126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2916 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2916  hypothetical protein  100 
 
 		 282 aa  518  1e-146  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.264108  normal  0.862431 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3356  hypothetical protein  50.54 
 
 		 287 aa  224  1e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2087  LysR family transcriptional regulator  46.49 
 
 		 283 aa  209  4e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.632032  hitchhiker  0.0000000953173 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3109  hypothetical protein  50 
 
 		 289 aa  206  2e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0895719 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0600  hypothetical protein  51.1 
 
 		 297 aa  205  8e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.172684 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0746  DMT family permease  48.06 
 
 		 297 aa  202  4e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0781  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.57 
 
 		 295 aa  197  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01739  hypothetical protein  47.65 
 
 		 303 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1774  hypothetical protein  45.77 
 
 		 297 aa  196  3e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2000  hypothetical protein  46.33 
 
 		 283 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389336  decreased coverage  0.00000000377823 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1975  hypothetical protein  45.95 
 
 		 283 aa  194  1e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0979714  hitchhiker  0.00214562 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4102  hypothetical protein  39.93 
 
 		 302 aa  191  1e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.576037  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4790  membrane protein  39.07 
 
 		 285 aa  186  4e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.278325  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4266  hypothetical protein  42.45 
 
 		 295 aa  183  3e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0646  hypothetical protein  41.22 
 
 		 288 aa  182  6e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00955347  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1068  hypothetical protein  41.7 
 
 		 311 aa  178  9e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2935  hypothetical protein  48 
 
 		 286 aa  178  9e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1656  hypothetical protein  45.56 
 
 		 297 aa  176  5e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0479067  normal  0.122332 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1850  sensor protein GLPS  40.43 
 
 		 302 aa  166  2.9999999999999998e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.829384 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5364  hypothetical protein  43.8 
 
 		 285 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.278081  normal  0.929346 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1416  hypothetical protein  36.82 
 
 		 304 aa  165  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.732037  normal  0.239593 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3521  hypothetical protein  46.49 
 
 		 290 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.349623  normal  0.801415 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1346  hypothetical protein  41.52 
 
 		 314 aa  162  7e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3816  hypothetical protein  45.05 
 
 		 307 aa  159  4e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1891  hypothetical protein  41.13 
 
 		 300 aa  157  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1446  hypothetical protein  33.22 
 
 		 314 aa  157  2e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001148  permease  40.59 
 
 		 289 aa  154  2e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.270511  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2406  hypothetical protein  47.94 
 
 		 290 aa  149  5e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.268881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2254  hypothetical protein  47.19 
 
 		 290 aa  146  5e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.290541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0856  hypothetical protein  47.17 
 
 		 288 aa  144  1e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0559005  normal  0.228089 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06636  hypothetical protein  38.75 
 
 		 289 aa  139  3.9999999999999997e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1051  DMT superfamily efflux pump  37.39 
 
 		 254 aa  137  3.0000000000000003e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.226473  normal  0.464817 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38950  hypothetical protein  47.81 
 
 		 287 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6439  hypothetical protein  39.93 
 
 		 275 aa  127  3e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.719443 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6146  hypothetical protein  39.56 
 
 		 302 aa  127  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1433  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.62 
 
 		 296 aa  125  6e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1689  protein of unknown function DUF6 transmembrane  49.08 
 
 		 301 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.112167  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02132  permease of the drug/metabolite transporter superfamily protein  41.03 
 
 		 194 aa  123  4e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.259073  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3318  hypothetical protein  45.62 
 
 		 286 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2262  hypothetical protein  48.66 
 
 		 319 aa  120  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.099345  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1613  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.12 
 
 		 307 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.76207  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1087  hypothetical protein  45.91 
 
 		 281 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.647653 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1636  hypothetical protein  33.33 
 
 		 335 aa  82  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.378464  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46360  hypothetical protein  51.72 
 
 		 285 aa  79  0.00000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.206778  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3002  hypothetical protein  30.87 
 
 		 298 aa  63.2  0.000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2341  hypothetical protein  26.62 
 
 		 312 aa  62.4  0.000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0925779 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1192  hypothetical protein  28.52 
 
 		 308 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.164294  normal  0.262505 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0199  hypothetical protein  26.59 
 
 		 298 aa  58.9  0.00000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2143  putative transmembrane protein  29.77 
 
 		 302 aa  58.5  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1102  hypothetical protein  29.19 
 
 		 308 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1099  hypothetical protein  31.56 
 
 		 310 aa  57.8  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.230747  normal  0.557471 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0996  hypothetical protein  22.46 
 
 		 274 aa  57.8  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31188  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1102  hypothetical protein  29.19 
 
 		 308 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.624335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1524  DMT family permease  30.47 
 
 		 310 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0739  hypothetical protein  28.52 
 
 		 308 aa  57  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1220  hypothetical protein  28.52 
 
 		 308 aa  57  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.10196  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1392  multidrug ABC transporter permease  30.11 
 
 		 310 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1398  hypothetical protein  30.11 
 
 		 310 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.974177  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2084  hypothetical protein  28.73 
 
 		 308 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4328  hypothetical protein  27.99 
 
 		 308 aa  54.7  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2847  hypothetical protein  28.99 
 
 		 310 aa  54.3  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1758  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.26 
 
 		 306 aa  54.3  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000138196  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1109  hypothetical protein  32.02 
 
 		 295 aa  53.9  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.12045 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4193  hypothetical protein  29.23 
 
 		 274 aa  53.1  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.582815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  21.35 
 
 		 317 aa  52.4  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1272  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.79 
 
 		 314 aa  51.6  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.162759  normal  0.535938 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1763  hypothetical protein  29.5 
 
 		 310 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.272283  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1194  hypothetical protein  29.5 
 
 		 302 aa  50.8  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00865316  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0675  hypothetical protein  29.5 
 
 		 310 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00975957  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0477  hypothetical protein  29.5 
 
 		 310 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2764  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.07 
 
 		 305 aa  50.1  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2637  hypothetical protein  31.98 
 
 		 320 aa  49.7  0.00005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000608588  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1445  DMT family permease  27.42 
 
 		 322 aa  49.7  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.658793  normal  0.0652074 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4793  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.74 
 
 		 300 aa  49.3  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2674  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.61 
 
 		 308 aa  49.3  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1374  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.03 
 
 		 289 aa  48.1  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0209968 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0882  hypothetical protein  24.47 
 
 		 296 aa  48.5  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000008536  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15760  DMT(drug/metabolite transporter) superfamily permease  26.42 
 
 		 327 aa  47.8  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.941518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1258  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.11 
 
 		 305 aa  48.1  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.559477  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0050  hypothetical protein  27.07 
 
 		 297 aa  48.1  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2185  hypothetical protein  27.6 
 
 		 291 aa  47.4  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0872  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.26 
 
 		 303 aa  47.4  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.187128  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2018  hypothetical protein  28.2 
 
 		 312 aa  47.4  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0644  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25 
 
 		 287 aa  47  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000380606  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3740  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.32 
 
 		 305 aa  47  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.184677 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1827  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.2 
 
 		 312 aa  47  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.297612  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2340  hypothetical protein  27.31 
 
 		 303 aa  46.6  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2371  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.85 
 
 		 310 aa  45.8  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.599012 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06582  hypothetical protein  30.66 
 
 		 295 aa  46.2  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0732  hypothetical protein  26.42 
 
 		 343 aa  46.2  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5896  hypothetical protein  28.77 
 
 		 321 aa  45.8  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.557426 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0873  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.66 
 
 		 305 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2562  hypothetical protein  28.89 
 
 		 298 aa  45.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0693579 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0169  hypothetical protein  23.97 
 
 		 311 aa  45.4  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5524  hypothetical protein  26.02 
 
 		 298 aa  45.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.895083  normal  0.458924 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0277  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28 
 
 		 325 aa  45.4  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3085  hypothetical protein  31.42 
 
 		 295 aa  45.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0753098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0184  integral membrane protein  27.84 
 
 		 291 aa  45.4  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0996996  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0304  hypothetical protein  28.1 
 
 		 273 aa  44.3  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.589486  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1039  hypothetical protein  30.69 
 
 		 303 aa  44.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.371653  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>