More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3560 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_3560  hypothetical protein  100 
 
 		 196 aa  386  1e-106  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2754  hypothetical protein  74.33 
 
 		 204 aa  280  1e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.229577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2823  hypothetical protein  72.83 
 
 		 204 aa  272  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1162  hypothetical protein  72.28 
 
 		 204 aa  271  6e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2909  hypothetical protein  72.58 
 
 		 203 aa  266  1e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.829531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0041  hypothetical protein  65.66 
 
 		 194 aa  263  1e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2591  hypothetical protein  67.18 
 
 		 206 aa  256  2e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.660768 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0030  hypothetical protein  53.12 
 
 		 199 aa  165  5e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.906317  normal  0.667348 
 
 
-
 
NC_004310  BR2162  hypothetical protein  49.12 
 
 		 219 aa  164  6.9999999999999995e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.213663  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2074  hypothetical protein  49.12 
 
 		 219 aa  164  6.9999999999999995e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0717176  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4390  hypothetical protein  48.84 
 
 		 201 aa  163  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3927  hypothetical protein  50 
 
 		 220 aa  163  1.0000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0750  hypothetical protein  47.37 
 
 		 224 aa  161  4.0000000000000004e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.251451  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3040  hypothetical protein  53.66 
 
 		 178 aa  161  7e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0296  hypothetical protein  45.6 
 
 		 286 aa  160  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.299993  normal  0.029017 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3625  hypothetical protein  49.41 
 
 		 207 aa  159  2e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.443103 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0164  hypothetical protein  48.21 
 
 		 204 aa  157  6e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.89885  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4070  hypothetical protein  47.09 
 
 		 201 aa  155  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1251  hypothetical protein  47.85 
 
 		 209 aa  154  9e-37  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4615  protein of unknown function DUF150  47.62 
 
 		 238 aa  153  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.130835  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2614  hypothetical protein  46.99 
 
 		 201 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.374195  normal  0.0922711 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3438  hypothetical protein  46.67 
 
 		 205 aa  151  5e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2067  hypothetical protein  43.3 
 
 		 207 aa  144  8.000000000000001e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.677656 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2822  protein of unknown function DUF150  42.7 
 
 		 255 aa  144  1e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.189115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2700  hypothetical protein  44.12 
 
 		 251 aa  142  2e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.765292 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2926  protein of unknown function DUF150  44.12 
 
 		 251 aa  142  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.104462 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0477  hypothetical protein  44.05 
 
 		 272 aa  140  9e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.981594  normal  0.577769 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0028  hypothetical protein  39.88 
 
 		 263 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3730  hypothetical protein  43.53 
 
 		 257 aa  138  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.401483  normal  0.0819057 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0234  hypothetical protein  42.2 
 
 		 262 aa  138  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3778  hypothetical protein  48.75 
 
 		 225 aa  136  2e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0597  hypothetical protein  41.86 
 
 		 259 aa  136  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1050  hypothetical protein  39.78 
 
 		 314 aa  136  2e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0443  hypothetical protein  42.2 
 
 		 259 aa  136  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0021  hypothetical protein  44.37 
 
 		 260 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0581916 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2298  protein of unknown function DUF150  43.71 
 
 		 279 aa  132  3e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.022015 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0222  hypothetical protein  44.94 
 
 		 201 aa  132  3e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2493  hypothetical protein  46.58 
 
 		 186 aa  131  6.999999999999999e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0301958  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0054  hypothetical protein  41.4 
 
 		 253 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.454767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0609  hypothetical protein  49.03 
 
 		 181 aa  130  1.0000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.142397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3820  hypothetical protein  41.46 
 
 		 186 aa  125  4.0000000000000003e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.646345  normal  0.0215546 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3076  hypothetical protein  43.45 
 
 		 153 aa  119  3e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0815  hypothetical protein  43.51 
 
 		 153 aa  114  6.9999999999999995e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00329343 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2122  hypothetical protein  44.52 
 
 		 151 aa  114  8.999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.330912  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1317  hypothetical protein  37.24 
 
 		 150 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2710  hypothetical protein  44.14 
 
 		 151 aa  114  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.955868 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1121  hypothetical protein  37.41 
 
 		 151 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2691  hypothetical protein  38.24 
 
 		 152 aa  112  3e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3350  hypothetical protein  41.01 
 
 		 153 aa  112  3e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.223242  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4714  hypothetical protein  46.46 
 
 		 169 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109953  hitchhiker  0.00798136 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4579  hypothetical protein  46.46 
 
 		 169 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.312509  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2822  hypothetical protein  37.5 
 
 		 152 aa  109  3e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1025  hypothetical protein  40.4 
 
 		 153 aa  109  3e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0701268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0819  hypothetical protein  39.19 
 
 		 153 aa  108  4.0000000000000004e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3466  hypothetical protein  39.85 
 
 		 154 aa  108  5e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.155297  normal  0.925377 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4491  hypothetical protein  39.85 
 
 		 154 aa  108  5e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5464  hypothetical protein  40.28 
 
 		 152 aa  108  5e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.220559  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62780  hypothetical protein  40.28 
 
 		 152 aa  108  5e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03037  hypothetical protein  40.77 
 
 		 150 aa  108  6e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1602  hypothetical protein  39.29 
 
 		 153 aa  108  6e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.781407  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0528  hypothetical protein  40.77 
 
 		 150 aa  108  6e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3601  hypothetical protein  40.77 
 
 		 150 aa  108  6e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.948868  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3655  hypothetical protein  40.77 
 
 		 150 aa  108  6e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.162114  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3362  hypothetical protein  40.77 
 
 		 150 aa  108  6e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0135446  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02988  hypothetical protein  40.77 
 
 		 150 aa  108  6e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1666  hypothetical protein  44.78 
 
 		 159 aa  108  7.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4714  hypothetical protein  49.14 
 
 		 152 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.875464 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3467  protein of unknown function DUF150  39.85 
 
 		 154 aa  108  7.000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0719  hypothetical protein  45.67 
 
 		 169 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.110167 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0561  hypothetical protein  39.29 
 
 		 153 aa  107  9.000000000000001e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0959  hypothetical protein  42.22 
 
 		 151 aa  107  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0670206  normal  0.152595 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2201  hypothetical protein  38.36 
 
 		 151 aa  106  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002607  UPF0090 domain-containing protein  38.51 
 
 		 151 aa  106  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000228557  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1046  hypothetical protein  40.65 
 
 		 158 aa  106  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000708313  unclonable  0.00000000857031 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1751  hypothetical protein  41.67 
 
 		 151 aa  106  2e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1898  hypothetical protein  41.67 
 
 		 159 aa  106  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000581162  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3645  hypothetical protein  40 
 
 		 150 aa  105  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.639432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3477  hypothetical protein  39.1 
 
 		 154 aa  106  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3546  hypothetical protein  39.1 
 
 		 154 aa  106  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.210683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3478  hypothetical protein  40 
 
 		 150 aa  105  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.615546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3583  hypothetical protein  40 
 
 		 150 aa  105  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1950  hypothetical protein  40.91 
 
 		 176 aa  105  5e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.197995  normal  0.0512088 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3607  hypothetical protein  37.69 
 
 		 150 aa  104  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0237098  normal  0.138606 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0777  hypothetical protein  46.55 
 
 		 173 aa  103  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000034015  normal  0.0524823 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0453  protein of unknown function DUF150  40.43 
 
 		 152 aa  103  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3610  hypothetical protein  46.55 
 
 		 152 aa  103  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01758  hypothetical protein  38.96 
 
 		 165 aa  102  3e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.632823  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2836  hypothetical protein  40.46 
 
 		 151 aa  102  4e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00113989  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3282  hypothetical protein  40.46 
 
 		 151 aa  102  4e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000111408  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3419  hypothetical protein  40.46 
 
 		 151 aa  102  4e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000324963  decreased coverage  0.0000990075 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1126  hypothetical protein  40.46 
 
 		 151 aa  102  4e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00017917  unclonable  0.00000000000392786 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3241  hypothetical protein  40.46 
 
 		 151 aa  102  4e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000301073  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1202  hypothetical protein  39.69 
 
 		 151 aa  102  5e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0573  protein of unknown function DUF150  36.81 
 
 		 147 aa  102  5e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.300735  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1024  hypothetical protein  39.69 
 
 		 151 aa  101  5e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000675581  hitchhiker  0.000125098 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1089  hypothetical protein  39.69 
 
 		 151 aa  101  5e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00297736  normal  0.0584009 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4182  hypothetical protein  45.69 
 
 		 158 aa  101  6e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.844103 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1028  hypothetical protein  39.69 
 
 		 151 aa  101  7e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0162582  hitchhiker  0.000040041 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1693  hypothetical protein  39.22 
 
 		 152 aa  101  8e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0535  protein of unknown function DUF150  41.32 
 
 		 140 aa  101  9e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>