More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_0175 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_0175  histidine kinase  100 
 
 		 184 aa  380  1e-105  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2141  histidine kinase  39.77 
 
 		 181 aa  153  2e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3802  histidine kinase  38.6 
 
 		 185 aa  142  3e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1296  histidine kinase  38.38 
 
 		 185 aa  142  4e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0917  histidine kinase  39.77 
 
 		 178 aa  139  1.9999999999999998e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0339  histidine kinase  37.08 
 
 		 188 aa  137  1e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000463655  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2235  histidine kinase  35.96 
 
 		 188 aa  134  9e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0545  histidine kinase  32.98 
 
 		 185 aa  123  2e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0097  histidine kinase  35.56 
 
 		 183 aa  121  4e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000393331 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0915  histidine kinase  33.53 
 
 		 176 aa  92.4  3e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.932987  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1164  histidine kinase  32.79 
 
 		 183 aa  92  4e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00214296  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0805  histidine kinase  37.08 
 
 		 179 aa  90.1  2e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1126  histidine kinase  30.05 
 
 		 183 aa  86.3  2e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000015615  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2579  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36 
 
 		 360 aa  63.9  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2929  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38 
 
 		 360 aa  63.2  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0437  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40.85 
 
 		 412 aa  63.2  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.148474  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2069  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.96 
 
 		 653 aa  62.8  0.000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1434  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38 
 
 		 360 aa  62.4  0.000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3071  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38 
 
 		 360 aa  62.4  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.429893 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2939  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38 
 
 		 360 aa  62.4  0.000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.924574  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4395  histidine kinase  35.58 
 
 		 484 aa  62.4  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.448772  normal  0.535318 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1346  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33 
 
 		 360 aa  62  0.000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3494  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.52 
 
 		 632 aa  61.6  0.000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2061  histidine kinase  32.35 
 
 		 412 aa  61.2  0.000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000174417 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1179  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.58 
 
 		 356 aa  61.2  0.000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1321  ATP-binding region, ATPase-like protein  33 
 
 		 356 aa  60.8  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1339  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33 
 
 		 360 aa  60.8  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.400038 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4457  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.91 
 
 		 661 aa  59.7  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3231  flagellar regulatory protein B  32 
 
 		 360 aa  59.7  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1016  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.46 
 
 		 441 aa  59.7  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0352523 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1650  histidine kinase  42.65 
 
 		 612 aa  59.3  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1279  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32 
 
 		 360 aa  59.3  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0047  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.25 
 
 		 626 aa  59.3  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.928233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2161  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.37 
 
 		 412 aa  58.9  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2924  sensor histidine kinase  48.53 
 
 		 495 aa  57.8  0.00000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.983626 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1311  sensory histidine kinase AtoS  34 
 
 		 614 aa  57.8  0.00000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3074  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.62 
 
 		 378 aa  57  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4825  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.17 
 
 		 582 aa  57  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.924426 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1363  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.38 
 
 		 362 aa  57.4  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1796  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.69 
 
 		 451 aa  57.4  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.323222  normal  0.540644 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4402  histidine kinase  33.33 
 
 		 471 aa  57.4  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.913757  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4409  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.92 
 
 		 585 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1285  Hpt sensor hybrid histidine kinase  29.51 
 
 		 1070 aa  57.4  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.102629  normal  0.010179 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1402  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.1 
 
 		 585 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3565  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.24 
 
 		 641 aa  56.2  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2378  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.07 
 
 		 551 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.81922 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2000  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.02 
 
 		 515 aa  56.2  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0673  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  33.33 
 
 		 1215 aa  57  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5473  sensor protein ZraS  29.46 
 
 		 458 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.548998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1767  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.67 
 
 		 785 aa  57  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0937227 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2632  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.26 
 
 		 510 aa  55.8  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4379  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.74 
 
 		 471 aa  56.2  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0969  sensory histidine kinase AtoS  33.98 
 
 		 622 aa  55.8  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000351141  normal  0.40359 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1555  sensory box histidine kinase/response regulator  32.17 
 
 		 1112 aa  55.5  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2755  periplasmic substrate-binding protein/sensor histidine kinase  29.91 
 
 		 590 aa  55.8  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2496  histidine kinase  30.53 
 
 		 423 aa  55.5  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0459847  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0253  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.38 
 
 		 458 aa  55.5  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0323249  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4246  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 469 aa  55.5  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1360  cellulose binding, type IV  35.09 
 
 		 544 aa  55.8  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0260  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.38 
 
 		 454 aa  55.1  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.018475  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3419  sensor histidine kinase  28.3 
 
 		 774 aa  55.1  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2387  sporulation kinase B  30.53 
 
 		 422 aa  55.5  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0102161  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2115  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 		 604 aa  55.5  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00123104  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4321  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.1 
 
 		 585 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0675  two-component sensor kinase CbrA  47.69 
 
 		 975 aa  55.5  0.0000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1677  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.07 
 
 		 477 aa  55.1  0.0000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1043  histidine kinase  33.01 
 
 		 585 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1966  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.54 
 
 		 492 aa  55.1  0.0000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.917004  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0824  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  41.18 
 
 		 616 aa  55.1  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.125796 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2038  histidine kinase  30.77 
 
 		 552 aa  55.1  0.0000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1727  hypothetical protein  32.69 
 
 		 343 aa  54.7  0.0000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1727  hypothetical protein  32.69 
 
 		 343 aa  54.7  0.0000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2160  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.89 
 
 		 377 aa  54.7  0.0000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0672592 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0110  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.84 
 
 		 592 aa  54.7  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2669  sporulation kinase B  28.57 
 
 		 389 aa  54.7  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.70932  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02433  sensor histide kinase  43.08 
 
 		 482 aa  54.7  0.0000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0197  histidine kinase  29.81 
 
 		 436 aa  54.7  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2426  sporulation kinase B  29.47 
 
 		 422 aa  54.7  0.0000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000668804  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0696  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.58 
 
 		 570 aa  54.7  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2661  sporulation kinase B  29.47 
 
 		 422 aa  54.7  0.0000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000107303 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3990  histidine kinase  28.57 
 
 		 465 aa  54.3  0.0000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2136  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.04 
 
 		 465 aa  54.3  0.0000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2300  flagellar regulatory protein B  34.38 
 
 		 357 aa  54.3  0.0000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.601872 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0260  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.43 
 
 		 458 aa  53.9  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00578995  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2111  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.87 
 
 		 682 aa  53.9  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2712  sporulation kinase B  29.47 
 
 		 422 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2671  sporulation kinase B  29.47 
 
 		 422 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0225198  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0255  histidine kinase  31.43 
 
 		 458 aa  53.9  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.126812  decreased coverage  0.0000137847 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0952  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.18 
 
 		 445 aa  53.9  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4452  sensor protein ZraS  28.57 
 
 		 458 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.260374  hitchhiker  0.000970682 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1751  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.02 
 
 		 671 aa  53.9  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1343  histidine kinase  41.67 
 
 		 468 aa  53.5  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03880  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with ZraR  28.57 
 
 		 458 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0731183  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1768  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.55 
 
 		 576 aa  53.5  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2463  sporulation kinase B  29.47 
 
 		 422 aa  53.5  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.956719  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1083  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.23 
 
 		 986 aa  53.1  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0721424  decreased coverage  0.00000190438 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2644  sporulation kinase B  29.47 
 
 		 422 aa  53.5  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.364917  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4547  sensor protein ZraS  28.57 
 
 		 458 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00542205  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4022  sensor protein ZraS  28.57 
 
 		 458 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.425845  normal  0.0216302 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3571  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.13 
 
 		 455 aa  52.8  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.382959  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>