246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3078 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009952  Dshi_3078  AzlC family protein  100 
 
 
234 aa  459  9.999999999999999e-129  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2457  AzlC family protein  56.52 
 
 
235 aa  253  1.0000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.201604  normal  0.404255 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0739  branched chain amino acid efflux pump, large (AzlC) subunit  54.78 
 
 
235 aa  249  2e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2393  AzlC family protein  54.78 
 
 
235 aa  249  2e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0461  AzlC-like  55.07 
 
 
240 aa  240  1e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3757  AzlC-like  50.64 
 
 
242 aa  233  3e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0429  AzlC family protein  52.65 
 
 
258 aa  206  3e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.000397006  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1962  AzlC family protein  39.11 
 
 
240 aa  164  2.0000000000000002e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1381  AzlC family protein  42.4 
 
 
234 aa  161  7e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.690005  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1415  AzlC family protein  38.77 
 
 
240 aa  142  5e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.430613  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0007  AzlC family protein  35.09 
 
 
246 aa  135  6.0000000000000005e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3295  AzlC family protein  41.41 
 
 
258 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0092  AzlC family protein  32.29 
 
 
228 aa  132  3e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0404  AzlC family protein  42.79 
 
 
242 aa  128  9.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.54377 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0389  AzlC family protein  42.25 
 
 
242 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3971  AzlC family protein  36.12 
 
 
244 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.312774  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0513  hypothetical protein  41.78 
 
 
242 aa  124  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0568797 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2539  branched-chain amino acid transport protein AzlC  31.3 
 
 
250 aa  122  5e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0525733  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0495  AzlC-like  39.34 
 
 
257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.294752  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2851  AzlC-like protein  42.01 
 
 
243 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.537039  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4209  branched chain amino acid efflux pump, AzlCD (extrudes azaleucine)  34.48 
 
 
255 aa  118  6e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000558659  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0434  AzlC-like protein  36.44 
 
 
265 aa  118  7e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.72937  normal  0.152736 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3606  AzlC family protein  33.03 
 
 
228 aa  115  7.999999999999999e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4071  AzlC family protein  39 
 
 
247 aa  113  3e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1996  AzlC-like  39.33 
 
 
241 aa  109  4.0000000000000004e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2058  AzlC family protein  39.33 
 
 
238 aa  107  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0454458 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2207  AzlC family protein  34.05 
 
 
292 aa  107  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0109045  normal  0.696476 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2936  AzlC family protein  33.03 
 
 
253 aa  107  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000187359  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1055  AzlC family protein  33.62 
 
 
250 aa  105  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0170281  normal  0.980601 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1096  AzlC family protein  34.05 
 
 
255 aa  105  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000023066  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4125  AzlC-like  33.19 
 
 
233 aa  105  6e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0617  AzlC-like  34.05 
 
 
280 aa  105  6e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.152652  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0804  AzlC family protein  31.76 
 
 
255 aa  105  9e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0112465  normal  0.194655 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1048  branched chain amino acid efflux pump LivE  33.94 
 
 
253 aa  103  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0218893  normal  0.990506 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0922  AzlC-like protein  30.57 
 
 
229 aa  102  7e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.376984  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1756  AzlC family protein  34.72 
 
 
240 aa  100  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2830  AzlC family protein  33.64 
 
 
243 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.997808  normal  0.0740152 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2569  AzlC family protein  33.64 
 
 
243 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2568  AzlC family protein  34.83 
 
 
233 aa  99.8  4e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2107  AzlC family protein  30 
 
 
244 aa  98.6  7e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000413868 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0976  AzlC family protein  34.91 
 
 
257 aa  98.2  9e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000153015  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0497  AzlC-like protein  28.27 
 
 
266 aa  97.1  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.896063  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0972  AzlC family protein  34.98 
 
 
257 aa  97.4  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00116086  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0256  AzlC family protein  29.65 
 
 
233 aa  95.9  5e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0306834  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1241  AzlC-like  31.6 
 
 
240 aa  95.5  7e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3053  AzlC family protein  35.65 
 
 
240 aa  94  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1274  AzlC family protein  28.51 
 
 
241 aa  92.4  6e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0235  AzlC family protein  31.42 
 
 
239 aa  90.9  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1955  AzlC-like protein  33.19 
 
 
242 aa  89.4  5e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.552602  normal  0.748996 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06280  hypothetical protein  29.69 
 
 
247 aa  88.6  7e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0668  AzlC family protein  25.53 
 
 
251 aa  88.2  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.69294 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2852  hypothetical protein  35.8 
 
 
236 aa  88.2  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2930  AzlC family protein  32.84 
 
 
245 aa  87.8  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.862263 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1470  AzlC family protein  32.46 
 
 
247 aa  87  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.555433  normal  0.0212209 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1599  AzlC family protein  28.76 
 
 
241 aa  87.4  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.732241  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1562  branched-chain amino acid transport protein  28.76 
 
 
241 aa  87.4  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1551  branched-chain amino acid transport protein  28.76 
 
 
241 aa  87  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1772  AzlC family protein  28.76 
 
 
241 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2174  AzlC family protein  34.93 
 
 
282 aa  87  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1722  AzlC family protein  28.76 
 
 
241 aa  87.4  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3535  AzlC family protein  29.65 
 
 
234 aa  87.4  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.485711  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1741  AzlC family protein  28.76 
 
 
241 aa  86.7  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001440  AzlC family protein  30.04 
 
 
236 aa  86.7  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1850  AzlC family protein  28.33 
 
 
241 aa  86.7  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1795  AzlC family protein  28.33 
 
 
241 aa  86.3  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3602  AzlC family protein  28.33 
 
 
241 aa  86.3  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1598  AzlC family protein  28.26 
 
 
242 aa  85.1  8e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.829588  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1691  AzlC family protein  33.91 
 
 
249 aa  85.1  9e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0039071  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0661  AzlC family protein  26.26 
 
 
253 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.428637  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1521  AzlC family protein  29.13 
 
 
240 aa  84  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.160339  normal  0.0253198 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0993  AzlC family protein  26.26 
 
 
249 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.486943  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0831  AzlC family protein  26.26 
 
 
249 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0835  AzlC family protein  26.26 
 
 
249 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.327675  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1048  AzlC family protein  34.48 
 
 
239 aa  82.8  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.635435 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0687  branched chain amino acid efflux pump LivE  27.68 
 
 
248 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.264369 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2538  AzlC family protein  29.36 
 
 
245 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4092  AzlC family protein  28.38 
 
 
242 aa  82.8  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0294  AzlC family protein  26.73 
 
 
249 aa  81.6  0.000000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.871513  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0589  AzlC family protein  26.73 
 
 
249 aa  81.6  0.000000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2422  AzlC family protein  26.73 
 
 
249 aa  81.6  0.000000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0035  AzlC family protein  26.73 
 
 
249 aa  81.6  0.000000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2019  AzlC-like  25 
 
 
272 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3237  AzlC family protein  28.1 
 
 
286 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000344272  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2630  AzlC family protein  25 
 
 
272 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.805391  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2659  AzlC family protein  25.42 
 
 
251 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.334456  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2550  AzlC family protein  26.72 
 
 
251 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.121866  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0563  AzlC-like  25.85 
 
 
276 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.973282  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4637  AzlC-like  30.46 
 
 
255 aa  80.9  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.621968  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3279  AzlC family protein  28.22 
 
 
248 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.981424  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3248  hypothetical protein  30.41 
 
 
247 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.351031  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5110  AzlC family protein  28.64 
 
 
246 aa  80.1  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0256895  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0320  branched chain amino acid ABC transporter  31.4 
 
 
242 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2677  AzlC family protein  26.27 
 
 
251 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.820347  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1459  AzlC family protein  28.81 
 
 
293 aa  78.6  0.00000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.878975  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38160  hypothetical protein  29.49 
 
 
252 aa  78.2  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0013657 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0768  AzlC family protein  33.17 
 
 
234 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.390341  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1760  AzlC family protein  30 
 
 
230 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2694  AzlC family protein  28.77 
 
 
255 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0350  AzlC family protein  32.02 
 
 
238 aa  77.8  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.303967  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3876  AzlC family protein  31.08 
 
 
249 aa  78.2  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>