238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3070 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_3070  methyltransferase type 11  100 
 
 		 256 aa  501  1e-141  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0748  N-6 adenine-specific DNA methylase  56.61 
 
 		 253 aa  248  8e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2404  methyltransferase small  57.14 
 
 		 253 aa  245  4e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.773816 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2469  methyltransferase small  54.55 
 
 		 271 aa  239  2e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3740  methyltransferase small  51.21 
 
 		 262 aa  230  2e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2029  methyltransferase small  48 
 
 		 252 aa  205  7e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.958184  normal  0.205429 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0489  methyltransferase small  48.56 
 
 		 247 aa  196  2.0000000000000003e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0724  O-methyltransferase  44.62 
 
 		 260 aa  174  1.9999999999999998e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1434  O-methyltransferase-like protein  41.56 
 
 		 239 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2351  hypothetical protein  40.77 
 
 		 257 aa  122  8e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.114107 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1234  methyltransferase small  41.48 
 
 		 259 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2952  methyltransferase small  40.49 
 
 		 260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.275413  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1216  methyltransferase small  39.38 
 
 		 259 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.937877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2182  methyltransferase small  42.73 
 
 		 242 aa  112  6e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3377  methyltransferase small  40.08 
 
 		 245 aa  112  8.000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.726212 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5345  methyltransferase small  39.48 
 
 		 252 aa  108  6e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0053  putative methyltransferase  37.75 
 
 		 272 aa  108  1e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0442288  normal  0.047519 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3299  methyltransferase small  39.11 
 
 		 250 aa  101  9e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.36754  normal  0.847529 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3425  methyltransferase small  38.05 
 
 		 250 aa  101  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.777581 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4352  methyltransferase small  42.31 
 
 		 253 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.165994  hitchhiker  0.00950666 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3214  methyltransferase small  37.87 
 
 		 288 aa  100  3e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.0042849  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1113  methyltransferase small  39.11 
 
 		 257 aa  100  3e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3106  methyltransferase small  38.96 
 
 		 250 aa  99  6e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.179696 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1090  methyltransferase small  40.87 
 
 		 265 aa  91.3  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3437  methyltransferase small  34.32 
 
 		 258 aa  90.5  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0010281  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3774  methyltransferase small  32.16 
 
 		 256 aa  90.1  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0460  methyltransferase small  33.74 
 
 		 256 aa  89.4  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.672041  normal  0.644692 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2590  methyltransferase small  35.93 
 
 		 261 aa  88.6  8e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.118813 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1375  methyltransferase small  36.8 
 
 		 256 aa  84.7  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0039  hypothetical protein  28.32 
 
 		 246 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577927  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4373  methyltransferase small  39.82 
 
 		 249 aa  83.2  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2876  putative RNA methylase:methyltransferase small  32.13 
 
 		 255 aa  83.2  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0219603  hitchhiker  0.0000945883 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0032  hypothetical protein  28.76 
 
 		 246 aa  82.8  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0043  hypothetical protein  28.76 
 
 		 246 aa  82.8  0.000000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0059  methyltransferase small  28.9 
 
 		 248 aa  82  0.000000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0440874  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5277  hypothetical protein  27.88 
 
 		 246 aa  82  0.000000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0030  methyltransferase  28.32 
 
 		 246 aa  82  0.000000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0030  methyltransferase  28.32 
 
 		 246 aa  82  0.000000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0039  hypothetical protein  28.32 
 
 		 246 aa  82  0.000000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0713  methyltransferase small  34.25 
 
 		 249 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.54079 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0543  methyltransferase small  28.44 
 
 		 241 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000179324  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0029  methyltransferase  27.88 
 
 		 246 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1198  Methyltransferase type 11  29.44 
 
 		 248 aa  80.9  0.00000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0033  hypothetical protein  27.88 
 
 		 246 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0031  hypothetical protein  27.88 
 
 		 246 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2743  methyltransferase small  34.23 
 
 		 245 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.85396  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0029  hypothetical protein  28.44 
 
 		 246 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20330  methyltransferase small  27.83 
 
 		 246 aa  79.7  0.00000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.349478  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0212  methyltransferase small  22.31 
 
 		 247 aa  79.7  0.00000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0709  methyltransferase small  32.62 
 
 		 286 aa  79.3  0.00000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.239384  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1417  methyltransferase small  33.19 
 
 		 268 aa  79.3  0.00000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.399028  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3911  methyltransferase type 11  27.65 
 
 		 256 aa  78.6  0.00000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0045  SAM-dependent methyltransferases  29.65 
 
 		 251 aa  77.8  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000698926  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3500  methyltransferase small  32.92 
 
 		 266 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.3587600000000004e-33 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1977  methyltransferase small  34.03 
 
 		 258 aa  76.6  0.0000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.7461 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0030  methyltransferase small  26.86 
 
 		 249 aa  77  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1201  O-methyltransferase  26.79 
 
 		 254 aa  75.1  0.000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.528983  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0637  hypothetical protein  32.46 
 
 		 258 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.973634  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0012  N-6 adenine-specific DNA methylases, putative  24.88 
 
 		 220 aa  72.4  0.000000000006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3501  hypothetical protein  33.33 
 
 		 275 aa  72.4  0.000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1706  methyltransferase small  24.47 
 
 		 228 aa  71.6  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0151999  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0266  hypothetical protein  26.79 
 
 		 249 aa  70.9  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00284579  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2227  SAM-dependent methyltransferase  31.47 
 
 		 249 aa  70.5  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000281055  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0779  hypothetical protein  24.77 
 
 		 254 aa  69.3  0.00000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.621531  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0125  hypothetical protein  24.43 
 
 		 241 aa  68.6  0.00000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0525  methyltransferase small  30.17 
 
 		 258 aa  68.6  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.3555  normal  0.371328 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0517  methyltransferase small  28.94 
 
 		 264 aa  68.6  0.00000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0590  methyltransferase small  23.72 
 
 		 237 aa  68.2  0.0000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2102  methyltransferase small  24.53 
 
 		 251 aa  68.6  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000596088  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0945  hypothetical protein  34.88 
 
 		 242 aa  67.4  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0681  O-methyltransferase-like protein  28.97 
 
 		 251 aa  66.6  0.0000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000217038  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0275  hypothetical protein  25.45 
 
 		 249 aa  66.2  0.0000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.343318  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0384  methyltransferase domain-containing protein  26.92 
 
 		 263 aa  66.6  0.0000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0028  methyltransferase small  26.34 
 
 		 249 aa  66.2  0.0000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0569  methyltransferase small  30.96 
 
 		 256 aa  65.9  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1154  methyltransferase small  20.93 
 
 		 233 aa  65.5  0.0000000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl674  S-adenosylmethionine:2-demethylmenaquinone methyltransferase  22.86 
 
 		 240 aa  65.1  0.000000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0399  hypothetical protein  27.23 
 
 		 252 aa  64.3  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2755  methyltransferase small  32.44 
 
 		 250 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0705  methyltransferase small  30.21 
 
 		 268 aa  64.3  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.566489  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0408  hypothetical protein  27.23 
 
 		 252 aa  64.3  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.429668  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0162  Methyltransferase type 11  25.57 
 
 		 260 aa  63.5  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000119856  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1524  hypothetical protein  24.77 
 
 		 254 aa  63.5  0.000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.930165  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1321  methyltransferase small  21.46 
 
 		 235 aa  63.2  0.000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1296  SAM-dependent methyltransferase  28.25 
 
 		 236 aa  62.4  0.000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0841  methyltransferase small  29.51 
 
 		 238 aa  62.4  0.000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3451  methyltransferase type 12  29.51 
 
 		 238 aa  62.4  0.000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0508  hypothetical protein  23.27 
 
 		 241 aa  61.6  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0521  hypothetical protein  23.27 
 
 		 241 aa  61.6  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.37562  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3526  methyltransferase small  28.96 
 
 		 238 aa  60.5  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2444  hypothetical protein  23.04 
 
 		 243 aa  60.1  0.00000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0923  conserved hypothetical protein, possible methylase  24.42 
 
 		 230 aa  59.7  0.00000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1949  UDP-MurNac-pentapeptide presynthetase  22.97 
 
 		 237 aa  59.3  0.00000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000302465  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0800  O-methyltransferase  25.11 
 
 		 338 aa  59.3  0.00000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000866383  hitchhiker  1.55907e-17 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3645  methyltransferase small  28.42 
 
 		 238 aa  58.5  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0974  O-methyltransferase  21.92 
 
 		 330 aa  58.5  0.0000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0397708  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2741  hypothetical protein  39 
 
 		 247 aa  58.2  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0330  O-methyltransferase-like protein  23.59 
 
 		 217 aa  57.8  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3602  hypothetical protein  34.03 
 
 		 248 aa  57  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.924537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1180  methyltransferase small  34.03 
 
 		 252 aa  57  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>