More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2920 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2920  chaperonin 10 Kd subunit  100 
 
 		 103 aa  199  9e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.907264  normal  0.269903 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5284  co-chaperonin GroES  68.93 
 
 		 104 aa  154  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.262452 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0596  co-chaperonin GroES  78.95 
 
 		 95 aa  153  7e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.474477  normal  0.0912075 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0034  chaperonin Cpn10  76.6 
 
 		 95 aa  150  4e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0295415  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0453  chaperonin Cpn10  77.66 
 
 		 95 aa  150  4e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3375  chaperonin Cpn10  77.66 
 
 		 95 aa  149  8.999999999999999e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0900877 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2190  co-chaperonin GroES  75.79 
 
 		 95 aa  149  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1165  chaperonin Cpn10  72.63 
 
 		 96 aa  149  1e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.731664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0984  co-chaperonin GroES  74.74 
 
 		 95 aa  148  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2310  co-chaperonin GroES  74.74 
 
 		 95 aa  148  2e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1282  chaperonin Cpn10  68.93 
 
 		 104 aa  148  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0543961  normal  0.509292 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3359  co-chaperonin GroES  77.89 
 
 		 95 aa  148  2e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.755845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4586  co-chaperonin GroES  79.79 
 
 		 95 aa  148  3e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.480478 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3233  co-chaperonin GroES  68.32 
 
 		 105 aa  148  3e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.211647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2228  co-chaperonin GroES  67.33 
 
 		 105 aa  147  7e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.145562  normal  0.505926 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1173  co-chaperonin GroES  73.91 
 
 		 98 aa  146  8e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.749354  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2458  co-chaperonin GroES  66.02 
 
 		 104 aa  146  9e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2504  co-chaperonin GroES  69.9 
 
 		 104 aa  145  1.0000000000000001e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5464  co-chaperonin GroES  68.27 
 
 		 104 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.835161  normal  0.183317 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0358  chaperonin Cpn10  75 
 
 		 98 aa  145  1.0000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1737  co-chaperonin GroES  73.4 
 
 		 95 aa  145  2.0000000000000003e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.168742  hitchhiker  0.00175489 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3033  co-chaperonin GroES  66.02 
 
 		 104 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.960902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0409  co-chaperonin GroES  72.83 
 
 		 98 aa  144  3e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.52328 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6083  co-chaperonin GroES  72.83 
 
 		 98 aa  144  3e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2191  co-chaperonin GroES  65.35 
 
 		 105 aa  144  4.0000000000000006e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0674  chaperonin Cpn10  69.15 
 
 		 95 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248436  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5848  chaperonin Cpn10  65.05 
 
 		 104 aa  144  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.134005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3660  chaperonin Cpn10  70.53 
 
 		 96 aa  143  6e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.39196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1768  chaperonin Cpn10  68.09 
 
 		 95 aa  143  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.939398  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2114  co-chaperonin GroES  65.05 
 
 		 104 aa  143  8.000000000000001e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3096  chaperonin Cpn10  66.99 
 
 		 104 aa  143  8.000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7829  chaperonin Cpn10  68.09 
 
 		 95 aa  143  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0196  co-chaperonin GroES  72.34 
 
 		 98 aa  142  1e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1770  chaperonin Cpn10  69.15 
 
 		 95 aa  142  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0933044  normal  0.173989 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4265  chaperonin Cpn10  63.11 
 
 		 104 aa  142  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.228969  normal  0.0528982 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0794  co-chaperonin GroES  70.21 
 
 		 95 aa  142  2e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0142401 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3335  chaperonin Cpn10  70.21 
 
 		 96 aa  142  2e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5581  chaperonin Cpn10  70.21 
 
 		 95 aa  141  3e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1177  co-chaperonin GroES  63.37 
 
 		 105 aa  141  3e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.510717  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5039  chaperonin Cpn10  66.02 
 
 		 104 aa  141  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.747065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0586  chaperonin Cpn10  71.28 
 
 		 95 aa  140  4e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.515387  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3027  chaperonin Cpn10  72.34 
 
 		 121 aa  141  4e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3171  co-chaperonin GroES  62.38 
 
 		 105 aa  140  6e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.50399  normal  0.859314 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0471  co-chaperonin GroES  71.74 
 
 		 98 aa  140  7e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0178  co-chaperonin GroES  71.28 
 
 		 98 aa  140  7e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000749715  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0516  co-chaperonin GroES  71.74 
 
 		 98 aa  140  7e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.218545 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0535  co-chaperonin GroES  69.15 
 
 		 96 aa  140  9e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.235794  normal  0.722093 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2078  chaperonin Cpn10  66.02 
 
 		 104 aa  139  9.999999999999999e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.354886  normal  0.301492 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1672  co-chaperonin GroES  69.57 
 
 		 98 aa  139  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.723246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5250  co-chaperonin GroES  68.09 
 
 		 96 aa  138  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.584342  normal  0.464773 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5326  co-chaperonin GroES  68.09 
 
 		 96 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.769005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4783  co-chaperonin GroES  68.09 
 
 		 96 aa  138  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0265575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2593  co-chaperonin GroES  64.58 
 
 		 105 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.458654  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2520  chaperone Hsp10, part of GroE chaperone system  67.02 
 
 		 95 aa  138  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.691961  normal  0.971453 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0605  chaperonin Cpn10  72.34 
 
 		 95 aa  138  1.9999999999999998e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.131818 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4725  co-chaperonin GroES  66.67 
 
 		 98 aa  138  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0272  co-chaperonin GroES  69.57 
 
 		 96 aa  137  4.999999999999999e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2573  co-chaperonin GroES  66.3 
 
 		 98 aa  136  1e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.320362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1332  co-chaperonin GroES  67.02 
 
 		 98 aa  136  1e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4151  co-chaperonin GroES  70.21 
 
 		 96 aa  136  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0190602  normal  0.541056 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1837  co-chaperonin GroES  65.96 
 
 		 98 aa  136  1e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.747297  normal  0.0192495 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5829  10 KD chaperonin (protein CPN10)  70.65 
 
 		 98 aa  135  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0158717  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4126  co-chaperonin GroES  65.96 
 
 		 98 aa  136  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.505672  normal  0.752904 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0740  co-chaperonin GroES  68.09 
 
 		 95 aa  133  8e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1043  chaperonin Cpn10  62.86 
 
 		 105 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3195  co-chaperonin GroES  63.04 
 
 		 98 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0862  chaperonin Cpn10  62.37 
 
 		 99 aa  130  6e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.000545681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0161  chaperonin Cpn10  67.02 
 
 		 104 aa  128  2.0000000000000002e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.327073  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0549  co-chaperonin GroES  64.89 
 
 		 95 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000019989  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0296  chaperonin Cpn10  63.83 
 
 		 97 aa  128  3e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.018883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2928  chaperonin Cpn10  63.83 
 
 		 96 aa  127  4.0000000000000003e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000296393  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5366  chaperonin Cpn10  63.83 
 
 		 95 aa  127  7.000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.583884  normal  0.676466 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2803  co-chaperonin GroES  62.77 
 
 		 95 aa  126  9.000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000132343  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0120  chaperonin Cpn10  64.89 
 
 		 96 aa  125  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0427234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0365  co-chaperonin GroES  61.7 
 
 		 96 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000241312  hitchhiker  0.00832872 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4306  co-chaperonin GroES  59.57 
 
 		 96 aa  124  6e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000235031  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3339  co-chaperonin GroES  58.51 
 
 		 95 aa  122  1e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.148697  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2175  chaperonin Cpn10  60.42 
 
 		 96 aa  122  1e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.95289 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3714  co-chaperonin GroES  64.13 
 
 		 97 aa  122  2e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.31168 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2625  chaperonin Cpn10  60.64 
 
 		 96 aa  122  2e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0092  co-chaperonin GroES  58.51 
 
 		 96 aa  122  2e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000241636  normal  0.390298 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0611  co-chaperonin GroES  70.21 
 
 		 105 aa  122  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.506455  normal  0.35889 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0760  co-chaperonin GroES  60.64 
 
 		 96 aa  122  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000000383794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0552  co-chaperonin GroES  58.51 
 
 		 96 aa  121  4e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0028  co-chaperonin GroES  58.51 
 
 		 95 aa  120  4e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  6.32588e-17  normal  0.625386 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0540  co-chaperonin GroES  58.51 
 
 		 96 aa  121  4e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0263712 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0425  co-chaperonin GroES  56.84 
 
 		 96 aa  120  5e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  1.1607099999999999e-20  hitchhiker  0.002869 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1098  chaperonin Cpn10/GroES  57.61 
 
 		 101 aa  120  5e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000000000347589  hitchhiker  0.000183313 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0639  co-chaperonin GroES  57.45 
 
 		 96 aa  120  6e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00560672  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0641  co-chaperonin GroES  55.79 
 
 		 96 aa  120  9e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2657  co-chaperonin GroES  54.74 
 
 		 96 aa  119  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0615  co-chaperonin GroES  54.74 
 
 		 96 aa  119  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0242301 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2474  co-chaperonin GroES  63.83 
 
 		 95 aa  118  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0230053  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2345  co-chaperonin GroES  58.51 
 
 		 96 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.0000000286758  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5254  chaperonin Cpn10  53 
 
 		 105 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.321205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3734  co-chaperonin GroES  63.04 
 
 		 97 aa  118  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.619596  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3593  co-chaperonin GroES  63.04 
 
 		 97 aa  118  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3660  co-chaperonin GroES  63.04 
 
 		 97 aa  118  3e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0336408  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1195  co-chaperonin GroES  60.64 
 
 		 95 aa  117  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0507909  hitchhiker  0.00286909 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0379  chaperonin Cpn10  59.78 
 
 		 95 aa  117  4.9999999999999996e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.00000000945621  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>