78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3529 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_3529  PUCC protein  100 
 
 		 433 aa  837    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.513682 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0278  putative light-harvesting 1 (B870) complex assembly protein PucC  67.44 
 
 		 427 aa  535  1e-151  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1921  PUCC protein  67.44 
 
 		 427 aa  533  1e-150  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.824161 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1017  PUCC protein  65.59 
 
 		 427 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0628  PUCC protein  53.44 
 
 		 449 aa  404  1e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.319243  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3746  PUCC protein  52.78 
 
 		 447 aa  397  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00047851 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3991  light harvesting pigment MFS transporter Bch2  52.41 
 
 		 447 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.772479  normal  0.25213 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1720  PUCC protein  53.1 
 
 		 438 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1303  PUCC protein  51.38 
 
 		 452 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5366  PUCC protein  53.49 
 
 		 455 aa  365  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.238327  normal  0.20788 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4821  PUCC protein  54.65 
 
 		 459 aa  360  3e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.052711 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6423  light harvesting pigment major facilitator family (MFS) transporter, Bch2-like protein  50.35 
 
 		 444 aa  360  3e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2062  PUCC protein  53.04 
 
 		 455 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.035842 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5288  PUCC protein  54.31 
 
 		 458 aa  357  2.9999999999999997e-97  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.212977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1601  PUCC protein  51.94 
 
 		 447 aa  355  1e-96  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1853  PUCC protein  52.9 
 
 		 512 aa  354  2e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0108975 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3713  PUCC protein  54.48 
 
 		 448 aa  349  6e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.368833  hitchhiker  0.000507532 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0166  PUCC protein  45.73 
 
 		 417 aa  267  2e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2893  PUCC protein  29.08 
 
 		 474 aa  153  5.9999999999999996e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00562586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3165  PUCC protein  28.54 
 
 		 474 aa  144  4e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0360392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1287  PUCC protein  28.97 
 
 		 432 aa  140  6e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1912  PUCC protein  29.25 
 
 		 457 aa  136  8e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.199112  unclonable  0.0000123013 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1534  PUCC protein  28.61 
 
 		 457 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00123663  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2807  PUCC protein  28.64 
 
 		 472 aa  133  5e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.724042 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0979  PUCC protein  30.48 
 
 		 459 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1903  PUCC protein  26.28 
 
 		 433 aa  128  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00453505 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0355  PUCC protein  28.81 
 
 		 488 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.446739 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3332  PUCC protein  30.21 
 
 		 481 aa  122  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0614362 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1022  PUCC protein  28.91 
 
 		 434 aa  121  3e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1762  hypothetical protein  30.79 
 
 		 483 aa  119  9.999999999999999e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1543  PUCC protein  28.28 
 
 		 433 aa  119  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000848404 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3131  PUCC protein  27.34 
 
 		 452 aa  116  7.999999999999999e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.400987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3539  PUCC protein  28.64 
 
 		 481 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3432  PUCC protein  28.64 
 
 		 434 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0654139 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0459  PUCC protein  27.08 
 
 		 478 aa  115  1.0000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.222585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0518  PUCC protein  28.75 
 
 		 449 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3083  chlorophyll major facilitator superfamily (MFS) exporter PucC  27.99 
 
 		 475 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1707  PUCC protein  26 
 
 		 487 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.711762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1689  PUCC protein  26 
 
 		 487 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1960  PUCC protein  29.52 
 
 		 459 aa  113  5e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.77527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0315  light-harvesting 1 (B870) complex assembly  29.52 
 
 		 459 aa  113  5e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1240  PUCC protein  28.4 
 
 		 484 aa  112  9e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.000359132  unclonable  0.0000000283623 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0658  PUCC protein  27.78 
 
 		 472 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.573961 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3785  PUCC protein  28.99 
 
 		 475 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0284698 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2398  PUCC protein  28.99 
 
 		 475 aa  110  5e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.6432  normal  0.14907 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4446  PucC chlorophyll MFS exporter  29.35 
 
 		 473 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.742071 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4031  PucC protein, chlorophyll MFS exporter  29.34 
 
 		 473 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.344544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1461  PucC protein  27.57 
 
 		 449 aa  108  3e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.833113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0618  PUCC protein  28.31 
 
 		 480 aa  107  4e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.328427  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1668  PUCC protein  25.81 
 
 		 448 aa  106  1e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3787  PUCC protein  28.93 
 
 		 483 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0990  PUCC protein  26.45 
 
 		 452 aa  105  2e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1680  PUCC protein  28.79 
 
 		 478 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0028  PUCC protein  28.93 
 
 		 477 aa  104  3e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.30591  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1849  PUCC protein  26.89 
 
 		 448 aa  104  4e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0156  PUCC protein  30.07 
 
 		 478 aa  104  4e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0689  PucC protein  27.08 
 
 		 448 aa  103  5e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.85813  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0911  PUCC protein  26.76 
 
 		 449 aa  103  5e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.592939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03411  Na+/melibiose symporter  28.1 
 
 		 472 aa  103  6e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6412  photosynthetic complex (LH1) assembly protein LhaA  27.32 
 
 		 477 aa  101  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1560  PUCC protein  26.11 
 
 		 450 aa  99  1e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.507042  hitchhiker  0.000951091 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2898  pucC  29.34 
 
 		 467 aa  96.7  8e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1583  PUCC protein  30.02 
 
 		 465 aa  95.5  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.652092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5356  PUCC protein  29.13 
 
 		 481 aa  90.9  4e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4811  PUCC protein  28.85 
 
 		 481 aa  90.5  6e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.200059 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1933  PUCC protein  27.21 
 
 		 479 aa  86.7  7e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0290  light-harvesting 1 (B870) complex assembly  27.21 
 
 		 479 aa  86.7  7e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3976  LhaA protein  26.01 
 
 		 477 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.27032  normal  0.197279 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2037  PUCC protein  28.57 
 
 		 476 aa  84.3  0.000000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3731  PUCC protein  26.67 
 
 		 477 aa  84  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.532821  hitchhiker  0.00503136 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1318  PUCC protein  27.94 
 
 		 477 aa  83.6  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.153345  normal  0.172961 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1735  PUCC protein  27.04 
 
 		 477 aa  82.4  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5278  PUCC protein  28.35 
 
 		 481 aa  81.3  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1632  PUCC protein  25.61 
 
 		 475 aa  79  0.0000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.369944  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3723  PUCC protein  28.94 
 
 		 476 aa  79.3  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0690908 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1843  PUCC protein  27.6 
 
 		 475 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.085296 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1652  light-harvesting 1 (B870) complex assembly protein PucC-like  26.41 
 
 		 459 aa  77  0.0000000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1005  PUCC protein  25.95 
 
 		 479 aa  74.3  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.516888 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>