More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3022 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_3022  PfkB domain protein  100 
 
 		 333 aa  671    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.523599  normal  0.417909 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1671  PfkB  66.06 
 
 		 331 aa  447  1.0000000000000001e-124  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.276087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2452  PfkB  65.64 
 
 		 330 aa  433  1e-120  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.826037  normal  0.155331 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2872  ribokinase-like domain-containing protein  63.66 
 
 		 335 aa  391  1e-108  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.417432 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0121  ribokinase-like domain-containing protein  49.68 
 
 		 328 aa  300  3e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.02163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0149  PfkB  47.08 
 
 		 407 aa  289  4e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.029935  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0457  PfkB  46.23 
 
 		 333 aa  279  4e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1030  pfkB family carbohydrate kinase  47.71 
 
 		 330 aa  278  7e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.577037  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0169  carbohydrate kinase  46.18 
 
 		 330 aa  278  8e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0162  carbohydrate kinase  46.18 
 
 		 330 aa  278  8e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.98466  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2691  ribokinase-like domain-containing protein  47.71 
 
 		 330 aa  278  8e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.272607  normal  0.270933 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1307  PfkB domain protein  44.95 
 
 		 338 aa  277  2e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.887451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3378  ribokinase-like domain-containing protein  46.96 
 
 		 330 aa  272  5.000000000000001e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.463525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0316  pfkB family carbohydrate kinase  43.73 
 
 		 330 aa  270  2.9999999999999997e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.930013  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1228  ribokinase-like domain-containing protein  44.92 
 
 		 337 aa  269  4e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1838  carbohydrate kinase  40.87 
 
 		 335 aa  268  1e-70  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0178  ribokinase-like domain-containing protein  45 
 
 		 331 aa  268  1e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.613115  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2872  PfkB  45.92 
 
 		 332 aa  268  1e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.626247 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05631  carbohydrate kinase  41.18 
 
 		 335 aa  268  1e-70  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.577343 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0690  carbohydrate kinase PfkB family  45.08 
 
 		 338 aa  266  2.9999999999999995e-70  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4021  PfkB  43.73 
 
 		 330 aa  263  3e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.737193  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4087  PfkB domain protein  43.73 
 
 		 330 aa  263  4e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4407  PfkB domain protein  43.73 
 
 		 330 aa  262  6e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5046  ribokinase-like domain-containing protein  45.57 
 
 		 329 aa  261  1e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151131 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1165  PfkB domain protein  44.48 
 
 		 335 aa  261  2e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.188666 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1260  PfkB domain protein  46.06 
 
 		 331 aa  259  4e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0251  PfkB  43.64 
 
 		 333 aa  259  6e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0010  PfkB  46.63 
 
 		 333 aa  259  6e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00317456  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0198  ribokinase-like domain-containing protein  46.18 
 
 		 330 aa  258  1e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07411  carbohydrate kinase  43.75 
 
 		 342 aa  258  1e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1639  ribokinase-like domain-containing protein  45.59 
 
 		 331 aa  256  3e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.487738  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1668  carbohydrate kinase PfkB family  44.13 
 
 		 337 aa  250  2e-65  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0036  pfkB family carbohydrate kinase  42.64 
 
 		 333 aa  250  2e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.564268  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0506  carbohydrate kinase-like  38.92 
 
 		 334 aa  250  2e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0461  PfkB domain protein  43.64 
 
 		 333 aa  251  2e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2989  ribokinase-like domain-containing protein  44.98 
 
 		 338 aa  250  3e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0218  PfkB  45.91 
 
 		 333 aa  247  2e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0581  PfkB  43.64 
 
 		 333 aa  245  6.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.189374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05321  carbohydrate kinase  37.14 
 
 		 333 aa  244  9.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0559209  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3532  ribokinase-like domain-containing protein  43.62 
 
 		 337 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321565  normal  0.851243 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0151  PfkB  45.34 
 
 		 331 aa  243  3e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05061  carbohydrate kinase  39.87 
 
 		 348 aa  243  3e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0313242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05621  carbohydrate kinase  37.14 
 
 		 333 aa  242  6e-63  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2565  ribokinase-like domain-containing protein  43.71 
 
 		 333 aa  238  1e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.650274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5186  PfkB domain protein  42.41 
 
 		 337 aa  235  7e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.430634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05691  carbohydrate kinase  35.62 
 
 		 338 aa  233  3e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0990225  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5108  PfkB domain protein  42.55 
 
 		 337 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.905931 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4645  ribokinase-like domain-containing protein  42.55 
 
 		 337 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0215  ribokinase-like domain-containing protein  42.54 
 
 		 333 aa  227  2e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.26013  normal  0.0979989 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2022  ribokinase-like domain-containing protein  44.23 
 
 		 330 aa  219  3.9999999999999997e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2568  ribokinase-like domain-containing protein  42.95 
 
 		 333 aa  202  6e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0562  PfkB domain protein  34.82 
 
 		 328 aa  178  1e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1084  PfkB domain protein  32.81 
 
 		 327 aa  172  6.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1494  PfkB domain protein  32.1 
 
 		 331 aa  171  1e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0243607  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1113  PfkB domain protein  32.81 
 
 		 327 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.941643 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3284  ribokinase-like domain-containing protein  33.74 
 
 		 330 aa  166  8e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000189129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0819  cell division protein FtsA  31.11 
 
 		 328 aa  162  6e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000392808  normal  0.759534 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2764  PfkB  33.02 
 
 		 370 aa  156  4e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.040802  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2854  ribokinase-like domain-containing protein  33.63 
 
 		 328 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000011716  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0494  PfkB domain protein  33.65 
 
 		 360 aa  146  6e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.441156  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3284  PfkB  27.73 
 
 		 336 aa  135  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.469583  normal  0.0441315 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1845  ribokinase-like domain-containing protein  28.17 
 
 		 341 aa  129  7.000000000000001e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000273033  unclonable  0.000000000472438 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2200  PfkB  29.32 
 
 		 339 aa  128  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000468276  decreased coverage  0.00888496 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0055  ribokinase-like domain-containing protein  32.39 
 
 		 334 aa  126  4.0000000000000003e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.747338  normal  0.368725 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1910  carbohydrate kinase  29.85 
 
 		 339 aa  123  4e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.0000000000000704659  hitchhiker  0.00127543 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0735  PfkB domain-containing protein  33.94 
 
 		 317 aa  113  4.0000000000000004e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.263465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05942  inosine-guanosine kinase  28.57 
 
 		 434 aa  97.4  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000207  inosine-guanosine kinase  28.8 
 
 		 434 aa  94.4  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.471058  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0491  PfkB  32.97 
 
 		 303 aa  91.7  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4395  aminoimidazole riboside kinase  28.26 
 
 		 319 aa  90.1  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4397  aminoimidazole riboside kinase  28.26 
 
 		 319 aa  89.7  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1755  PfkB domain protein  33.33 
 
 		 304 aa  89  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2019  aminoimidazole riboside kinase  32.16 
 
 		 298 aa  87.8  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0270358  normal  0.162694 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4464  aminoimidazole riboside kinase  27.17 
 
 		 319 aa  88.2  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.680577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7068  PfkB  32.97 
 
 		 297 aa  87.4  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4283  aminoimidazole riboside kinase  27.17 
 
 		 319 aa  87  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0500  inosine-guanosine kinase  26.8 
 
 		 434 aa  86.7  5e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0187048  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0433  inosine-guanosine kinase  27.31 
 
 		 434 aa  86.7  6e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.355559  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2496  kinase, pfkB family  29.04 
 
 		 310 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4312  aminoimidazole riboside kinase  27.54 
 
 		 319 aa  83.2  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0647  inosine-guanosine kinase  27.2 
 
 		 434 aa  82.8  0.000000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.243174  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1498  PfkB domain protein  32.08 
 
 		 300 aa  82  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3755  PfkB domain protein  30.04 
 
 		 307 aa  81.6  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0212856  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2001  PfkB domain protein  28.75 
 
 		 321 aa  80.9  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01741  predicted kinase  28.02 
 
 		 315 aa  80.5  0.00000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01729  hypothetical protein  28.02 
 
 		 315 aa  80.5  0.00000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1860  ribokinase-like domain-containing protein  28.32 
 
 		 315 aa  80.5  0.00000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.335723  decreased coverage  0.00000390561 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00428  inosine/guanosine kinase  27.84 
 
 		 434 aa  79.7  0.00000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1870  PfkB domain protein  28.32 
 
 		 315 aa  79.7  0.00000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0114143  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3133  Inosine kinase  27.84 
 
 		 434 aa  79.7  0.00000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.838114  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0409  inosine kinase  27.84 
 
 		 434 aa  79.7  0.00000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0569  inosine kinase  27.84 
 
 		 434 aa  79.7  0.00000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.858923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0554  inosine-guanosine kinase  27.84 
 
 		 434 aa  79.7  0.00000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00433  hypothetical protein  27.84 
 
 		 434 aa  79.7  0.00000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1847  inosine-guanosine kinase  26.4 
 
 		 434 aa  79.7  0.00000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.324608  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0521  inosine kinase  27.84 
 
 		 434 aa  79.7  0.00000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0701891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1996  PfkB family kinase  28.32 
 
 		 315 aa  79.7  0.00000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3139  inosine kinase  27.84 
 
 		 434 aa  79.7  0.00000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000536368 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0516  inosine-guanosine kinase  27.84 
 
 		 434 aa  79.7  0.00000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.812213  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003853  inosine-guanosine kinase  26.8 
 
 		 434 aa  79.3  0.00000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.088353  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>