126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3147 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_3147  hypothetical protein  100 
 
 		 246 aa  478  1e-134  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.075945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3279  hypothetical protein  51.2 
 
 		 142 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.529844  normal  0.627727 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2593  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  29.03 
 
 		 267 aa  99.4  5e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0695  hypothetical protein  27.42 
 
 		 267 aa  93.2  3e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0686  hypothetical protein  27.02 
 
 		 297 aa  90.5  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2470  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  29.96 
 
 		 282 aa  88.6  8e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0121591  normal  0.0239407 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1898  twin-arginine translocation pathway signal  40.19 
 
 		 154 aa  82.8  0.000000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3700  hypothetical protein  41.28 
 
 		 161 aa  78.6  0.00000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1519  putative lipoprotein  37.4 
 
 		 132 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.345658  normal  0.713007 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4204  hypothetical protein  37.4 
 
 		 132 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.40853 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16840  putative lipoprotein  37.8 
 
 		 132 aa  75.1  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1125  lipoprotein  36.64 
 
 		 132 aa  75.1  0.0000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.719915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4099  lipoprotein  35.88 
 
 		 132 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1465  putative lipoprotein  36.22 
 
 		 132 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.160617  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0254  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  36.53 
 
 		 266 aa  73.2  0.000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4709  putative lipoprotein  42.42 
 
 		 144 aa  73.6  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0121  hypothetical protein  38.98 
 
 		 149 aa  72.8  0.000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.797255 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2630  hypothetical protein  43.64 
 
 		 297 aa  70.1  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.427988 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1424  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  38.53 
 
 		 152 aa  68.6  0.00000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1548  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  29.08 
 
 		 305 aa  67.4  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00510236 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1083  putative lipoprotein  38.05 
 
 		 132 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1373  hypothetical protein  38.3 
 
 		 136 aa  67  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0504546 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3075  putative lipoprotein  37.14 
 
 		 173 aa  65.9  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000475601  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3035  hypothetical protein  35.9 
 
 		 210 aa  66.2  0.0000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.288853  normal  0.111602 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3216  putative lipoprotein  37.14 
 
 		 173 aa  65.9  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.696284  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3082  lipoprotein-related protein  42.45 
 
 		 141 aa  65.9  0.0000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.185373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1394  hypothetical protein  39.47 
 
 		 144 aa  63.9  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.031757  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1928  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  36.11 
 
 		 278 aa  62.4  0.000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000453787  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0582  putative lipoprotein  35.45 
 
 		 143 aa  62  0.000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000375847  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2666  hypothetical protein  37.39 
 
 		 144 aa  62  0.000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000306187  normal  0.191163 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2773  hypothetical protein  37.39 
 
 		 144 aa  62  0.000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.474482  hitchhiker  0.00136931 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2599  hypothetical protein  37.39 
 
 		 144 aa  61.2  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000664036  hitchhiker  0.00000856257 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004013  lipoprotein-related protein  39.62 
 
 		 144 aa  61.6  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1194  hypothetical protein  33.62 
 
 		 228 aa  61.2  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0921  glycoprotein/polysaccharide metabolism  35.83 
 
 		 189 aa  60.5  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.226366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0515  putative lipoprotein  36 
 
 		 189 aa  60.1  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.335784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0568  hypothetical protein  36 
 
 		 189 aa  60.1  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0525  putative lipoprotein  36 
 
 		 189 aa  60.1  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0465904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0506  putative lipoprotein  36 
 
 		 189 aa  60.1  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000703673  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0509  putative lipoprotein  36 
 
 		 189 aa  60.1  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.668519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2859  hypothetical protein  42.17 
 
 		 139 aa  59.7  0.00000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00929385  hitchhiker  0.00000000043608 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1492  hypothetical protein  42.17 
 
 		 139 aa  59.7  0.00000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000310821  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1487  hypothetical protein  42.17 
 
 		 139 aa  59.7  0.00000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0816292  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1523  hypothetical protein  42.17 
 
 		 139 aa  59.7  0.00000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0159792  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00405  predicted outer membrane lipoprotein  35 
 
 		 190 aa  58.9  0.00000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00409  hypothetical protein  35 
 
 		 190 aa  58.9  0.00000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0489  putative lipoprotein  35 
 
 		 190 aa  58.9  0.00000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4560  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  28.97 
 
 		 284 aa  58.5  0.00000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.98407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0798  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  35.96 
 
 		 148 aa  58.2  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.952791  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01451  hypothetical protein  37 
 
 		 144 aa  58.2  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0530  putative lipoprotein  35 
 
 		 190 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0543  putative lipoprotein  35 
 
 		 185 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.50203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3162  glycoprotein/polysaccharide metabolism  35 
 
 		 190 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0497  putative lipoprotein  35 
 
 		 190 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1675  hypothetical protein  40.74 
 
 		 125 aa  57.4  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3278  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  29.05 
 
 		 280 aa  57.4  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0192  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  28.87 
 
 		 354 aa  57.8  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000042827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3930  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  28.63 
 
 		 274 aa  56.6  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0182  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  31.07 
 
 		 365 aa  55.5  0.0000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.630616  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3156  conserved hypothetical protein  34 
 
 		 190 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.858149  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1063  lipoprotein  36.17 
 
 		 193 aa  54.7  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2665  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  32.32 
 
 		 335 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1112  putative lipoprotein  37.36 
 
 		 163 aa  53.1  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000897823  hitchhiker  0.00000162029 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0508  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  33.94 
 
 		 126 aa  53.9  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2552  hypothetical protein  33.68 
 
 		 133 aa  53.1  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3054  lipoprotein  36.17 
 
 		 185 aa  52.8  0.000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0385716  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1402  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  32.99 
 
 		 146 aa  52.4  0.000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.418877  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1816  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  33.02 
 
 		 242 aa  52  0.000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3248  lipoprotein  35.11 
 
 		 194 aa  51.6  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1969  putative lipoprotein  35.11 
 
 		 162 aa  51.2  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.612911  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0743  hypothetical protein  30.89 
 
 		 288 aa  51.2  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0212  hypothetical protein  28.29 
 
 		 176 aa  50.4  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1471  hypothetical protein  32.26 
 
 		 133 aa  50.4  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0482642  hitchhiker  0.000540477 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2578  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  28.57 
 
 		 279 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1348  hypothetical protein  39.73 
 
 		 224 aa  49.3  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.243872  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4523  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  32.91 
 
 		 139 aa  49.3  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.207196  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1923  hypothetical protein  39.73 
 
 		 182 aa  49.3  0.00006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.87534  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1033  hypothetical protein  39.73 
 
 		 182 aa  49.3  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.365055  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0834  hypothetical protein  39.73 
 
 		 182 aa  49.3  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.653609  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1186  hypothetical protein  39.73 
 
 		 182 aa  49.3  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.323907  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1194  hypothetical protein  39.73 
 
 		 182 aa  49.3  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.121272  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0316  hypothetical protein  39.73 
 
 		 182 aa  49.3  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00587093  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3541  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  29.13 
 
 		 145 aa  48.9  0.00007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1980  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  33.33 
 
 		 149 aa  48.9  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0977  hypothetical protein  40 
 
 		 187 aa  48.9  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2252  putative lipoprotein  26.09 
 
 		 138 aa  48.5  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.208393  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2054  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  40.85 
 
 		 234 aa  48.5  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.957862  normal  0.117423 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2785  hypothetical protein  36.47 
 
 		 133 aa  48.1  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0379372  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1254  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  32.29 
 
 		 151 aa  47.8  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.540401  normal  0.154785 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5662  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  36.19 
 
 		 181 aa  47.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.938365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0957  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  42.31 
 
 		 181 aa  47.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0115  hypothetical protein  36.46 
 
 		 478 aa  46.6  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.3697  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0260  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  37.17 
 
 		 206 aa  46.2  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0115  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  36.46 
 
 		 478 aa  46.6  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2405  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  36.11 
 
 		 138 aa  46.2  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.437003  hitchhiker  0.00230018 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2088  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  43.06 
 
 		 197 aa  45.8  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.162999  normal  0.076046 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3205  hypothetical protein  36.47 
 
 		 143 aa  45.8  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0205729  unclonable  0.0000000149917 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1889  hypothetical protein  34.19 
 
 		 159 aa  45.4  0.0008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1173  heat shock protein-like  29.91 
 
 		 157 aa  45.4  0.0009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1708  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  37.14 
 
 		 181 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>