More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3187 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_3187  nitric oxide reductase E protein  100 
 
 		 184 aa  356  9.999999999999999e-98  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3679  hypothetical protein  67.84 
 
 		 202 aa  203  9e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.668184 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2116  cytochrome c oxidase, subunit III  55.68 
 
 		 198 aa  152  2e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.479128 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2480  cytochrome c oxidase, subunit III  56.71 
 
 		 178 aa  148  3e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1513  cytochrome c oxidase subunit III  47.54 
 
 		 184 aa  142  2e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2086  NorE protein involved in nitric oxide reduction  46.45 
 
 		 192 aa  140  8e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.289144  normal  0.597939 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1639  cytochrome c oxidase subunit III  46.77 
 
 		 202 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6291  cytochrome c oxidase subunit III  42.53 
 
 		 183 aa  121  5e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4384  cytochrome c oxidase subunit III  40.11 
 
 		 187 aa  119  3e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0246  cytochrome c oxidase, subunit III  39.31 
 
 		 189 aa  117  9.999999999999999e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0819  cytochrome c oxidase, subunit III  38.33 
 
 		 203 aa  115  3e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0560  putative additional subunit of nitric oxide reductase (Nor) complex, membrane protein  38.17 
 
 		 197 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0830367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4575  cytochrome c oxidase, subunit III  36.31 
 
 		 200 aa  112  3e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.383719 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0622  putative cytochrome c oxidase subunit  40.88 
 
 		 190 aa  111  7.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.524381  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3192  putative additional subunit of nitric oxide reductase (Nor) complex, membrane protein  33.83 
 
 		 201 aa  109  3e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1250  cytochrome c oxidase, subunit III  35.64 
 
 		 197 aa  108  6e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.287461  hitchhiker  0.0000975001 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0222  cytochrome c oxidase, subunit III  37.57 
 
 		 234 aa  108  6e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1918  cytochrome c oxidase subunit III family protein  32.45 
 
 		 204 aa  106  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2320  cytochrome c oxidase subunit III family protein  32.76 
 
 		 174 aa  107  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0210247  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1813  cytochrome c oxidase, subunit III  38.14 
 
 		 194 aa  106  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0407  cytochrome c oxidase, subunit III  39.2 
 
 		 196 aa  106  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4156  cytochrome c oxidase subunit III family protein  32.09 
 
 		 205 aa  103  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.487941  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06790  putative cytochrome c oxidase subunit  40.23 
 
 		 175 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4757  cytochrome c oxidase, subunit III  39.01 
 
 		 193 aa  102  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0954288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4376  cytochrome c oxidase, subunit III  39.01 
 
 		 193 aa  102  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265005  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4463  cytochrome c oxidase, subunit III  39.01 
 
 		 193 aa  102  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.327335  normal  0.0356516 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2600  cytochrome c oxidase subunit III  37.91 
 
 		 204 aa  100  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1246  cytochrome/quinol oxidase subunit 3  34.15 
 
 		 214 aa  100  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1968  cytochrome c oxidase, subunit III  34.81 
 
 		 212 aa  99  3e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0224  cytochrome c oxidase subunit III  38.25 
 
 		 229 aa  99.4  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.933417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0168  cytochrome c oxidase subunit III  38.25 
 
 		 229 aa  99  4e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0413962 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0850  cytochrome c oxidase subunit III  35.11 
 
 		 211 aa  96.7  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0805  cytochrome c oxidase, subunit III  33.33 
 
 		 209 aa  95.9  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0853  cytochrome c oxidase subunit III  33.33 
 
 		 209 aa  95.1  5e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0857  cytochrome c oxidase subunit III  33.33 
 
 		 209 aa  95.1  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5815  cytochrome c oxidase subunit III  34.33 
 
 		 225 aa  94.7  6e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.186525  hitchhiker  0.0033512 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2704  cytochrome c oxidase subunit III  35.29 
 
 		 224 aa  93.2  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.343343  normal  0.321582 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1586  cytochrome c oxidase subunit III  30.11 
 
 		 234 aa  92.8  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3791  cytochrome c oxidase, subunit III  33.51 
 
 		 198 aa  92  4e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0359951  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3864  cytochrome c oxidase, subunit III  33.51 
 
 		 198 aa  92  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00290565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4437  cytochrome c oxidase, subunit III  35.33 
 
 		 209 aa  92  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.424494  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1777  cytochrome c oxidase, subunit III  31.76 
 
 		 211 aa  92  5e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.723591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4932  cytochrome c oxidase, subunit III  36.79 
 
 		 193 aa  91.3  8e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.318049  normal  0.0324373 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0026  cytochrome c oxidase subunit III  34.45 
 
 		 229 aa  90.9  9e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.471967 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3795  cytochrome c oxidase, subunit III  33.51 
 
 		 198 aa  90.5  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.478856  normal  0.908261 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1163  cytochrome c oxidase, subunit III family protein  33.89 
 
 		 209 aa  90.5  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.322361  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2238  cytochrome c oxidase, subunit III family protein  33.89 
 
 		 209 aa  90.5  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.394617  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0911  cytochrome c oxidase, subunit III  33.89 
 
 		 209 aa  90.5  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0998  cytochrome c oxidase, subunit III  33.89 
 
 		 209 aa  90.5  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0530  cytochrome c oxidase subunit III  33.71 
 
 		 207 aa  89.7  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3105  cytochrome c oxidase subunit I  35.2 
 
 		 819 aa  89.4  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0044  cytochrome c oxidase subunit III  31.68 
 
 		 199 aa  89  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.388042  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6884  cytochrome c oxidase subunit III  34.05 
 
 		 215 aa  89  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1541  cytochrome c oxidase, subunit III family protein  33.33 
 
 		 209 aa  88.6  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0077  cytochrome c oxidase, subunit III family protein  33.33 
 
 		 209 aa  88.6  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0129097  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0231  cytochrome c oxidase subunit III  31.19 
 
 		 226 aa  88.2  7e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38618  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1977  cytochrome c oxidase, subunit III  29.28 
 
 		 243 aa  86.7  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.888389  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0272  cytochrome c oxidase subunit III family protein  27.51 
 
 		 206 aa  85.5  4e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2994  cytochrome c oxidase, subunit III  29.23 
 
 		 229 aa  85.1  5e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.153495 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0043  cytochrome c oxidase subunit III  37.11 
 
 		 199 aa  84.7  6e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000712999 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3118  cytochrome c oxidase, subunit III  35.94 
 
 		 191 aa  84.7  7e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5946  cytochrome c oxidase subunit III  28.71 
 
 		 211 aa  83.6  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2421  cytochrome c oxidase subunit III  27.73 
 
 		 262 aa  84  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0162196  normal  0.448728 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1213  cytochrome c oxidase subunit III  29.48 
 
 		 208 aa  83.6  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.84888  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3575  cytochrome c oxidase  31.79 
 
 		 206 aa  83.6  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1602  cytochrome c oxidase subunit III  29.11 
 
 		 234 aa  82.4  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0896497  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1678  cytochrome c oxidase subunit III  29.11 
 
 		 234 aa  82.4  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6231  cytochrome c oxidase subunit III  36.41 
 
 		 225 aa  82.4  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.211629  normal  0.107946 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1900  Cytochrome-c oxidase  28.49 
 
 		 208 aa  82  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.910491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05061  cytochrome c oxidase, subunit III  29.07 
 
 		 200 aa  81.6  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.581628  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4120  Cytochrome-c oxidase  28.81 
 
 		 200 aa  81.6  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.929846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2248  cytochrome c oxidase subunit I  31.77 
 
 		 825 aa  81.6  0.000000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0586  Cytochrome-c oxidase  30.64 
 
 		 205 aa  81.3  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0569  cytochrome c oxidase subunit III  30.64 
 
 		 205 aa  81.3  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3134  cytochrome c oxidase, subunit III  30.16 
 
 		 215 aa  81.3  0.000000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1540  cytochrome c oxidase subunit III  33.17 
 
 		 199 aa  81.3  0.000000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4073  cytochrome c oxidase subunit III  33.08 
 
 		 214 aa  80.5  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3527  cytochrome c oxidase subunit III  29.71 
 
 		 199 aa  80.5  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000550439 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1824  cytochrome c oxidase, subunit III  31.09 
 
 		 199 aa  80.5  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.240701  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0257  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  29.14 
 
 		 201 aa  80.9  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3295  cytochrome c oxidase, subunit III  29.14 
 
 		 199 aa  80.1  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.496142  normal  0.166605 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2273  cytochrome c oxidase, subunit III  28.57 
 
 		 235 aa  79.7  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.545672  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0065  cytochrome c oxidase, subunit III  33.55 
 
 		 295 aa  80.1  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4178  cytochrome c oxidase, subunit III  34.33 
 
 		 211 aa  80.1  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.304449  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04991  cytochrome c oxidase, subunit III  28.49 
 
 		 200 aa  79.3  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.487367  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0183  cytochrome c oxidase subunit III  32.26 
 
 		 295 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2777  cytochrome c oxidase, subunit III  29.79 
 
 		 211 aa  79.3  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.735853 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0513  cytochrome c oxidase subunit III  30.23 
 
 		 202 aa  79  0.00000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01320  cytochrome c oxidase, subunit III  31.61 
 
 		 295 aa  78.6  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.647452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04681  cytochrome c oxidase, subunit III  28.49 
 
 		 200 aa  78.2  0.00000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2604  cytochrome c oxidase subunit III  31.43 
 
 		 195 aa  78.2  0.00000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.204507 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1788  cytochrome c oxidase subunit III  31.49 
 
 		 208 aa  78.2  0.00000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1679  cytochrome c oxidase subunit III  37.12 
 
 		 293 aa  77.8  0.00000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2267  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  29.95 
 
 		 211 aa  77  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.462963  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2224  putative denitrification protein NorE  28.57 
 
 		 202 aa  77  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3161  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  28.74 
 
 		 209 aa  77  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000281204 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2812  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  28.74 
 
 		 213 aa  77  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0443  cytochrome c oxidase, subunit III  28.49 
 
 		 200 aa  76.6  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.547798  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3541  cytochrome c oxidase, subunit I  31.79 
 
 		 743 aa  76.3  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0106  cytochrome c oxidase subunit III  32.67 
 
 		 208 aa  76.6  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>