19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2982 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2982  hypothetical protein  100 
 
 		 116 aa  243  6e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1174  hypothetical protein  35.92 
 
 		 126 aa  60.8  0.000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000759972 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0980  hypothetical protein  34.91 
 
 		 129 aa  60.1  0.000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00330636  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2873  hypothetical protein  30.3 
 
 		 131 aa  53.9  0.0000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0008  monoheme cytochrome c, putative  30.19 
 
 		 127 aa  51.2  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0100224 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0008  monoheme cytochrome c, putative  30.19 
 
 		 127 aa  50.8  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4082  hypothetical protein  38.89 
 
 		 121 aa  50.8  0.000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0716  monoheme cytochrome c, putative  35.38 
 
 		 127 aa  49.7  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0008  monoheme cytochrome c, putative  36.92 
 
 		 127 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000351615 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0917  hypothetical protein  37.04 
 
 		 121 aa  49.7  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.606921  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0004  hypothetical protein  34.67 
 
 		 113 aa  49.3  0.00002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.408251  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3623  hypothetical protein  28.16 
 
 		 135 aa  49.3  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.599999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0030  hypothetical protein  33.33 
 
 		 113 aa  48.1  0.00004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.593403  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0948  hypothetical protein  32.63 
 
 		 112 aa  44.7  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.356447  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0008  hypothetical protein  29.29 
 
 		 111 aa  44.7  0.0004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3243  hypothetical protein  35.19 
 
 		 131 aa  44.3  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.984975  normal  0.679111 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6938  hypothetical protein  37.29 
 
 		 183 aa  44.3  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3097  cytochrome c-552 like protein  35.82 
 
 		 106 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.517981  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3082  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorB  34.33 
 
 		 208 aa  41.2  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.299915  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>