19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2943 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2943  hypothetical protein  100 
 
 		 332 aa  654    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0604603 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1037  hypothetical protein  36.69 
 
 		 339 aa  189  5.999999999999999e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2098  hypothetical protein  34.62 
 
 		 337 aa  176  4e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.234685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2286  hypothetical protein  35.76 
 
 		 331 aa  157  2e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.444474  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0962  hypothetical protein  35.76 
 
 		 331 aa  157  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0340948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2378  hypothetical protein  25.93 
 
 		 336 aa  70.9  0.00000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.268153 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1585  hypothetical protein  25.3 
 
 		 366 aa  66.2  0.0000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.399212 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2548  hypothetical protein  25.95 
 
 		 337 aa  60.8  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1407  hypothetical protein  30.58 
 
 		 349 aa  57  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.308323  normal  0.379983 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5213  hypothetical protein  25.85 
 
 		 397 aa  50.8  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1869  hypothetical protein  25.42 
 
 		 367 aa  50.1  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.274473  normal  0.277649 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1649  conserved hypothetical proteinn  25.36 
 
 		 368 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.179828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1590  hypothetical protein  25.71 
 
 		 366 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.625227  normal  0.0229246 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0016  hypothetical protein  23.51 
 
 		 354 aa  47.8  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.142957 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0839  hypothetical protein  23.31 
 
 		 397 aa  47.4  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.268531 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1181  hypothetical protein  22.58 
 
 		 394 aa  46.6  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0948  hypothetical protein  25 
 
 		 397 aa  46.2  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.754604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4862  hypothetical protein  24.84 
 
 		 395 aa  43.9  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0687822  normal  0.242066 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2441  hypothetical protein  27.31 
 
 		 368 aa  43.1  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>