37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2991 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2991  conserved hypothetical protein DUF1643  100 
 
 		 172 aa  357  5e-98  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.47572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4033  hypothetical protein  75.44 
 
 		 173 aa  267  5.9999999999999995e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.773314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1110  hypothetical protein  72.19 
 
 		 170 aa  248  3e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.135016  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2772  hypothetical protein  72.19 
 
 		 170 aa  248  3e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2920  hypothetical protein  71.6 
 
 		 169 aa  244  4e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.8287  normal  0.334962 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0083  hypothetical protein  67.07 
 
 		 173 aa  239  2e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3746  hypothetical protein  47.47 
 
 		 172 aa  153  1e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000131898  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1928  hypothetical protein  44.94 
 
 		 170 aa  133  9e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00260784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2367  hypothetical protein  44.58 
 
 		 188 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5660  protein of unknown function DUF1643  46 
 
 		 158 aa  122  3e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.163406 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2963  hypothetical protein  39.07 
 
 		 155 aa  122  3e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.280917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3032  protein of unknown function DUF1643  40.23 
 
 		 337 aa  118  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0234736  normal  0.151204 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5873  hypothetical protein  44.67 
 
 		 208 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5473  hypothetical protein  44.67 
 
 		 208 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5791  hypothetical protein  40.28 
 
 		 155 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.827947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1210  hypothetical protein  40.65 
 
 		 155 aa  95.9  3e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06761  hypothetical protein  35.26 
 
 		 215 aa  94  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0031  hypothetical protein  35.4 
 
 		 162 aa  94  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00242203  normal  0.074145 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04721  hypothetical protein  33.33 
 
 		 189 aa  92.4  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0362408  normal  0.769212 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1804  hypothetical protein  30.25 
 
 		 173 aa  85.9  2e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2474  protein of unknown function DUF1643  34.97 
 
 		 186 aa  85.5  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1722  hypothetical protein  34.94 
 
 		 216 aa  74.3  0.0000000000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0639  hypothetical protein  35.71 
 
 		 200 aa  73.2  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4991  protein of unknown function DUF1643  31.06 
 
 		 182 aa  71.6  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0525726  normal  0.369909 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4066  hypothetical protein  34.76 
 
 		 198 aa  68.6  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.982882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1464  hypothetical protein  25.79 
 
 		 178 aa  68.6  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0120527  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15701  hypothetical protein  25.16 
 
 		 178 aa  68.2  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.341972  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15551  hypothetical protein  26.67 
 
 		 178 aa  66.6  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0244532  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15331  hypothetical protein  22.15 
 
 		 177 aa  65.9  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0922  hypothetical protein  26.97 
 
 		 196 aa  57  0.0000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05271  hypothetical protein  28.3 
 
 		 127 aa  51.6  0.000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.172397  normal  0.0522853 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2504  hypothetical protein  23.87 
 
 		 168 aa  50.1  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0045  hypothetical protein  23.87 
 
 		 168 aa  50.1  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0045  hypothetical protein  23.87 
 
 		 168 aa  50.1  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2467  hypothetical protein  23.23 
 
 		 167 aa  48.9  0.00004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.206216  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5745  hypothetical protein  31.71 
 
 		 209 aa  48.5  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5897  protein of unknown function DUF1643  30.3 
 
 		 183 aa  45.4  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.657196  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>