38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3917 on replicon NC_009956
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009956  Dshi_3917  hypothetical protein  100 
 
 		 155 aa  314  3e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.665319 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3988  protein required for attachment to host cells-like  50.68 
 
 		 163 aa  153  8e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0273028  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1930  hypothetical protein  40.85 
 
 		 151 aa  111  4.0000000000000004e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0895084  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1123  hypothetical protein  38.73 
 
 		 148 aa  101  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.144161 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0970  hypothetical protein  38.73 
 
 		 148 aa  98.6  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.106543  normal  0.810268 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3808  hypothetical protein  37.06 
 
 		 149 aa  85.1  4e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.356133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2244  hypothetical protein  37.23 
 
 		 132 aa  82  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.287622  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3501  hypothetical protein  35.66 
 
 		 149 aa  82  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4993  hypothetical protein  36.03 
 
 		 148 aa  80.1  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.483995  normal  0.647734 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2719  hypothetical protein  31.08 
 
 		 148 aa  77.4  0.00000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.011554  normal  0.177928 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2164  hypothetical protein  32.12 
 
 		 148 aa  70.5  0.000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.337472  normal  0.392693 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3884  hypothetical protein  30.77 
 
 		 149 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0985147  normal  0.0815674 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2101  putative AtsE  32.85 
 
 		 132 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.26663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2873  hypothetical protein  32.86 
 
 		 151 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.387065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2176  hypothetical protein  29.58 
 
 		 138 aa  65.1  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.186581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3252  putative AtsE  29.55 
 
 		 132 aa  61.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.859314 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2415  hypothetical protein  30.5 
 
 		 155 aa  57.4  0.00000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.19788 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1283  host cell attachment-required protein  29.86 
 
 		 144 aa  57  0.00000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.999255  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2253  AtsE  30.14 
 
 		 134 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.797018  normal  0.537968 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3343  putative AtsE  29.2 
 
 		 132 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.578122  normal  0.0666927 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1670  Host attachment protein  32.28 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.20183  normal  0.815187 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0764  AtsE  28.08 
 
 		 132 aa  55.8  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.550753  normal  0.208804 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4485  hypothetical protein  30.88 
 
 		 172 aa  56.2  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.172681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7762  hypothetical protein  39.47 
 
 		 83 aa  54.7  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.409186  normal  0.0323872 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03440  AtsE  32.17 
 
 		 132 aa  51.6  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0677  hypothetical protein  33.33 
 
 		 145 aa  50.4  0.000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1667  hypothetical protein  38.36 
 
 		 148 aa  49.3  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2573  host cell attachment-required protein  26.39 
 
 		 149 aa  48.1  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2201  hypothetical protein  27.64 
 
 		 148 aa  47.8  0.00006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0686  hypothetical protein  27.27 
 
 		 149 aa  47  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000136633  hitchhiker  0.0000890362 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0528  hypothetical protein  27.27 
 
 		 149 aa  47  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0852655  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2265  hypothetical protein  26.95 
 
 		 167 aa  47  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5091  hypothetical protein  30.46 
 
 		 164 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1435  hypothetical protein  28.08 
 
 		 155 aa  42  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3367  hypothetical protein  31.25 
 
 		 146 aa  40.8  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1225  hypothetical protein  28.12 
 
 		 150 aa  40.8  0.007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.171501 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0963  hypothetical protein  25.83 
 
 		 149 aa  40.8  0.008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0409  hypothetical protein  21.24 
 
 		 147 aa  40.4  0.009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>