More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_0225 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_0225  RNA binding S1 domain protein  100 
 
 		 134 aa  256  1e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000584856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0122  RNA-binding S1 domain-containing protein  66.13 
 
 		 126 aa  165  2e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0142  RNA binding S1 domain protein  61.42 
 
 		 128 aa  156  8e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000417569  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0092  RNA binding S1  60.16 
 
 		 130 aa  150  5.9999999999999996e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000304617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2662  RNA binding S1  54.74 
 
 		 140 aa  133  8e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000144376  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3080  RNA binding S1 domain protein  52.11 
 
 		 144 aa  132  1.9999999999999998e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000220475  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0696  hypothetical protein  50.74 
 
 		 140 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000983919  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0075  RNA binding S1 domain protein  55.83 
 
 		 120 aa  127  7.000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000591466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00520  RNA binding S1 domain protein  56.67 
 
 		 124 aa  127  7.000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  6.85433e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0058  hypothetical protein  55.28 
 
 		 132 aa  123  7e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000238948  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2797  hypothetical protein  52.24 
 
 		 134 aa  121  4e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000000939181  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2483  hypothetical protein  52.24 
 
 		 134 aa  121  4e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000579369  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0056  hypothetical protein  54.47 
 
 		 132 aa  120  5e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0056  hypothetical protein  47.55 
 
 		 152 aa  120  7e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000148596  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0146  hypothetical protein  47.33 
 
 		 133 aa  115  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0059  hypothetical protein  45.03 
 
 		 160 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000000544172  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0060  hypothetical protein  45.03 
 
 		 160 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000201317  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0056  hypothetical protein  45.03 
 
 		 160 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  1.61011e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0056  hypothetical protein  45.03 
 
 		 160 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000079318  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0060  hypothetical protein  45.03 
 
 		 160 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000119651  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0067  hypothetical protein  45.03 
 
 		 160 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0543  hypothetical protein  49.62 
 
 		 133 aa  115  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000100816  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0530  hypothetical protein  49.62 
 
 		 133 aa  115  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000417558  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0066  hypothetical protein  44.74 
 
 		 161 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000157952  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0056  hypothetical protein  44.74 
 
 		 161 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000117621  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5250  hypothetical protein  44.74 
 
 		 161 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000341067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0070  hypothetical protein  45.03 
 
 		 160 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000137683  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0653  RNA binding S1 domain protein  52.94 
 
 		 120 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000131287  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0191  RNA binding S1 domain protein  47.58 
 
 		 134 aa  107  4.0000000000000004e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0089  RNA binding S1  42.76 
 
 		 152 aa  105  3e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0265  RNA-binding S1 domain-containing protein  42.86 
 
 		 164 aa  94.7  4e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1301  RNA binding S1 domain protein  41.86 
 
 		 140 aa  89.7  1e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000152887  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0674  RNA binding S1  40 
 
 		 127 aa  84.7  3e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.175739 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1805  RNA-binding S1 domain-containing protein  38.21 
 
 		 123 aa  84.7  4e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000194904  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0066  RNA binding S1 domain protein  43.27 
 
 		 129 aa  82.8  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0265  RNA binding S1 domain-containing protein  43.27 
 
 		 125 aa  81.6  0.000000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.383538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1166  RNA-binding S1 domain-containing protein  39.81 
 
 		 123 aa  81.6  0.000000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000391852  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3511  general stress protein 13  44.23 
 
 		 133 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07900  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  54.17 
 
 		 705 aa  77.8  0.00000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0908  transcriptional accessory protein  50.59 
 
 		 759 aa  76.6  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000019173  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0182  RNA binding S1  55.56 
 
 		 757 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.000000000267713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2252  RNA-binding S1 domain-containing protein  53.42 
 
 		 757 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000694259  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3006  general stress protein 13  44.71 
 
 		 124 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0892  30S ribosomal protein S1  43 
 
 		 399 aa  75.5  0.0000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000236762  decreased coverage  0.00000000000000302812 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0245  S1 RNA-binding domain-containing protein  55.71 
 
 		 861 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.409954  normal  0.0128243 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0260  RNA-binding S1 domain-containing protein  55.71 
 
 		 774 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.217676 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0257  RNA binding S1  52.05 
 
 		 772 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0259  RNA binding S1  52.05 
 
 		 774 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.742809  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1149  RNA-binding S1 domain-containing protein  34.43 
 
 		 124 aa  74.3  0.0000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000879414  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0981  RNA-binding S1 domain-containing protein  34.43 
 
 		 124 aa  74.3  0.0000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000445297  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4967  RNA-binding S1 domain-containing protein  55.71 
 
 		 774 aa  74.3  0.0000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00735813 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5945  hypothetical protein  52.86 
 
 		 779 aa  73.9  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.961122  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68710  hypothetical protein  52.86 
 
 		 779 aa  73.9  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.329631  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0270  RNA-binding S1 domain-containing protein  54.29 
 
 		 774 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05040  transcriptional accessory protein  52.86 
 
 		 770 aa  73.9  0.0000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.948642  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5044  general stress protein 13  50.68 
 
 		 114 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5039  general stress protein 13  50.68 
 
 		 114 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5011  general stress protein 13  50.68 
 
 		 114 aa  73.9  0.0000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4770  general stress protein 13  50.68 
 
 		 114 aa  73.9  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4610  general stress protein 13  50.68 
 
 		 114 aa  73.9  0.0000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4632  general stress protein 13  50.68 
 
 		 114 aa  73.9  0.0000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5032  general stress protein 13  50.68 
 
 		 114 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0608546  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5132  general stress protein 13  50.68 
 
 		 114 aa  73.9  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0202  general stress protein 13  50.68 
 
 		 114 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0358  RNA-binding S1 domain-containing protein  50.7 
 
 		 774 aa  73.6  0.0000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0380  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  45.83 
 
 		 703 aa  73.6  0.0000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00000345435  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4722  general stress protein 13  50.68 
 
 		 114 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0327  S1 RNA binding domain protein  52.86 
 
 		 773 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0541  general stress protein 13  39.56 
 
 		 126 aa  72.4  0.000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001874  transcription accessory protein  48.89 
 
 		 773 aa  72  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3342  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  47.44 
 
 		 722 aa  71.6  0.000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2822  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  47.95 
 
 		 700 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000990055  hitchhiker  0.000418907 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0493  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  50 
 
 		 705 aa  71.6  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000650099  normal  0.24755 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3461  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  50 
 
 		 706 aa  71.6  0.000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2017  polyribonucleotide nucleotidyltransferase  43.53 
 
 		 718 aa  71.6  0.000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000536157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1466  RNA-binding S1 domain-containing protein  39.5 
 
 		 769 aa  71.2  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1085  RNA binding S1 domain protein  50.7 
 
 		 705 aa  71.2  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.972092 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2875  RNA binding S1 domain protein  46.34 
 
 		 791 aa  70.9  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2013  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  48.57 
 
 		 712 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0339212  normal  0.44313 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0464  RNA-binding S1 domain-containing protein  52.86 
 
 		 774 aa  70.9  0.000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1303  RNA binding S1  54.29 
 
 		 765 aa  70.9  0.000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.493241  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0589  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  48.65 
 
 		 706 aa  70.9  0.000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.119802  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3460  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  50 
 
 		 711 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.234004 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3601  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  50 
 
 		 711 aa  70.9  0.000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0442861 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0812  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  48 
 
 		 706 aa  70.9  0.000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.2264  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03031  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  50 
 
 		 734 aa  70.5  0.000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0974  RNA-binding S1 domain-containing protein  37.36 
 
 		 125 aa  70.5  0.000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2860  general stress protein 13  35.54 
 
 		 121 aa  70.5  0.000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0955  RNA-binding S1 domain-containing protein  37.36 
 
 		 125 aa  70.5  0.000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00618  transcriptional accessory protein  41.75 
 
 		 766 aa  70.5  0.000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1493  transcription accessory protein  46.25 
 
 		 767 aa  70.5  0.000000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02982  hypothetical protein  50 
 
 		 734 aa  70.5  0.000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0541  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  50 
 
 		 711 aa  70.5  0.000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0534  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  50 
 
 		 711 aa  70.5  0.000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000544711 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4483  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  50 
 
 		 711 aa  70.5  0.000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3647  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  50 
 
 		 711 aa  70.5  0.000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3607  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  50 
 
 		 711 aa  70.5  0.000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3356  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  50 
 
 		 711 aa  70.5  0.000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5581  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  48.61 
 
 		 715 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.298486  normal  0.0925755 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2170  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  47.3 
 
 		 714 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0402548  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>