More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_0059 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_0059  transcription termination factor Rho  100 
 
 
436 aa  884    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.121136  hitchhiker  0.0035916 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3174  transcription termination factor Rho  74.94 
 
 
450 aa  652    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000371975  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2408  transcription termination factor Rho  71.88 
 
 
425 aa  617  1e-176  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000414081  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2402  transcription termination factor Rho  72.08 
 
 
429 aa  594  1e-169  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0058  transcription termination factor Rho  71.07 
 
 
458 aa  592  1e-168  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00215813  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2173  transcription termination factor Rho  75.33 
 
 
492 aa  586  1e-166  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3329  transcription termination factor Rho  69.16 
 
 
424 aa  580  1e-164  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000488877  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3439  transcription termination factor Rho  68.26 
 
 
424 aa  577  1.0000000000000001e-163  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2782  transcription termination factor Rho  66.99 
 
 
434 aa  577  1.0000000000000001e-163  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000423025  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3853  transcription termination factor Rho  70.44 
 
 
423 aa  575  1.0000000000000001e-163  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000371532  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5460  transcription termination factor Rho  69.46 
 
 
423 aa  569  1e-161  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000364812  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5181  transcription termination factor Rho  69.21 
 
 
423 aa  568  1e-161  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.21574  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5016  transcription termination factor Rho  69.46 
 
 
423 aa  570  1e-161  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.88034e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5032  transcription termination factor Rho  69.46 
 
 
423 aa  570  1e-161  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00629962  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5130  transcription termination factor Rho  69.46 
 
 
423 aa  570  1e-161  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000119523  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5510  transcription termination factor Rho  69.46 
 
 
423 aa  569  1e-161  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000155234  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18010  transcription termination factor Rho  67.97 
 
 
418 aa  568  1e-161  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000155456  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5424  transcription termination factor Rho  69.46 
 
 
423 aa  570  1e-161  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.80667e-59 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5575  transcription termination factor Rho  69.21 
 
 
423 aa  568  1e-161  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000155129  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5455  transcription termination factor Rho  69.46 
 
 
423 aa  570  1e-161  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000522794  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5497  transcription termination factor Rho  69.46 
 
 
423 aa  570  1e-161  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000613532  unclonable  1.32525e-25 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3229  transcription termination factor Rho  65.38 
 
 
415 aa  562  1.0000000000000001e-159  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000000548676  normal  0.0477745 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1711  transcription termination factor Rho  64.82 
 
 
437 aa  562  1.0000000000000001e-159  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000145962  normal  0.971448 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3713  transcription termination factor Rho  64.1 
 
 
415 aa  556  1e-157  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000184202  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3808  transcription termination factor Rho  64.66 
 
 
415 aa  555  1e-157  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2695  transcription termination factor Rho  63.37 
 
 
415 aa  548  1e-155  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000315458  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4065  transcription termination factor Rho  63.86 
 
 
415 aa  551  1e-155  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000187673  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2651  transcription termination factor Rho  63.61 
 
 
415 aa  550  1e-155  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000111099  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0376  transcription termination factor Rho  63.13 
 
 
415 aa  542  1e-153  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000395561  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3108  transcription termination factor Rho  62.89 
 
 
415 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0843  transcription termination factor Rho  63.17 
 
 
415 aa  539  9.999999999999999e-153  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.0000000000858809  normal  0.0802102 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1025  transcription termination factor Rho  61.93 
 
 
415 aa  535  1e-151  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0252595  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3710  transcription termination factor Rho  61.59 
 
 
445 aa  533  1e-150  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.238599  hitchhiker  0.000000242256 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2875  transcription termination factor Rho  61.99 
 
 
414 aa  531  1e-150  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000596182  hitchhiker  0.0000000051711 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3222  transcription termination factor Rho  61.35 
 
 
444 aa  525  1e-148  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.584785  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3627  transcription termination factor Rho  60.48 
 
 
420 aa  524  1e-147  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.2483  normal  0.795626 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0470  transcription termination factor Rho  61.95 
 
 
414 aa  524  1e-147  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000467448  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3377  transcription termination factor Rho  59.66 
 
 
416 aa  523  1e-147  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000542218  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0391  transcription termination factor Rho  62.62 
 
 
429 aa  519  1e-146  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000575661  normal  0.0124015 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0323  transcription termination factor Rho  62.38 
 
 
429 aa  518  1e-146  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0180092  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1756  transcription termination factor Rho  62.14 
 
 
429 aa  518  1e-146  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.147978  normal  0.349316 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0677  transcription termination factor Rho  60.98 
 
 
415 aa  520  1e-146  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000284119  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0424  transcription termination factor Rho  61.59 
 
 
429 aa  519  1e-146  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00623615  normal  0.0254414 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0491  transcription termination factor Rho  60.19 
 
 
416 aa  518  1e-146  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000212536 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0137  transcription termination factor Rho  60.96 
 
 
421 aa  519  1e-146  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000246562  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0393  transcription termination factor Rho  62.14 
 
 
429 aa  519  1e-146  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.023811  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1503  transcription termination factor Rho  63.31 
 
 
548 aa  516  1.0000000000000001e-145  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000037905  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0427  transcription termination factor Rho  61.41 
 
 
429 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000196448  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2210  transcription termination factor Rho  59.71 
 
 
418 aa  512  1e-144  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000272927  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0459  transcription termination factor Rho  61.41 
 
 
429 aa  514  1e-144  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1339  transcription termination factor Rho  60 
 
 
642 aa  513  1e-144  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2184  transcription termination factor Rho  59.71 
 
 
418 aa  512  1e-144  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.000000392995  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2174  transcription termination factor Rho  67.41 
 
 
653 aa  514  1e-144  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000672374  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1728  transcription termination factor Rho  63.66 
 
 
438 aa  508  1e-143  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00025665  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2130  transcription termination factor Rho  58.88 
 
 
503 aa  508  1e-143  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00148034  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3619  transcription termination factor Rho  60.29 
 
 
418 aa  508  1e-143  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1562  transcription termination factor Rho  58.65 
 
 
449 aa  508  1e-143  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.135636  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1456  transcription termination factor Rho  58.74 
 
 
431 aa  509  1e-143  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00134709  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0367  transcription termination factor Rho  59.33 
 
 
418 aa  508  1e-143  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.151601 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2835  transcription termination factor Rho  57.42 
 
 
418 aa  504  9.999999999999999e-143  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.182498 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2055  transcription termination factor Rho  58.95 
 
 
419 aa  505  9.999999999999999e-143  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.224008  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2195  transcription termination factor Rho  62.16 
 
 
438 aa  507  9.999999999999999e-143  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00569958  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1260  transcription termination factor Rho  59.47 
 
 
422 aa  507  9.999999999999999e-143  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2157  transcription termination factor Rho  62.16 
 
 
438 aa  507  9.999999999999999e-143  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.894966  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2309  transcription termination factor Rho  66.94 
 
 
518 aa  501  1e-141  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0139277  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2085  transcription termination factor Rho  58.85 
 
 
419 aa  501  1e-141  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2469  transcription termination factor Rho  58 
 
 
419 aa  504  1e-141  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0734  transcription termination factor Rho  59.76 
 
 
437 aa  501  1e-141  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3081  transcription termination factor Rho  57.38 
 
 
484 aa  501  1e-141  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0725  transcription termination factor Rho  60.05 
 
 
417 aa  498  1e-140  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0807  transcription termination factor Rho  58.61 
 
 
418 aa  501  1e-140  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0726  transcription termination factor Rho  60.05 
 
 
417 aa  498  1e-140  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.578535  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1824  transcription termination factor Rho  59.81 
 
 
422 aa  500  1e-140  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0768704 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3376  transcription termination factor Rho  66.3 
 
 
690 aa  500  1e-140  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000138614  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0690  transcription termination factor Rho  59.28 
 
 
437 aa  500  1e-140  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0120  transcription termination factor Rho  57.42 
 
 
418 aa  499  1e-140  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.342043  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2290  transcription termination factor Rho  58.23 
 
 
419 aa  501  1e-140  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000767102  normal  0.288713 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0658  transcription termination factor Rho  58.61 
 
 
418 aa  501  1e-140  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1393  transcription termination factor Rho  57.21 
 
 
423 aa  495  1e-139  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.107129  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2668  transcription termination factor Rho  58.41 
 
 
422 aa  495  1e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.169241  normal  0.40239 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0037  transcription termination factor Rho  56.94 
 
 
419 aa  495  1e-139  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.245355 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1231  transcription termination factor Rho  58.17 
 
 
422 aa  495  1e-139  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.287939  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0393  transcription termination factor Rho  58.17 
 
 
421 aa  494  1e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.557794 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0358  transcription termination factor Rho  57.18 
 
 
419 aa  496  1e-139  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.956758  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3991  transcription termination factor Rho  57.48 
 
 
421 aa  494  1e-139  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.800219  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5982  transcription termination factor Rho  58.13 
 
 
419 aa  495  1e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2845  transcription termination factor Rho  56.94 
 
 
418 aa  496  1e-139  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.495163  normal  0.0341841 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4223  transcription termination factor Rho  57.38 
 
 
433 aa  497  1e-139  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0343455  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2699  transcription termination factor Rho  58.61 
 
 
419 aa  496  1e-139  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000370225  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69190  transcription termination factor Rho  58.13 
 
 
419 aa  495  1e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2892  transcription termination factor Rho  58.17 
 
 
422 aa  495  1e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3932  transcription termination factor Rho  57.21 
 
 
421 aa  491  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.713144  normal  0.45905 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1126  transcription termination factor Rho  57.38 
 
 
420 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.722702  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2064  transcription termination factor Rho  57.93 
 
 
421 aa  492  9.999999999999999e-139  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.244754  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0301  transcription termination factor Rho  58.13 
 
 
419 aa  491  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2998  transcription termination factor Rho  56.94 
 
 
419 aa  493  9.999999999999999e-139  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0194587  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2217  transcription termination factor Rho  57.38 
 
 
420 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0809447  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5123  transcription termination factor Rho  58.13 
 
 
419 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.763827 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3656  transcription termination factor Rho  57.18 
 
 
419 aa  493  9.999999999999999e-139  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.04416  normal  0.624434 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1984  transcription termination factor Rho  57.93 
 
 
418 aa  493  9.999999999999999e-139  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>