More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3331 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_3331  beta-ketothiolase  100 
 
 		 394 aa  787    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3026  beta-ketothiolase  80.21 
 
 		 391 aa  630  1e-179  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.345239  normal  0.537231 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0262  beta-ketothiolase  82.01 
 
 		 391 aa  621  1e-177  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0012  beta-ketothiolase  74.23 
 
 		 389 aa  573  1.0000000000000001e-162  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0216237 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2663  beta-ketothiolase  73.66 
 
 		 393 aa  567  1e-160  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.574059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0022  beta-ketothiolase  73.64 
 
 		 400 aa  552  1e-156  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1354  beta-ketothiolase  73.2 
 
 		 389 aa  550  1e-155  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1581  beta-ketothiolase  63.78 
 
 		 394 aa  497  1e-139  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.328438  normal  0.0356466 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1910  beta-ketothiolase  63.78 
 
 		 394 aa  496  1e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.614831  normal  0.0602088 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1637  beta-ketothiolase  63.52 
 
 		 394 aa  493  9.999999999999999e-139  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.363472 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4451  acetyl-CoA acetyltransferase  64.86 
 
 		 392 aa  478  1e-134  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0975  beta-ketothiolase  60.91 
 
 		 394 aa  475  1e-133  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2335  beta-ketothiolase  59.9 
 
 		 394 aa  474  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.268919  normal  0.101585 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5080  beta-ketothiolase  60.61 
 
 		 396 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1850  beta-ketothiolase  59.9 
 
 		 394 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.373704  normal  0.0696668 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1076  beta-ketothiolase  58.88 
 
 		 394 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1316  beta-ketothiolase  58.88 
 
 		 394 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0933153  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1353  beta-ketothiolase  60.15 
 
 		 394 aa  467  9.999999999999999e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2325  beta-ketothiolase  59.14 
 
 		 394 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2197  beta-ketothiolase  59.14 
 
 		 427 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.112905  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2261  beta-ketothiolase  59.39 
 
 		 394 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.955375  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1805  beta-ketothiolase  58.88 
 
 		 427 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.815366  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0091  beta-ketothiolase  58.88 
 
 		 394 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.383998  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1362  beta-ketothiolase  60.77 
 
 		 394 aa  466  9.999999999999999e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2160  beta-ketothiolase  58.88 
 
 		 427 aa  464  1e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.473084  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1871  beta-ketothiolase  62.5 
 
 		 395 aa  461  1e-129  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2196  beta-ketothiolase  63.14 
 
 		 394 aa  462  1e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.858736 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2149  beta-ketothiolase  61.86 
 
 		 394 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00811795 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1577  beta-ketothiolase  61.17 
 
 		 394 aa  459  9.999999999999999e-129  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1734  beta-ketothiolase  61.68 
 
 		 394 aa  454  1e-127  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.6798  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1931  beta-ketothiolase  61.68 
 
 		 394 aa  454  1e-127  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.488777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1159  beta-ketothiolase  61.42 
 
 		 394 aa  455  1e-127  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6874  beta-ketothiolase  61.22 
 
 		 397 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000797473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5365  beta-ketothiolase  60.46 
 
 		 409 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199368  normal  0.275852 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1536  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  59.39 
 
 		 396 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.567648 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2009  beta-ketothiolase  61.6 
 
 		 394 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0651285  normal  0.413243 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3754  beta-ketothiolase  61.34 
 
 		 394 aa  451  1e-125  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.414029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5531  beta-ketothiolase  60.71 
 
 		 397 aa  450  1e-125  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.649531  normal  0.870894 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6768  beta-ketothiolase  60.71 
 
 		 397 aa  449  1e-125  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0332  beta-ketothiolase  58.46 
 
 		 421 aa  449  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000471879  hitchhiker  0.00997806 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1841  beta-ketothiolase  61.18 
 
 		 394 aa  449  1e-125  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1950  acetyl-CoA acetyltransferase  58.23 
 
 		 395 aa  449  1e-125  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273343 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5771  beta-ketothiolase  60.71 
 
 		 397 aa  448  1e-125  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0060  beta-ketothiolase  60.66 
 
 		 394 aa  447  1.0000000000000001e-124  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.629911 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1553  beta-ketothiolase  60.46 
 
 		 397 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6276  beta-ketothiolase  60.46 
 
 		 397 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.115814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5309  acetyl-CoA acetyltransferase  57.4 
 
 		 398 aa  443  1e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.330072 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0702  acetyl-CoA acetyltransferase  57.54 
 
 		 396 aa  435  1e-121  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000219092 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3022  beta-ketothiolase  59.08 
 
 		 393 aa  436  1e-121  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00935658  normal  0.736627 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0809  beta-ketothiolase  59.02 
 
 		 392 aa  435  1e-121  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0031  beta-ketothiolase  60.36 
 
 		 398 aa  436  1e-121  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2273  beta-ketothiolase  58.57 
 
 		 393 aa  432  1e-120  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0377  beta-ketothiolase  59.64 
 
 		 395 aa  432  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6830  acetyl-CoA acetyltransferase  57.76 
 
 		 393 aa  427  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.369067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0927  beta-ketothiolase  55.33 
 
 		 394 aa  418  1e-116  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0480332  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0032  beta-ketothiolase  58.21 
 
 		 395 aa  419  1e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0914  beta-ketothiolase  55.08 
 
 		 394 aa  419  1e-116  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.579266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0688  beta-ketothiolase  58.02 
 
 		 395 aa  418  1e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.494591  normal  0.737365 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4348  acetyl-CoA acetyltransferase  57.29 
 
 		 396 aa  414  9.999999999999999e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.430233  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0305  acetyl-CoA acetyltransferase  57.51 
 
 		 393 aa  417  9.999999999999999e-116  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.372663 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2893  beta-ketothiolase  56.81 
 
 		 393 aa  412  1e-114  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.229185 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0025  beta-ketothiolase  58.46 
 
 		 395 aa  414  1e-114  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0014  beta-ketothiolase  57.18 
 
 		 395 aa  412  1e-114  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.962279 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2659  beta-ketothiolase  53.98 
 
 		 393 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.738973  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16380  acetoacetyl-CoA thiolase  55.18 
 
 		 397 aa  393  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.506905  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1951  acetyl-CoA acetyltransferase  52.84 
 
 		 393 aa  393  1e-108  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3854  beta-ketothiolase  54.85 
 
 		 395 aa  380  1e-104  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1514  acetyl-CoA acetyltransferase  49.62 
 
 		 394 aa  367  1e-100  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.113339  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1165  acetyl-CoA acetyltransferase  50.38 
 
 		 393 aa  364  2e-99  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000755496  normal  0.122862 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0970  acetyl-CoA acetyltransferase  50.51 
 
 		 393 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1701  acetyl-CoA acetyltransferase  49.62 
 
 		 393 aa  360  2e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.689247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1138  acetyl-CoA acetyltransferase  50.64 
 
 		 393 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.495494 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2256  acetyl-CoA acetyltransferase  50 
 
 		 393 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0160796  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0543  acetyl-CoA acetyltransferase  50 
 
 		 393 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3597  acetyl-CoA acetyltransferase  50.38 
 
 		 393 aa  356  5e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.840519 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1109  acetyl-CoA acetyltransferase  46.8 
 
 		 391 aa  355  5.999999999999999e-97  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.228356  normal  0.198631 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0824  acetyl-CoA acetyltransferase  50.13 
 
 		 392 aa  355  5.999999999999999e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.122225  hitchhiker  0.00529979 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1484  acetyl-CoA acetyltransferase  49.74 
 
 		 393 aa  355  1e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.226113  normal  0.0550721 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4076  acetyl-CoA acetyltransferase  46.55 
 
 		 391 aa  354  1e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0498749  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3932  acetyl-CoA acetyltransferase  46.55 
 
 		 391 aa  354  1e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.650395  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3765  acetyl-CoA acetyltransferase  46.55 
 
 		 391 aa  354  1e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4043  acetyl-CoA acetyltransferase  46.55 
 
 		 391 aa  354  1e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4240  acetyl-CoA acetyltransferase  46.55 
 
 		 391 aa  354  1e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.749727  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4150  acetyl-CoA acetyltransferase  46.55 
 
 		 391 aa  353  2e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0127373  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2389  acetyl-CoA acetyltransferase  49.36 
 
 		 402 aa  354  2e-96  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.166385  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3852  acetyl-CoA acetyltransferase  46.29 
 
 		 391 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.647198  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2783  acetyl-CoA acetyltransferase  49.49 
 
 		 393 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1814  acetyl-CoA acetyltransferase  49.49 
 
 		 393 aa  353  4e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.390128 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6289  acetyl-CoA acetyltransferase  49.49 
 
 		 393 aa  353  4e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1790  acetyl-CoA acetyltransferase  49.49 
 
 		 393 aa  353  4e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2165  acetyl-CoA acetyltransferase  49.49 
 
 		 393 aa  352  5e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.810092  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6102  acetyl-CoA acetyltransferase  49.23 
 
 		 393 aa  352  5e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5091  acetyl-CoA acetyltransferase  49.23 
 
 		 393 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4636  acetyl-CoA acetyltransferase  49.36 
 
 		 392 aa  352  7e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3162  acetyl-CoA acetyltransferase  48.08 
 
 		 392 aa  352  7e-96  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2772  acetyl-CoA acetyltransferase  49.23 
 
 		 393 aa  351  1e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2158  acetyl-CoA acetyltransferase  49.23 
 
 		 393 aa  351  1e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2058  acetyl-CoA acetyltransferase  51.88 
 
 		 395 aa  350  2e-95  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2330  acetyl-CoA acetyltransferase  49.23 
 
 		 393 aa  350  2e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.2487  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4129  acetyl-CoA acetyltransferase  46.29 
 
 		 391 aa  350  2e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00256645  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>