28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_0027 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_0027  Pyrrolysine-tRNA ligase  100 
 
 
278 aa  573  1.0000000000000001e-162  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4858  tRNA synthetase class II (G H P and S)  57.91 
 
 
279 aa  341  7e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2086  pyrolysyl-tRNA synthetase  37.32 
 
 
416 aa  192  6e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00625446  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0839  pyrolysyl-tRNA synthetase  33.7 
 
 
419 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1397  Histidine--tRNA ligase  31.58 
 
 
424 aa  47.8  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000267418  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0537  O-phosphoseryl-tRNA synthetase  25.32 
 
 
526 aa  47.4  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.79062 
 
 
-
 
NC_002978  WD0978  threonyl-tRNA synthetase  25.79 
 
 
633 aa  46.2  0.0005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0006  threonyl-tRNA synthetase  31.31 
 
 
633 aa  46.6  0.0005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.999215  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1028  lysyl-tRNA synthetase  32.64 
 
 
510 aa  46.2  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.296051  normal  0.894371 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0186  phenylalanyl-tRNA synthetase, alpha subunit  28.79 
 
 
486 aa  45.1  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0534122  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0958  lysyl-tRNA synthetase  33.57 
 
 
514 aa  45.4  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0760523 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1070  lysyl-tRNA synthetase  31.25 
 
 
516 aa  45.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0893  lysyl-tRNA synthetase  33.57 
 
 
514 aa  45.4  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.246749  normal  0.0933962 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7134  threonyl-tRNA synthetase  33.68 
 
 
404 aa  44.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.713185 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1034  lysyl-tRNA synthetase  30.56 
 
 
515 aa  43.9  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.269597 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0934  threonyl-tRNA synthetase  31 
 
 
633 aa  43.9  0.003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.026136  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0851  threonyl-tRNA synthetase  28.04 
 
 
646 aa  43.9  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2039  threonyl-tRNA synthetase  28.04 
 
 
646 aa  43.5  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0385  threonyl-tRNA synthetase  28.04 
 
 
646 aa  43.9  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.752042  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2281  threonyl-tRNA synthetase  28.03 
 
 
684 aa  43.5  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2289  threonyl-tRNA synthetase  28.03 
 
 
684 aa  43.5  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.45784  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2242  threonyl-tRNA synthetase  28.03 
 
 
684 aa  43.5  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0173806  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0420  lysyl-tRNA synthetase  28.48 
 
 
325 aa  42.7  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000643447 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3487  threonyl-tRNA synthetase  29.59 
 
 
643 aa  42.7  0.007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0599  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  23.53 
 
 
392 aa  42.4  0.009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.38894  normal  0.541606 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3166  histidyl-tRNA synthetase  21.34 
 
 
420 aa  42.4  0.009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.218543  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0472  threonyl-tRNA synthetase  28.28 
 
 
642 aa  42  0.01  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.158793  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1577  threonyl-tRNA synthetase  28.57 
 
 
635 aa  42  0.01  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.704052  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>