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for query gene Dshi_3956 on replicon NC_009957
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



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Organism name
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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009955  Dshi_3618  electron transport protein SCO1/SenC  100 
 
 		 208 aa  426  1e-118  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0565663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3956  electron transport protein SCO1/SenC  100 
 
 		 208 aa  426  1e-118  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0454728  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1992  electron transport protein SCO1/SenC  40.61 
 
 		 220 aa  161  7e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4443  electron transport protein SCO1/SenC  46.45 
 
 		 210 aa  157  1e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00591291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0144  electron transport protein SCO1/SenC  40.4 
 
 		 197 aa  150  1e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.962644  normal  0.838775 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2426  electron transport protein SCO1/SenC  45.95 
 
 		 221 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0897177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0210  electron transport protein SCO1/SenC  38.89 
 
 		 197 aa  146  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3205  electron transport protein SCO1/SenC  46 
 
 		 206 aa  144  7.0000000000000006e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2053  electron transport protein SCO1/SenC  38.12 
 
 		 199 aa  144  9e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.160668 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0885  electron transport protein SCO1/SenC  42.76 
 
 		 199 aa  142  3e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7627  electron transport protein  37.56 
 
 		 219 aa  142  5e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.160482  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4131  electron transport protein SCO1/SenC  44.65 
 
 		 197 aa  141  6e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.229515  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0721  electron transport protein SCO1/SenC  42.76 
 
 		 196 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.288054 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2858  cytochrome c oxidase assembly factor transmembrane protein  43.59 
 
 		 199 aa  140  1.9999999999999998e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1760  electron transport protein SCO1/SenC  44.02 
 
 		 196 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2835  electron transport protein SCO1/SenC  38.27 
 
 		 200 aa  138  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.954587  normal  0.0193725 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1380  electron transport protein SCO1/SenC  40.24 
 
 		 215 aa  138  7e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.019613  hitchhiker  0.0000640851 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0997  electron transport protein SCO1/SenC  40.79 
 
 		 199 aa  137  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.995366  normal  0.775153 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2574  electron transport protein SCO1/SenC  42.41 
 
 		 200 aa  136  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.125643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1655  electron transport protein SCO1/SenC  39.05 
 
 		 215 aa  135  4e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.270396  normal  0.565146 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2862  electron transport protein SCO1/SenC  43.42 
 
 		 197 aa  135  5e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1375  electron transport protein SCO1/SenC  39.64 
 
 		 211 aa  135  5e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.101668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3419  electron transport protein SCO1/SenC  44.6 
 
 		 196 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1416  SCO1/SenC family protein  43.05 
 
 		 196 aa  133  1.9999999999999998e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.974158  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1372  SCO1/SenC family protein  43.05 
 
 		 196 aa  133  1.9999999999999998e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2379  electron transport protein SCO1/SenC  37.86 
 
 		 204 aa  132  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.778887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5169  electron transport protein SCO1/SenC  37.5 
 
 		 199 aa  132  5e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0787  putative electron transport protein  37.13 
 
 		 197 aa  132  5e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00305145 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3548  electron transport protein SCO1/SenC  43.17 
 
 		 200 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230336  normal  0.675478 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3622  electron transport protein SCO1/SenC  44.07 
 
 		 200 aa  129  4.0000000000000003e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.847452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3960  electron transport protein SCO1/SenC  44.07 
 
 		 200 aa  129  4.0000000000000003e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.105512  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3224  electron transport protein SCO1/SenC  43.17 
 
 		 226 aa  128  6e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.533734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3768  electron transport protein SCO1/SenC  45.45 
 
 		 197 aa  124  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.197212  normal  0.330218 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0014  Classical-complement-pathway C3/C5 convertase  35.98 
 
 		 203 aa  122  5e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.143116  hitchhiker  0.00194121 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4631  electron transport protein SCO1/SenC  42.65 
 
 		 193 aa  121  7e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.154208 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1998  electron transport protein SCO1/SenC  43.97 
 
 		 221 aa  120  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2475  electron transport protein SCO1/SenC  34.01 
 
 		 208 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2400  electron transport protein SCO1/SenC  30.81 
 
 		 211 aa  119  3e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3662  electron transport protein SCO1/SenC  36 
 
 		 209 aa  117  9.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.392982  normal  0.146749 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3172  putative lipoprotein  36.54 
 
 		 198 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0416881  normal  0.34002 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1061  electron transport protein SCO1/SenC  38.82 
 
 		 201 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.099105  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1393  electron transport protein SCO1/SenC  38.95 
 
 		 210 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.210991  normal  0.211501 
 
 
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NC_007347  Reut_A0324  electron transport protein SCO1/SenC  37.58 
 
 		 231 aa  114  7.999999999999999e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0373  lipoprotein  39.57 
 
 		 200 aa  114  8.999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1433  SCO1/SenC family protein  40.44 
 
 		 205 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0500  SCO1/SenC family protein  40.44 
 
 		 205 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3187  SCO1/SenC family protein  40.44 
 
 		 181 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1472  electron transport protein SCO1/SenC  37.42 
 
 		 192 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0683  SCO1/SenC family protein  40.44 
 
 		 181 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.744521  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0159  SCO1/SenC family protein  40.44 
 
 		 205 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.477348  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0518  SCO1/SenC family protein  40.44 
 
 		 205 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.83409  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0436  SCO1/SenC family protein  40.44 
 
 		 181 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.465063  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0229  electron transport protein SCO1/SenC  36.31 
 
 		 203 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0628  electron transport protein SCO1/SenC  39.39 
 
 		 191 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000013207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2860  SCO1/SenC family protein  40.44 
 
 		 205 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1389  electron transport protein SCO1/SenC  35.85 
 
 		 206 aa  113  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.324761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1995  electron transport protein SCO1/SenC  42.86 
 
 		 197 aa  112  3e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000392946 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0287  electron transport protein SCO1/SenC  41.18 
 
 		 205 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0337  putative SCO1/SenC family protein  36.17 
 
 		 197 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.769347  normal  0.0226866 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0248  electron transport protein SCO1/SenC  35.67 
 
 		 203 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0520152 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0934  SCO1/SenC family protein  36.81 
 
 		 192 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.140398  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1577  electron transport protein SCO1/SenC  32.39 
 
 		 200 aa  111  8.000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0514  electron transport protein SCO1/SenC  31.4 
 
 		 219 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0888  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 		 210 aa  110  1.0000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.147718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3526  electron transport protein SCO1/SenC  34.22 
 
 		 203 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2382  electron transport protein SCO1/SenC  34.39 
 
 		 205 aa  110  2.0000000000000002e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4161  electron transport protein SCO1/SenC  40.58 
 
 		 205 aa  109  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.992536 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2753  electron transport protein SCO1/SenC  40.74 
 
 		 205 aa  108  5e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2625  electron transport protein SCO1/SenC  38 
 
 		 204 aa  108  5e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00219906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0857  electron transport protein SCO1/SenC  32.76 
 
 		 208 aa  108  6e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1892  electron transport protein SCO1/SenC  41.35 
 
 		 202 aa  108  6e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1255  electron transport protein SCO1/SenC  32.04 
 
 		 209 aa  108  7.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0467  electron transport protein SCO1/SenC  38.85 
 
 		 205 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1240  electron transport protein SCO1/SenC  33.95 
 
 		 219 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.637304 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5935  electron transport protein SCO1/SenC  40.31 
 
 		 215 aa  107  9.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1635  electron transport protein SCO1/SenC  38.52 
 
 		 194 aa  107  1e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.132888  normal  0.682458 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3791  electron transport protein SCO1/SenC  37.82 
 
 		 264 aa  107  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2223  electron transport protein SCO1/SenC  41.18 
 
 		 205 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2847  electron transport protein SCO1/SenC  41.18 
 
 		 191 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2836  electron transport protein SCO1/SenC  41.18 
 
 		 205 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1066  electron transport protein SCO1/SenC  34.12 
 
 		 224 aa  106  3e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.262024  normal  0.435541 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0555  electron transport protein SCO1/SenC  38.97 
 
 		 205 aa  106  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0945335  normal  0.591506 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6166  electron transport protein SCO1/SenC  41.18 
 
 		 205 aa  106  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.527334  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4381  electron transport protein SCO1/SenC  35.51 
 
 		 209 aa  106  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.558879  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1132  electron transport protein SCO1/SenC  38.85 
 
 		 211 aa  105  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.323541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3360  electron transport protein SCO1/SenC  31.41 
 
 		 210 aa  105  4e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0677  electron transport protein SCO1/SenC  38.85 
 
 		 211 aa  105  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.606062  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1156  electron transport protein SCO1/SenC  38.85 
 
 		 211 aa  105  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1930  electron transport protein SCO1/SenC  36.62 
 
 		 196 aa  105  5e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2893  electron transport protein SCO1/SenC  40 
 
 		 205 aa  105  5e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.945666  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1683  electron transport protein SCO1/SenC  37.04 
 
 		 204 aa  105  6e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2849  electron transport protein SCO1/SenC  34.15 
 
 		 187 aa  105  7e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010681  Bphyt_2882  electron transport protein SCO1/SenC  33.13 
 
 		 204 aa  104  8e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.756738  normal  0.288207 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4007  electron transport protein SCO1/SenC  32.54 
 
 		 209 aa  104  9e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.612084  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1038  electron transport protein SCO1/SenC  38.13 
 
 		 217 aa  104  9e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.303988 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2285  twin-arginine translocation pathway signal  40.15 
 
 		 201 aa  103  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.14309  hitchhiker  0.000889852 
 
 
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NC_008390  Bamb_1034  electron transport protein SCO1/SenC  38.13 
 
 		 217 aa  103  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.240451  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3423  electron transport protein SCO1/SenC  34.78 
 
 		 198 aa  103  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.118762 
 
 
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NC_010338  Caul_4652  electron transport protein SCO1/SenC  32.63 
 
 		 197 aa  103  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.753044  normal  1 
 
 
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NC_007492  Pfl01_2208  electron transport protein SCO1/SenC  38.93 
 
 		 201 aa  103  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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