More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_0160 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_0148  YD repeat protein  94.93 
 
 
765 aa  1293    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0160  YD repeat protein  100 
 
 
2658 aa  5463    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0874  YD repeat protein  48.44 
 
 
1732 aa  1185    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.409966  normal  0.012689 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0132  YD repeat protein  67.82 
 
 
2349 aa  2363    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0152  YD repeat protein  74.92 
 
 
307 aa  467  1e-129  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0137  hypothetical protein  96.2 
 
 
192 aa  370  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1130  wall-associated protein  26.75 
 
 
2225 aa  336  3e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490053  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1275  wall-associated protein, putative  27.95 
 
 
2221 aa  335  6e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3445  wall-associated protein  27.69 
 
 
2178 aa  328  9e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.837931  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1201  wall associated protein, putative  27 
 
 
2246 aa  322  9e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.491377  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1022  wall-associated protein  27.74 
 
 
2224 aa  319  4e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1094  wall-associated protein  27.74 
 
 
2224 aa  319  4e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0876  YD repeat protein  55.26 
 
 
396 aa  279  6e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00249892 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1178  putative wall-associated protein  25.32 
 
 
2224 aa  243  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.811104 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2902  YD repeat protein  29.68 
 
 
1271 aa  199  7e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.729617  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  30.87 
 
 
2096 aa  184  1e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1253  wall-associated protein  27.93 
 
 
765 aa  176  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  27.74 
 
 
1352 aa  176  3.9999999999999995e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1371  YD repeat-containing protein  26.34 
 
 
1959 aa  168  2.0000000000000002e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0009  YD repeat-containing protein  27.17 
 
 
1840 aa  168  2.0000000000000002e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.886586  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1967  YD repeat-containing protein  29.54 
 
 
2486 aa  166  8.000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1373  YD repeat-containing protein  26.28 
 
 
1917 aa  162  8e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0941  YD repeat protein  29.06 
 
 
1467 aa  160  3e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.125138  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0004  YD repeat-containing protein  25.75 
 
 
1942 aa  159  6e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0173  Rhs family protein  27.36 
 
 
1381 aa  159  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1472  YD repeat-containing protein  27.96 
 
 
1600 aa  154  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.059879  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1938  YD repeat protein  29.82 
 
 
678 aa  154  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0129  Rhs family protein  27.89 
 
 
1427 aa  150  3e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1475  YD repeat-containing protein  26.95 
 
 
2294 aa  150  5e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.705972 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3232  YD repeat-containing protein  25.97 
 
 
1669 aa  147  2e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2036  YD repeat-containing protein  27.68 
 
 
3073 aa  145  7e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2443  YD repeat-containing protein  27.39 
 
 
927 aa  140  2e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2042  Rhs family protein  23.9 
 
 
1576 aa  140  4e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.901099  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0346  YD repeat-containing protein  25.89 
 
 
2035 aa  139  7.000000000000001e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3459  YD repeat-containing protein  28.17 
 
 
3193 aa  138  1.9999999999999998e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2808  peptidase C39, bacteriocin processing  25.82 
 
 
1599 aa  136  6e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1452  YD repeat protein  26.95 
 
 
1464 aa  135  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0017  YD repeat protein  26.4 
 
 
738 aa  130  3e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.215545  hitchhiker  0.000002636 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1255  wall-associated protein  37.55 
 
 
504 aa  130  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  27.96 
 
 
2277 aa  129  6e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1206  cell wall-associated protein, putative  34.7 
 
 
400 aa  128  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00333262  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2167  YD repeat-containing protein  25.15 
 
 
2003 aa  126  5e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.154621 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0188  YD repeat-containing protein  26.31 
 
 
1147 aa  126  5e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.336651  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1751  Rhs family protein  25.37 
 
 
1595 aa  124  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2934  YD repeat protein  26.1 
 
 
1953 aa  124  1.9999999999999998e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.601825 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  26.55 
 
 
3027 aa  125  1.9999999999999998e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003490  Rhs family protein  25.41 
 
 
1384 aa  124  3e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1676  Rhs family protein  25.2 
 
 
1586 aa  124  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.143254 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4426  Rhs family protein  23.98 
 
 
1362 aa  124  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.479042 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1946  YD repeat-containing protein  27.05 
 
 
1433 aa  123  4.9999999999999996e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.465933  normal  0.94223 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2437  YD repeat-containing protein  27.68 
 
 
690 aa  122  9.999999999999999e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20520  hypothetical protein  26.3 
 
 
903 aa  122  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000061545  normal  0.488224 
 
 
-
 
NC_002936  DET1472  NHL/RHS/YD repeat-containing protein  26.38 
 
 
1834 aa  121  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4560  YD repeat protein  27.33 
 
 
1485 aa  121  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6268  YD repeat-containing protein  29.18 
 
 
1623 aa  121  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2563  YD repeat-containing protein  25.16 
 
 
1611 aa  119  6e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08820  Rhs family protein  23.95 
 
 
1485 aa  119  7.999999999999999e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0271193  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1132  wall-associated protein  36.8 
 
 
382 aa  119  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0407345  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1050  YD repeat protein  25.62 
 
 
2731 aa  119  8.999999999999998e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0303  YD repeat-containing protein  25.86 
 
 
3273 aa  119  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5438  Rhs family protein  26.85 
 
 
1572 aa  118  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196818  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5146  YD repeat-containing protein  25.81 
 
 
2374 aa  118  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00948  Rhs family protein  26.06 
 
 
1008 aa  118  1.0000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00234387  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06218  Rhs family protein  26.06 
 
 
1008 aa  118  1.0000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.374255  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3576  YD repeat protein  24.62 
 
 
2149 aa  118  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  hitchhiker  0.00854554 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0284  adhesin HecA family  65.12 
 
 
2651 aa  118  2.0000000000000002e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3550  Rhs family protein  24.66 
 
 
1560 aa  117  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.955949 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0347  YD repeat protein  25.81 
 
 
1379 aa  117  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43100  putative Rhs family protein  25.8 
 
 
1614 aa  117  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0535223  normal  0.616257 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05631  RHS Repeat family  25.88 
 
 
1345 aa  116  5e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000440631  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06221  RHS Repeat family  25.88 
 
 
1345 aa  116  5e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0388129  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4370  YD repeat-containing protein  25.86 
 
 
869 aa  115  1.0000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4544  YD repeat protein  23.97 
 
 
1488 aa  115  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0377133  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04760  putative RHS-related protein  25.8 
 
 
788 aa  114  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05695  putative RHS-related protein  25.8 
 
 
788 aa  114  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2251  YD repeat protein  25.04 
 
 
1577 aa  113  4.0000000000000004e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.37026  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6958  YD repeat protein  25.6 
 
 
1495 aa  114  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0165328  normal  0.66981 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5681  RHS protein  22.57 
 
 
1609 aa  114  4.0000000000000004e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2434  RHS protein  23.9 
 
 
1348 aa  113  5e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4142  YD repeat protein  26.04 
 
 
1046 aa  113  5e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32830  hypothetical protein  25.5 
 
 
889 aa  112  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000050197  hitchhiker  0.0000345173 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3108  rhs-related protein  24.34 
 
 
1385 aa  111  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.93941 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0331  Rhs family protein  25.04 
 
 
1568 aa  111  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1283  YD repeat-containing protein  24.46 
 
 
1531 aa  110  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.950777 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3881  YD repeat-containing protein  24.69 
 
 
1386 aa  110  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1441  hypothetical protein  25.33 
 
 
2138 aa  109  6e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05482  putative RHS-related transmembrane protein  26.21 
 
 
1517 aa  108  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.489685  normal  0.876645 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2520  YD repeat-containing protein  24.18 
 
 
1411 aa  108  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0521301  normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1158  YD repeat-containing protein  27.07 
 
 
1517 aa  107  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0480723  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00355  putative RHS-related transmembrane protein  25.67 
 
 
741 aa  107  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1373  integrins alpha chain  27.82 
 
 
1976 aa  108  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0435  YD repeat-containing protein  24.31 
 
 
1527 aa  107  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00763231 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3233  YD repeat protein  23.33 
 
 
1639 aa  108  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.471244  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8635  YD repeat protein  23.07 
 
 
1489 aa  107  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128218  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0460  YD repeat-containing protein  24.07 
 
 
1551 aa  106  6e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.61036  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1310  YD repeat protein  27.5 
 
 
2387 aa  105  9e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05537  putative RHS-related protein  26.01 
 
 
764 aa  105  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.285743  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3519  YD repeat protein  22.86 
 
 
1508 aa  104  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0534715  normal  0.146276 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7071  YD repeat protein  28.23 
 
 
1160 aa  105  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1325  YD repeat protein  25.88 
 
 
2350 aa  105  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>