More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3925 on replicon NC_009956
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009956  Dshi_3925  peptidase C26  100 
 
 		 240 aa  481  1e-135  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.792522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1160  peptidase C26  46.33 
 
 		 222 aa  189  2.9999999999999997e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3159  peptidase C26  41.09 
 
 		 261 aa  179  4e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2941  glutamine amidotransferase related enzyme  43.04 
 
 		 237 aa  173  1.9999999999999998e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4921  peptidase C26  40.36 
 
 		 299 aa  169  4e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1620  glutamine amidotransferase-like  36.59 
 
 		 278 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000108554  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2671  peptidase C26  34.68 
 
 		 229 aa  160  1e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0625878 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2749  peptidase C26  40.86 
 
 		 262 aa  159  4e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.101154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0191  peptidase C26  37.5 
 
 		 274 aa  155  6e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.300566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2009  peptidase C26  44.02 
 
 		 245 aa  152  4e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1964  peptidase C26  38.3 
 
 		 239 aa  130  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.918763 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1878  hypothetical protein  43.02 
 
 		 230 aa  127  2.0000000000000002e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12875  amidotransferase  42.55 
 
 		 272 aa  124  2e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.853598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2104  peptidase C26  42.49 
 
 		 240 aa  123  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.297238  normal  0.0236912 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2041  peptidase C26  42.49 
 
 		 240 aa  123  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.755428  normal  0.5084 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2058  peptidase C26  42.49 
 
 		 251 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1636  peptidase C26  42.24 
 
 		 252 aa  123  3e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.370641  normal  0.14821 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2279  peptidase C26  41.33 
 
 		 280 aa  121  8e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249131 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4064  peptidase C26  36.72 
 
 		 256 aa  121  8e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.529097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3742  peptidase C26  36.96 
 
 		 237 aa  121  9e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00011892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2021  peptidase C26  41 
 
 		 250 aa  121  9.999999999999999e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0143  peptidase C26  43.09 
 
 		 238 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0075  peptidase C26  39.67 
 
 		 244 aa  120  1.9999999999999998e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.70164  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0076  peptidase C26  38.4 
 
 		 236 aa  119  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.484929  normal  0.0652283 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1757  peptidase C26  36.17 
 
 		 231 aa  118  7e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.721348  normal  0.077261 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2164  peptidase C26  41.85 
 
 		 233 aa  118  7.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000115799  hitchhiker  0.0000699279 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0094  peptidase C26  42.16 
 
 		 236 aa  116  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000432288  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0082  peptidase C26  42.16 
 
 		 236 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.831872  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1701  glutamine amidotransferase, class II/dipeptidase  37.76 
 
 		 602 aa  116  3e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.176176 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2261  peptidase C26  35.45 
 
 		 312 aa  115  5e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03870  putative glutamine amidotransferase  37.6 
 
 		 250 aa  115  6e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1349  peptidase C26  38.64 
 
 		 240 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000385212  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0319  peptidase C26  40.1 
 
 		 233 aa  114  1.0000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.783639 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1429  glutamine amidotransferase (class I), putative  33.05 
 
 		 231 aa  114  1.0000000000000001e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0388  putative glutamine amidotransferase  40.82 
 
 		 250 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.55028  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0076  peptidase C26  41.8 
 
 		 236 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3356  peptidase C26  32.97 
 
 		 238 aa  113  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.95955  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0954  peptidase C26  34.57 
 
 		 264 aa  114  2.0000000000000002e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000028221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19230  predicted glutamine amidotransferase  38.78 
 
 		 273 aa  113  3e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0453236 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12430  predicted glutamine amidotransferase  36.55 
 
 		 247 aa  112  4.0000000000000004e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.124059  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3248  peptidase C26  38.54 
 
 		 251 aa  109  3e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0361  peptidase C26  36.44 
 
 		 253 aa  109  4.0000000000000004e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21880  peptidase C26  33.7 
 
 		 231 aa  109  4.0000000000000004e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2893  peptidase C26  36.7 
 
 		 233 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.220365  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3226  peptidase C26  41.27 
 
 		 285 aa  108  5e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1339  peptidase C26  38 
 
 		 253 aa  108  6e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2379  peptidase C26  39.25 
 
 		 261 aa  108  6e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.732768  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2993  peptidase C26  39.25 
 
 		 261 aa  108  6e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3012  peptidase C26  39.25 
 
 		 261 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.90022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3002  peptidase C26  35.48 
 
 		 253 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00604755  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1643  glutamine amidotransferase, class I  30.34 
 
 		 229 aa  108  8.000000000000001e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0420698  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4227  peptidase C26  40.76 
 
 		 260 aa  108  8.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135339  normal  0.255877 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2162  peptidase C26  32.26 
 
 		 238 aa  108  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000124945  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2902  peptidase C26  38.71 
 
 		 261 aa  107  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5913  peptidase C26  39.23 
 
 		 279 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2164  peptidase C26  39.23 
 
 		 279 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1267  glutamine amidotransferase  35.48 
 
 		 253 aa  107  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2182  peptidase C26  39.34 
 
 		 279 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.418745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5474  peptidase C26  39.34 
 
 		 268 aa  107  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6342  peptidase C26  39.25 
 
 		 262 aa  107  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2920  peptidase C26  35.08 
 
 		 253 aa  107  2e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.129807  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2718  peptidase C26  36.41 
 
 		 242 aa  107  2e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0577548  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3099  peptidase C26  35.08 
 
 		 253 aa  107  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.015015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4415  peptidase C26  44.44 
 
 		 255 aa  107  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.663907 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2381  Gamma-glutamyl-gamma-aminobutyrate hydrolase  39.49 
 
 		 255 aa  106  3e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00995781  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0730  peptidase C26  34.74 
 
 		 238 aa  106  3e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48870  glutamine amidotransferase  35.57 
 
 		 250 aa  106  4e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3033  peptidase C26  32.93 
 
 		 254 aa  105  4e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.008786  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3790  hypothetical protein  34.41 
 
 		 254 aa  105  5e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1477  peptidase C26  37.55 
 
 		 237 aa  105  5e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1848  peptidase C26  37.77 
 
 		 251 aa  105  5e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.845506 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2465  peptidase C26  39.01 
 
 		 247 aa  105  7e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000302907  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0799  peptidase C26  36.65 
 
 		 235 aa  105  7e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2536  peptidase C26  32.97 
 
 		 237 aa  105  8e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2528  glutamine amidotransferase, class I  33.19 
 
 		 250 aa  105  9e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2155  peptidase C26  33.19 
 
 		 250 aa  105  9e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000159832 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3598  peptidase C26  35.6 
 
 		 269 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.420407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3375  peptidase C26  33.6 
 
 		 259 aa  104  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.290232 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3097  peptidase C26  35.6 
 
 		 269 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.925767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0416  peptidase C26  36.96 
 
 		 264 aa  104  1e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0393355  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1378  peptidase C26  36.68 
 
 		 253 aa  103  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.735257  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3050  peptidase C26  35.94 
 
 		 250 aa  103  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1072  peptidase C26  29.79 
 
 		 259 aa  103  2e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3040  peptidase C26  38.17 
 
 		 279 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1789  glutamine amidotransferase  34.22 
 
 		 241 aa  103  2e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000030649  hitchhiker  5.3956e-25 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0444  glutamine amidotransferase class I  32.44 
 
 		 241 aa  103  3e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000517  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04810  predicted glutamine amidotransferase  32.63 
 
 		 279 aa  103  3e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00756632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2080  peptidase C26  37.91 
 
 		 268 aa  103  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.285654  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3677  Gamma-glutamyl-gamma-aminobutyrate hydrolase  33.74 
 
 		 259 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.272698 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2202  peptidase C26  38.39 
 
 		 268 aa  103  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1092  peptidase C26  34.27 
 
 		 253 aa  103  3e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.337501  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1164  peptidase C26  34.27 
 
 		 253 aa  102  4e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.399023  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1197  peptidase C26  34.27 
 
 		 253 aa  102  4e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0734619  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3194  peptidase C26  34.27 
 
 		 253 aa  102  4e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0388042 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1106  peptidase C26  34.27 
 
 		 253 aa  102  4e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00657887  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4215  peptidase C26  30.4 
 
 		 253 aa  102  4e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1775  glutamine amidotransferase  34.44 
 
 		 227 aa  102  4e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000113696 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1797  glutamine amidotransferase  36.09 
 
 		 238 aa  102  4e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.239238  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0847  peptidase C26  42.49 
 
 		 246 aa  102  4e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3558  peptidase C26  38.78 
 
 		 257 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>