More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3030 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_3030  F0F1 ATP synthase subunit A  100 
 
 		 248 aa  491  9.999999999999999e-139  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.311093 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0767  F0F1 ATP synthase subunit A  79.75 
 
 		 282 aa  380  1e-104  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2879  F0F1 ATP synthase subunit A  76.61 
 
 		 248 aa  351  5e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.775771  normal  0.224886 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2594  F0F1 ATP synthase subunit A  73.06 
 
 		 267 aa  344  7e-94  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00546841 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0190  F0F1 ATP synthase subunit A  63.98 
 
 		 261 aa  328  6e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2699  F0F1 ATP synthase subunit A  63.98 
 
 		 261 aa  327  9e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.911208  normal  0.0328457 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1038  F0F1 ATP synthase subunit A  64.37 
 
 		 247 aa  315  5e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0697  F0F1 ATP synthase subunit A  48.28 
 
 		 260 aa  229  3e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4816  F0F1 ATP synthase subunit A  45.56 
 
 		 249 aa  216  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.635732  normal  0.84617 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0830  F0F1 ATP synthase subunit A  45.42 
 
 		 250 aa  216  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.109906 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0238  F0F1 ATP synthase subunit A  47.01 
 
 		 247 aa  214  9.999999999999999e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4571  F0F1 ATP synthase subunit A  46.77 
 
 		 248 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0846  F0F1 ATP synthase subunit A  47.01 
 
 		 247 aa  212  3.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.372067 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0914  F0F1 ATP synthase subunit A  46.77 
 
 		 248 aa  212  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.323491  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0269  F0F1 ATP synthase subunit A  45.97 
 
 		 247 aa  212  3.9999999999999995e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2514  F0F1 ATP synthase subunit A  47.01 
 
 		 249 aa  208  5e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.733206  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0696  F0F1 ATP synthase subunit A  48 
 
 		 249 aa  208  7e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2201  F0F1 ATP synthase subunit A  47.64 
 
 		 258 aa  207  9e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.440732 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3822  F0F1 ATP synthase subunit A  45.08 
 
 		 250 aa  204  9e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0719416 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3246  F0F1 ATP synthase subunit A  47.33 
 
 		 241 aa  204  1e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.911216  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1979  F0F1 ATP synthase subunit A  46.64 
 
 		 250 aa  203  2e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0398518 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0500  F0F1 ATP synthase subunit A  49.33 
 
 		 249 aa  202  6e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.215569  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0376  F0F1 ATP synthase subunit A  45.16 
 
 		 252 aa  198  7e-50  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0743  F0F1 ATP synthase subunit A  43.95 
 
 		 253 aa  198  7.999999999999999e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.230064  normal  0.396268 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0872  F0F1 ATP synthase subunit A  41.84 
 
 		 243 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.397381  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0929  F0F1 ATP synthase subunit A  48.23 
 
 		 250 aa  196  3e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0554  F0F1 ATP synthase subunit A  45.16 
 
 		 250 aa  196  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0447  F0F1 ATP synthase subunit A  46.31 
 
 		 250 aa  196  3e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.726542  normal  0.18577 
 
 
-
 
NC_004310  BR0382  F0F1 ATP synthase subunit A  46.22 
 
 		 249 aa  193  2e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0394  F0F1 ATP synthase subunit A  46.22 
 
 		 249 aa  193  2e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0512  F0F1 ATP synthase subunit A  47.32 
 
 		 250 aa  191  8e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.172215  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7657  F0F1 ATP synthase subunit A  44.49 
 
 		 251 aa  191  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0416353  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1086  F0F1 ATP synthase subunit A  41.42 
 
 		 243 aa  190  2e-47  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6944  F0F1 ATP synthase subunit A  45.31 
 
 		 251 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0362387 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0397  F0F1 ATP synthase subunit A  44.57 
 
 		 251 aa  187  9e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.923861  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3499  F0F1 ATP synthase subunit A  44.35 
 
 		 251 aa  186  2e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3175  F0F1 ATP synthase subunit A  44.35 
 
 		 251 aa  186  2e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3370  F0F1 ATP synthase subunit A  44.35 
 
 		 251 aa  186  4e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0220561  normal  0.798518 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3674  F0F1 ATP synthase subunit A  46.82 
 
 		 268 aa  180  2e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000787111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0714  F0F1 ATP synthase subunit A  41.53 
 
 		 251 aa  178  7e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.211309  normal  0.557455 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0396  F0F1 ATP synthase subunit A  40.57 
 
 		 243 aa  178  9e-44  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0427  F0F1 ATP synthase subunit A  41.49 
 
 		 241 aa  177  2e-43  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0574735  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4483  F0F1 ATP synthase subunit A  41.51 
 
 		 261 aa  174  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.639337 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4377  F0F1 ATP synthase subunit A  42.67 
 
 		 257 aa  172  5e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.672786 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1076  F0F1 ATP synthase subunit A  42.16 
 
 		 261 aa  171  1e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1316  F0F1 ATP synthase subunit A  42.19 
 
 		 260 aa  167  1e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1893  F0F1 ATP synthase subunit A  44.94 
 
 		 249 aa  146  3e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0190421 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4018  ATP synthase F0, A subunit  37.25 
 
 		 265 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.457408  decreased coverage  0.0000501156 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1500  ATP synthase F0, A subunit  37.63 
 
 		 229 aa  120  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.872932  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12110  F0F1-type ATP synthase, alpha subunit  36.02 
 
 		 263 aa  118  7e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0599  ATP synthase F0, A subunit  36.6 
 
 		 229 aa  118  9e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1039  ATP synthase F0, A subunit  35.68 
 
 		 261 aa  117  9.999999999999999e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0480809 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0334  ATP synthase F0, A subunit  35.89 
 
 		 229 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00388354  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3359  H+-transporting two-sector ATPase, A subunit  36.68 
 
 		 229 aa  116  3e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000661102  hitchhiker  0.00336377 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2611  F0F1 ATP synthase subunit A  38.74 
 
 		 266 aa  116  3e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.183518  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1310  ATP synthase F0 subunit A  34.25 
 
 		 265 aa  115  3.9999999999999997e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146401  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4015  ATP synthase F0, A subunit  35.58 
 
 		 229 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.91883e-28 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2344  F0F1 ATP synthase subunit A  39.91 
 
 		 266 aa  114  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000801138 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3713  F0F1 ATP synthase subunit A  36.67 
 
 		 284 aa  113  3e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3931  ATP synthase F0, A subunit  35.1 
 
 		 229 aa  113  3e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000143086  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1018  F0F1 ATP synthase subunit A  35.09 
 
 		 295 aa  112  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.147129  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0894  ATP synthase F0 subunit A  32.79 
 
 		 263 aa  112  6e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1212  F0F1 ATP synthase subunit A  36.4 
 
 		 283 aa  112  7.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4142  ATP synthase F0, A subunit  35.22 
 
 		 275 aa  112  8.000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4248  ATP synthase F0, A subunit  37.11 
 
 		 229 aa  112  8.000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000462325  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21460  F0F1-type ATP synthase, alpha subunit  31.78 
 
 		 267 aa  111  9e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3922  ATP synthase F0, A subunit  31.6 
 
 		 267 aa  108  6e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1264  ATP synthase F0, A subunit  33.73 
 
 		 262 aa  108  7.000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0705285 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3216  ATP synthase F0, A subunit  34.36 
 
 		 373 aa  108  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.100229 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2700  ATP synthase F0, A subunit  37.44 
 
 		 233 aa  107  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.208406  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18260  ATP synthase F0 subcomplex A subunit  33.86 
 
 		 261 aa  107  2e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.469356  normal  0.320479 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1644  ATP synthase F0, A subunit  34.1 
 
 		 258 aa  107  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.283093  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3142  ATP synthase F0, A subunit  34.17 
 
 		 230 aa  106  4e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000247619  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08120  F0F1 ATP synthase subunit A  35.29 
 
 		 266 aa  103  3e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.823185  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0330  ATP synthase F0, A subunit  32.86 
 
 		 280 aa  102  4e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.169685 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2413  H+-transporting two-sector ATPase, A subunit  32.62 
 
 		 285 aa  102  5e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2384  ATP synthase F0, A subunit  32.47 
 
 		 218 aa  102  8e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0489262 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2119  ATP synthase F0, A subunit  33.04 
 
 		 270 aa  101  9e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00507952  hitchhiker  0.00505029 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2087  ATP synthase F0, A subunit  37.14 
 
 		 226 aa  101  9e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000656805  normal  0.938168 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3636  ATP synthase F0, A subunit  33.88 
 
 		 259 aa  101  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.595965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1780  ATP synthase F0, A subunit  37.56 
 
 		 281 aa  100  3e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0951  ATP synthase F0, A subunit  34.76 
 
 		 234 aa  99.4  5e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.162071  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1301  ATP synthase F0, A subunit  32.18 
 
 		 282 aa  99  6e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.548364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1388  ATP synthase F0, A subunit  33.65 
 
 		 233 aa  98.6  9e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1665  F0F1 ATP synthase subunit A  29.9 
 
 		 263 aa  97.1  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.766695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2066  ATP synthase F0, A subunit  33.65 
 
 		 233 aa  96.7  3e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.120848 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09970  ATP synthase F0 subcomplex A subunit  32.95 
 
 		 294 aa  95.5  6e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19190  F0F1-type ATP synthase, alpha subunit  32.1 
 
 		 247 aa  95.1  8e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0970  ATP synthase F0, A subunit  29.9 
 
 		 207 aa  95.1  9e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000117673  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03040  putative ATP synthase A chain  33.94 
 
 		 361 aa  94.7  1e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0015  ATP synthase F0, A subunit  32.16 
 
 		 234 aa  94  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000326077  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5025  ATP synthase F0, A subunit  32.99 
 
 		 364 aa  93.6  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.436472  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1973  ATP synthase F0, A subunit  33.49 
 
 		 303 aa  93.6  3e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000495974  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4472  ATP synthase F0, A subunit  34.48 
 
 		 258 aa  92.8  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0170  ATP synthase F0, A subunit  34.86 
 
 		 339 aa  92.8  5e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.222204  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29610  ATP synthase F0 subcomplex A subunit  32.54 
 
 		 272 aa  92.4  6e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2776  F0F1 ATP synthase subunit A  31.62 
 
 		 230 aa  91.3  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.261232  normal  0.580168 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6142  ATP synthase F0, A subunit  31.8 
 
 		 283 aa  90.5  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0877  ATP synthase F0, A subunit  32.7 
 
 		 217 aa  90.9  2e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1757  ATP synthase F0, A subunit  36.64 
 
 		 276 aa  90.1  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.731668  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>