More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3470 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_3470  peptidase M48 Ste24p  100 
 
 		 343 aa  671    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0326  peptidase M48 Ste24p  39.34 
 
 		 353 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.988889  normal  0.269331 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0388  peptidase M48 Ste24p  40.79 
 
 		 349 aa  197  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0132188  normal  0.117009 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0258  peptidase M48, Ste24p  32.66 
 
 		 352 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00863149  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1120  peptidase M48 Ste24p  31.9 
 
 		 354 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.597091  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4143  peptidase M48, Ste24p  30.59 
 
 		 347 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.724866  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1147  peptidase M48 Ste24p  30.12 
 
 		 363 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1953  peptidase M48, Ste24p  28.88 
 
 		 367 aa  105  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0119619  normal  0.0677006 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0096  peptidase M48, Ste24p  28.7 
 
 		 348 aa  102  7e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.220235  normal  0.168407 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2801  peptidase M48, Ste24p  30.59 
 
 		 341 aa  102  9e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.57827 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0462  M48 family peptidase  29.23 
 
 		 357 aa  99.4  7e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169095  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0514  peptidase M48 Ste24p  33.07 
 
 		 343 aa  97.4  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0802067  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2197  hypothetical protein  32.54 
 
 		 265 aa  97.1  5e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0644  putative transmembrane protein  28.57 
 
 		 358 aa  94.7  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0264  peptidase M48 Ste24p  37.75 
 
 		 288 aa  93.6  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.197309  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0209  peptidase M48, Ste24p  38.78 
 
 		 289 aa  93.6  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2182  peptidase M48, Ste24p  30.29 
 
 		 349 aa  93.2  6e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0332  peptidase M48 Ste24p  37.16 
 
 		 305 aa  90.9  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0456  peptidase M48 Ste24p  34.39 
 
 		 395 aa  90.9  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2077  putative Zn-dependent protease  27.99 
 
 		 336 aa  90.1  4e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01850  mitochondrial inner membrane metallopeptidase Oma1, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G09730)  39.19 
 
 		 376 aa  90.1  5e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0378  peptidase M48 Ste24p  25.45 
 
 		 345 aa  89  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03032  peptidase  29.19 
 
 		 331 aa  88.6  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0218  peptidase M48 Ste24p  34.69 
 
 		 311 aa  87  4e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45606  predicted protein  36.71 
 
 		 366 aa  86.7  5e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0166385  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0192  peptidase M48, Ste24p  35.81 
 
 		 319 aa  86.3  6e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.461964  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1783  zinc metallopeptidase  32.28 
 
 		 270 aa  86.3  7e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0517  peptidase M48, Ste24p  35.57 
 
 		 281 aa  86.3  7e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3390  peptidase M48 Ste24p  32.48 
 
 		 268 aa  86.3  8e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000240796  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0107  putative lipoprotein  30.99 
 
 		 262 aa  85.9  9e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0469  peptidase M48 Ste24p  36.97 
 
 		 567 aa  85.5  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0280  peptidase M48, Ste24p  35.14 
 
 		 284 aa  85.9  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2861  peptidase M48, Ste24p  34.88 
 
 		 271 aa  85.9  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2062  peptidase M48, Ste24p  32.28 
 
 		 270 aa  85.9  0.000000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.02015  normal  0.416312 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0203  peptidase M48, Ste24p  34.69 
 
 		 291 aa  84.7  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23907  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0561  putative signal peptide protein  36.97 
 
 		 561 aa  85.1  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.611701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0482  peptidase M48 Ste24p  36.97 
 
 		 569 aa  85.1  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1437  M48 family peptidase  34.13 
 
 		 264 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.142211  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4104  peptidase M48 Ste24p  34.69 
 
 		 316 aa  84.3  0.000000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000775761 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0581  peptidase M48 Ste24p  31.49 
 
 		 424 aa  84  0.000000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0013814  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0429  peptidase M48 Ste24p  25.96 
 
 		 345 aa  84  0.000000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0123  putative exported peptidase  31.1 
 
 		 479 aa  83.6  0.000000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1823  peptidase M48, Ste24p  36.36 
 
 		 562 aa  83.2  0.000000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0487  peptidase M48, Ste24p  34.76 
 
 		 605 aa  83.2  0.000000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.72194 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3072  peptidase M48 Ste24p  36.24 
 
 		 271 aa  83.2  0.000000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1711  M48 family peptidase  37.93 
 
 		 267 aa  82.8  0.000000000000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1219  hypothetical protein  34.27 
 
 		 258 aa  82.8  0.000000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0147  peptidase M48, Ste24p  33.54 
 
 		 284 aa  82.8  0.000000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0856  peptidase M48 Ste24p  31.21 
 
 		 268 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0642  peptidase M48, Ste24p  27.73 
 
 		 347 aa  82.4  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0212  peptidase M48, Ste24p  33.56 
 
 		 267 aa  82  0.00000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000330567  normal  0.366898 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1904  peptidase M48, Ste24p  34.39 
 
 		 493 aa  82  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.429469  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0537  peptidase M48 Ste24p  27.06 
 
 		 364 aa  82  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.426689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3183  peptidase M48 Ste24p  38.67 
 
 		 259 aa  81.6  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.262303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0541  peptidase M48, Ste24p:tetratricopeptide TPR_4  33.54 
 
 		 573 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.864475  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1865  peptidase M48, Ste24p  36.31 
 
 		 280 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.130359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0393  peptidase M48 Ste24p  36.84 
 
 		 248 aa  81.3  0.00000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000617052  hitchhiker  0.0000065256 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1538  peptidase M48 Ste24p  35.76 
 
 		 565 aa  80.9  0.00000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0972  peptidase M48, Ste24p  32.52 
 
 		 268 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000310302  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2301  peptidase M48 Ste24p  35.71 
 
 		 270 aa  80.9  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.114592  normal  0.277953 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1137  hypothetical protein  35.36 
 
 		 269 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0581  peptidase M48 Ste24p  29.64 
 
 		 361 aa  80.5  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.380263 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2660  peptidase M48 Ste24p  34.35 
 
 		 395 aa  80.5  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.110854 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0567  peptidase M48 Ste24p  26.11 
 
 		 333 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4429  peptidase M48 Ste24p  33.16 
 
 		 271 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3721  peptidase M48, Ste24p  38.95 
 
 		 377 aa  80.5  0.00000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0533853  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0287  hypothetical protein  35.54 
 
 		 560 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0985  M48 family peptidase  35.54 
 
 		 589 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399945  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0028  hypothetical protein  35.54 
 
 		 572 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.189438  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2415  hypothetical protein  35.54 
 
 		 572 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0582  hypothetical protein  35.54 
 
 		 572 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.10883  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1800  peptidase M48, Ste24p  35.37 
 
 		 263 aa  80.1  0.00000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0722089  normal  0.0408488 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0824  hypothetical protein  35.54 
 
 		 572 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0827  hypothetical protein  35.54 
 
 		 589 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1000  peptidase M48, Ste24p  34.25 
 
 		 269 aa  80.1  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00216639  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0210  peptidase M48, Ste24p  29.5 
 
 		 280 aa  79.7  0.00000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0548  peptidase M48, Ste24p  26.82 
 
 		 268 aa  79.3  0.00000000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.420219  hitchhiker  0.000000269933 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1200  peptidase M48 Ste24p  33.53 
 
 		 275 aa  79.3  0.00000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.724049 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0962  peptidase M48, Ste24p  34.25 
 
 		 269 aa  79.3  0.00000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00197465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0032  peptidase M48, Ste24p  35.53 
 
 		 270 aa  78.6  0.0000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0654  M48 family peptidase  34.46 
 
 		 589 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2637  peptidase M48, Ste24p  33.56 
 
 		 302 aa  79.3  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.148422  normal  0.423145 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3581  peptidase M48 Ste24p  30.81 
 
 		 266 aa  79  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000704965  normal  0.319279 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0759  hypothetical protein  31.05 
 
 		 279 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3308  peptidase M48 Ste24p  35.39 
 
 		 269 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000556254  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03478  peptidase M48, Ste24p  34 
 
 		 268 aa  78.2  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1238  peptidase M48, Ste24p  29.3 
 
 		 278 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0665176  normal  0.164191 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2068  peptidase M48 Ste24p  33.94 
 
 		 320 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0233  peptidase M48 Ste24p  39.46 
 
 		 289 aa  78.2  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2567  peptidase M48, Ste24p  36.55 
 
 		 392 aa  78.2  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2917  peptidase M48, Ste24p  25.78 
 
 		 335 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.154407  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0222  peptidase M48 Ste24p  39.46 
 
 		 289 aa  78.2  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3004  peptidase M48 Ste24p  38.37 
 
 		 374 aa  78.6  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.558677  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0655  peptidase M48, Ste24p  34.97 
 
 		 268 aa  78.2  0.0000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0730736  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0801  peptidase M48 Ste24p  30.53 
 
 		 272 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.740627 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1809  peptidase M48 Ste24p  31.54 
 
 		 289 aa  77.4  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000151059 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0964  peptidase M48, Ste24p  34.25 
 
 		 269 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00161877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0787  peptidase M48, Ste24p  31.05 
 
 		 272 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1048  peptidase M48 Ste24p  34.83 
 
 		 269 aa  77  0.0000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000265758  hitchhiker  0.000000297579 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3529  peptidase M48 Ste24p  34.83 
 
 		 269 aa  77  0.0000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000517295  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>