More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_0001 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  100 
 
 
446 aa  915    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000208181  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0001  chromosomal replication initiation protein  61.29 
 
 
441 aa  555  1e-157  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000247534  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  58.04 
 
 
453 aa  536  1e-151  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000208022  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0001  chromosomal replication initiation protein  56.99 
 
 
457 aa  528  1e-149  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000597417  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0001  chromosomal replication initiation protein  57.17 
 
 
457 aa  528  1e-148  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000458864  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0001  chromosomal replication initiation protein  58.31 
 
 
445 aa  521  1e-147  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00343862  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0001  chromosomal replication initiation protein  56.21 
 
 
446 aa  514  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000594007  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0001  chromosomal replication initiation protein  57.05 
 
 
443 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00172749  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0001  chromosomal replication initiation protein  55.13 
 
 
450 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5319  chromosomal replication initiation protein  55.81 
 
 
446 aa  515  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.679479  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0001  chromosomal replication initiation protein  56.21 
 
 
446 aa  514  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000184902  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0001  chromosomal replication initiation protein  55.16 
 
 
450 aa  514  1.0000000000000001e-145  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000447845  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0001  chromosomal replication initiation protein  55.81 
 
 
446 aa  514  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000585905  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  56.82 
 
 
444 aa  514  1e-144  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0001  chromosomal replication initiation protein  56.21 
 
 
446 aa  514  1e-144  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000244098  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0001  chromosomal replication initiation protein  56.21 
 
 
446 aa  514  1e-144  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000163866  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0001  chromosomal replication initiation protein  56.21 
 
 
446 aa  514  1e-144  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000459109  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0001  chromosomal replication initiation protein  55.81 
 
 
446 aa  512  1e-144  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.562714  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0001  chromosomal replication initiation protein  55.58 
 
 
446 aa  512  1e-144  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000325337  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0001  chromosomal replication initiation protein  56.21 
 
 
446 aa  514  1e-144  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000425777  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0002  chromosomal replication initiation protein  56.85 
 
 
442 aa  512  1e-144  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0135977  hitchhiker  0.0000101386 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0001  chromosomal replication initiation protein  56.21 
 
 
446 aa  514  1e-144  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00010  chromosomal replication initiator protein DnaA  54.85 
 
 
463 aa  505  9.999999999999999e-143  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00536902  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0001  chromosomal replication initiation protein  56.24 
 
 
440 aa  506  9.999999999999999e-143  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000118947  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  56.4 
 
 
443 aa  504  1e-141  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2371  chromosomal replication initiation protein  57.5 
 
 
443 aa  498  1e-139  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0166544  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  54.59 
 
 
449 aa  495  1e-139  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141272  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0001  initiation of chromosome replication  54.11 
 
 
436 aa  493  9.999999999999999e-139  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  52.97 
 
 
454 aa  489  1e-137  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00039195  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2553  chromosomal replication initiation protein  52.12 
 
 
451 aa  470  1.0000000000000001e-131  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000248403  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  53.91 
 
 
453 aa  468  1.0000000000000001e-131  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0001  chromosomal replication initiation protein  51.22 
 
 
453 aa  461  9.999999999999999e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.101414  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0001  chromosomal replication initiation protein  51.22 
 
 
453 aa  461  9.999999999999999e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000795473  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  53.85 
 
 
454 aa  460  9.999999999999999e-129  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000331762  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0000.1  chromosomal replication initiation protein  48.06 
 
 
445 aa  450  1e-125  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.159401  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0001  chromosomal replication initiation protein  48.09 
 
 
450 aa  445  1.0000000000000001e-124  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0001  chromosomal replication initiation protein  47.82 
 
 
458 aa  442  1e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000304436  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0001  chromosomal replication initiation protein  48.66 
 
 
449 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0001  chromosomal replication initiation protein  47.17 
 
 
460 aa  437  1e-121  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  58.88 
 
 
591 aa  432  1e-120  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.000633656  unclonable  0.0000000292755 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  58.88 
 
 
587 aa  434  1e-120  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00000000718914  hitchhiker  0.000588843 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  49.89 
 
 
450 aa  434  1e-120  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000842824  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  47.79 
 
 
461 aa  429  1e-119  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000000704659  normal  0.0525005 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0001  chromosomal replication initiation protein  48.78 
 
 
452 aa  425  1e-118  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.98376e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0001  chromosomal replication initiation protein  45.16 
 
 
472 aa  428  1e-118  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000368077  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0001  chromosomal replication initiation protein  47.36 
 
 
470 aa  421  1e-116  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000177247  normal  0.980205 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  48.3 
 
 
439 aa  420  1e-116  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000109214  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0827  chromosomal replication initiation protein  50.86 
 
 
492 aa  419  1e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0001  chromosomal replication initiation protein  53.7 
 
 
495 aa  415  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0454037 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0009  chromosomal replication initiation protein  53.7 
 
 
495 aa  415  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.166715  normal  0.0809665 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0001  chromosomal replication initiation protein  44.49 
 
 
478 aa  418  9.999999999999999e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000339822  hitchhiker  0.0000314878 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0001  chromosomal replication initiation protein  53.7 
 
 
495 aa  415  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  48.18 
 
 
439 aa  418  9.999999999999999e-116  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00780596  normal  0.982574 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0001  chromosomal replication initiation protein  44.09 
 
 
480 aa  416  9.999999999999999e-116  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000170377  unclonable  0.000000000650471 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0001  chromosomal replication initiation protein  54.12 
 
 
494 aa  414  1e-114  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.124904  normal  0.26229 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0001  chromosomal replication initiation protein  43.37 
 
 
481 aa  413  1e-114  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000056365  unclonable  0.0000112062 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  56.93 
 
 
509 aa  412  1e-114  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0001  chromosomal replication initiation protein  45.5 
 
 
459 aa  409  1e-113  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000386226  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0001  chromosomal replication initiation protein  48.1 
 
 
453 aa  409  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0003  chromosomal replication initiation protein  45.47 
 
 
453 aa  408  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0001  chromosomal replication initiation protein  45.25 
 
 
453 aa  406  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.755155  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  49.22 
 
 
480 aa  408  1.0000000000000001e-112  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  58.04 
 
 
566 aa  402  1e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.0000150843  normal  0.201816 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00010  chromosomal replication initiation protein  54.31 
 
 
597 aa  402  1e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.000000278732  normal  0.616682 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  51.93 
 
 
473 aa  398  9.999999999999999e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000000284064 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0001  chromosomal replication initiation protein  46.59 
 
 
451 aa  401  9.999999999999999e-111  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.000000000123931  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0001  chromosomal replication initiation protein  46.59 
 
 
451 aa  401  9.999999999999999e-111  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00187127  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  59.82 
 
 
527 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0861644  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  45.13 
 
 
456 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0001  chromosomal replication initiation protein  45.23 
 
 
460 aa  396  1e-109  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.831436  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0001  chromosomal replication initiation protein  44.25 
 
 
456 aa  395  1e-109  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0198  chromosomal replication initiation protein  42.95 
 
 
460 aa  397  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00733858  normal  0.0821352 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  58.04 
 
 
721 aa  396  1e-109  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000423182  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  57.57 
 
 
528 aa  398  1e-109  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.561876  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  51.7 
 
 
474 aa  395  1e-108  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00000398294  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  44.27 
 
 
461 aa  389  1e-107  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.926832  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00010  chromosomal replication initiator protein DnaA  57.06 
 
 
506 aa  389  1e-107  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  46.38 
 
 
447 aa  390  1e-107  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0001  chromosomal replication initiation protein  56.51 
 
 
577 aa  389  1e-107  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0108959  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00010  chromosomal replication initiator protein DnaA  57.26 
 
 
515 aa  392  1e-107  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  47.3 
 
 
489 aa  391  1e-107  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0001  DNA replication initiation ATPase- like protein  58.63 
 
 
582 aa  389  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00000523076  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0001  chromosomal replication initiation protein  42.86 
 
 
452 aa  386  1e-106  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0001  chromosomal replication initiation protein  42.86 
 
 
452 aa  386  1e-106  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0001  chromosomal replication initiation protein  56.53 
 
 
615 aa  387  1e-106  Thermobifida fusca YX  Bacteria  unclonable  0.000000000479277  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  59.52 
 
 
570 aa  387  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000116219  normal  0.231349 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10001  chromosomal replication initiation protein  56.85 
 
 
507 aa  386  1e-106  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0001  chromosomal replication initiation protein  56.51 
 
 
557 aa  384  1e-105  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00010  chromosomal replication initiator protein DnaA  44.7 
 
 
490 aa  384  1e-105  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1100  chromosomal replication initiation protein  41.14 
 
 
482 aa  382  1e-105  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.018395 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4153  chromosomal replication initiation protein  42.7 
 
 
462 aa  382  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  7.6269e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  57.69 
 
 
518 aa  383  1e-105  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.7384  hitchhiker  0.00538334 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0032  chromosomal replication initiation protein  43.27 
 
 
463 aa  384  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000217775  normal  0.251102 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  41.38 
 
 
480 aa  384  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0206444  normal  0.0774659 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05681  chromosomal replication initiation protein  42.83 
 
 
454 aa  384  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.263255  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0001  chromosomal replication initiation protein  42.47 
 
 
460 aa  382  1e-105  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000179736  unclonable  0.0000000000313535 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4177  chromosomal replication initiation protein  42.7 
 
 
462 aa  382  1e-105  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510804  normal  0.0257346 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  57.57 
 
 
652 aa  382  1e-105  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.00000505913  hitchhiker  0.00770539 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0001  chromosomal replication initiation protein  41.69 
 
 
462 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000562887  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0001  chromosomal replication initiation protein  50.28 
 
 
524 aa  379  1e-104  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0237228  normal  0.131634 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>