More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3458 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_3458  chromosome partitioning protein parB  100 
 
 		 299 aa  602  1.0000000000000001e-171  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1225  chromosome segregation DNA-binding protein  63.12 
 
 		 301 aa  368  1e-101  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2868  chromosome segregation DNA-binding protein  62.33 
 
 		 299 aa  368  1e-101  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.108879  normal  0.100087 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0203  chromosome segregation DNA-binding protein  58.8 
 
 		 301 aa  365  1e-100  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.435492 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2663  parB-like partition protein  62.42 
 
 		 300 aa  362  5.0000000000000005e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0851711  normal  0.479198 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2887  parB-like partition proteins  62.84 
 
 		 296 aa  362  5.0000000000000005e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0007  parB-like partition proteins  60.4 
 
 		 292 aa  352  2.9999999999999997e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5027  parB-like partition protein  56.71 
 
 		 297 aa  320  1.9999999999999998e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.717365 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2960  chromosome segregation DNA-binding protein  53.11 
 
 		 306 aa  298  1e-79  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1277  parB-like partition protein  53.31 
 
 		 303 aa  297  2e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3468  chromosome segregation DNA-binding protein  52.86 
 
 		 288 aa  296  2e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2058  chromosome partitioning protein ParB  49.5 
 
 		 293 aa  290  2e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1978  chromosome partitioning protein ParB  49.5 
 
 		 293 aa  290  2e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0862  parB-like partition protein  50.66 
 
 		 293 aa  290  3e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1407  parB-like partition protein  51.33 
 
 		 297 aa  285  5e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.238658 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3201  parB-like partition protein  50.67 
 
 		 296 aa  283  3.0000000000000004e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0293  parB-like partition protein  50 
 
 		 296 aa  278  9e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145749  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0014  chromosome partitioning protein ParB  46.13 
 
 		 303 aa  276  3e-73  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.110445  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3628  chromosome segregation DNA-binding protein  51.92 
 
 		 326 aa  276  4e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0424656  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1837  parB-like partition protein  53.95 
 
 		 305 aa  276  4e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0869216  normal  0.672881 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0388  parB-like partition proteins  49.33 
 
 		 296 aa  275  5e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.450209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2857  parB-like partition proteins  47.71 
 
 		 319 aa  273  3e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.233007 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4385  chromosome partitioning protein  48.16 
 
 		 292 aa  271  1e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0168  chromosome segregation DNA-binding protein  48.49 
 
 		 298 aa  271  1e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1025  parB-like partition protein  51.54 
 
 		 297 aa  270  2e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.777652  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2591  parB-like partition protein  48.97 
 
 		 294 aa  268  5.9999999999999995e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.107076 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0433  parB-like partition proteins  49.83 
 
 		 296 aa  268  8.999999999999999e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0287  parB-like partition proteins  48.14 
 
 		 293 aa  267  2e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.68713 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3927  parB-like partition protein  48.17 
 
 		 293 aa  265  5e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.47088 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4253  parB-like partition protein  47.84 
 
 		 293 aa  265  5.999999999999999e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.513173 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0094  ParB-like partition protein  47.8 
 
 		 293 aa  262  4.999999999999999e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0639944 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0133  chromosome segregation DNA-binding protein  46.43 
 
 		 315 aa  261  8e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0102  parB-like partition proteins  47.12 
 
 		 294 aa  256  3e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1936  parB-like partition protein  46.98 
 
 		 296 aa  250  2e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2849  chromosome segregation DNA-binding protein  48.15 
 
 		 298 aa  245  6e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573322  normal  0.191816 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2403  parB-like partition protein  42.71 
 
 		 292 aa  242  3.9999999999999997e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.117345  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0001  ParB family chromosome partitioning protein  42.71 
 
 		 281 aa  241  1e-62  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.642229  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1218  ParB family protein  41.02 
 
 		 283 aa  234  2.0000000000000002e-60  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4590  parB-like partition protein  44.93 
 
 		 306 aa  233  2.0000000000000002e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.740178  normal  0.297176 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4094  parB-like partition protein  45.36 
 
 		 306 aa  232  7.000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0135978 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4106  chromosome segregation DNA-binding protein  45.15 
 
 		 284 aa  225  9e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000709761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3292  chromosome segregation DNA-binding protein  45.21 
 
 		 306 aa  221  9.999999999999999e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3588  parB-like partition protein  40.84 
 
 		 323 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2045  parB-like partition protein  42.63 
 
 		 310 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1586  parB-like partition protein  46.74 
 
 		 300 aa  220  3e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.746131  normal  0.0130059 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1653  parB-like partition protein  45.55 
 
 		 300 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.623968  normal  0.854391 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0929  chromosome segregation DNA-binding protein  38.62 
 
 		 283 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1865  parB-like partition protein  46.74 
 
 		 298 aa  219  6e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0917667 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3760  parB-like partition proteins  42.33 
 
 		 294 aa  218  1e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0200998  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0029  chromosome segregation DNA-binding protein  42.42 
 
 		 305 aa  216  4e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3082  ParB-like partition protein  42.07 
 
 		 291 aa  213  2.9999999999999995e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0110147  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4615  chromosome segregation DNA-binding protein  42.66 
 
 		 289 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2940  parB-like partition protein  43.55 
 
 		 282 aa  210  2e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0115  chromosome segregation DNA-binding protein  40.96 
 
 		 295 aa  210  3e-53  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3552  parB-like partition protein  41.22 
 
 		 289 aa  209  5e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6364  chromosome partitioning protein Spo0J  43.69 
 
 		 290 aa  208  8e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73330  chromosome partitioning protein Spo0J  43.69 
 
 		 290 aa  208  9e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2567  transcriptional regulator  41.75 
 
 		 280 aa  208  1e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.183752  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3883  parB-like partition protein  40.82 
 
 		 295 aa  207  2e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0441095  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2752  chromosome segregation DNA-binding protein  44.18 
 
 		 286 aa  207  2e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000743085  normal  0.651861 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3956  parB-like partition protein  41.16 
 
 		 279 aa  207  2e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0209  parB-like partition protein  40.54 
 
 		 272 aa  206  3e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4501  parB-like partition protein  42.47 
 
 		 298 aa  206  3e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.125529 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2606  parB-like partition proteins  40.94 
 
 		 285 aa  205  7e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.860771 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4041  parB-like partition protein  41.61 
 
 		 279 aa  204  1e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.111922 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4494  ParB family protein  40.4 
 
 		 294 aa  204  1e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00131449  hitchhiker  0.00000708734 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1362  parB-like partition protein  39.06 
 
 		 286 aa  204  1e-51  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3193  parB-like partition protein  40.47 
 
 		 274 aa  204  1e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3176  parB-like partition protein  39.12 
 
 		 282 aa  204  2e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5044  parB family protein  42.72 
 
 		 300 aa  204  2e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3853  parB-like partition protein  40.2 
 
 		 292 aa  203  2e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0431793  unclonable  0.00000203867 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2378  chromosome segregation DNA-binding protein  40.35 
 
 		 289 aa  203  2e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0015  parB-like partition protein  42.21 
 
 		 304 aa  204  2e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0146438  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5439  parB-like partition protein  42.21 
 
 		 290 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0584  parB-like partition proteins  41.96 
 
 		 284 aa  203  2e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.654355  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3049  parB-like partition protein  41.67 
 
 		 272 aa  203  3e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.622521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4009  chromosome segregation DNA-binding protein  39.09 
 
 		 304 aa  203  3e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0625805 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2154  chromosome segregation DNA-binding protein  40.33 
 
 		 321 aa  203  3e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0001  parB-like partition protein  42.56 
 
 		 290 aa  202  4e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000184934 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5303  parB-like partition protein  42.56 
 
 		 290 aa  202  4e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157969  normal  0.0415765 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0207  parB-like partition protein  41.81 
 
 		 283 aa  202  4e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02929  chromosome partitioning protein  40.67 
 
 		 309 aa  202  4e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3313  ParB-like partition protein  41.02 
 
 		 286 aa  202  5e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.267567  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2815  parB-like partition protein  43.01 
 
 		 294 aa  202  5e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.121053  normal  0.211024 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3211  parB family protein  43.01 
 
 		 294 aa  202  5e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3965  parB-like partition protein  40.59 
 
 		 307 aa  202  6e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2403  parB-like partition protein  39.18 
 
 		 286 aa  201  9e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4248  parB-like partition protein  39.73 
 
 		 294 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00203372  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3278  chromosome segregation DNA-binding protein  40.47 
 
 		 305 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.325017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3209  chromosome segregation DNA-binding protein  41.2 
 
 		 288 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4470  parB-like partition protein  39.8 
 
 		 294 aa  200  1.9999999999999998e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000450981  hitchhiker  0.00000000228393 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0035  parB-like partition proteins  41.95 
 
 		 304 aa  199  3e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4374  parB-like partition protein  40.33 
 
 		 292 aa  200  3e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000285839  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4373  parB-like partition protein  40.33 
 
 		 292 aa  200  3e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000487851  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4318  parB-like partition protein  40.33 
 
 		 292 aa  200  3e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0394503  hitchhiker  0.000000000117233 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5208  parB-like partition protein  42.21 
 
 		 290 aa  200  3e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4515  parB-like partition protein  40.33 
 
 		 292 aa  200  3e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0559335  normal  0.0103959 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3750  chromosome segregation DNA-binding protein  36.88 
 
 		 305 aa  199  3e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000000652126  unclonable  0.00000102935 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4906  parB-like partition protein  40.33 
 
 		 296 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00066278  normal  0.174016 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0096  parB-like partition proteins  40.13 
 
 		 305 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>