More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_4063 on replicon NC_009957
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009957  Dshi_4063  DSBA oxidoreductase  100 
 
 		 243 aa  489  1e-137  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3787  DSBA oxidoreductase  100 
 
 		 243 aa  489  1e-137  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.117786  normal  0.763789 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3405  thiol:disulfide interchange protein DsbA  60.43 
 
 		 253 aa  276  2e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3792  DSBA oxidoreductase  51.91 
 
 		 205 aa  181  1e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.344865  normal  0.0187029 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2703  DSBA oxidoreductase  38.75 
 
 		 260 aa  177  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0600597  normal  0.0595664 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4989  Fis family transcriptional regulator  44.92 
 
 		 209 aa  174  8e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1733  DSBA oxidoreductase  40.61 
 
 		 252 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.690258  normal  0.0758369 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4108  DSBA oxidoreductase  40.44 
 
 		 247 aa  173  1.9999999999999998e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2720  DSBA oxidoreductase  39.68 
 
 		 255 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0209  outer membrane protein  35.94 
 
 		 252 aa  170  2e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00342599  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2114  outer membrane protein  35.94 
 
 		 252 aa  170  2e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.155557  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4209  hypothetical protein  39.84 
 
 		 254 aa  169  3e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3499  DSBA oxidoreductase  43.03 
 
 		 266 aa  169  3e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.511327 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3281  DSBA oxidoreductase  42.38 
 
 		 263 aa  169  3e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.101876  normal  0.665873 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3948  DSBA oxidoreductase  40.5 
 
 		 259 aa  167  1e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0375371  normal  0.31258 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3655  DSBA oxidoreductase  40.5 
 
 		 259 aa  167  2e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2428  DSBA oxidoreductase  44.09 
 
 		 255 aa  166  2e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.53532  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3941  DSBA oxidoreductase  38.14 
 
 		 259 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0405057 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6044  DSBA oxidoreductase  42 
 
 		 257 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.680515  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3016  DSBA oxidoreductase  41.47 
 
 		 255 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.517861  normal  0.845616 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2185  DSBA oxidoreductase  38.86 
 
 		 255 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.829499  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0909  outer membrane protein, putative  40.57 
 
 		 265 aa  160  2e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1539  DSBA oxidoreductase  41.12 
 
 		 252 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0905  putative outer membrane protein  40.57 
 
 		 265 aa  160  2e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.787524  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2271  DSBA oxidoreductase  40.2 
 
 		 268 aa  159  5e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.112284  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5427  DSBA oxidoreductase  41 
 
 		 257 aa  158  8e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.878245 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2436  DSBA oxidoreductase  39.63 
 
 		 255 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.43203 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2862  DSBA oxidoreductase  37.8 
 
 		 255 aa  156  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.898425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1790  outer membrane protein  37.71 
 
 		 274 aa  153  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0730  DSBA oxidoreductase  35.25 
 
 		 260 aa  151  1e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.22688 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0622  twin-arginine translocation pathway signal  42.95 
 
 		 233 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1860  DSBA oxidoreductase  41.18 
 
 		 247 aa  150  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1102  hypothetical protein  39.67 
 
 		 211 aa  148  8e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.983538  normal  0.0993738 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1750  DSBA oxidoreductase  40.19 
 
 		 254 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0404971  normal  0.241511 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3685  putative disulfide bond formation protein D precursor (disulfide oxidoreductase D)  37.77 
 
 		 211 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0106163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1713  DSBA oxidoreductase  37.16 
 
 		 252 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0344853  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1661  DSBA oxidoreductase  34.86 
 
 		 275 aa  143  3e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.148876  normal  0.0992596 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1270  DSBA oxidoreductase  38.56 
 
 		 248 aa  142  4e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0360105  hitchhiker  0.00278647 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0863  DSBA oxidoreductase  38.92 
 
 		 254 aa  142  5e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00216121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1627  DSBA oxidoreductase  38.73 
 
 		 247 aa  142  5e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2981  putative protein-disulfide isomerase  38.73 
 
 		 247 aa  142  6e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.241141  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1805  hypothetical protein  32.43 
 
 		 261 aa  141  9.999999999999999e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1806  hypothetical protein  32.43 
 
 		 261 aa  141  9.999999999999999e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0741  DSBA oxidoreductase  38.12 
 
 		 222 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.486242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2570  DSBA oxidoreductase  35.59 
 
 		 245 aa  140  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.649073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0955  DSBA oxidoreductase  38.57 
 
 		 255 aa  139  3e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.616231  hitchhiker  0.0061431 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4143  DSBA oxidoreductase  42.26 
 
 		 211 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2538  DSBA oxidoreductase  39.23 
 
 		 250 aa  139  6e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.171459  normal  0.017866 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0134  DSBA oxidoreductase  45.58 
 
 		 210 aa  137  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.631277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3248  DSBA oxidoreductase  42.2 
 
 		 226 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0322461  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3494  DSBA oxidoreductase  40.48 
 
 		 197 aa  136  3.0000000000000003e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4299  twin-arginine translocation pathway signal  37.65 
 
 		 222 aa  133  3e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4198  DSBA oxidoreductase  37.2 
 
 		 236 aa  133  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0122  DSBA oxidoreductase  39.88 
 
 		 211 aa  133  3e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0339396 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1214  DSBA oxidoreductase  37.28 
 
 		 217 aa  132  5e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.734825  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3688  DSBA oxidoreductase  40.12 
 
 		 211 aa  132  5e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0968997 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1073  DSBA oxidoreductase  38.51 
 
 		 209 aa  131  7.999999999999999e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4361  DSBA oxidoreductase  37.5 
 
 		 210 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00151652  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0366  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  38.55 
 
 		 204 aa  127  1.0000000000000001e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0381  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  38.55 
 
 		 204 aa  127  1.0000000000000001e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4908  DSBA oxidoreductase  36.9 
 
 		 210 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.771858 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4245  DSBA oxidoreductase  32.84 
 
 		 210 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.354657 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0474  DSBA oxidoreductase  39.39 
 
 		 204 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0844568  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3349  DSBA oxidoreductase  34.11 
 
 		 238 aa  125  6e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0763  thioredoxin domain-containing protein  29.55 
 
 		 265 aa  125  7e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0476  Disulfide bonded thioredoxin protein  35.98 
 
 		 198 aa  121  8e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1819  DSBA oxidoreductase  31.43 
 
 		 250 aa  114  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.621459  normal  0.210082 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3850  DSBA oxidoreductase  33.49 
 
 		 253 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.197074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0293  disulfide oxidoreductase  28.71 
 
 		 246 aa  105  7e-22  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1312  DsbA-like disulfide oxidoreductase  28.34 
 
 		 252 aa  105  9e-22  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0500823  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0515  DSBA oxidoreductase  30.99 
 
 		 269 aa  104  1e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.498642 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3004  DSBA oxidoreductase  26.17 
 
 		 263 aa  104  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.159469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0229  DSBA oxidoreductase  35.62 
 
 		 265 aa  103  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.12077  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0710  DSBA oxidoreductase  26.53 
 
 		 246 aa  100  2e-20  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3170  DSBA oxidoreductase  34.1 
 
 		 535 aa  98.2  9e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0578033  normal  0.438922 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1179  copper sensitivity supression protein  31.71 
 
 		 207 aa  97.8  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0901  disulfide oxidoreductase  28.4 
 
 		 257 aa  97.8  1e-19  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00296205  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4310  DSBA oxidoreductase  28.5 
 
 		 262 aa  97.1  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.387734  hitchhiker  0.000746831 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1190  suppressor for copper-sensitivity C  31.71 
 
 		 207 aa  97.1  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1074  suppressor for copper-sensitivity C  31.1 
 
 		 207 aa  96.7  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1210  copper sensitivity supression protein  32.73 
 
 		 207 aa  96.3  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.822664  normal  0.622691 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1225  copper sensitivity supression protein  32.73 
 
 		 207 aa  96.3  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.724279 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1379  thiol:disulfide interchange protein DsbA  26.14 
 
 		 242 aa  96.3  4e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1504  DSBA oxidoreductase  31.48 
 
 		 228 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.146939  normal  0.747814 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0444  DSBA oxidoreductase  30 
 
 		 335 aa  89.7  3e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0770663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3906  DSBA oxidoreductase  30.59 
 
 		 273 aa  89.4  5e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3549  DsbA oxidoreductase  30.88 
 
 		 272 aa  88.6  8e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.421671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0031  hypothetical protein  27.2 
 
 		 281 aa  88.6  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.115246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0115  DSBA oxidoreductase  24.66 
 
 		 274 aa  88.2  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0538996  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3286  DSBA oxidoreductase  35.12 
 
 		 228 aa  87.4  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0691509  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4224  DSBA oxidoreductase  25 
 
 		 294 aa  86.7  3e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1504  DSBA oxidoreductase  32.1 
 
 		 228 aa  85.5  7e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.844939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0163  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  30.51 
 
 		 270 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3950  DsbA oxidoreductase  33.77 
 
 		 349 aa  84.3  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6639  DSBA oxidoreductase  32.32 
 
 		 235 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.100221 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3199  DSBA oxidoreductase  27.78 
 
 		 244 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4152  DSBA oxidoreductase  25 
 
 		 270 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1783  DSBA oxidoreductase  31.48 
 
 		 228 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.277988  normal  0.178175 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1217  DSBA oxidoreductase  28.51 
 
 		 263 aa  84.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.364209  normal  0.993383 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0018  DSBA oxidoreductase  32.9 
 
 		 299 aa  84.3  0.000000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.445672 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>