More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_0256 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_0256  DNA repair protein RadA  100 
 
 		 457 aa  924    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00319082  normal  0.307702 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1786  DNA repair protein RadA  56.42 
 
 		 454 aa  511  1e-143  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000301687  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0182  DNA repair protein RadA  57.3 
 
 		 449 aa  506  9.999999999999999e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0084  DNA repair protein RadA  53.61 
 
 		 457 aa  499  1e-140  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.391084  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5223  DNA repair protein RadA  53.49 
 
 		 458 aa  494  1e-139  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00190969  unclonable  1.94383e-25 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0082  DNA repair protein RadA  53.28 
 
 		 458 aa  495  1e-139  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0081  DNA repair protein RadA  53.28 
 
 		 458 aa  495  1e-139  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0077  DNA repair protein RadA  53.49 
 
 		 458 aa  496  1e-139  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0092  DNA repair protein RadA  53.28 
 
 		 458 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.92971e-61 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0082  DNA repair protein RadA  53.28 
 
 		 458 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0079  DNA repair protein RadA  53.28 
 
 		 458 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0078  DNA repair protein RadA  53.28 
 
 		 458 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0103  DNA repair protein RadA  53.49 
 
 		 458 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00530334  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0112  DNA repair protein RadA  53.28 
 
 		 458 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.328977  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0077  DNA repair protein RadA  52.4 
 
 		 458 aa  489  1e-137  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0080  DNA repair protein RadA  53.66 
 
 		 484 aa  488  1e-136  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0400  DNA repair protein RadA  53.98 
 
 		 450 aa  482  1e-135  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000197198  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0836  DNA repair protein RadA  54.37 
 
 		 457 aa  482  1e-135  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0984957  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0166  DNA repair protein RadA  52.86 
 
 		 457 aa  475  1e-133  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3459  DNA repair protein RadA  53.18 
 
 		 452 aa  474  1e-132  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.261832  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0422  DNA repair protein RadA  51.32 
 
 		 448 aa  474  1e-132  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00757431  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2341  DNA repair protein RadA  51.98 
 
 		 453 aa  472  1e-132  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0548  DNA repair protein RadA  52.09 
 
 		 454 aa  469  1.0000000000000001e-131  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0562  DNA repair protein RadA  52.09 
 
 		 454 aa  469  1.0000000000000001e-131  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0182  DNA repair protein RadA  57.89 
 
 		 445 aa  471  1.0000000000000001e-131  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.28154  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2739  DNA repair protein RadA  52.44 
 
 		 448 aa  469  1.0000000000000001e-131  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0184  DNA repair protein RadA  50.66 
 
 		 476 aa  465  9.999999999999999e-131  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00274159  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0373  DNA repair protein RadA  51 
 
 		 452 aa  467  9.999999999999999e-131  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0711643  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0301  DNA repair protein RadA  50.76 
 
 		 457 aa  462  1e-129  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0390  DNA repair protein RadA  52.1 
 
 		 449 aa  461  1e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0198908  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3277  DNA repair protein RadA  51.22 
 
 		 449 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.142573  normal  0.6246 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0130  DNA repair protein RadA  49 
 
 		 453 aa  460  9.999999999999999e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000766532  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0110  DNA repair protein RadA  50.87 
 
 		 454 aa  457  1e-127  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.242522  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2490  DNA repair protein RadA  52.09 
 
 		 489 aa  456  1e-127  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.858464  normal  0.0874227 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2361  DNA repair protein RadA  51.33 
 
 		 453 aa  456  1e-127  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0285  DNA repair protein RadA  49.89 
 
 		 450 aa  451  1.0000000000000001e-126  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0463822  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2366  DNA repair protein RadA  51.79 
 
 		 451 aa  451  1.0000000000000001e-126  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000262714  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0251  DNA repair protein RadA  50.93 
 
 		 462 aa  446  1.0000000000000001e-124  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336717  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1987  DNA repair protein RadA  50.9 
 
 		 453 aa  442  1e-123  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.355792 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1877  DNA repair protein RadA  46.75 
 
 		 507 aa  443  1e-123  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.647793 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3255  DNA repair protein RadA  49.34 
 
 		 465 aa  442  1e-123  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1707  DNA repair protein RadA  52.11 
 
 		 453 aa  439  9.999999999999999e-123  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0112208  normal  0.59861 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2065  DNA repair protein RadA  51.99 
 
 		 446 aa  439  9.999999999999999e-123  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0567358  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1582  DNA repair protein RadA  49.18 
 
 		 451 aa  436  1e-121  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000655938  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0575  DNA repair protein RadA  49.18 
 
 		 451 aa  436  1e-121  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2178  DNA repair protein RadA  50.11 
 
 		 463 aa  436  1e-121  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.965225  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0336  DNA repair protein RadA  47.06 
 
 		 459 aa  435  1e-121  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000102144 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4772  DNA repair protein RadA  47.62 
 
 		 457 aa  434  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000283378 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2764  DNA repair protein RadA  48.79 
 
 		 460 aa  433  1e-120  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000385269  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4206  DNA repair protein RadA  46.45 
 
 		 520 aa  434  1e-120  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2440  DNA repair protein RadA  52.22 
 
 		 452 aa  429  1e-119  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.526497  hitchhiker  0.000264442 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2303  DNA repair protein RadA  46.95 
 
 		 514 aa  430  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3455  DNA repair protein RadA  50.11 
 
 		 462 aa  431  1e-119  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0956  DNA repair protein RadA  47.51 
 
 		 517 aa  429  1e-119  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0419823 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2817  DNA repair protein RadA  52.22 
 
 		 452 aa  429  1e-119  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2354  DNA repair protein RadA  46.95 
 
 		 514 aa  430  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.561638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1358  DNA repair protein RadA  52.62 
 
 		 458 aa  426  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.156859  normal  0.874233 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0125  DNA repair protein RadA  46.98 
 
 		 458 aa  427  1e-118  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2476  DNA repair protein RadA  51.5 
 
 		 458 aa  426  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0409258  hitchhiker  0.0000251063 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00880  DNA repair protein RadA  48.11 
 
 		 451 aa  426  1e-118  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000121912  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3614  DNA repair protein RadA  47.66 
 
 		 455 aa  426  1e-118  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.356128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2430  DNA repair protein RadA  46.53 
 
 		 453 aa  426  1e-118  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0318  DNA repair protein RadA  47.59 
 
 		 470 aa  427  1e-118  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1385  DNA repair protein RadA  50 
 
 		 447 aa  423  1e-117  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.674348  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1245  DNA repair protein RadA  52.17 
 
 		 456 aa  424  1e-117  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.579553 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3606  DNA repair protein RadA  50.22 
 
 		 462 aa  422  1e-117  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0927  DNA repair protein RadA  45.95 
 
 		 482 aa  424  1e-117  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1452  DNA repair protein RadA  48.1 
 
 		 478 aa  423  1e-117  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00987951 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2743  DNA repair protein RadA  46.31 
 
 		 453 aa  424  1e-117  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1311  DNA repair protein RadA  52.17 
 
 		 456 aa  422  1e-117  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1372  DNA repair protein RadA  51.88 
 
 		 456 aa  419  1e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.232721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2457  DNA repair protein RadA  52.08 
 
 		 458 aa  420  1e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.108981  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1574  DNA repair protein RadA  52.08 
 
 		 458 aa  420  1e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.700761  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_58  DNA repair protein RadA  49.23 
 
 		 462 aa  419  1e-116  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0584  DNA repair protein RadA  45.44 
 
 		 518 aa  421  1e-116  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.50622  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5347  DNA repair protein RadA  52.31 
 
 		 458 aa  421  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3565  DNA repair protein RadA  51.77 
 
 		 471 aa  419  1e-116  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.946618  normal  0.041039 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2008  DNA repair protein RadA  52.08 
 
 		 458 aa  421  1e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.480875  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0878  DNA repair protein RadA  46.58 
 
 		 457 aa  419  1e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1661  DNA repair protein RadA  51.15 
 
 		 458 aa  421  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0578663  normal  0.050684 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2513  DNA repair protein RadA  52.08 
 
 		 458 aa  420  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.167746  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1487  DNA repair protein RadA  45.62 
 
 		 481 aa  419  1e-116  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.652724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3235  DNA repair protein RadA  52.08 
 
 		 458 aa  420  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.150478  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1349  DNA repair protein RadA  52.08 
 
 		 458 aa  420  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.517323  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0589  DNA repair protein RadA  48.1 
 
 		 451 aa  419  1e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.268839  hitchhiker  1.37134e-16 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2077  DNA repair protein RadA  52.08 
 
 		 458 aa  420  1e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0646051  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0794  DNA repair protein RadA  50.35 
 
 		 477 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4275  DNA repair protein RadA  50.47 
 
 		 455 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.783093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1499  DNA repair protein RadA  48.24 
 
 		 459 aa  415  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4885  DNA repair protein RadA  49.77 
 
 		 455 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1939  DNA repair protein RadA  51.85 
 
 		 458 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.763295 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1239  DNA repair protein RadA  51.85 
 
 		 458 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.873439 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02051  DNA repair protein RadA  48.47 
 
 		 459 aa  418  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169271  normal  0.619218 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1803  DNA repair protein RadA  52.11 
 
 		 452 aa  418  9.999999999999999e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2017  DNA repair protein RadA  48.57 
 
 		 464 aa  417  9.999999999999999e-116  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.404277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0828  DNA repair protein RadA  44.71 
 
 		 453 aa  416  9.999999999999999e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2252  DNA repair protein RadA  49.79 
 
 		 472 aa  417  9.999999999999999e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.130347  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0827  DNA repair protein RadA  47.01 
 
 		 482 aa  417  9.999999999999999e-116  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2070  DNA repair protein RadA  51.85 
 
 		 458 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0157  DNA repair protein RadA  54.66 
 
 		 408 aa  417  9.999999999999999e-116  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>