
 
 
93 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000288714  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2406  ribosomal protein L7AE family protein  37.5 
 
 
79 aa  52.8  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000118333  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2720  ribosomal protein L7AE family protein  37.5 
 
 
79 aa  52.8  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000573483  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0451  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  37.68 
 
 
120 aa  52  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.202723  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0185  putative ribosomal protein L7Ae-like  40.28 
 
 
86 aa  52  0.000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.0000360647  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01110  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  36.59 
 
 
82 aa  49.7  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000450722  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1068  ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45  42.03 
 
 
130 aa  49.3  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.0039063  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1842  50S ribosomal protein L7Ae  37.68 
 
 
120 aa  48.1  0.00004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00104534  normal  0.186642 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0581  putative ribosomal protein L7Ae-like  39.73 
 
 
84 aa  47.4  0.00007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00254265  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0567  putative ribosomal protein L7Ae-like  39.73 
 
 
84 aa  47.4  0.00007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000530013  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0750  50S ribosomal protein L7Ae  36.23 
 
 
120 aa  47  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.897962  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1601  50S ribosomal protein L7Ae  37.68 
 
 
122 aa  46.6  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.718255 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2132  50S ribosomal protein L7Ae  36.36 
 
 
125 aa  45.8  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00358351  hitchhiker  0.0000558661 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0589  50S ribosomal protein L7Ae  42.65 
 
 
169 aa  46.2  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.962005  hitchhiker  0.000204671 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0219  50S ribosomal protein L7Ae  39.68 
 
 
117 aa  45.8  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000000043194  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3388  50S ribosomal protein L7Ae  36.76 
 
 
120 aa  46.2  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00000000000732492  normal  0.0682764 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1580  50S ribosomal protein L7Ae  40.58 
 
 
151 aa  44.7  0.0005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1759  50S ribosomal protein L7Ae  40.58 
 
 
153 aa  44.7  0.0005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0217268  hitchhiker  0.000585072 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0081  50S ribosomal protein L7Ae  34.18 
 
 
117 aa  44.3  0.0006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.309731  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0225  50S ribosomal protein L7Ae  37.88 
 
 
128 aa  43.1  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0331  50S ribosomal protein L7Ae  37.68 
 
 
122 aa  43.1  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0721  50S ribosomal protein L7Ae  34.78 
 
 
122 aa  42.7  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0318706  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1190  ribosomal protein L7AE family protein  27.85 
 
 
82 aa  40.4  0.008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000936899  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>