More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3436 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_3436  nucleotidyl transferase  100 
 
 		 227 aa  454  1e-127  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2796  nucleotidyl transferase  56.7 
 
 		 223 aa  228  5e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0176  nucleotidyl transferase  53.78 
 
 		 221 aa  215  5e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00476295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1524  nucleotidyltransferase family protein  53.33 
 
 		 221 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0834784  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2953  nucleotidyl transferase  53.33 
 
 		 221 aa  211  9e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.295776  normal  0.0446833 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4543  nucleotidyl transferase  48.71 
 
 		 250 aa  199  3e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0136  nucleotidyl transferase  46.75 
 
 		 236 aa  197  1.0000000000000001e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2844  nucleotidyl transferase  46.85 
 
 		 226 aa  196  3e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.55388 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1607  Nucleotidyl transferase  48.29 
 
 		 248 aa  196  3e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0819429  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0159  nucleotidyl transferase  47.41 
 
 		 239 aa  192  3e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.938482  normal  0.555394 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0204  nucleotidyl transferase  46.05 
 
 		 257 aa  190  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.184599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0385  nucleotidyl transferase  45.61 
 
 		 241 aa  190  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.615277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0627  nucleotidyl transferase  47.37 
 
 		 240 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.065942  normal  0.378103 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0586  nucleotidyl transferase  45.85 
 
 		 250 aa  187  8e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.787562 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0079  Nucleotidyl transferase  44.74 
 
 		 240 aa  185  4e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.195195  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1999  nucleotidyl transferase  45.65 
 
 		 240 aa  183  2.0000000000000003e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00143776  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0492  nucleotidyl transferase  45.78 
 
 		 245 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021214 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3298  nucleotidyl transferase  47.66 
 
 		 255 aa  182  4.0000000000000006e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.998134 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2678  nucleotidyl transferase  45.02 
 
 		 252 aa  182  4.0000000000000006e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4064  nucleotidyl transferase  46.26 
 
 		 226 aa  182  5.0000000000000004e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.168419 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3244  nucleotidyl transferase  43.81 
 
 		 243 aa  181  8.000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0048  nucleotidyl transferase  44.74 
 
 		 241 aa  181  9.000000000000001e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.413317  normal  0.396027 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0053  nucleotidyltransferase protein  44.35 
 
 		 237 aa  180  2e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0056  nucleotidyl transferase  44.3 
 
 		 240 aa  178  7e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0088  putative nucleotidyl transferase family protein  45.25 
 
 		 240 aa  177  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.781518  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4288  Nucleotidyl transferase  42.73 
 
 		 243 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.237933  normal  0.419035 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3961  Nucleotidyl transferase  42.73 
 
 		 243 aa  175  6e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2101  nucleotidyltransferase family protein  44.02 
 
 		 239 aa  174  7e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.721567  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4894  Nucleotidyl transferase  45.78 
 
 		 248 aa  174  7e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.692515 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0665  nucleotidyl transferase  44.16 
 
 		 241 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.51351 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4851  nucleotidyl transferase  43.53 
 
 		 239 aa  173  1.9999999999999998e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.557988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3436  nucleotidyl transferase  45.96 
 
 		 253 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.604999  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4430  nucleotidyl transferase  45.33 
 
 		 248 aa  170  1e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.543814 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3579  nucleotidyl transferase  44.16 
 
 		 252 aa  171  1e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00479956  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4940  Nucleotidyl transferase  44 
 
 		 248 aa  169  3e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.291574 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2018  nucleotidyltransferase family protein  43.67 
 
 		 232 aa  167  9e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0084  nucleotidyl transferase  46.33 
 
 		 237 aa  162  4.0000000000000004e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.684587 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0819  nucleotidyl transferase  43.35 
 
 		 243 aa  162  5.0000000000000005e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.978036  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1297  putative nucleotidyl transferase  42.02 
 
 		 252 aa  149  3e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0963  nucleotidyl transferase  38.77 
 
 		 244 aa  126  4.0000000000000003e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.168083  hitchhiker  0.00146596 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2073  mannose-1-phosphate guanyltransferase  35.27 
 
 		 219 aa  121  9.999999999999999e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.403503  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0109  nucleotidyl transferase family protein  35.27 
 
 		 219 aa  120  1.9999999999999998e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00238886  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0197  nucleotidyl transferase  37.77 
 
 		 223 aa  120  1.9999999999999998e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0927184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0982  nucleotidyl transferase  37.5 
 
 		 225 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0968395  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0915  nucleotidyl transferase  40.27 
 
 		 222 aa  118  6e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.177826  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0406  nucleotidyl transferase  40.44 
 
 		 223 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0741  putative nucleotidyl transferase  40.17 
 
 		 224 aa  116  3e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.115145  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0440  nucleotidyl transferase  40 
 
 		 223 aa  116  3e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.792142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3307  Nucleotidyl transferase  37.5 
 
 		 225 aa  116  3e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.276059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0437  nucleotidyl transferase  41.86 
 
 		 223 aa  116  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07790  putative nucleotidyl transferase  39.91 
 
 		 224 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0225083 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2641  Nucleotidyl transferase  37.9 
 
 		 229 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.782296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3032  nucleotidyltransferase family protein  37.9 
 
 		 229 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1084  nucleotidyl transferase  37.07 
 
 		 225 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.166383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1051  nucleotidyl transferase  37.07 
 
 		 225 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00300889  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0565  nucleotidyl transferase  40.65 
 
 		 222 aa  113  3e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2300  Nucleotidyl transferase  37.9 
 
 		 230 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.706405  normal  0.0677947 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4796  nucleotidyl transferase  36.96 
 
 		 223 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.814441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5130  nucleotidyl transferase  35.09 
 
 		 223 aa  108  5e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0373  hypothetical protein  33.63 
 
 		 220 aa  108  6e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0348  hypothetical protein  33.8 
 
 		 220 aa  108  9.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1018  nucleotidyl transferase  38.53 
 
 		 228 aa  106  2e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.352994  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2073  nucleotidyl transferase  33.78 
 
 		 220 aa  106  3e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46780  nucleotidyl transferase  37.61 
 
 		 222 aa  105  5e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0867  nucleotidyl transferase  35.38 
 
 		 222 aa  105  7e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0335423  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0994  nucleotidyl transferase  35.53 
 
 		 225 aa  103  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.65594  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6040  nucleotidyl transferase  39.21 
 
 		 239 aa  103  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1652  nucleotidyl transferase  33.18 
 
 		 232 aa  102  4e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0497  Nucleotidyl transferase  34.19 
 
 		 232 aa  102  6e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.756206  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2814  nucleotidyl transferase  35.98 
 
 		 226 aa  100  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.164974  normal  0.604361 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3634  nucleotidyltransferase family protein  36.64 
 
 		 226 aa  99.8  3e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4622  nucleotidyl transferase  35.84 
 
 		 240 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0978754  normal  0.426238 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2101  nucleotidyl transferase  37.5 
 
 		 240 aa  99  5e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.539682  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2740  nucleotidyl transferase  37.5 
 
 		 240 aa  99.4  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.518203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2713  nucleotidyl transferase  37.5 
 
 		 240 aa  99  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3661  nucleotidyl transferase  35.09 
 
 		 223 aa  98.2  8e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3074  nucleotidyl transferase  33.02 
 
 		 232 aa  98.2  9e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0599  nucleotidyltransferase family protein  36.45 
 
 		 232 aa  97.8  1e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0586  nucleotidyl transferase  36.6 
 
 		 240 aa  97.4  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3416  nucleotidyl transferase  35.54 
 
 		 250 aa  96.3  4e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.307515  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0742  transaldolase AB  34.21 
 
 		 230 aa  95.1  7e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1452  Nucleotidyl transferase  36.28 
 
 		 243 aa  94.7  9e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.748194  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4008  nucleotidyl transferase  34.08 
 
 		 223 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0884  nucleotidyl transferase  34.62 
 
 		 249 aa  94.7  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000795934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3110  nucleotidyl transferase  35.48 
 
 		 222 aa  94  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.133152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2431  nucleotidyl transferase  35.48 
 
 		 223 aa  93.2  3e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2147  nucleotidyl transferase  34.5 
 
 		 221 aa  92.8  4e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0690  nucleotidyl transferase family protein  36.64 
 
 		 239 aa  92.4  5e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0206  nucleotidyltransferase family protein  36.64 
 
 		 239 aa  92.4  5e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2419  nucleotidyltransferase family protein  36.64 
 
 		 231 aa  92.4  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2739  nucleotidyltransferase family protein  36.64 
 
 		 239 aa  92.4  5e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0868  nucleotidyltransferase family protein  36.64 
 
 		 239 aa  92.4  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2339  nucleotidyltransferase family protein  36.64 
 
 		 239 aa  92.4  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.329535  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3204  nucleotidyl transferase  35.11 
 
 		 221 aa  92.4  5e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0602858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0969  nucleotidyl transferase  34.35 
 
 		 229 aa  92.4  5e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0165491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0704  nucleotidyl transferase family protein  36.64 
 
 		 239 aa  92  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1019  nucleotidyl transferase  33.91 
 
 		 229 aa  92  6e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.176753  normal  0.0292468 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1716  nucleotidyl transferase  32.08 
 
 		 240 aa  92.4  6e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0694785  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0975  Nucleotidyl transferase  33.33 
 
 		 236 aa  91.7  8e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.395928  normal  0.0477553 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02245  nucleotidyl transferase  35.4 
 
 		 236 aa  91.7  9e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.9499  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>