More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3067 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_3067  acetoacetyl-CoA reductase  100 
 
 		 240 aa  487  1e-137  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0492  acetoacetyl-CoA reductase  91.25 
 
 		 240 aa  458  9.999999999999999e-129  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3736  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  86.25 
 
 		 240 aa  429  1e-119  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2402  acetoacetyl-CoA reductase  77.92 
 
 		 240 aa  390  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0747  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  77.92 
 
 		 240 aa  390  1e-107  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.333065  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2027  acetoacetyl-CoA reductase  77.59 
 
 		 241 aa  379  1e-104  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.631295  normal  0.210082 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2467  acetoacetyl-CoA reductase  75.42 
 
 		 241 aa  367  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.109628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3821  acetoacetyl-CoA reductase  70.95 
 
 		 241 aa  359  2e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4345  acetoacetyl CoA reductase; poly-beta-hydroxybutyrate biosynthesis  73.44 
 
 		 241 aa  358  4e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.322844  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3375  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  70.71 
 
 		 240 aa  357  9e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4149  acetoacetyl-CoA reductase  70 
 
 		 241 aa  356  1.9999999999999998e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.738636 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3107  acetoacetyl-CoA reductase  71.43 
 
 		 240 aa  348  4e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3116  acetoacetyl-CoA reductase  72.92 
 
 		 241 aa  342  2e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.937548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2997  acetoacetyl-CoA reductase  66.25 
 
 		 241 aa  333  1e-90  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.685049 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0426  acetoacetyl-CoA reductase  65.98 
 
 		 241 aa  327  8e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.346827 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3061  acetoacetyl-CoA reductase  66.67 
 
 		 241 aa  322  4e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.109458  normal  0.323939 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3689  acetoacetyl-CoA reductase  66.53 
 
 		 241 aa  319  1.9999999999999998e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0305  acetoacetyl-CoA reductase  64.29 
 
 		 241 aa  314  7e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.108778  normal  0.261711 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1247  acetoacetyl-CoA reductase  64.17 
 
 		 241 aa  314  7e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0508  acetoacetyl-CoA reductase  64.17 
 
 		 241 aa  314  9e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.448115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0505  acetoacetyl-CoA reductase  64.71 
 
 		 241 aa  311  6.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0483754 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0533  acetoacetyl-CoA reductase  62.66 
 
 		 241 aa  309  2.9999999999999997e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7613  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  63.75 
 
 		 241 aa  308  4e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0792782 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5119  acetoacetyl-CoA reductase  62.76 
 
 		 242 aa  307  8e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.28454  normal  0.417051 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1574  acetoacetyl-CoA reductase  61.51 
 
 		 241 aa  307  1.0000000000000001e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.50991  normal  0.311491 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3470  acetoacetyl-CoA reductase  62.61 
 
 		 242 aa  303  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.887481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3668  acetoacetyl-CoA reductase  61.76 
 
 		 242 aa  302  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.814536  normal  0.461474 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3778  acetoacetyl-CoA reductase  61.76 
 
 		 242 aa  301  5.000000000000001e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.576302  normal  0.884276 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1330  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  60.67 
 
 		 240 aa  298  7e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4599  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  59.83 
 
 		 240 aa  297  8e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2255  acetoacetyl-CoA reductase  61.09 
 
 		 240 aa  295  4e-79  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4092  acetoacetyl-CoA reductase  58.65 
 
 		 240 aa  292  4e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5281  acetoacetyl-CoA reductase  61.76 
 
 		 242 aa  292  4e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.815871  normal  0.208516 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4780  acetoacetyl-CoA reductase  62.18 
 
 		 242 aa  291  5e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.125649  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5916  acetoacetyl-CoA reductase  62.18 
 
 		 242 aa  291  5e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.256521  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2384  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  58.75 
 
 		 241 aa  285  4e-76  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.503632 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3212  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  57.74 
 
 		 240 aa  282  3.0000000000000004e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0273  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  58.4 
 
 		 242 aa  278  8e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2753  acetoacetyl-CoA reductase  59.49 
 
 		 240 aa  277  9e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4514  acetoacetyl-CoA reductase  56.49 
 
 		 241 aa  273  2.0000000000000002e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.59438 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1946  acetoacetyl-CoA reductase  55.23 
 
 		 242 aa  268  8e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0354  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  52.3 
 
 		 240 aa  267  8.999999999999999e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.679576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3065  acetoacetyl-CoA reductase  52.32 
 
 		 247 aa  248  5e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.000577101  normal  0.0493909 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1166  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  52.8 
 
 		 247 aa  248  5e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0201131  normal  0.113287 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3123  acetoacetyl-CoA reductase  52.24 
 
 		 246 aa  241  5e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1310  acetoacetyl-CoA reductase  50.62 
 
 		 248 aa  239  2e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.331099  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00406  acetoacetyl-CoA reductase  54.96 
 
 		 246 aa  238  5e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1515  acetoacetyl-CoA reductase  54.96 
 
 		 249 aa  237  1e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0732362  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2750  acetoacetyl-CoA reductase  52.89 
 
 		 246 aa  235  5.0000000000000005e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.826289  normal  0.454733 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3915  acetoacetyl-CoA reductase  50.82 
 
 		 252 aa  234  8e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1609  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  50.2 
 
 		 246 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.481338 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5756  acetoacetyl-CoA reductase  51.24 
 
 		 249 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.788384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2205  acetoacetyl-CoA reductase  47.74 
 
 		 248 aa  230  2e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000734439  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6555  acetoacetyl-CoA reductase  51.64 
 
 		 247 aa  228  5e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.660753 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5123  acetoacetyl-CoA reductase  46.72 
 
 		 248 aa  225  6e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.753936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1845  acetyacetyl-CoA reductase  50.42 
 
 		 246 aa  224  8e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.142964 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1914  acetyacetyl-CoA reductase  50.42 
 
 		 246 aa  223  2e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.263338  normal  0.044907 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1585  acetyacetyl-CoA reductase  50 
 
 		 246 aa  223  2e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.633023  normal  0.0323128 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1813  acetyacetyl-CoA reductase  51.26 
 
 		 246 aa  223  2e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.486438 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1789  acetyacetyl-CoA reductase  51.26 
 
 		 246 aa  223  2e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6290  acetyacetyl-CoA reductase  51.26 
 
 		 246 aa  223  2e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1485  acetyacetyl-CoA reductase  50.84 
 
 		 246 aa  223  2e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.050583  normal  0.0314041 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2486  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  48.76 
 
 		 248 aa  223  2e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.38654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0544  acetoacetyl-CoA reductase  48.15 
 
 		 247 aa  223  3e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2329  acetyacetyl-CoA reductase  51.26 
 
 		 248 aa  222  3e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0663628  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1700  acetyacetyl-CoA reductase  51.26 
 
 		 246 aa  222  3e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1727  acetyacetyl-CoA reductase  51.26 
 
 		 246 aa  222  3e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.337687  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2201  acetyacetyl-CoA reductase  51.26 
 
 		 246 aa  222  4e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0378854  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1809  acetyacetyl-CoA reductase  51.26 
 
 		 246 aa  222  4e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0410945  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0087  acetyacetyl-CoA reductase  51.26 
 
 		 246 aa  222  4e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1320  acetyacetyl-CoA reductase  51.26 
 
 		 246 aa  222  4e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0653328  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1080  acetyacetyl-CoA reductase  51.26 
 
 		 246 aa  222  4e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.597092  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1333  acetoacetyl-CoA reductase  47.93 
 
 		 248 aa  222  4e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.58717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2164  acetyacetyl-CoA reductase  51.26 
 
 		 246 aa  222  4e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.456725  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0994  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  50.41 
 
 		 247 aa  222  4e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0983572  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2625  acetoacetyl-CoA reductase  48.15 
 
 		 248 aa  222  4.9999999999999996e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5090  acetyacetyl-CoA reductase  50.84 
 
 		 246 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.682377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2690  acetoacetyl-CoA reductase  48.56 
 
 		 247 aa  221  6e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0685514  normal  0.204101 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2257  acetyacetyl-CoA reductase  51.26 
 
 		 260 aa  221  6e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0153797  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2823  acetoacetyl-CoA reductase  48.56 
 
 		 247 aa  221  6e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3865  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  48.15 
 
 		 277 aa  221  8e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3449  acetoacetyl-CoA reductase  48.76 
 
 		 248 aa  221  9.999999999999999e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0871838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0971  acetyacetyl-CoA reductase  50 
 
 		 246 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.438237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2771  acetoacetyl-CoA reductase  48.15 
 
 		 264 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2157  acetoacetyl-CoA reductase  48.15 
 
 		 264 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.722529  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3122  acetoacetyl-CoA reductase  49.58 
 
 		 246 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.868541  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2341  acetyacetyl-CoA reductase  49.58 
 
 		 246 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.25299  normal  0.0840076 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3029  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  49.78 
 
 		 249 aa  220  1.9999999999999999e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1358  acetyacetyl-CoA reductase  48.32 
 
 		 246 aa  219  3e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0631  acetoacetyl-CoA reductase  46.75 
 
 		 246 aa  218  5e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2085  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  50.21 
 
 		 245 aa  218  7.999999999999999e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.514176 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1349  acetyacetyl-CoA reductase  48.32 
 
 		 246 aa  218  7.999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.640594  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6018  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  46.5 
 
 		 247 aa  217  1e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5342  acetoacetyl-CoA reductase  48.56 
 
 		 251 aa  217  1e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.684648  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000520  acetoacetyl-CoA reductase  46.94 
 
 		 246 aa  216  2e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0181  acetoacetyl-CoA reductase  49.16 
 
 		 246 aa  217  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0243891 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0924  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  47.48 
 
 		 246 aa  216  2.9999999999999998e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.25353  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4127  acetoacetyl-CoA reductase  46.5 
 
 		 247 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2744  acetoacetyl-CoA reductase  47.28 
 
 		 248 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163143  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2601  acetoacetyl-CoA reductase  46.86 
 
 		 248 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>