More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3367 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_0006  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  71.73 
 
 
509 aa  719    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1337  2-octaprenylphenol hydroxylase  70.99 
 
 
493 aa  686    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.42741  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4208  2-octaprenylphenol hydroxylase  74.54 
 
 
509 aa  729    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3367  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  100 
 
 
509 aa  1021    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3027  2-octaprenylphenol hydroxylase  70.53 
 
 
508 aa  716    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.272776 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2594  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  70.78 
 
 
509 aa  715    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.185494  hitchhiker  0.000000409266 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4510  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  72.59 
 
 
511 aa  692    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.850081  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3571  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  48.93 
 
 
524 aa  439  9.999999999999999e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000179776 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0387  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  48.59 
 
 
527 aa  434  1e-120  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.00400126  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4637  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  47.72 
 
 
524 aa  426  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.657767  normal  0.0525544 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1003  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  45.27 
 
 
527 aa  426  1e-118  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.232865  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1065  ubiquinone biosynthesis protein UbiB  45.27 
 
 
527 aa  425  1e-117  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.277258  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1318  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  50.61 
 
 
527 aa  422  1e-117  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0662679  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2241  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  49.89 
 
 
525 aa  425  1e-117  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4366  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  47.29 
 
 
524 aa  422  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00962608 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3928  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  48.61 
 
 
520 aa  419  1e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.875977  normal  0.133275 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4402  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  48.19 
 
 
520 aa  421  1e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3657  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  48.23 
 
 
534 aa  422  1e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  2.6671799999999998e-20 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4296  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  48.61 
 
 
521 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.156569 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2671  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  48.23 
 
 
520 aa  413  1e-114  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4090  2-octaprenylphenol hydroxylase  52.35 
 
 
524 aa  414  1e-114  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0171499  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2908  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  47.22 
 
 
523 aa  409  1e-113  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.306207 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0379  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  51.14 
 
 
522 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1348  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  48.18 
 
 
529 aa  411  1e-113  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0050  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  51.03 
 
 
518 aa  409  1e-113  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.725319  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0085  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  50.91 
 
 
525 aa  409  1e-113  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0082  2-octaprenylphenol hydroxylase  48.17 
 
 
524 aa  409  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.590645 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0210  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  50.57 
 
 
524 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.443925 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7056  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  51.08 
 
 
517 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0042  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  47.11 
 
 
526 aa  400  9.999999999999999e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0621  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  49.77 
 
 
524 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0569858  normal  0.317873 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6251  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  50.84 
 
 
517 aa  396  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.900931  normal  0.0207356 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2017  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  51.11 
 
 
523 aa  379  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0594  2-octaprenylphenol hydroxylase  46.24 
 
 
519 aa  369  1e-101  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.282335  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3185  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  45.25 
 
 
514 aa  369  1e-100  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.187339 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4883  2-octaprenylphenol hydroxylase  47.68 
 
 
510 aa  358  9.999999999999999e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3797  2-octaprenylphenol hydroxylase  48.42 
 
 
519 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00377233  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5072  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  48.45 
 
 
500 aa  348  1e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3494  2-octaprenylphenol hydroxylase  42.09 
 
 
530 aa  341  2e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0061  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  38.24 
 
 
558 aa  338  9.999999999999999e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3072  2-octaprenylphenol hydroxylase  46.76 
 
 
512 aa  338  9.999999999999999e-92  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1207  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  40.98 
 
 
553 aa  337  1.9999999999999998e-91  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.842555  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3417  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  38.9 
 
 
547 aa  330  4e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2019  ubiquinone biosynthesis protein AarF  42.58 
 
 
542 aa  329  6e-89  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0939  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  41.56 
 
 
476 aa  326  6e-88  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0101  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  39.31 
 
 
561 aa  320  5e-86  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.207696  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0250  2-octaprenylphenol hydroxylase  39.91 
 
 
480 aa  318  1e-85  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.602394  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0719  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  40.83 
 
 
509 aa  318  2e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4010  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  40.29 
 
 
522 aa  315  9.999999999999999e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000133652 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0521  2-octaprenylphenol hydroxylase  39.72 
 
 
527 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.273302  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4098  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  36.84 
 
 
549 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3869  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  35.83 
 
 
506 aa  315  1.9999999999999998e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.838483 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0071  2-octaprenylphenol hydroxylase  39.77 
 
 
553 aa  315  1.9999999999999998e-84  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3204  ubiquinone biosynthesis protein AarF  36.13 
 
 
549 aa  314  2.9999999999999996e-84  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0971234  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001925  ubiquinone biosynthesis monooxygenase UbiB  39.62 
 
 
544 aa  312  9e-84  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0745  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  39.32 
 
 
547 aa  311  2e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2998  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  40.05 
 
 
543 aa  311  2e-83  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2430  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  40.05 
 
 
544 aa  310  2.9999999999999997e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3794  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  36.52 
 
 
549 aa  310  4e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.647257  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0213  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  40.47 
 
 
522 aa  309  6.999999999999999e-83  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.331416 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45430  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  38.48 
 
 
537 aa  309  6.999999999999999e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0696  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  38.13 
 
 
514 aa  309  8e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66920  ubiquinone biosynthesis protein UbiB  36.68 
 
 
533 aa  309  9e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2820  hypothetical protein  34.03 
 
 
549 aa  308  1.0000000000000001e-82  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5804  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  36.68 
 
 
533 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0403  2-octaprenylphenol hydroxylase  35.02 
 
 
549 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.977603  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3553  2-octaprenylphenol hydroxylase  35.02 
 
 
549 aa  307  3e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.96851  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3958  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  37.38 
 
 
546 aa  306  4.0000000000000004e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0959958 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3727  2-octaprenylphenol hydroxylase  35.02 
 
 
549 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00564  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  39.14 
 
 
544 aa  306  5.0000000000000004e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0175  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  40.19 
 
 
551 aa  306  6e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.356136  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0840  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  37.44 
 
 
480 aa  306  7e-82  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.27773  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2972  hypothetical protein  33.61 
 
 
549 aa  305  1.0000000000000001e-81  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0065  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  36.8 
 
 
541 aa  305  1.0000000000000001e-81  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0459  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  37.3 
 
 
549 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0429  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  37.14 
 
 
549 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000673337 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4201  ubiquinone biosynthesis protein AarF  36.65 
 
 
549 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0417  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  37.14 
 
 
549 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.915437  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0504  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  37.38 
 
 
549 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0988  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  40.38 
 
 
504 aa  304  2.0000000000000002e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0443  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  37.14 
 
 
549 aa  304  3.0000000000000004e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.627543 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3897  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  37.14 
 
 
549 aa  304  3.0000000000000004e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4126  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  37.75 
 
 
521 aa  304  3.0000000000000004e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0185917  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1067  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  39.81 
 
 
525 aa  304  3.0000000000000004e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.487592  normal  0.456322 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3375  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  36.96 
 
 
549 aa  304  3.0000000000000004e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0562258  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0400  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  36.68 
 
 
546 aa  303  4.0000000000000003e-81  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4180  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  37.85 
 
 
546 aa  303  6.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.944164  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0385  2-octaprenylphenol hydroxylase  37.33 
 
 
534 aa  303  6.000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.312761  normal  0.126935 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4359  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  37.85 
 
 
546 aa  303  6.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4252  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  37.85 
 
 
546 aa  303  6.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4299  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  37.85 
 
 
546 aa  303  6.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.128892  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4203  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  37.85 
 
 
546 aa  303  6.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0799  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  37.53 
 
 
521 aa  303  6.000000000000001e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4144  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  38.08 
 
 
546 aa  303  7.000000000000001e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2120  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase accessory protein  36.61 
 
 
541 aa  303  7.000000000000001e-81  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.191993  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4307  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  38.08 
 
 
546 aa  303  7.000000000000001e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4173  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  38.08 
 
 
546 aa  303  7.000000000000001e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00514072 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5276  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  38.08 
 
 
546 aa  303  7.000000000000001e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.709941  normal  0.225701 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0870  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  37.53 
 
 
521 aa  303  7.000000000000001e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.216871  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4356  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  38.08 
 
 
546 aa  303  7.000000000000001e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>