More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_4169 on replicon NC_009959
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009959  Dshi_4169  cytochrome B561  100 
 
 		 185 aa  368  1e-101  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0139606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0302  cytochrome B561  61.24 
 
 		 181 aa  204  6e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4356  cytochrome B561  54.4 
 
 		 182 aa  179  2e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3670  cytochrome B561  50.88 
 
 		 178 aa  160  8.000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.380007  normal  0.0318656 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1020  cytochrome B561  39.76 
 
 		 191 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000282036 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2549  cytochrome B561  38.51 
 
 		 182 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.481387  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4984  cytochrome B561  38.07 
 
 		 179 aa  111  5e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0448124 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1272  cytochrome B561  37.36 
 
 		 190 aa  110  1.0000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.0192884 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0259  cytochrome B561  37.5 
 
 		 178 aa  109  3e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0714  cytochrome B561  37.71 
 
 		 186 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0230  cytochrome B561  37.71 
 
 		 186 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0681  cytochrome B561  37.79 
 
 		 186 aa  108  6e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.400799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2036  cytochrome B561  40.34 
 
 		 193 aa  107  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.625854 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1861  cytochrome B561  35.63 
 
 		 178 aa  106  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.846018  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0014  cytochrome B561  36.21 
 
 		 176 aa  105  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0030  cytochrome B561  35.8 
 
 		 177 aa  105  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000693928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0508  cytochrome B561  34.76 
 
 		 191 aa  105  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3507  cytochrome B561  39.55 
 
 		 185 aa  105  3e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.563423 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0006  cytochrome B561  36.21 
 
 		 176 aa  105  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000161036  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2671  cytochrome B561  35.96 
 
 		 186 aa  105  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0005  cytochrome B561  35.23 
 
 		 177 aa  105  5e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0183044 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2358  cytochrome B561  37.08 
 
 		 178 aa  104  8e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.289419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1521  cytochrome B561  35.06 
 
 		 182 aa  104  8e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0009  cytochrome B561  35.63 
 
 		 176 aa  104  9e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000000853372  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0062  cytochrome B561  35.63 
 
 		 176 aa  104  9e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000272347  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1636  hypothetical protein  33.69 
 
 		 184 aa  103  2e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0965469  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3195  cytochrome B561  34.48 
 
 		 176 aa  102  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.0000000000038673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3802  cytochrome B561  36.63 
 
 		 186 aa  102  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0605  cytochrome B561  36.05 
 
 		 186 aa  102  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0296  cytochrome B561  36.63 
 
 		 174 aa  102  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000303628  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0086  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  36.63 
 
 		 175 aa  102  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.083674  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3152  cytochrome B561  37.06 
 
 		 197 aa  102  4e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.159258  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0086  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  36.63 
 
 		 175 aa  101  5e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2064  putative cytochrome b-561 membrane protein  33.91 
 
 		 184 aa  101  7e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.913396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0761  cytochrome B561  31.4 
 
 		 204 aa  100  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.599963 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1056  cytochrome B561  34.09 
 
 		 181 aa  100  1e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.52465  normal  0.404456 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2886  cytochrome B561  41.67 
 
 		 177 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0147593  normal  0.995623 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0073  cytochrome b561, putative  36.05 
 
 		 175 aa  99.8  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.475436  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0629  cytochrome B561  35.47 
 
 		 186 aa  99.8  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1404  cytochrome B561  38.95 
 
 		 179 aa  99.8  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.610566  normal  0.317054 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2804  cytochrome B561  41.07 
 
 		 177 aa  99  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.850837  normal  0.374097 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0706  cytochrome B561  36.26 
 
 		 186 aa  98.2  6e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.404491  normal  0.794115 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1026  cytochrome B561  41.11 
 
 		 188 aa  97.8  7e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5858  cytochrome B561  33.33 
 
 		 184 aa  97.4  9e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3478  cytochrome B561  33.71 
 
 		 180 aa  96.3  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.579466  hitchhiker  0.000371098 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3997  putative cytochrome b-561 membrane protein  34.86 
 
 		 186 aa  96.7  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.50922  normal  0.334764 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1554  cytochrome B561  37.5 
 
 		 183 aa  95.5  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0781  cytochrome B561  30.73 
 
 		 183 aa  94.7  6e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.231084  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02863  cytochrome B561  36.63 
 
 		 177 aa  94.4  8e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2179  cytochrome B561  36.96 
 
 		 203 aa  94  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2553  cytochrome B561  33.33 
 
 		 193 aa  93.6  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.885989  normal  0.411403 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2596  cytochrome B561  36.78 
 
 		 190 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.047019 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3682  cytochrome B561  34.1 
 
 		 188 aa  93.6  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.388705  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2963  cytochrome B561  33.14 
 
 		 193 aa  93.6  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5356  putative cytochrome b561  31.84 
 
 		 180 aa  93.6  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00398289 
 
 
-
 
NC_002978  WD1169  cytochrome b561, putative  28.49 
 
 		 173 aa  92.8  3e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.840411  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2719  putative cytochrome B-561 transmembrane protein  33.91 
 
 		 195 aa  92.8  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.12151 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0459  cytochrome B561  34.86 
 
 		 189 aa  92  4e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2896  cytochrome B561  43.45 
 
 		 177 aa  91.3  7e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.950416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3459  putative cytochrome B561  38.76 
 
 		 177 aa  91.3  8e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.422444 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0522  hypothetical protein  31.03 
 
 		 189 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.336315  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05500  hypothetical protein  31.03 
 
 		 189 aa  90.5  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2532  cytochrome B561  36.84 
 
 		 206 aa  90.1  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0252  cytochrome B561  32.37 
 
 		 180 aa  89.4  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0173258  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1661  cytochrome B561  33.71 
 
 		 179 aa  89.4  3e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.142328  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4855  cytochrome B561  31.25 
 
 		 183 aa  89  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.745808  normal  0.0891705 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4185  cytochrome B561  31.98 
 
 		 189 aa  89  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4982  cytochrome B561  31.25 
 
 		 183 aa  88.6  5e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2228  cytochrome B561  37.91 
 
 		 197 aa  88.6  5e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000575966  hitchhiker  0.00851734 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3505  cytochrome b561, putative  36.05 
 
 		 179 aa  88.2  6e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.437089  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0231  cytochrome B561  38.37 
 
 		 188 aa  87.8  9e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.827972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01688  cytochrome B561  33.33 
 
 		 187 aa  87  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.883966  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3506  putative cytochrome b-561 membrane protein  38.98 
 
 		 186 aa  87.4  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.456908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3174  cytochrome B561  33.71 
 
 		 188 aa  86.3  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0189588 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5031  cytochrome B561  30.68 
 
 		 183 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.416621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1745  cytochrome B561  39.43 
 
 		 406 aa  86.7  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.399847  normal  0.227689 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3199  cytochrome B561  31.43 
 
 		 183 aa  86.3  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000519809  normal  0.560519 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4986  cytochrome B561  33.71 
 
 		 188 aa  86.3  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1400  cytochrome B561  37.08 
 
 		 397 aa  86.3  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.687205 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1811  nickel-dependent hydrogenase b561-type cytochrome subunit  33.91 
 
 		 175 aa  85.5  4e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0046692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1538  cytochrome B561  36.47 
 
 		 191 aa  85.5  4e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.757647 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0483  cytochrome B561  31.82 
 
 		 183 aa  85.1  5e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1934  cytochrome B561  34.62 
 
 		 190 aa  85.1  5e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.48407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6723  cytochrome B561  38.95 
 
 		 180 aa  85.1  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3042  cytochrome B561  31.43 
 
 		 183 aa  84.7  6e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000618987  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2389  cytochrome B561  39.29 
 
 		 177 aa  84.7  7e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6508  cytochrome B561  34.73 
 
 		 188 aa  84.7  7e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0286753 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1322  cytochrome B561  31.43 
 
 		 183 aa  84.7  7e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00114864  normal  0.0249294 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1178  cytochrome B561  33.95 
 
 		 183 aa  84.3  8e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000103692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0967  cytochrome B561  30.56 
 
 		 181 aa  84.3  9e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2589  cytochrome B561  28.41 
 
 		 188 aa  83.6  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.806134  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2271  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  28.41 
 
 		 188 aa  84  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2703  cytochrome B561  32 
 
 		 183 aa  84  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.100012  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1436  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  28.41 
 
 		 188 aa  84  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.887549  normal  0.160518 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2543  cytochrome B561  28.41 
 
 		 188 aa  84  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.210551  normal  0.464909 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1848  cytochrome B561  25.95 
 
 		 193 aa  84  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.739636  normal  0.0557217 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1179  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  28.41 
 
 		 188 aa  84  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3056  cytochrome B561  30.86 
 
 		 183 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000111673  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1177  cytochrome B561  33.33 
 
 		 183 aa  84  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000321845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0175  cytochrome B561  38.37 
 
 		 188 aa  84  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.276444  normal  0.139015 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>