103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_0003 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_0003  RNA-binding S4 domain protein  100 
 
 		 71 aa  142  2e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.518781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0003  RNA-binding S4 domain-containing protein  60 
 
 		 70 aa  70.5  0.000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.212549  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2373  RNA-binding S4  52.63 
 
 		 68 aa  68.6  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09031  hypothetical protein  55.17 
 
 		 82 aa  66.2  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2293  RNA-binding S4 domain protein  52.46 
 
 		 70 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.26047 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1550  S4 domain protein YaaA  62 
 
 		 71 aa  63.9  0.0000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.715034  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10421  S4 domain-containing protein  62.5 
 
 		 58 aa  62.8  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.507688  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10421  S4 domain-containing protein  62.5 
 
 		 58 aa  62.8  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0464  S4 domain-containing protein  52.94 
 
 		 71 aa  60.8  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0103248  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0972  RNA-binding S4  60.42 
 
 		 58 aa  61.2  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09391  S4 domain-containing protein  52.83 
 
 		 69 aa  60.8  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000185916 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1824  RNA-binding S4  59.18 
 
 		 73 aa  59.7  0.00000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13901  S4 domain-containing protein  56.86 
 
 		 65 aa  59.7  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.453758 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0003  RNA-binding S4  49.12 
 
 		 64 aa  59.3  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000218407  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0098  RNA-binding S4  52.94 
 
 		 65 aa  58.5  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000456096  normal  0.262898 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0081  RNA-binding S4  49.12 
 
 		 69 aa  58.5  0.00000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1437  RNA-binding S4 domain-containing protein  60 
 
 		 62 aa  58.2  0.00000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.614466  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00030  RNA-binding S4 domain protein  60 
 
 		 72 aa  58.2  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0383  RNA-binding S4  44.26 
 
 		 72 aa  57.4  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0414  RNA-binding S4 domain protein  54 
 
 		 65 aa  57.4  0.00000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1607  RNA-binding S4 domain protein  49.02 
 
 		 76 aa  57.4  0.00000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.932623 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4907  RNA-binding S4  50.88 
 
 		 68 aa  56.6  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.93545  normal  0.42321 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0831  hypothetical protein  58.33 
 
 		 91 aa  56.6  0.0000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.366919  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10651  S4 domain-containing protein  44.26 
 
 		 72 aa  56.6  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0278753 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0003  RNA-binding S4 domain-containing protein  56 
 
 		 68 aa  56.2  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3539  RNA-binding S4 domain-containing protein  50 
 
 		 67 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0130697 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0004  RNA-binding S4  46.55 
 
 		 61 aa  55.8  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000361246  hitchhiker  0.0000000730719 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0003  RNA-binding S4 domain protein  47.37 
 
 		 71 aa  55.8  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.241542  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3096  RNA-binding S4  49.02 
 
 		 72 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3156  RNA-binding S4 domain-containing protein  49.02 
 
 		 72 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.914223  normal  0.39579 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1301  RNA-binding S4 domain protein  50 
 
 		 77 aa  54.7  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.517293  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3116  RNA-binding S4 domain-containing protein  49.02 
 
 		 72 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.147068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0173  S4 domain protein YaaA  48 
 
 		 72 aa  54.3  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.563705  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0126  RNA-binding S4 domain protein  49.02 
 
 		 76 aa  53.9  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.564525  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1693  RNA-binding S4 domain-containing protein  50.98 
 
 		 84 aa  53.1  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0200012  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0342  RNA-binding S4 domain-containing protein  49.02 
 
 		 65 aa  53.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000486446  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5767  hypothetical protein  47.54 
 
 		 72 aa  53.5  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.401314 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2770  RNA-binding S4 domain-containing protein  52.08 
 
 		 78 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.013443  normal  0.790943 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3548  RNA-binding S4 domain protein  43.86 
 
 		 61 aa  52.8  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.101956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3479  RNA-binding S4  44.07 
 
 		 74 aa  51.6  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2576  RNA-binding S4 domain protein  48.28 
 
 		 71 aa  51.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0003  S4 domain protein YaaA  44.07 
 
 		 76 aa  52  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0313437  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3643  RNA-binding S4 domain-containing protein  50 
 
 		 80 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.252029  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0112  RNA-binding S4 domain protein  48 
 
 		 80 aa  51.2  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.361623  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22660  hypothetical protein  46 
 
 		 72 aa  50.8  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.294703  normal  0.222073 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1088  RNA-binding S4 domain protein  50 
 
 		 84 aa  50.4  0.000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.115578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0002  RNA-binding S4 domain protein  40.68 
 
 		 70 aa  50.4  0.000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000678168  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6817  hypothetical protein  50 
 
 		 65 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3530  RNA-binding S4 domain protein  48.28 
 
 		 71 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0053  RNA-binding S4 domain protein  46.94 
 
 		 74 aa  49.7  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.525969  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1729  RNA-binding S4 domain protein  50 
 
 		 91 aa  49.3  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0180543  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0618  RNA-binding S4 domain-containing protein  43.33 
 
 		 70 aa  48.5  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.109181  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1365  RNA-binding S4 domain protein  54 
 
 		 77 aa  48.5  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000548467 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06080  hypothetical protein  44.9 
 
 		 80 aa  48.1  0.00004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0041  RNA-binding S4 domain protein  44.9 
 
 		 67 aa  48.1  0.00004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0003  S4 domain-containing protein  40.35 
 
 		 68 aa  47.8  0.00005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0003  S4 domain-containing protein  40.35 
 
 		 68 aa  47.8  0.00005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0046  hypothetical protein  48 
 
 		 74 aa  47.8  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1328  RNA-binding S4 domain-containing protein  52 
 
 		 92 aa  47  0.00009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0003  hypothetical protein  42.37 
 
 		 74 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.239482  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0003  hypothetical protein  42.37 
 
 		 74 aa  45.8  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0003  hypothetical protein  42.37 
 
 		 74 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1647  RNA-binding S4  44.23 
 
 		 66 aa  45.8  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.396094  normal  0.423975 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0003  hypothetical protein  42.03 
 
 		 70 aa  46.2  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0881433  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0003  S4 region YaaA family protein  46 
 
 		 70 aa  45.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2551  hypothetical protein  38.1 
 
 		 78 aa  45.1  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.28368  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0003  hypothetical protein  42.37 
 
 		 70 aa  45.4  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0003  hypothetical protein  42.37 
 
 		 70 aa  45.4  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.674518  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0003  hypothetical protein  42.37 
 
 		 70 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000693166  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0003  hypothetical protein  42.37 
 
 		 70 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.28946 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05955  hypothetical protein  37.5 
 
 		 179 aa  44.7  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000219  hypothetical protein  37.5 
 
 		 177 aa  44.7  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0366  hypothetical protein  34.48 
 
 		 128 aa  44.3  0.0007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1224  hypothetical protein  34.62 
 
 		 73 aa  43.9  0.0007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0985687 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0409  hypothetical protein  37.93 
 
 		 135 aa  43.9  0.0007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000857637  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2237  hypothetical protein  38.71 
 
 		 120 aa  43.9  0.0008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1502  RNA-binding S4  31.03 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5317  hypothetical protein  38.98 
 
 		 70 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0232645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0003  RNA-binding S4 domain-containing protein  42.37 
 
 		 71 aa  42.4  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04773  hypothetical protein  36.84 
 
 		 80 aa  42.4  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0003  hypothetical protein  38.98 
 
 		 70 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000654454  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0003  S4 domain protein YaaA  44.26 
 
 		 73 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000126771  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0503  hypothetical protein  32.69 
 
 		 73 aa  41.6  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000422283  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2938  hypothetical protein  32.69 
 
 		 73 aa  41.6  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196039  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1687  hypothetical protein  32.69 
 
 		 73 aa  42  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.643727  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2510  hypothetical protein  32.69 
 
 		 73 aa  41.6  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000911795  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2771  hypothetical protein  32.69 
 
 		 73 aa  41.6  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00316834  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2823  hypothetical protein  32.69 
 
 		 73 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0464209  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2884  hypothetical protein  32.69 
 
 		 73 aa  41.6  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.120593  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1834  hypothetical protein  32.69 
 
 		 73 aa  41.6  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0149554  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0526  hypothetical protein  37.93 
 
 		 160 aa  41.6  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0003  S4 region, YaaA  34.92 
 
 		 78 aa  41.6  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0386838  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0003  S4 region YaaA family protein  34.92 
 
 		 78 aa  41.6  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0799775  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4205  hypothetical protein  32.69 
 
 		 72 aa  41.2  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00355095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0613  hypothetical protein  32.69 
 
 		 87 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1092  hypothetical protein  32.69 
 
 		 87 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0115858  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2197  hypothetical protein  44 
 
 		 83 aa  41.2  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.330181 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1051  hypothetical protein  32.69 
 
 		 87 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.751549  normal  0.509643 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3089  RNA-binding S4 domain-containing protein  42.55 
 
 		 98 aa  40.8  0.006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0414  RNA-binding S4 domain protein  54 
 
 		 65 aa  40.8  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0499509  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>