90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3220 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_3220  cas1: CRISPR-associated protein Cas1  100 
 
 		 291 aa  574  1.0000000000000001e-163  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.615148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2234  CRISPR-associated protein Cas1  61.32 
 
 		 297 aa  322  4e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0949  CRISPR-associated Cas1 family protein  57.64 
 
 		 298 aa  317  1e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0628062  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0930  CRISPR-associated Cas1 family protein  57.64 
 
 		 296 aa  315  4e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.264886  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0347  CRISPR-associated Cas1 family protein  58.19 
 
 		 293 aa  308  5e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0486  CRISPR-associated protein Cas1  59.79 
 
 		 297 aa  298  1e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0583925  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0784  CRISPR-associated protein Cas1  57.59 
 
 		 294 aa  296  3e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0784  CRISPR-associated protein Cas1  57.79 
 
 		 294 aa  296  4e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00721188  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2989  CRISPR-associated Cas1 family protein  37.41 
 
 		 309 aa  175  8e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.786147  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3755  CRISPR-associated Cas1 family protein  37.69 
 
 		 304 aa  167  1e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.44675 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00872  CRISPR-associated protein Cas1  35.93 
 
 		 306 aa  164  2.0000000000000002e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3092  crispr-associated protein Cas1  37.01 
 
 		 305 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.79761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3148  CRISPR-associated protein Cas1  37.87 
 
 		 305 aa  163  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2337  CRISPR-associated Cas1 family protein  36.74 
 
 		 307 aa  162  6e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00747033  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3320  CRISPR-associated Cas1 family protein  42.67 
 
 		 320 aa  161  9e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.118981  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1808  CRISPR-associated Cas1 family protein  42.67 
 
 		 320 aa  161  9e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2830  CRISPR-associated Cas1 family protein  37.28 
 
 		 306 aa  161  1e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3541  CRISPR-associated Cas1 family protein  34.77 
 
 		 307 aa  160  3e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.608984  normal  0.0531608 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0933  CRISPR-associated protein Cas1  37.13 
 
 		 305 aa  159  4e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0957  CRISPR-associated Cas1 family protein  37.13 
 
 		 305 aa  159  4e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5409  CRISPR-associated protein Cas1  39.85 
 
 		 314 aa  159  8e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.031752  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2474  CRISPR-associated protein Cas1  36.36 
 
 		 307 aa  158  1e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3585  CRISPR-associated protein Cas1  38.24 
 
 		 307 aa  158  1e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0232  CRISPR-associated Cas1 family protein  35.13 
 
 		 306 aa  157  2e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2894  CRISPR-associated Cas1 family protein  36.76 
 
 		 305 aa  157  2e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0403  CRISPR-associated protein Cas1  37.05 
 
 		 305 aa  156  3e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0402524  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0964  CRISPR-associated Cas1 family protein  34.7 
 
 		 306 aa  157  3e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1592  CRISPR-associated Cas1 family protein  34.05 
 
 		 305 aa  156  4e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.328898 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0835  CRISPR-associated Cas1 family protein  35.23 
 
 		 307 aa  156  4e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.855521  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1392  CRISPR-associated Cas1 family protein  34.7 
 
 		 306 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4008  CRISPR-associated protein Cas1  35.29 
 
 		 307 aa  153  4e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1375  CRISPR-associated Cas1 family protein  36.03 
 
 		 299 aa  152  5e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00127759  normal  0.582034 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0858  CRISPR-associated Cas1 family protein  38.64 
 
 		 255 aa  152  5.9999999999999996e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.41465  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0599  CRISPR-associated Cas1 family protein  35.23 
 
 		 303 aa  152  8e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000773136  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3132  CRISPR-associated protein Cas1  35.34 
 
 		 306 aa  151  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3057  CRISPR-associated Cas1 family protein  35.34 
 
 		 306 aa  150  3e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.82457  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1602  CRISPR-associated protein Cas1  36.36 
 
 		 303 aa  150  3e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.19087  normal  0.843574 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3066  CRISPR-associated protein Cas1  34.96 
 
 		 306 aa  149  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3249  crispr-associated protein Cas1  34.96 
 
 		 306 aa  149  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.222064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2883  CRISPR-associated Cas1 family protein  34.96 
 
 		 307 aa  149  4e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.921772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0928  CRISPR-associated protein Cas1  36.26 
 
 		 303 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4088  CRISPR-associated protein Cas1  31.75 
 
 		 303 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0463414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0169  CRISPR-associated Cas1 family protein  33.94 
 
 		 313 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2444  CRISPR-associated protein Cas1  32.23 
 
 		 303 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.68429 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3013  CRISPR-associated protein Cas1  32.23 
 
 		 320 aa  144  2e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00425226  decreased coverage  0.00852288 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1286  CRISPR-associated protein Cas1  33.93 
 
 		 327 aa  143  3e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2685  CRISPR-associated protein Cas1  35.29 
 
 		 315 aa  143  3e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000995939  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1530  CRISPR-associated protein Cas1  35.16 
 
 		 327 aa  143  4e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00231307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17300  CRISPR-associated protein, Cas1 family  37.32 
 
 		 342 aa  142  5e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3904  CRISPR-associated protein Cas1  34.29 
 
 		 323 aa  140  3.9999999999999997e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.242948  normal  0.0868629 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0983  CRISPR-associated protein Cas1  31.29 
 
 		 314 aa  140  3.9999999999999997e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0765  CRISPR-associated endonuclease Cas1, ECOLI subtype  28.77 
 
 		 313 aa  136  3.0000000000000003e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0747275 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0422  CRISPR-associated protein Cas1  40.42 
 
 		 319 aa  137  3.0000000000000003e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0368078  normal  0.0376622 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0645  CRISPR-associated Cas1 family protein  35.96 
 
 		 315 aa  135  6.0000000000000005e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.354682  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1901  CRISPR-associated protein Cas1  32.78 
 
 		 324 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2636  CRISPR-associated Cas1 family protein  42 
 
 		 316 aa  134  9.999999999999999e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.34834  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1236  CRISPR-associated protein Cas1  30.04 
 
 		 337 aa  134  1.9999999999999998e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00257289  normal  0.15537 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0023  CRISPR-associated Cas1 family protein  40.59 
 
 		 330 aa  129  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.408897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0946  CRISPR-associated protein Cas1  35.25 
 
 		 324 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.291315  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1977  CRISPR-associated Cas1 family protein  33.76 
 
 		 320 aa  129  6e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.147845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3049  CRISPR-associated protein Cas1  34.96 
 
 		 318 aa  127  3e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000891408  hitchhiker  0.000905677 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17190  CRISPR-associated protein, Cas1 family  35.02 
 
 		 328 aa  126  3e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.866435  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0906  CRISPR-associated protein Cas1  31.67 
 
 		 291 aa  126  4.0000000000000003e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.16838  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2578  CRISPR-associated Cas1 family protein  38.61 
 
 		 322 aa  124  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0729404 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2164  CRISPR-associated protein Cas1  31.74 
 
 		 291 aa  123  3e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0192086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2676  CRISPR-associated protein Cas1  31.25 
 
 		 291 aa  123  3e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1413  CRISPR-associated protein Cas1  30.43 
 
 		 291 aa  118  9.999999999999999e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0233391  normal  0.0713718 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4348  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.39 
 
 		 277 aa  113  3e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1587  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.47 
 
 		 332 aa  92.8  6e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0375026  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33350  hypothetical protein  25 
 
 		 324 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.142175 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1401  CRISPR-associated Cas1 family protein  22.81 
 
 		 325 aa  59.7  0.00000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.612871  normal  0.155418 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2751  hypothetical protein  28.31 
 
 		 295 aa  59.3  0.00000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00117385  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1942  hypothetical cytosolic protein  21.27 
 
 		 322 aa  59.3  0.00000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1460  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.69 
 
 		 329 aa  57.8  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1535  CRISPR-associated protein Cas1  22.91 
 
 		 326 aa  53.9  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1644  CRISPR-associated Cas1 family protein  22.91 
 
 		 326 aa  53.9  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0746674  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1728  hypothetical protein  22.91 
 
 		 326 aa  53.9  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00792911  hitchhiker  0.000413169 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1209  CRISPR-associated Cas1 family protein  23.2 
 
 		 337 aa  53.5  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0696  CRISPR-associated protein Cas1  20.43 
 
 		 333 aa  52.8  0.000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.101778  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1819  CRISPR-associated Cas1 family protein  20.19 
 
 		 325 aa  52.4  0.000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0734  CRISPR-associated protein Cas1  21.34 
 
 		 333 aa  52.4  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2447  CRISPR-associated protein Cas1  22.8 
 
 		 325 aa  51.2  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.43322  normal  1 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0052  hypothetical protein  20.06 
 
 		 322 aa  50.1  0.00004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.553204  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3377  CRISPR-associated Cas1 family protein  20.75 
 
 		 325 aa  49.7  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000538903 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3241  CRISPR-associated Cas1 family protein  20.75 
 
 		 325 aa  49.7  0.00005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2837  hypothetical protein  20.06 
 
 		 322 aa  49.7  0.00006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3659  CRISPR-associated protein Cas1  22.37 
 
 		 326 aa  48.9  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.208917  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2719  hypothetical protein  33.33 
 
 		 130 aa  45.8  0.0009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0489  CRISPR-associated Cas1 family protein  21.18 
 
 		 334 aa  45.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.121384 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3327  CRISPR-associated protein Cas1  29.57 
 
 		 331 aa  43.1  0.006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>