54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2971 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2971  hypothetical protein  100 
 
 		 204 aa  410  1e-114  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0479  hypothetical protein  58.33 
 
 		 200 aa  198  3.9999999999999996e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.539349 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0914  hypothetical protein  50.59 
 
 		 190 aa  185  4e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1942  hypothetical protein  59.12 
 
 		 200 aa  179  2.9999999999999997e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0398084  decreased coverage  0.00719314 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2312  hypothetical protein  55.64 
 
 		 191 aa  160  1e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.418457  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0986  hypothetical protein  55.64 
 
 		 203 aa  160  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2188  hypothetical protein  53.79 
 
 		 197 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3642  hypothetical protein  40.78 
 
 		 199 aa  130  2.0000000000000002e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000544722 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0072  hypothetical protein  44.62 
 
 		 137 aa  128  7.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.237291  normal  0.464662 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0044  hypothetical protein  40.28 
 
 		 185 aa  126  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0353  hypothetical protein  41.84 
 
 		 175 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0615  hypothetical protein  41.79 
 
 		 174 aa  124  7e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.190546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0427  protein of unknown function DUF1058  38.51 
 
 		 174 aa  124  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0036  hypothetical protein  37.58 
 
 		 176 aa  124  1e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.239823 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0510  hypothetical protein  41.01 
 
 		 192 aa  122  4e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.833855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3942  hypothetical protein  37.87 
 
 		 185 aa  121  6e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2687  hypothetical protein  39.23 
 
 		 187 aa  121  7e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.296797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4125  hypothetical protein  40.25 
 
 		 183 aa  121  9e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.111694  normal  0.305565 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0218  hypothetical protein  41.04 
 
 		 174 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.236167  normal  0.0484329 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0422  hypothetical protein  39.6 
 
 		 197 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.26681 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2486  protein of unknown function DUF1058  41.73 
 
 		 177 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.11896 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0455  protein of unknown function DUF1058  39.6 
 
 		 197 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.277988  normal  0.196103 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1266  hypothetical protein  35.06 
 
 		 185 aa  119  3e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0379  protein of unknown function DUF1058  40.97 
 
 		 187 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.403111  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0492  protein of unknown function DUF1058  38.93 
 
 		 197 aa  115  3e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.216806 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0735  hypothetical protein  40.15 
 
 		 190 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2176  hypothetical protein  40.3 
 
 		 181 aa  113  2.0000000000000002e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5957  protein of unknown function DUF1058  34.29 
 
 		 184 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0475342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2088  hypothetical protein  40.3 
 
 		 245 aa  112  3e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3789  hypothetical protein  36.81 
 
 		 186 aa  112  3e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0315  hypothetical protein  37.5 
 
 		 179 aa  108  6e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2231  hypothetical protein  38.19 
 
 		 194 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.115294 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3061  hypothetical protein  38.18 
 
 		 188 aa  105  7e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1100  hypothetical protein  38.46 
 
 		 239 aa  104  9e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00740954  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3379  hypothetical protein  33.33 
 
 		 183 aa  103  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.393119  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4408  protein of unknown function DUF1058  34.1 
 
 		 179 aa  102  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4088  protein of unknown function DUF1058  35.37 
 
 		 179 aa  101  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5059  hypothetical protein  33.09 
 
 		 182 aa  97.4  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.549476 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4584  hypothetical protein  35.43 
 
 		 160 aa  97.1  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2170  hypothetical protein  37.4 
 
 		 177 aa  96.7  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.82966  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0779  hypothetical protein  38.39 
 
 		 113 aa  95.5  5e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1176  hypothetical protein  29.84 
 
 		 163 aa  89.7  3e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2000  protein of unknown function DUF1058  46.75 
 
 		 367 aa  82  0.000000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2307  hypothetical protein  30.4 
 
 		 173 aa  79.7  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2403  hypothetical protein  30.21 
 
 		 156 aa  54.7  0.0000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.482031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0346  hypothetical protein  25.62 
 
 		 149 aa  53.9  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00234847  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1125  hypothetical protein  33.67 
 
 		 162 aa  51.6  0.000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3295  hypothetical protein  28.23 
 
 		 158 aa  51.2  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164661 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1788  SH3 type 3 domain-containing protein  27.64 
 
 		 158 aa  48.5  0.00006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.292681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1934  SH3 type 3 domain protein  27.64 
 
 		 158 aa  48.5  0.00006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.890926  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3400  protein of unknown function DUF1058  26.61 
 
 		 153 aa  46.6  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.874568  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2184  hypothetical protein  27.34 
 
 		 141 aa  46.6  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.483241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1540  protein of unknown function DUF1058  33.01 
 
 		 165 aa  44.3  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0258  hypothetical protein  23.85 
 
 		 157 aa  41.6  0.009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>