151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_0259 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_0259  transcriptional regulator, CarD family  100 
 
 		 158 aa  318  1.9999999999999998e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000116082  normal  0.0229238 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0185  CarD family transcriptional regulator  79.11 
 
 		 158 aa  251  2.0000000000000002e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0164199  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0184  CarD family transcriptional regulator  75.95 
 
 		 158 aa  251  3e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000461905  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0399  transcriptional regulator, CarD family  68.55 
 
 		 159 aa  214  4e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00433509  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2489  CarD family transcriptional regulator  61.39 
 
 		 158 aa  206  1e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00883814  normal  0.0681247 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00900  transcriptional regulator, CarD family  59.87 
 
 		 176 aa  201  3e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  8.92061e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0164  transcriptional regulator, CarD family  59.24 
 
 		 161 aa  200  8e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.475576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0392  transcriptional regulator, CarD family  57.59 
 
 		 158 aa  192  1e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000362697  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2940  CarD family transcriptional regulator  56.49 
 
 		 158 aa  184  3e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0340  transcriptional regulator, CarD family  59.57 
 
 		 159 aa  184  3e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.18012  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2907  CarD family transcriptional regulator  51.27 
 
 		 160 aa  171  3.9999999999999995e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0173  transcriptional regulator, CarD family  50.65 
 
 		 159 aa  170  7.999999999999999e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4319  transcriptional regulator, CarD family  51.28 
 
 		 160 aa  167  4e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0703  transcriptional regulator, CarD family  50 
 
 		 160 aa  167  5e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0540347  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1901  transcriptional regulator, CarD family  49.68 
 
 		 159 aa  167  6e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.488949  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5340  CarD family transcriptional regulator  48.1 
 
 		 162 aa  164  4e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1444  CarD family transcriptional regulator  48.1 
 
 		 162 aa  164  4e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.250117 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4740  CarD family transcriptional regulator  48.1 
 
 		 162 aa  164  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4826  CarD family transcriptional regulator  48.1 
 
 		 162 aa  164  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.652741  normal  0.999363 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5126  CarD family transcriptional regulator  48.1 
 
 		 162 aa  164  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.593452 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0364  transcriptional regulator, CarD family  49.37 
 
 		 162 aa  163  6.9999999999999995e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.376987  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0651  transcriptional regulator, CarD family  49.68 
 
 		 160 aa  163  1.0000000000000001e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.058243  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0963  CarD family transcriptional regulator  49.36 
 
 		 160 aa  162  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13616  transcription factor  46.84 
 
 		 162 aa  163  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.392977 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4255  CarD family transcriptional regulator  49.04 
 
 		 160 aa  162  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0362  CarD family transcriptional regulator  49.04 
 
 		 160 aa  162  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0755625  hitchhiker  0.00187432 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0501  CarD family transcriptional regulator  49.36 
 
 		 163 aa  161  3e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35090  transcriptional regulator, CarD family  48.41 
 
 		 163 aa  159  1e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.86286 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0898  transcriptional regulator, CarD family  47.77 
 
 		 160 aa  157  5e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00538334 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0601  transcriptional regulator, CarD family  46.2 
 
 		 162 aa  156  1e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.251005  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0866  transcriptional regulator, CarD family  46.84 
 
 		 160 aa  154  6e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.795809 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2077  transcriptional regulator, CarD family  47.13 
 
 		 161 aa  153  1e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.90671  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0773  transcriptional regulator, CarD family  46.5 
 
 		 160 aa  152  2e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.164526  normal  0.216229 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4262  transcription factor CarD  45.86 
 
 		 161 aa  152  2e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.102192 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4692  CarD family transcriptional regulator  45.86 
 
 		 161 aa  152  2e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.372756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2959  transcriptional regulator, CarD family  46.5 
 
 		 160 aa  152  2e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3388  CarD family transcriptional regulator  45.75 
 
 		 159 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1687  transcriptional regulator, CarD family  50.71 
 
 		 171 aa  151  4e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.613225  normal  0.385121 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31820  transcriptional regulator, CarD family  45.86 
 
 		 160 aa  150  7e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0726  CarD family transcriptional regulator  46.2 
 
 		 160 aa  150  8e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0852  transcriptional regulator, CarD family  46.2 
 
 		 160 aa  150  8e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09270  transcriptional regulator, CarD family  43.95 
 
 		 160 aa  148  3e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0078  CarD family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 160 aa  147  4e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.805764 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3244  CarD family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 155 aa  147  7e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4447  CarD family transcriptional regulator  43.62 
 
 		 164 aa  146  1.0000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.948938  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4465  CarD family transcriptional regulator  43.62 
 
 		 164 aa  146  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4040  CarD family transcriptional regulator  46.2 
 
 		 161 aa  146  1.0000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4833  transcriptional regulator, CarD family  43.62 
 
 		 164 aa  146  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03720  transcriptional regulator, CarD family  42.04 
 
 		 160 aa  145  2.0000000000000003e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.178862 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0142  transcriptional regulator, CarD family  45.22 
 
 		 161 aa  145  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.432895  normal  0.208842 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4857  CarD family transcriptional regulator  42.95 
 
 		 164 aa  144  3e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4851  transcriptional regulator, CarD family  42.95 
 
 		 164 aa  144  3e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.906261  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8145  transcriptional regulator, CarD family  47.77 
 
 		 160 aa  142  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03770  transcriptional regulator, CarD family  42.68 
 
 		 160 aa  142  2e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0832449  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2498  CarD family transcriptional regulator  45.86 
 
 		 171 aa  140  7e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.860997  hitchhiker  0.00028149 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0970  transcription factor CarD  43.31 
 
 		 162 aa  140  8e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0421613  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4967  CarD family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 148 aa  137  4.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0352786  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1065  CarD family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 153 aa  137  4.999999999999999e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0695746  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2124  transcriptional regulator, CarD family  44.94 
 
 		 161 aa  137  6e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0696719  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1271  CarD family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 171 aa  137  8.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0355661  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2685  transcriptional regulator, CarD family  44.59 
 
 		 171 aa  137  8.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.000114953  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2592  transcriptional regulator, CarD family  44.59 
 
 		 171 aa  137  8.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0112448  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4611  CarD family transcriptional regulator  43.7 
 
 		 153 aa  136  1e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0663  transcriptional regulator, CarD family  45.86 
 
 		 160 aa  136  1e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.471723  hitchhiker  0.000789071 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3655  CarD family transcriptional regulator  46.31 
 
 		 159 aa  135  2e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000563805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3335  CarD family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 158 aa  134  4e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.512684  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2164  transcriptional regulator, CarD family  44.16 
 
 		 153 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0104  putative transcriptional regulator  45.06 
 
 		 161 aa  132  9.999999999999999e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3676  CarD family transcriptional regulator  42.48 
 
 		 158 aa  131  3e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1245  transcriptional regulator, CarD family  39.13 
 
 		 168 aa  130  5e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000622315  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2880  CarD family transcriptional regulator  41.83 
 
 		 158 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3756  transcriptional regulator, CarD family  41.18 
 
 		 158 aa  127  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4827  transcriptional regulator, CarD family  42.48 
 
 		 164 aa  127  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1560  transcriptional regulator, CarD family  41.18 
 
 		 158 aa  127  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.879343  normal  0.22005 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0751  transcriptional_regulator  42.58 
 
 		 197 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.024387  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3438  CarD family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 158 aa  127  6e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.270269  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3350  CarD family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 158 aa  127  6e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3708  CarD family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 158 aa  127  6e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.672649  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3658  transcriptional regulator, CarD family  41.18 
 
 		 158 aa  127  6e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3401  CarD family transcriptional regulator  40.52 
 
 		 158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4546  CarD family transcriptional regulator  42.48 
 
 		 159 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3681  transcriptional regulator, CarD family  40.52 
 
 		 158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0786327  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0409  transcriptional regulator, CarD family  41.83 
 
 		 164 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3201  transcriptional regulator, CarD family  42.14 
 
 		 174 aa  124  5e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4522  transcriptional regulator, CarD family  38.61 
 
 		 162 aa  124  7e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.76792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0598  CarD-like protein  40.65 
 
 		 198 aa  120  5e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.80876 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0553  CarD family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 186 aa  116  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.106892 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2821  CarD family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 188 aa  114  6.9999999999999995e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000911518  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0842  transcriptional regulator, CarD family  37.89 
 
 		 174 aa  111  4.0000000000000004e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000502927  normal  0.471539 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1561  CarD family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 171 aa  105  2e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0294353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0676  transcriptional regulator, CarD family  36.65 
 
 		 176 aa  105  3e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000000026469  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2290  transcriptional regulator, putative  32.68 
 
 		 208 aa  104  4e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2129  CarD family transcriptional regulator  35 
 
 		 171 aa  99.8  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000417327  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1455  transcriptional regulator, CarD family  35.76 
 
 		 171 aa  98.6  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000871292  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0490  transcriptional regulator, CarD family  35 
 
 		 171 aa  98.6  3e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00257809 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1516  transcriptional regulator, CarD family  29.3 
 
 		 191 aa  95.5  2e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4143  transcriptional regulator, CarD family  31.37 
 
 		 190 aa  90.5  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0239678  normal  0.0810654 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3814  transcriptional regulator, CarD family  31.37 
 
 		 190 aa  90.5  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4352  transcriptional regulator CarD family  31.37 
 
 		 223 aa  89.7  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2425  CarD family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 169 aa  89.4  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.0000259686  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>